DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NF1 and nf1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001035957.1 Gene:NF1 / 4763 HGNCID:7765 Length:2839 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002936865.2 Gene:nf1 / 100493879 XenbaseID:XB-GENE-488024 Length:2785 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2842 Identity:2562/2842 - (90%)
Similarity:2672/2842 - (94%) Gaps:60/2842 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAHRPVEWVQAVVSRFDEQLPIKTGQQNTHTKVSTEHNKECLINISKYKFSLVISGLTTILKNV 65
            ||||:|||||||||:|||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
 Frog     1 MAAHKPVEWVQAVVNRFDEQLPIKASQQNTHTKVSMEHNKECLINISKYKFSLVISGLTNILKNV 65

Human    66 NNMRIFGEAAEKNLYLSQLIILDTLEKCLAGQPKDTMRLDETMLVKQLLPEICHFLHTCREGNQH 130
            |:|||.||.:|||||||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||:||.|||||:
 Frog    66 NHMRISGETSEKNLYLSQLIILDTLDKCLAGQPKDSMRLDETMLVKQLLPEICHFIHTYREGNQY 130

Human   131 AAELRNSASGVLFSLSCNNFNAVFSRISTRLQELTVCSEDNVDVHDIELLQYINVDCAKLKRLLK 195
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:|:|||||||:||||||:
 Frog   131 AAELRMSASGVLFSLSCNNFNAVFSRISTRLQELTVCSEDNADVHDIDLIQYINVDCSKLKRLLQ 195

Human   196 ETAFKFKALKKVAQLAVINSLEKAFWNWVENYPDEFTKLYQIPQTDMAECAEKLFDLVDGFAEST 260
            ||.||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:||||||||||.||||.
 Frog   196 ETVFKFKSLKKVAQLAVINSLEKAFWNWVENYPDEFTKLYQRPQTDMADCAEKLFDLVDSFAESN 260

Human   261 KRKAAVWPLQIILLILCPEIIQDISKDVVDENNMNKKLFLDSLRKALAGHGGSRQLTESAAIACV 325
            ||||||||||||||:||||||||||||||:|:.|||||||::||||||||||::.|||:||||.|
 Frog   261 KRKAAVWPLQIILLVLCPEIIQDISKDVVEESKMNKKLFLENLRKALAGHGGTKSLTETAAIASV 325

Human   326 KLCKASTYINWEDNSVIFLLVQSMVVDLKNLLFNPSKPFSRG--SQPADVDLMIDCLVSCFRISP 388
            ||||||||||||||||||.||||:|:||||||||||||||||  ||.||:|||||||||||||:|
 Frog   326 KLCKASTYINWEDNSVIFHLVQSLVIDLKNLLFNPSKPFSRGAVSQNADLDLMIDCLVSCFRINP 390

Human   389 HNNQHFKICLAQNSPSTFHYVLVNSLHRIITNSALDWWPKIDAVYCHSVELRNMFGETLHKAVQG 453
            |||||||.||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||:||.|||...:| 
 Frog   391 HNNQHFKTCLAQSSPTTFHYVLVNSLHRIITNSALDWWPKIDAVYCYSGELRSMFSETLKLVMQ- 454

Human   454 CGAHPAIRMAPSLTFKEKVTSLKFKEKPTDLETRSYKYLLLSMVKLIHADPKLLLCNPRKQGPET 518
               ..|.|:.||||||||:..||||::..|.||:||||||||:|||||.||||||.||.|...:|
 Frog   455 ---QTASRLTPSLTFKEKMPYLKFKDRLADPETKSYKYLLLSVVKLIHGDPKLLLYNPGKAVSDT 516

Human   519 QGSTAELITGLVQLVPQSHMPEIAQEAMEALLVLHQLDSIDLWNPDAPVETFWEISSQMLFYICK 583
            |.||||||.|||||||||:|||||||||||||||||.|||:||||:||:|||||||||||:.||.
 Frog   517 QSSTAELINGLVQLVPQSNMPEIAQEAMEALLVLHQSDSIELWNPEAPIETFWEISSQMLYSICT 581

Human   584 KLTSHQMLSSTEILKWLREILICRNKFLLKNKQADRSSCHFLLFYGVGCDIPSSGNTSQMSMDHE 648
            |||.||:|:|||||||||||||||||||||.|                                 
 Frog   582 KLTGHQLLNSTEILKWLREILICRNKFLLKYK--------------------------------- 613

