DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)03659 and MRP

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610482.3 Gene:l(2)03659 / 47905 FlyBaseID:FBgn0010549 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_723772.2 Gene:MRP / 34686 FlyBaseID:FBgn0032456 Length:1549 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1376 Identity:461/1376 - (33%)
Similarity:734/1376 - (53%) Gaps:160/1376 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    88 ENPRARSNFISSLCFWYTIPIFRKGYRKTLDSTDLY--RPLEEQKSDILGNRLCASWERELK--- 147
            |.|...::|:|.:.:.:...:..||||..|:..||:  || ::..|::: ......|.:.::   
  Fly   223 EIPELSASFLSRITYQWFDKMALKGYRNPLEEKDLWDLRP-QDSCSEVM-PIFAHHWNQNVRKNY 285

  Fly   148 -------------------------NDGRSPSLVRALLRVFGWQLGFPGLAIF--VVELGLRTL- 184
                                     .:||...:...:..::   ..|.|:.:|  :::|...|| 
  Fly   286 KNKARVEPKAQFSNGNVTFENPHGEKNGRKKGMASIMPPIY---KSFGGVFLFGALMKLFTDTLT 347

  Fly   185 --QPIFLVKLISYF---SGEPDAANAGFYYAVAQIVISALTVMILTPTTFGIHHVCFKMRVAMGS 244
              ||..|..:||:.   ..||:.  .|..|||...|::|....||......:..|..::|.|:.:
  Fly   348 FAQPQVLSLIISFVEAQDAEPEW--KGILYAVLLFVLAAAQTFILGQYFHRMFIVGLRIRTALIN 410

  Fly   245 MIFRKALRLTKGALGDTTSGHVVNLISNDIPRLDSAPYTVHYLWVGPLQVLVITYLMYQEIGISA 309
            .|:|||||::.....::|.|.:|||::.|..|.......::.:|..|||:.:..|.::|::|.|.
  Fly   411 AIYRKALRISNSTKKESTVGEIVNLMAVDAQRFMELTTYLNMIWSAPLQIGLALYFLWQQLGPSV 475

  Fly   310 VFGVLFMLLFMPIQMYLGTRTSAIQLKAAERTDNRIRMVNEIISAIQVLKMYAWEQPFEQMVTHA 374
            :.|:..|::.:|:...:.:|....|::..:..|.|::::||::|.|:|||:||||..||:.|...
  Fly   476 LAGLAVMIILIPVNGVIASRIKTYQIRQMKYKDERVKLMNEVLSGIKVLKLYAWEPSFEKQVLDI 540

  Fly   375 REKEMNTIRQGQYIR-GFDFARRIVLSRVAIFLSLV---GYVILGKV--FTPEIAFMITAYYNVL 433
            |:||:.|:|...|:. |..|    :.|.....:|||   .||:..:.  .:.|...:..|.::::
  Fly   541 RDKEIATLRSTAYLNAGTSF----LWSCAPFLVSLVTFATYVLTSEANQLSVEKVLVSIALFDLM 601

  Fly   434 LAAMSIYVPSAIIQTAQFLTSIRRVEQFMQSEELGSSDKSEGPSKDTVPGNPPSNNNEADLLKSA 498
            ...::| :|...:..|:...|:.|:.:|:.||||..:......||.    :|             
  Fly   602 KLPLTI-LPMLSVDIAETQVSVNRINKFLNSEELDPNSVLHDSSKP----HP------------- 648

  Fly   499 ISIRDLKAKWDPNSPDYTLSGINLEIKPGSVVAVIGLTGSGKSSLIQAILGELKANSGQLQVNGS 563
            :||.:.:..|   ..:.||..||:|:|.||:||::|..||||||::||.|||::..:|.:...|.
  Fly   649 MSIENGEFSW---GDEITLRNINIEVKKGSLVALVGTVGSGKSSVVQAFLGEMEKLAGVVNTVGK 710

  Fly   564 LSYTSQESWLFSGTVRQNILFGQPMDSQRYEEVVKKCALERDFDLLPLRDNTIVGERGATLSGGQ 628
            |:|..|::|:.:.|||.||||||..|.:||.:|:..|||..|.|:|...|.|.:||:|..|||||
  Fly   711 LAYVPQQAWIQNATVRDNILFGQTYDRKRYNKVIDACALRADIDILSAGDLTEIGEKGINLSGGQ 775

  Fly   629 KARISLARSVYRKASIYLLDDPLSAVDASVARHLFDQCV--RGHLRGSTVVLVTHQEQFLPHVDQ 691
            |.||||||:||..|.:||||||||||||.|.:|:|::.:  :|.|...:.|||||...|||.||.
  Fly   776 KQRISLARAVYSDADLYLLDDPLSAVDAHVGKHIFEEVIGPKGILARKSRVLVTHGVTFLPQVDS 840

  Fly   692 IVILANGQIKALGDYESLLKT----------GLITG-----------------------LGSLSK 723
            |.::..|:|...|.::.|:|.          .|..|                       ||::.|
  Fly   841 IYVIKMGEISESGTFDQLVKNKGAFADFIIQHLQEGNEEEEELNQIKRQISSTADVPELLGTVEK 905

