DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP1A3 and atp1a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001243143.1 Gene:ATP1A3 / 478 HGNCID:801 Length:1026 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001120366.1 Gene:atp1a3 / 100145440 XenbaseID:XB-GENE-996131 Length:1025 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1026 Identity:952/1026 - (92%)
Similarity:993/1026 - (96%) Gaps:1/1026 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGSGGSDSYRIATSQDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQG 65
            ||.|.|||||:||:||.||| :||||.||.:::::|||||||||||||::|||||||.|||||||
 Frog     1 MGYGRSDSYRVATTQDNKDD-ESPKKGKGVQKKEIDDLKKEVAMTEHKITVEEVCRKLNTDCVQG 64

Human    66 LTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSG 130
            ||.|||.||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||.||||.|..|::|||
 Frog    65 LTLSKAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFFAYGILASMEEEPSG 129

Human   131 DNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVE 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
 Frog   130 DNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQLNAEEVVVGDLVE 194

Human   196 IKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGV 260
            :||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||:
 Frog   195 VKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGI 259

Human   261 VVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVI 325
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||:||:||||||||||||||
 Frog   260 VVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAKEIEHFIHLITGVAVFLGVTFFVLSLILGYTWLEAVI 324

Human   326 FLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   325 FLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMT 389

Human   391 VAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDAS 455
            |||||||||||||||||||||.||||||.||:.|:.||.||||||||.|.|||||||||||||||
 Frog   390 VAHMWFDNQIHEADTTEDQSGASFDKSSPTWLGLARIAALCNRAVFKAGNDNIPVLKRDVAGDAS 454

Human   456 ESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDR 520
            |||||||||||.||||.|||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
 Frog   455 ESALLKCIELSCGSVKAMREKSKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDV 519

Human   521 CSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDN 585
            |||||:||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.:|:||:|:|
 Frog   520 CSTILIQGKEQPLDDELKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYFPEELHPKGFAFDTEDLNFSTEN 584

Human   586 LCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   585 LCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR 649

Human   651 LNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIV 715
            |||||||||||||||||||||||||.::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   650 LNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDMSTEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIV 714

Human   716 AVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   715 AVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA 779

Human   781 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRTD 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   780 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRTD 844

Human   846 KLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLEDSYGQQWT 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|:||||.||||:|||||||||||||
 Frog   845 KLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPSHLIGIRLTWDDRSVNDLEDSYGQQWT 909

Human   911 YEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP 975
            |||||:||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   910 YEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADVIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP 974

Human   976 GMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY 1026
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||
 Frog   975 GMDIALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRHPGGWVEKESYY 1025

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP1A3NP_001243143.1 ATPase-IIC_X-K 30..1026 CDD:273445 929/995 (93%)
atp1a3NP_001120366.1 ATPase-IIC_X-K 30..1025 CDD:273445 929/994 (93%)

Return to query results.
Submit another query.