Human   649 ELLRTPGASLRKGKGNSSMDSAAGCSGTPPICRQAQTKLEVALYMFLWNPDTEAVLVAMSCFRHL 713
                               :|||..||. |||||||||||||||||||:||||||||||||||.|
 Frog   614 -------------------ESAAAGSGI-PICRQAQTKLEVALYMFLWSPDTEAVLVAMSCFRSL 658

Human   714 CEEADIRCGVDEVSVHNLLPNYNTFMEFASVSNMMSTGRAALQKRVMALLRRIEHPTAGNTEAWE 778
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   659 CEEADIRCGVDEVSVHNFLPNYNTFMEFASVSNMVSTGRAALQKRVMALLRRIEHPTAGNTEAWE 723

Human   779 DTHAKWEQATKLILNYPKAKMEDGQAAESLHKTIVKRRMSHVSGGGSIDLSDTDSLQEWINMTGF 843
            ||||||:.||:|||||||.|:|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
 Frog   724 DTHAKWDHATRLILNYPKTKLEDGQAPESLHKTIVKRRMSHVSGGGSIDLSDTDCLQEWINMTGF 788

Human   844 LCALGGVCLQQRSNSGLATYSPPMGPVSERKGSMISVMSSEGNADTPVSKFMDRLLSLMVCNHEK 908
            |.||||||||.|.|:||.|||||||||:|||||:||::|:||||:||||||:|||||||||||||
 Frog   789 LSALGGVCLQHRGNAGLVTYSPPMGPVNERKGSVISMVSTEGNAETPVSKFLDRLLSLMVCNHEK 853

Human   909 VGLQIRTNVKDLVGLELSPALYPMLFNKLKNTISKFFDSQGQVLLTDTNTQFVEQTIAIMKNLLD 973
            ||:|||.|:|||||||||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||.|:|||||
 Frog   854 VGIQIRNNIKDLVGLELSPALYPMLFNKMKNNISKFFDSQGQVLLTDTNTQFVEQTITILKNLLD 918

Human   974 NHTEGSSEHLGQASIETMMLNLVRYVRVLGNMVHAIQIKTKLCQLVEVMMARRDDLSFCQEMKFR 1038
            ||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||||||.||||||||||||||
 Frog   919 NHTEGSSEHLGQASLETMMLNLVRYVRVLGNLVHAIQIKTKLCQLVEVMMERRDDLSFCQEMKFR 983

Human  1039 NKMVEYLTDWVMGTSNQAADDDVKCLTRDLDQASMEAVVSLLAGLPLQPEEGDGVELMEAKSQLF 1103
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   984 NKMVEYLTDWVMGTSNQAADEDVKCLTRDLDQASMEAVVSLLAGLPLQPEEGDGVELMEAKSQLF 1048

Human  1104 LKYFTLFMNLLNDCSEVEDESAQTGGRKRGMSRRLASLRHCTVLAMSNLLNANVDSGLMHSIGLG 1168
            ||||||||||||||||.||:..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1049 LKYFTLFMNLLNDCSEAEDDGTQTGGRKRGMSRRLASLRHCTVLAMSNLLNANVDSGLMHSIGLG 1113

Human  1169 YHKDLQTRATFMEVLTKILQQGTEFDTLAETVLADRFERLVELVTMMGDQGELPIAMALANVVPC 1233
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1114 YHKDLQTRATFMEVLTKILQQGTEFDTLAETVLADRFERLVELVTMMGDQGELPIAMALANVVPC 1178

Human  1234 SQWDELARVLVTLFDSRHLLYQLLWNMFSKEVELADSMQTLFRGNSLASKIMTFCFKVYGATYLQ 1298
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1179 SQWDELARVLVTLFDSRHLLYQLLWNMFSKEVELADSMQTLFRGNSLASKIMTFCFKVYGATYLQ 1243

Human  1299 KLLDPLLRIVITSSDWQHVSFEVDPTRLEPSESLEENQRNLLQMTEKFFHAIISSSSEFPPQLRS 1363
            |||:||||..|||.:||:||||||.||||.:|.||||||.|||||||||||||:|::|||.||||
 Frog  1244 KLLEPLLRTFITSPEWQYVSFEVDSTRLEGNELLEENQRRLLQMTEKFFHAIINSTNEFPTQLRS 1308

