DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)03659 and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610482.3 Gene:l(2)03659 / 47905 FlyBaseID:FBgn0010549 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236159.2 Gene:Cftr / 24255 RGDID:2332 Length:1665 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1593 Identity:430/1593 - (26%)
Similarity:754/1593 - (47%) Gaps:302/1593 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 QPVLEPTFDSVSERENTSIEESSLLENNGFDHRNKDESLSVNTSPPLVCRKCFELGHQTENCKQK 68
            :|:|.|..:.:|:||    |..:|  |..:..|::.:...|.|                    |.
  Rat   144 EPLLGPPCEGLSKRE----EPKAL--NGSWISRSRVQPEPVRT--------------------QT 182

  Fly    69 LTVNSENNSAQNEKEKVLPENPRARSNFISSLCFWYTIPIFRKGYRKTLDSTDLYRPLEEQKSDI 133
            |..:.:          ::.::|..:::|||.|.|.:|.||.|||||..|:.:|:|:......:|.
  Rat   183 LVHHGD----------IMQKSPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQAPSSDSADH 237

  Fly   134 LGNRLCASWERELKNDGRSPSLVRALLRVFGWQLGFPGLAIFVVELGLRTLQPIFLVKLI-SYFS 197
            |..:|...|:|| :...:.|.|:.||.|.|.|:..|.|:.:::.|: .:.:||:.|.::| ||..
  Rat   238 LSEKLEREWDRE-QASKKKPQLIHALRRCFVWRFVFYGVLLYLGEV-TKAVQPVLLGRIIASYDP 300

  Fly   198 GEPDAANAGFYYAVAQIVISALTVMILTPTTFGIHHVCFKMRVAMGSMIFRKALRLTKGALGDTT 262
            ...:..:...|..:...::..:..::|.|..||:||:..:||:||.|:|::|.|:|:...|...:
  Rat   301 DNTEERSIAIYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKIS 365

  Fly   263 SGHVVNLISNDIPRLDSAPYTVHYLWVGPLQVLVITYLMYQEIGISAVFGVLFMLLFMPIQMYLG 327
            .|.:::|:||::.:.|......|::|:.||||:::..|::..:..||..|:..:::.:..|..||
  Rat   366 IGQLISLLSNNLNKFDEGLALAHFIWIAPLQVVLLMGLLWDLLQFSAFCGLGLLIVLVIFQAILG 430

  Fly   328 TRTSAIQLKAAERTDNRIRMVNEIISAIQVLKMYAWEQPFEQMVTHAREKEMNTIRQGQYIRGFD 392
            ......:.|.|.:.:.|:.:.:|:|..|..:|.|.||...|:::...||:|:...|:..|:|.|.
  Rat   431 KMMVKYRDKRAAKINERLVITSEVIDNIYSVKAYCWESAMEKIIESLREEELKMTRRSAYMRFFT 495

  Fly   393 FARRIVLSRVAIFLSLVGY-----VILGKVFTPEIAFMITAYYNVLLAAMSIYVPSAIIQTAQFL 452
            .:.........:|||::.|     ::|.|:|| .|:|.|     ||..:::...|:|:......|
  Rat   496 SSAFFFSGFFVVFLSVLPYTVINGIVLRKIFT-TISFCI-----VLRMSVTRQFPTAVQIWYDSL 554

  Fly   453 TSIRRVEQFMQSEELGSSDKSEGPSKDTVPGNPPSNNNEADLLKSAISIRDLKAKWDP------- 510
            ..||:::.|:|::|.                    ...|.:|:.:.:.:.::.|.|:.       
  Rat   555 GMIRKIQDFLQTQEY--------------------KVLEYNLMFTGLVMENVTAFWEEGFQELLE 599

  Fly   511 ----NSPDY--------------------TLSGINLEIKPGSVVAVIGLTGSGKSSLIQAILGEL 551
                |:.|.                    .|..|||.||.|.::|:.|.||:||:||:..|||||
  Rat   600 KVQLNNDDRKTSNGENHLSFSHLCLVGNPVLKNINLNIKKGEMLAITGSTGAGKTSLLMLILGEL 664

  Fly   552 KANSGQLQVNGSLSYTSQESWLFSGTVRQNILFGQPMDSQRYEEVVKKCALERDFDLLPLRDNTI 616
            :|:.|.::.:|.:|::||.||:..||:::||:||...|..||:.|||.|.|:.|......:|||:
  Rat   665 EASEGIIKHSGRVSFSSQISWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYKSVVKACQLQEDITKFAEQDNTV 729

  Fly   617 VGERGATLSGGQKARISLARSVYRKASIYLLDDPLSAVDASVARHLFDQCVRGHLRGSTVVLVTH 681
            :||.|.||||||:|||||||:||:.|.:||||.|...:|......:|:.||...:...|.:|||.
  Rat   730 LGEGGVTLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEEQIFESCVCKLMASKTRILVTS 794

  Fly   682 QEQFLPHVDQIVILANGQIKALG----------DYESLL-------------KTGLITG------ 717
            :.:.|...|:|:||..|.....|          |:.|.|             ::.::|.      
  Rat   795 KMEQLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQSLRPDFSSKLMGYDTFDQFTEERRSSILTETLRRFS 859

