DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP1A3 and eat-6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001243143.1 Gene:ATP1A3 / 478 HGNCID:801 Length:1026 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_506269.1 Gene:eat-6 / 179796 WormBaseID:WBGene00001137 Length:996 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1008 Identity:734/1008 - (72%)
Similarity:846/1008 - (83%) Gaps:20/1008 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    25 KKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTT 89
            ||:|   :::|.|||:||.|.||.:.:||:..:..|:...|||..||||:||::|||||:||.||
 Worm     3 KKDK---KQELHDLKQEVKMDEHIVPIEELVARLGTNLETGLTRQKAQEVLAKNGPNALSPPETT 64

Human    90 PEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQE 154
            |||:|||:.|||||::|||:|||||::||.:...|.:.||.|||||||||..||:|||.|.||||
 Worm    65 PEWIKFCKNLFGGFAMLLWVGAILCYIAYSVDYFTMEYPSKDNLYLGIVLMTVVVITGVFQYYQE 129

Human   155 AKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNS 219
            :||||||:|||||||..|||.|:|:|.||..||:||||:||:|||||||||||::||.|.|||||
 Worm   130 SKSSKIMDSFKNMVPTFALVHRDGQKQQVKTEELVVGDIVEVKGGDRVPADLRVVSAFGFKVDNS 194

Human   220 SLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGK 284
            |||||||||:||||||::||||||||.|||||.|||||:|:|:.|||.|||||||.|||||:.|.
 Worm   195 SLTGESEPQSRSPDCTNENPLETRNIAFFSTNAVEGTAKGIVIYTGDNTVMGRIAHLASGLDTGM 259

Human   285 TPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTL 349
            ||||.||||||.||||||||||:||||::.||||.||.||:||||||||||||||:|||||||||
 Worm   260 TPIAREIEHFIHLITGVAVFLGISFFIIAFILGYHWLTAVVFLIGIIVANVPEGLIATVTVCLTL 324

Human   350 TAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQ----- 409
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|..|||.||||.|     
 Worm   325 TAKRMASKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWYDETIHECDTTETQTSQEK 389

Human   410 -SGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLM 473
             :|.||:       ||..||.|||||.||.||.:.|:|:||..|||||.||||..||:.|:|..:
 Worm   390 RTGASFE-------ALVRIASLCNRAEFKAGQQDTPILRRDCTGDASEIALLKFTELTQGNVIAV 447

Human   474 RERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMK 538
            ||:|||:||||||||||||:|||:    |.:.||||||||||||||.||||.|.|||..|.::::
 Worm   448 REKNKKIAEIPFNSTNKYQVSIHD----NGDHYLLVMKGAPERILDVCSTIFLNGKESELTDKLR 508

Human   539 EAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVP 603
            |.|..|||||||:||||||||.:.||.::|||||.||.::|||...||.||||||||||||||||
 Worm   509 EDFNTAYLELGGMGERVLGFCDFVLPADKFPKGFKFDVEEVNFPLKNLRFVGLMSMIDPPRAAVP 573

Human   604 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVI 668
            |||.|||||||||:|||||||||||||||.|||||:|.|||||||.|..|||.:||||:|||.||
 Worm   574 DAVAKCRSAGIKVVMVTGDHPITAKAIAKSVGIISDGTETVEDIAIRRGIPVEEVNPREAKAAVI 638

Human   669 HGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADI 733
            ||:||::.:.:|:.||::.|:|||||||||||||:||||.|:||.||||||||||||||||||||
 Worm   639 HGSDLREMSEDQLAEIIKYHSEIVFARTSPQQKLMIVEGFQKQGQIVAVTGDGVNDSPALKKADI 703

Human   734 GVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIM 798
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||.:|:
 Worm   704 GVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVVGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEISPFLTYIL 768

Human   799 ANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMI 863
            ..|||||||:||||||||||||||||||||.|||||||||||:|..||||||||||:||||||||
 Worm   769 FGIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEEAESDIMKRQPRDPIRDKLVNERLISLAYGQIGMI 833

Human   864 QALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVS 928
            ||..|||:||.|:|:|||:|.:|..:|..||.|..|::.|||||:|||..||::|:||.||:|||
 Worm   834 QASAGFFTYFWIMADNGFMPWDLYQLRAQWDSRAYNNVLDSYGQEWTYANRKILEYTCQTAYFVS 898

Human   929 IVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFC 993
            |||||||||||.||||||:.||||.|..|.|||..|||||.|:.||||:|..||||.|:.|||||
 Worm   899 IVVVQWADLIISKTRRNSLVQQGMSNWTLNFGLVFETALAWFMCYCPGLDNGLRMYGLRFSWWFC 963

Human   994 AFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY 1026
            |.|:|.|||||||||:.::||.||||||:||||
 Worm   964 ALPFSILIFVYDEIRRFLIRRYPGGWVERETYY 996

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP1A3NP_001243143.1 ATPase-IIC_X-K 30..1026 CDD:273445 729/1001 (73%)
eat-6NP_506269.1 P-type_ATPase_Na-K_like 40..993 CDD:319794 715/963 (74%)
HAD <574..657 CDD:432733 60/82 (73%)

Return to query results.
Submit another query.