DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP1A3 and atp1a3b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001243143.1 Gene:ATP1A3 / 478 HGNCID:801 Length:1026 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_571760.2 Gene:atp1a3b / 64611 ZFINID:ZDB-GENE-001212-8 Length:1023 Species:Danio rerio


Alignment Length:1026 Identity:942/1026 - (91%)
Similarity:985/1026 - (96%) Gaps:3/1026 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGSGGSDSYRIATSQDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQG 65
            ||.|.|||||:||:|| ||:|.||||.||  .:|||||||||.:|||||||||||||:.||.|||
Zfish     1 MGYGRSDSYRVATTQD-KDEKGSPKKKKG--AKDLDDLKKEVPLTEHKMSVEEVCRKFQTDIVQG 62

Human    66 LTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSG 130
            ||::||::.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||:|
Zfish    63 LTNAKARDFLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYAIQAATEDDPAG 127

Human   131 DNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVE 195
            |||||||||:|||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||
Zfish   128 DNLYLGIVLSAVVIITGCFSYFQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVAGDLVE 192

Human   196 IKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGV 260
            :|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Zfish   193 VKGGDRIPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRNIAFFSTNCVEGTARGV 257

Human   261 VVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVI 325
            ||.|||||||||||||.||||.||||||.||||||.:|||||||||||||||::|||||||||||
Zfish   258 VVCTGDRTVMGRIATLTSGLETGKTPIAKEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILAVILGYTWLEAVI 322

Human   326 FLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   323 FLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMT 387

Human   391 VAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDAS 455
            |||.|||||||||||||||||.||||||.|||||:.:|.||||||||.|||::|:||||||||||
Zfish   388 VAHKWFDNQIHEADTTEDQSGASFDKSSVTWVALARVAALCNRAVFKAGQDSLPILKRDVAGDAS 452

Human   456 ESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDR 520
            ||||||||||||||||.|||:||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Zfish   453 ESALLKCIELSSGSVKAMREKNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDNNDNRYLLVMKGAPERILDR 517

Human   521 CSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDN 585
            ||||:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||..:||:|:|||||||.|||||.|||
Zfish   518 CSTIMLQGKEQPMDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHVLMPEDQYPKGFAFDTDDVNFQTDN 582

Human   586 LCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   583 LCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR 647

Human   651 LNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIV 715
            |||||||||||||||||||||||||::.|||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   648 LNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDYSQEQIDEVLRNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIV 712

Human   716 AVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA 780
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   713 AVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGISGSDVSKQAADTILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA 777

Human   781 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRTD 845
            |||||||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Zfish   778 YTLTSNIPEITPFLLFIIVNIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPMRD 842

Human   846 KLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLEDSYGQQWT 910
            |||||||||:|||||||||||||||:||||||||||||..|||||||||||.:||||||||||||
Zfish   843 KLVNERLISIAYGQIGMIQALGGFFAYFVILAENGFLPSLLVGIRLNWDDRAMNDLEDSYGQQWT 907

Human   911 YEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP 975
            |||||:||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   908 YEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADVIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP 972

Human   976 GMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY 1026
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||
Zfish   973 GMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEVRKLLLRRNPGGWVEKETYY 1023

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP1A3NP_001243143.1 ATPase-IIC_X-K 30..1026 CDD:273445 919/995 (92%)
atp1a3bNP_571760.2 ATPase-IIC_X-K 25..1023 CDD:273445 922/999 (92%)

Return to query results.
Submit another query.