Human  1364 VCHCLYQATCHSLLNKATVKEKKENKKSVVSQRFPQNSIGAVGSAMFLRFINPAIVSPYEAGILD 1428
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1309 VCHCLYQATCHSLLSKATVKEKKENKKSVVSQRFPQNSIGAVGSAMFLRFINPAIVSPYEAGILD 1373

Human  1429 KKPPPRIERGLKLMSKILQSIANHVLFTKEEHMRPFNDFVKSNFDAARRFFLDIASDCPTSDAVN 1493
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.|||::||.||.||
 Frog  1374 KKPPPRLERGLKLMSKILQSIANHVLFTKEEHMRPFNEFVKSNFDAARRFFFDIANNCPPSDTVN 1438

Human  1494 HSLSFISDGNVLALHRLLWNNQEKIGQYLSSNRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVADTH 1558
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1439 HSLSFITDGNVLALHRLLWNNQEKIGQYLSSNRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVADTH 1503

Human  1559 WSSLNLTSSKFEEFMTRHQVHEKEEFKALKTLSIFYQAGTSKAGNPIFYYVARRFKTGQINGDLL 1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||:|||:||||||||||||||
 Frog  1504 WSSLNLTSSKFEEFMTRHQVHEKEEFKALKTLNIFYQAGTSRAGNPVFYYIARRFKTGQINGDLL 1568

Human  1624 IYHVLLTLKPYYAKPYEIVVDLTHTGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVSAVYIYNCNSWVRE 1688
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||
 Frog  1569 IYHVLLTLKPYYAKPYEIVVDLTHAGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYENVTAVYIYNCNSWVRE 1633

Human  1689 YTKYHERLLTGLKGSKRLVFIDCPGKLAEHIEHEQQKLPAATLALEEDLKVFHNALKLAHKDTKV 1753
            ||||||||||||||||||:|||..|||.|:||||||||||||||||||||:||||||||||||||
 Frog  1634 YTKYHERLLTGLKGSKRLIFIDPSGKLTEYIEHEQQKLPAATLALEEDLKLFHNALKLAHKDTKV 1698

Human  1754 SIKVGSTAVQVTSAERTKVLGQSVFLNDIYYASEIEEICLVDENQFTLTIANQGTPLTFMHQECE 1818
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1699 SIKVGSTAVQVTSAERTRVLGQSVFLNDIYYASEIEEICLVDENQFTLTIANQGTPLTFMHQECE 1763

Human  1819 AIVQSIIHIRTRWELSQPDSIPQHTKIRPKDVPGTLLNIALLNLGSSDPSLRSAAYNLLCALTCT 1883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1764 AIVQSIIHIRTRWELSQPDSIPQHTKIRPKDVPGTLLNIALLNLGSSDPSLRSAAYNLLCALTCT 1828

Human  1884 FNLKIEGQLLETSGLCIPANNTLFIVSISKTLAANEPHLTLEFLEECISGFSKSSIELKHLCLEY 1948
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1829 FNLKIEGQLLETSGLCIPANNTLFIVSISKTLAANEPHLTLEFLEECISGFSKSSIELKHLCLEY 1893

Human  1949 MTPWLSNLVRFCKHNDDAKRQRVTAILDKLITMTINEKQMYPSIQAKIWGSLGQITDLLDVVLDS 2013
            |||||.|||||||..||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1894 MTPWLLNLVRFCKLTDDAKRQRVSAILDKLITMTINEKQMYPSIQAKIWGSLGQITDLLDVVLDS 1958

Human  2014 FIKTSATGGLGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGRMCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDI 2078
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1959 FIKTSATGGLGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGRMCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDI 2023

Human  2079 AILARYMLMLSFNNSLDVAAHLPYLFHVVTFLVATGPLSLRASTHGLVINIIHSLCTCSQLHFSE 2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||:|||
 Frog  2024 AILARYMLMLSFNNSLDVAAHLPYLFHVVTLLVATGPLSLRASTHGLVINIIHSLCTCSQLNFSE 2088

Human  2144 ETKQVLRLSLTEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVIAFRSSYRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEA 2208
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2089 ETKQVLRLSLTEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVIAFRSSYRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEA 2153

