DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)03659 and CG11898

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610482.3 Gene:l(2)03659 / 47905 FlyBaseID:FBgn0010549 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_651679.2 Gene:CG11898 / 43451 FlyBaseID:FBgn0039645 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1334 Identity:521/1334 - (39%)
Similarity:802/1334 - (60%) Gaps:79/1334 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    77 SAQNEKEKVLPENPRARSNFISSLCFWYTIPIFRKGYRKTLDSTDLYRPLEEQKSDILGNRLCAS 141
            ||.:|:.:   .||..::||.|...|.:|..|..||.::.||.:|||......:|..:.:.|...
  Fly     2 SAVHEQRQ---PNPVTKANFFSKWFFIWTREILVKGLQRNLDPSDLYETEPSLESTQVSSFLLGH 63

  Fly   142 WERELKNDGRSPSLVRALLRVFGWQLGFPGLAIFVVELGLRTLQPIFLVKLISYFSGEPD--AAN 204
            ||:|||..  .|:::|.:.:.:||......:...::.:.:.|.||:.|..|:|:||....  ..:
  Fly    64 WEQELKRS--KPNVLRMIFKAYGWSFVPASIVYSIMAIAVHTTQPLMLGGLVSFFSESTGKITKH 126

  Fly   205 AGFYYAVAQIVISALTVMILTPTTFGIHHVCFKMRVAMGSMIFRKALRLTKGALGDTTSGHVVNL 269
            :.:.||:..::.|.::.:...|....:..|..::|:|...:::||.||::..|.....||:.::|
  Fly   127 SAYLYAMGVVLCSLISGLFFHPFMKYLFRVGSRVRLACAGLVYRKFLRVSVAADNSGVSGYAISL 191

  Fly   270 ISNDIPRLDSAPYTVHYLWVGPLQVLVITYLMYQEIGISAVFGVLFMLLFMPIQMYLGTRTSAIQ 334
            ::.|:|..:.:.|..|.||.|||:.:|..|::||.||..||.|:..::.|:|:|.:.....:..:
  Fly   192 MATDLPTFNESFYCFHELWRGPLEGVVFVYIIYQLIGWPAVVGLGTIVAFIPLQAWAARAIARYK 256

  Fly   335 LKAAERTDNRIRMVNEIISAIQVLKMYAWEQPFEQMVTHAREKEMNTIRQGQYI-RGFDFARRIV 398
            ..:|:..|.|::::||||:|:|::||||||:.|.:::...|::||::||...|| .|.....  :
  Fly   257 RSSADVGDERVKLMNEIIAAMQLIKMYAWEKSFAKLIGKVRKEEMDSIRGSTYIYAGLQCTG--M 319

  Fly   399 LSRVAIFLSLVGYVILGKVFTPEIAFMITAYYNVLLAAMSIYVPSAIIQTAQFLTSIRRVEQFMQ 463
            :|::::|||||.||..|.:.|.:..|::.:||:.|..::....|.||....:......||:.|:.
  Fly   320 ISKLSLFLSLVTYVFTGDIVTSQKVFIVASYYDHLNDSLLHSWPLAINMWVETFVVANRVKDFLF 384

  Fly   464 SEELGSSDKSEGPSKDTVPGNPPSNN-------NEADLLKSAISIRDLKAKWDPNSPDYT---LS 518
            ..| ..:|......|: ...||...|       .:|::  .:|::..|.|.||....:..   :.
  Fly   385 QHE-NPADGGVHNFKE-AEDNPEHGNFFGRTHKPKAEV--KSITVHKLSASWDQKKQEKRHRHIE 445

  Fly   519 GINLEIKPGSVVAVIGLTGSGKSSLIQAILGELKANSGQLQVNGSLSYTSQESWLFSGTVRQNIL 583
            .::.:.:....|.::|..|:|||:|:|.|||||...||.::|||.|||..||.||..|::|.|||
  Fly   446 DVSFQAQDQQFVGIVGTVGAGKSTLLQVILGELDIISGSVEVNGVLSYAPQEPWLLRGSLRDNIL 510

  Fly   584 FGQPMDSQRYEEVVKKCALERDFDLLPLRDNTIVGERGATLSGGQKARISLARSVYRKASIYLLD 648
            |.:|.|.|||.||::.|.|:||.:.|||.|:|.|||.||:||||||||:||||:|||||.|||||
  Fly   511 FTEPYDEQRYLEVLRVCHLDRDVEQLPLGDSTRVGEGGASLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLD 575

  Fly   649 DPLSAVDASVARHLFDQCVRGHLRGSTVVLVTHQEQFLPHVDQIVILANGQIKALGDYESLLKTG 713
            |||||||:.|::.|.|:|:...|.....:||||:.|.|.|||.:|:|..|:|...|.|::|.|  
  Fly   576 DPLSAVDSHVSKMLLDRCLNEFLSKKIRILVTHRVQLLRHVDHLVLLEGGRISVQGHYDALKK-- 638

