Protein Alignment l(2)03659 and abc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610482.3
• Gene: l(2)03659 / 47905
• FlyBaseID: FBgn0010549
• Length: 1374
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_594585.1
• Gene: abc1 / 2542640
• PomBaseID: SPAC9E9.12C
• Length: 1427
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1354
• Identity: 380/1354 - (28%)
• Similarity: 638/1354 - (47%)
• Gaps: 205/1354 - (15%)

  Fly   106 IPI-FRKGYRKTLDSTDLYRPLEEQKSDI---------LGNRLCASWEREL-------------- 146
            ||: |.:.:..|:..:.:.||..||...|         |...:..||::.:
pombe   171 IPLFFPRAWSPTVKFSKVARPSPEQTCSIFSLIFTYGWLNGIIWKSWKKPITLTDVPALPDTECT 235

  Fly   147 --------KNDGRS------PSLVRALLRVFGWQLGFPGLAIFVVELGLRTL--QPIFLVKLISY 195
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pombe   236 QIWYSRFAKNDRKSLMHTILLSLKSTIL-----------LMVFLSVLVSSTLFVTPLAIKKLLQY 289

  Fly   196 FSG-EPDAANAGFYYAVAQIVISALTVMILTPTTFGIHHVCFKMRVAMGSMIFRKALRLTKGALG 259
            ... :.|..|:.|.:....::...|..::.............:::.|:..||::|.  ||...|.
pombe   290 LQNPKSDEGNSPFLWVFVLLIGPYLASVVKELYVHVSRRFMLRIKAAITQMIYKKV--LTSKTLF 352

  Fly   260 DTTSG------HVVNLISNDIPRLDSAPYTVHYLWVGPLQVLVITYLMYQEIGISAVFGVLFMLL 318
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pombe   353 VAVDGSKINLDYVYNLLAKDVDNIGEMREFIGIIARAPLEMGVSMYFLYQLLGWSAYVGLLLAIL 417

  Fly   319 FMPIQMYLGTRTSAIQLKAAERTDNRIRMVNEIISAIQVLKMYAWEQPFEQMVTHAREKEMNTI- 382
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pombe   418 SSSFPLLVASKISRLTSIANTSSDERIRLTTELLKSIKITKLFGWERPMLSRIQEKRSFEVNNMY 482

  Fly   383 ---------RQGQYIRGFDFARRIVLSRVAIFLSLVGYV-ILGKVFTPEIAFMITAYYNVLLAAM 437
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pombe   483 SLTLFDIIFKSGMKIAPF----------ISMFITFAIYTKIMGHQLTPATAFTSISMFG-LLRYQ 536

  Fly   438 SIYVPSAIIQTAQFLTSIRRVEQFMQSEELGSSDKSEGPSKDTVPGNPPSNNNEADLLKSAISIR 502
            .|::.|...|..||..|::||:.|:....:..|......|                     ....
pombe   537 FIWLASVSRQFIQFKVSLKRVDNFVYGNMVNDSSIESSDS---------------------FVFE 580

  Fly   503 DLKAKWDPNSPD---YTLSGINLEIKPGSVVAVIGLTGSGKSSLIQAILGELKANSGQL---QVN 561
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pombe   581 NTSLSWSP-TPSTALFQLKNLNFTIPRNQFTLVVGSTGSGKSTLAMALLGELHVISGKMTTPSIS 644

  Fly   562 GSLSYTSQESWLFSGTVRQNILFGQPMDSQRYEEVVKKCALERDFDLLPLRDNTIVGERGATLSG 626
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pombe   645 QRIAYVPQAAWLRNGTIRSNILFGEPYDEERYFQIIKACCLDSDLNSMNDGDLTYIHSNGSSLSG 709

  Fly   627 GQKARISLARSVYRKASIYLLDDPLSAVDASVARHLFDQC-VRGHLRGSTVVLVTHQEQF-LPHV 689
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pombe   710 GQKQRVSLARALYSNAEVYIFDDIFSALDVSTSRKIYESCFLSTLLQHKTIILFTHNVSLCLPIA 774

  Fly   690 DQIVILAN--GQIKALGDYESLLKTGLITGLGSLSKTDKAKTEEQEPLNLNSPDNKNEVTPIKEN 752
            :.:::|.|  .|:.:....:.|:.:   |...|.:|.|..:.|..||.:.              :
pombe   775 ENVIVLKNSTAQLVSPDSIQELVPS---TFFSSNTKKDNIEEENLEPHSF--------------S 822