Human  2209 LLEIMEACMRDIPTCKWLDQWTELAQRFAFQYNPSLQPRALVVFGCISKRVSHGQIKQIIRILSK 2273
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2154 LLEIMEACMRDIPTCKWLDQWTELAQKFAFQYNPSLQPRALVVFGCISKRVSHGQIKQIIRILSK 2218

Human  2274 ALESCLKGPDTYNSQVLIEATVIALTKLQPLLNKDSPLHKALFWVAVAVLQLDEVNLYSAGTALL 2338
            .|||||||||.||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||
 Frog  2219 GLESCLKGPDNYNSQVLIEATVIALTKLQPLLNKDSPMHKALFWVAMAVLQLDEVNLYSAGTALL 2283

Human  2339 EQNLHTLDSLRIFNDKSPEEVFMAIRNPL-EWHCKQMDHFVGLNFNSNFNFALVGHLLKGYRHPS 2402
            |||||||||||:|||||||||||.||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2284 EQNLHTLDSLRVFNDKSPEEVFMEIRNPLEEWHCKQMDHFVGLNFNSNFNFALVGHLLKGYRHPS 2348

Human  2403 PAIVARTVRILHTLLTLVNKHRNCDKFEVNTQSVAYLAALLTVSEEVRSRCSLKHRKSLLLTDIS 2467
            |..||||:|||||||.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:|
 Frog  2349 PTTVARTIRILHTLLALVNKHRNCDKFEVNTESVAYLAALLTVSEEVRSRCSLKHRKSLLLTDVS 2413

Human  2468 MENVPMDTYPIHHGDPSYRTLKETQPWSSPKGSEGYLAATYPTVGQTSPRARKSMSLDMGQPSQA 2532
            ||||||||||:||.||:.|||||.||||||:.|..:|||:||||||.|||.||||||||||||||
 Frog  2414 MENVPMDTYPVHHNDPTCRTLKENQPWSSPQASGMHLAASYPTVGQVSPRTRKSMSLDMGQPSQA 2478

Human  2533 NTKKLLGTRKSFDHLISDTKAPKRQEMESGITTPPKMRRVAETDYEMETQRISSSQQHPHLRKVS 2597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:::|.||||.||||||||||
 Frog  2479 NTKKLLGTRKSFDHLISDTKAPKRQEMESGITTPPKMRRVAEHDYDIDTPRISSPQQHPHLRKVS 2543

Human  2598 VSESNVLLDEEVLTDPKIQALLLTVLATLVKYTTDEFDQRILYEYLAEASVVFPKVFPVVHNLLD 2662
            ||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2544 VSESTVLLDEEVLTDPKTQALLLTVLATLVKYTTDEFDQRILYEYLAEASVVFPKVFPVVHNLLD 2608

Human  2663 SKINTLLSLCQDPNLLNPIHGIVQSVVYHEESPPQYQTSYLQSFGFNGLWRFAGPFSKQTQIPDY 2727
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2609 SKISTLLSLCQDPNLLNPIHGIVQSVVYHEESPPQYQPSYLQSFGFNGLWRFAGPFSKQTQIPDY 2673

Human  2728 AELIVKFLDALIDTYLPGIDEETSEESLLTPTSPYPPALQSQLSITANLNLSNSMTSLATSQHSP 2792
            |||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2674 AELIVKFLDALIDKYLPVIDEEASEESLLTPTSPYPPAVQSQLSITANLNLSNSMTSLATSQHSP 2738

Human  2793 GIDKENVELSPTTGHCNSGRTRHGSASQVQKQRSAGSFKRNSIKKIV 2839
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||:||||||
 Frog  2739 GIDKENVELSPTTGHSNSSRTRHGSASQVQKQRSAGSFKRHSIKKIV 2785

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NF1NP_001035957.1 RasGAP_Neurofibromin 1198..1551 CDD:213332 328/352 (93%)
Lipid binding 1580..1837 242/256 (95%)
CRAL_TRIO_2 1602..1736 CDD:463965 123/133 (92%)
PH_NF1 1728..1837 CDD:270123 106/108 (98%)
Bipartite nuclear localization signal 2555..2571 15/15 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2787..2839 48/51 (94%)
nf1XP_002936865.2 RasGAP_Neurofibromin 1143..1496 CDD:213332 328/352 (93%)
CRAL_TRIO_2 1547..1681 CDD:463965 123/133 (92%)
PH_NF1 1673..1782 CDD:270123 106/108 (98%)

Return to query results.
Submit another query.