  Fly   714 LITGLGSLS-----------KTDKAKTEEQEPLNLNSPDNKNEVTPIKENSEQTVGGSSSGKEHV 767
            ||....|::           :||.. .||.||..                       |.|.:||:
  Fly   639 LIRFRMSVANDVEVAKLRAMRTDSV-YEEPEPRK-----------------------SLSQEEHM 679

  Fly   768 ER----------QESGGISLALYRKYFQAGGGLVAFLVMLSSSVLAQVAVTGGDYFLTYWVKKES 822
            :|          |:.|.:.|..|::||:..|..:..:::|...|:|:.:....|.||:.|...|.
  Fly   680 DRHEIEQQFKEQQQIGSVKLQTYKEYFKVLGHPLVVVLILLMFVVARSSEATMDIFLSKWATWEE 744

  Fly   823 TAAGHGE--MEDMESKSMDVYKYTLIIILSVIMNLSSSFLLFNIAKKASIRLHNTIFNRVTRADM 885
            |.....|  .|...::...:..||.:|:.::|..:..:|..|.:..:.|:|:|:.:|..|.||.|
  Fly   745 TEPNQHEPIPEYHRTRLRMMILYTFLILCTLIFYVLRTFGFFMMTLRISLRIHDQLFQGVIRAFM 809

  Fly   886 HFFSINKHGSILNRFTKDMSQVDEVLPVVLVDVMQIALWLAGIIIVIANVNPLLLVPTLMLSVIF 950
            |||::...|.|||||:.|:..:|..||..::|.::.|:....::.|::..|..||:|..::..:.
  Fly   810 HFFTLATSGRILNRFSSDVLAIDVNLPQAMMDSIEFAVNALAVLAVVSTANIWLLIPATVVVALL 874

  Fly   951 YHLRNLYLKTSRDLKRVEAINRSPVYSHLAASLNGLTTIRALDAQRVLEKEFDSYQDAHSSAFFM 1015
            |..|.||:..||.|||:|.|:|||:|||..|:..||.|||||:..:.:|::|..||:.::||.::
  Fly   875 YGCRCLYIGASRSLKRIETISRSPIYSHTNATFKGLATIRALNGTKYMERDFHYYQNENTSALYL 939

  Fly  1016 YISTSQAFGYCMNCICVIYISIITLSFFAFPPGNG---ADVGLVITQAMGLIDMVQWGVRQTAEL 1077
            ::|.::||.:..:.|||:||..:|.||..|....|   .||||.|||:|.|:.|.|.|:|||.||
  Fly   940 HVSINRAFAFWTDLICVLYILAVTFSFLLFDKHRGYYSGDVGLAITQSMKLVLMCQAGMRQTVEL 1004

  Fly  1078 ENTMTAVERVVEYESIEPEGMLEAPDDKKPPKTWPEQGEIIFKELNLRYTPNAKAENVLKSLSFV 1142
            ||.||:||||:||.:|..|...|..:....||.||..|::.|::|.|||:.:  ...:||.|:|.
  Fly  1005 ENMMTSVERVMEYVNIPSEPAYETEESVNLPKHWPSGGQLDFRDLRLRYSNH--GPYILKGLTFT 1067

  Fly  1143 IQPREKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYTDGSVLIDTRDTRQMGLHDLRRQISIIPQEPVLFSG 1207
            |:..||:||||.|.|||||:::|||||::.:|.:.||..:|.|:|||||||:||||||:||||||
  Fly  1068 IRGEEKIGIVGHTAAGKSSIVHALFRLAHINGHISIDGFETSQLGLHDLRRRISIIPQDPVLFSG 1132

  Fly  1208 TMRYNLDPFDEYSDEKLWGCLEEVKLKEVVSDLPDGLASKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRE 1272
            ::|:|||||:|.:||:||..||.|||||.||:|.||:..::.:.|.|||:|||||||||||:||:
  Fly  1133 SLRFNLDPFEEKTDEELWLALEAVKLKEFVSNLKDGINCRLHDCGANFSMGQRQLVCLARALLRQ 1197

  Fly  1273 NRILVMDEATANVDPQTDGLIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLHTIIDSDKVMVMDAGRVVEFGSPY 1337
            |:||:||||||||||:||.|||..|.:||..||||||||||||::|:|:|||:|.|||||.|.|:
  Fly  1198 NKILIMDEATANVDPETDNLIQEAIHTKFAHCTVLTIAHRLHTVMDNDRVMVVDMGRVVELGHPH 1262

  Fly  1338 ELMTKSDSKVFHNLVNQSGRASYEGLLKIAQETF 1371
            ||:..... ..|..|.::|..:.:.|..:|::::
  Fly  1263 ELLHNRHG-YLHRFVEKTGVGTAQHLRHLAEQSY 1295

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)03659NP_610482.3 PLN03130 83..1369 CDD:215595 518/1324 (39%)
CG11898NP_651679.2 MRP_assoc_pro 2..1268 CDD:188098 516/1304 (40%)

Return to query results.
Submit another query.