  Fly   718 -----------------------------LGSLSKTDKAKTEEQEPLNLNS-------------P 740
                                         |.|.|...|....::.||::..             |
  Rat   860 VDDASTTWNKAKQSFRQTGEFGEKRKNSILSSFSSVKKISIVQKTPLSIEGESDDLQERRLSLVP 924

  Fly   741 DNKNEVTPIKENSEQTVGGSSSGKEH-----------------VERQESG--GISLA-------- 778
            |:::....:..::..|.|.:..|:..                 ::|..:.  .||||        
  Rat   925 DSEHGEAALPRSNMITAGPTFPGRRRQSVLDLMTFTPSSVSSSLQRTRASIRKISLAPRISLKEE 989

  Fly   779 ------------------------------------------LYRKYFQAGGGLVAFLVMLSSSV 801
                                                      .|.:||....||.|.|:......
  Rat   990 DIYSRRLSQDSTLNITEEINEEDLKECFFDDMVKIPTVTTWNTYLRYFTLHRGLFAVLIWCVLVF 1054

  Fly   802 LAQVAVTGGDYFLTYWVKKESTAAGHGEMEDMESKSMDVYKYTLII-------ILSVIMNLSSSF 859
            |.:||.:    ....|:.|.:...|......:.:.|     |.::|       |..:.:.::.:.
  Rat  1055 LVEVAAS----LFVLWLLKNNPVNGGNNGTKIANTS-----YVVVITSSSFYYIFYIYVGVADTL 1110

  Fly   860 LLFNIAK---------KASIRLHNTIFNRVTRADMHFFSINKHGSILNRFTKDMSQVDEVLPVVL 915
            |..::.:         .||..||..:.:.:..|.|..|:..|.|.|||||:||::.:|:.||:.:
  Rat  1111 LALSLFRGLPLVHTLITASKILHRKMLHSILHAPMSTFNKLKAGGILNRFSKDIAILDDFLPLTI 1175

  Fly   916 VDVMQIALWLAGIIIVIANVNPLLLVPTLMLSVIFYHLRNLYLKTSRDLKRVEAINRSPVYSHLA 980
            .|.:|:...:.|.|||::.:.|.:.:.|:....:|..||..:|.||:.||::|:..|||:::||.
  Rat  1176 FDFIQLLFIVVGAIIVVSALQPYIFLATVPGLAVFILLRAYFLHTSQQLKQLESEGRSPIFTHLV 1240

  Fly   981 ASLNGLTTIRALDAQRVLEKEFDSYQDAHSSAFFMYISTSQAFGYCMNCICVIYISIIT-LSFFA 1044
            .||.||.|:||...|...|..|....:.|::.:|||::|.:.|...::.|.|::..::| :|...
  Rat  1241 TSLKGLWTLRAFRRQTYFETLFHKALNLHTANWFMYLATLRWFQMRIDMIFVLFFIVVTFISILT 1305

  Fly  1045 FPPGNGADVGLVITQAMGLIDMVQWGVRQTAELENTMTAVERVVEY------ESI---------- 1093
            ...|.|. .|:::|.||.::..:||.|..:.:.::.|.:|.||.::      |||          
  Rat  1306 TGEGEGT-TGIILTLAMNIMSTLQWAVNSSIDTDSLMRSVSRVFKFIDIQTEESICTKIMKELHS 1369

  Fly  1094 --EPEGMLEAPDDKKPPKTWPEQGEIIFKELNLRYTPNAKAENVLKSLSFVIQPREKVGIVGRTG 1156
              .|..::...:..|...|||..||::.|:|.::|..:..|  :|:::||.|.|.::||::||||
  Rat  1370 EDSPNALVIKNEHVKKCDTWPSGGEMVVKDLTVKYVDDGNA--ILENISFSISPGQRVGLLGRTG 1432

  Fly  1157 AGKSSLINALFRLSYTDGSVLIDTRDTRQMGLHDLRRQISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSD 1221
            :|||:|::|..|:....|.:.||......|.|.:.|:...:|.|:..:||||.|.||||..::.|
  Rat  1433 SGKSTLLSAFLRMLNIKGEIQIDGVSWNSMTLQEWRKAFGVITQKVFIFSGTFRQNLDPNGKWRD 1497

  Fly  1222 EKLWGCLEEVKLKEVVSDLPDGLASKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVD 1286
            |::|...::|.||.|:...|..|...:.:||...|.|.:||:||||::|.:.:|:::||.:||:|
  Rat  1498 EEIWKVADQVGLKSVIEQFPGQLNFTLVDGGYVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKIILLDEPSANLD 1562

  Fly  1287 PQTDGLIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLHTIIDSDKVMVMDAGRVVEFGSPYELMTKSDSKVFHNL 1351
            |.|..:|:..:|..|..|||:...||:..::|..:.:|::.|.|.::.|...|:  |:..||...
  Rat  1563 PITYQVIRRVLRQAFAGCTVVLCEHRIEAMLDCQRFLVIEQGNVWQYESLQALL--SEKSVFQRA 1625

  Fly  1352 VNQS-------GRASYE-----GLLKIAQETFE 1372
            ::.|       ||.|.:     .:..:.:||.|
  Rat  1626 LSSSEKMKLFHGRHSSKQKPRTQITAVKEETEE 1658

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)03659NP_610482.3 PLN03130 83..1369 CDD:215595 413/1509 (27%)
CftrXP_006236159.2 None

Return to query results.
Submit another query.