  Fly   753 SEQTVGGSSSGKEHVERQESGGISLAL----YRKYFQAGGGLVAFLVMLSSSVLAQVAVTGGDYF 813
            .:.|:..||...|  :|..:...|:.|    |.|||.:...::..::::   :::||::....::
pombe   823 FDSTLASSSDNDE--QRDFASNSSIVLLGLHYLKYFGSNKYILGSILLV---MMSQVSLASIHFW 882

  Fly   814 LTYWVKKESTAAGHGEME-DMESKSMDVYKYTLIIILSVIMNLSSSFLLFNIAKKASIRLHNTIF 877
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pombe   883 IALW-------SGNSLFSLKLPSSFSFLWGYAILLFIYFLMDLSRAITFAKGGRTASENIHDILS 940

  Fly   878 NRVTRADMHFFSINKHGSILNRFTKDMSQVDEVLPVVLVDVMQIALWLAGIIIVIANVN---PLL 939
            .||..:.:|:|.....|.|||||:|||...|.:|...|..::   |.:..|:|.:.||.   |:.
pombe   941 ERVLYSPLHWFEKTAAGRILNRFSKDMYATDNLLWASLEGML---LCVMAILITMLNVTLVMPIF 1002

  Fly   940 LVPTLMLSVIFYHLRNLYLKTSRDLKRVEAINRSPVYSHLAASLNGLTTIRALDAQRVLEKEFDS 1004
            :||...:|::.|.....|.|..:.|..:::...|||::.|..:|.|:|.|||...:::.|.|
pombe  1003 MVPAAFVSLLVYLHGYAYSKAQKQLTSLQSSRTSPVFTMLGETLGGITVIRAFKKEKIFEHE--- 1064

  Fly  1005 YQDAHSSAFF------MYIS-------------TSQAFGYCMNCICVIYISIITLSFFAFPPGNG 1050
                 :.||.      :|||             .|...|:....|.::..:|        |||.
pombe  1065 -----NMAFIDDMIQPLYISFAINRWLAIRTDGISGLVGFSTGLIALLRQNI--------PPGL- 1115

  Fly  1051 ADVGLVITQAMGLIDMVQWGVRQTAELENTMTAVERVVEYESIEPEGMLEAPDDKKPPKTWPEQG 1115
              ||..:..|:|....|...||...|:...:....|:.||..:..|....:...|...|.||..|
pombe  1116 --VGFSLNSAIGFNISVLVFVRANNEILTYINNFRRLYEYMLLPSEKNESSCLTKPMNKEWPTLG 1178

  Fly  1116 EIIFKELNLRYTPNAKAENVLKSLSFVIQPREKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLS-YTDGSVLID 1179
            .:..|.|.:.|:....|  ||:.::..|.|:||:.||||||:|||::...|.|.: ...|:|.:|
pombe  1179 HVSIKNLTVSYSIGQAA--VLEDINLEILPKEKIAIVGRTGSGKSTMGLTLLRFTMIMSGAVEVD 1241

  Fly  1180 TRDTRQMGLHDLRRQISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDEKLWGCLEEVKLKEVV----SDL 1240
            ..|...:.|..||::||:|||:|||.|||:|.|||||:||.|.:|...|:....:.:|    .:.
pombe  1242 GIDINSLDLEVLRQRISLIPQDPVLISGTVRSNLDPFEEYGDGELNEILKTASCESLVQASNKNS 1306

  Fly  1241 PDGLA----SKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDGLIQATIRSKF 1301
            .|..|    :.:..||.|||.||||::.||||::|::||:::||:||:||..||..||..:|:.|
pombe  1307 LDAFAIHLDTPVDSGGVNFSSGQRQILALARALVRKSRIVILDESTASVDDTTDRRIQQMLRAAF 1371

  Fly  1302 RDCTVLTIAHRLHTIIDSDKVMVMDAGRVVEFGSPYELMTKSDSKVFHNLVNQS 1355
            :..|||.||||:.||:|.|||:|:|:|:.||||||..|.|:  .:.|..:..:|
pombe  1372 KHATVLCIAHRIKTIVDYDKVLVLDSGKTVEFGSPKSLYTQ--RRAFWKMCKES 1423

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
l(2)03659	NP_610482.3	PLN03130	83..1369	CDD:215595	380/1354 (28%)
abc1	NP_594585.1	MRP_assoc_pro	166..1423	CDD:188098	379/1352 (28%)