  Fly   724 TDK-AKTEE-QEPLNLNSPDN--------KNEVTPIKENSEQTVGGSSSGKE---------HVER 769
            ..| |:||. .:.:::.|.|:        :....  :::|..:|..::|.|:         ..|:
  Fly   906 AIKLARTESLSDSISVTSADSLMGGGGSLRRRTK--RQDSHDSVASAASLKKKQEVEGKLIETEK 968

  Fly   770 QESGGISLALYRKYFQAGGGLVAFLVMLSSSVLAQVAVTGGDYFLTYWVKKESTAAGHGEMEDME 834
            .::||:..|:|:.|.::.|..::...::.:.|. |....|.:.:||.|...::.|...| :.|| 
  Fly   969 SQTGGVEFAVYKHYIKSVGIFLSVATLVLNFVF-QAFQIGSNLWLTQWANDQNVANDTG-LRDM- 1030

  Fly   835 SKSMDVY------KYTLIIILSVIMNLSSSFLLFNIAKKASIRLHNTIFNRVTRADM-HFFSINK 892
              .:.||      :..|.....||:.|..    |..||    .:||.:...:.|..: .||.|..
  Fly  1031 --YLGVYGAFGFGQGVLAYFAVVIVYLGG----FQAAK----TIHNELLAVIIRGSVCRFFDITP 1085

  Fly   893 HGSILNRFTKDMSQVDEVLPVVLVDVMQIALWLAGIIIVIANVNPLLLVPTLMLSVIFYHLRNLY 957
            .|.:||.|:.||..|||.||..:...|.....:...|:||:...|:.|...:.::.::|..:..|
  Fly  1086 IGRLLNSFSGDMDVVDEELPATMDSFMTFIFMVLATIVVISLSTPIFLAVIVPIAFLYYFAQRFY 1150

  Fly   958 LKTSRDLKRVEAINRSPVYSHLAASLNGLTTIRALDAQRVLEKEFDSYQDAHSSAFFMYISTSQA 1022
            :.|||.|.|:|:::|||:|||.:.::.|.:||||.:......:|.|:..|.:....:..:..::.
  Fly  1151 VATSRQLMRLESVSRSPIYSHFSETVTGASTIRAYNVGDRFIEESDAKVDKNQVCKYPSVIANRW 1215

  Fly  1023 FGYCMNCICVIYISIITLSFFAFPPG--NGADVGLVITQAMGLIDMVQWGVRQTAELENTMTAVE 1085
            ....:.  .|..:.|:..|.||...|  |...|||.::.|:.:...:.|.||.::::|..:.:||
  Fly  1216 LAIRLE--MVGNLIILFASLFAVLGGQTNPGLVGLSVSYALQVTQTLNWLVRMSSDIETNIVSVE 1278

  Fly  1086 RVVEYESIEPEGMLEAPDDKKPPKTWPEQGEIIFKELNLRYTPNAKAENVLKSLSFVIQPREKVG 1150
            |:.||...:.|...|...||..||.||::|.:.|:...:||...  .:.||:.:||.||..||||
  Fly  1279 RIKEYGETKQEAPWELEQDKNKPKNWPQEGRVEFQNFQVRYREG--LDLVLRGVSFNIQGGEKVG 1341

  Fly  1151 IVGRTGAGKSSLINALFR-LSYTDGSVLIDTRDTRQMGLHDLRRQISIIPQEPVLFSGTMRYNLD 1214
            ||||||||||||..|||| :....|.:.||..|...||||.||.:::||||:||||||::|.|||
  Fly  1342 IVGRTGAGKSSLTLALFRIIEAAGGRISIDGVDIASMGLHMLRSRLTIIPQDPVLFSGSLRINLD 1406

  Fly  1215 PFDEYSDEKLWGCLEEVKLKEVVSDLPDGLASKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMD 1279
            ||:..:|:::|..||...||..|..|..||..:|:|||.|.|||||||||||||:||:.::||:|
  Fly  1407 PFEIKTDDEIWKALELSHLKSFVKSLAAGLNHEIAEGGENLSVGQRQLVCLARALLRKTKVLVLD 1471

  Fly  1280 EATANVDPQTDGLIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLHTIIDSDKVMVMDAGRVVEFGSPYELMTKSD 1344
            ||||.||.:||.|||.|||::|::||||||||||:||:|||||:|:|.|:::||.||.||:....
  Fly  1472 EATAAVDLETDDLIQKTIRTEFKECTVLTIAHRLNTILDSDKVIVLDKGQIIEFASPTELLDNPK 1536

  Fly  1345 SKVFHNLVNQS 1355
            | .|:::...:
  Fly  1537 S-AFYSMAKDA 1546

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)03659NP_610482.3 PLN03130 83..1369 CDD:215595 461/1376 (34%)
MRPNP_723772.2 MRP_assoc_pro 14..1548 CDD:188098 461/1376 (34%)

Return to query results.
Submit another query.