DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Gpo1 and Gpd2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611063.1 Gene:Gpo1 / 47611 FlyBaseID:FBgn0022160 Length:724 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036868.1 Gene:Gpd2 / 25062 RGDID:2726 Length:727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:687 Identity:438/687 - (63%)
Similarity:544/687 - (79%) Gaps:19/687 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    46 RTLPPRADQIKSLMSGEEFDVLIIGGGATGAGCALDSVTRGLKTALVELDDFASGTSSRSTKLIH 110
            |..|.|..|:.:|.:..|||:|:|||||||.|||||:|||||||||||.:|||||||||||||||
  Rat    52 REPPSREAQLMTLQNTSEFDILVIGGGATGCGCALDAVTRGLKTALVERNDFASGTSSRSTKLIH 116

  Fly   111 GGVRYLQKAILGLDLEQYRMVKEALAERATMLESAPHLTHPLPIMLPVYTWWQVPYYWVGIKAYD 175
            ||||||||||..||:||||||||||.|||.:||.||||:.|||||||:|.|||:||||||||.||
  Rat   117 GGVRYLQKAITNLDVEQYRMVKEALHERANLLEIAPHLSAPLPIMLPLYKWWQLPYYWVGIKMYD 181

  Fly   176 LVAGDRNVKSSYYLSKKDALELFPMLKKDKLCGAIVYYDGQQDDARMCLAVALTAARHGATVCNH 240
            ||||...:||||.|||..|||.||||:||||.|||||||||.:||||.||:||||||:||...|:
  Rat   182 LVAGSHCLKSSYVLSKSRALEHFPMLQKDKLVGAIVYYDGQHNDARMNLAIALTAARYGAATANY 246

  Fly   241 VEVKELLKK-DDGTGKQVLCGAKVKDHISGKEFTVKAKCIVNAAGPFTDSIRKMDNPTVKSICCP 304
            :||..|||| |..|||:.:.||:.||.::|.||.|:|||::||.||||||:||||:..|..||.|
  Rat   247 MEVVSLLKKTDPETGKERVSGARCKDVLTGHEFNVRAKCVINATGPFTDSVRKMDDNDVVPICQP 311

  Fly   305 SSGVHIVLPGYYSPDQMGLLDPSTSDGRVIFFLPWQRQTIAGTTDLPCEITHNPTPTEDEIQFIL 369
            |:|||||:||||||:.||||||:||||||||||||::.|||||||.|.::||:|.|:||:|.|||
  Rat   312 SAGVHIVMPGYYSPENMGLLDPATSDGRVIFFLPWEKMTIAGTTDSPTDVTHHPIPSEDDINFIL 376

  Fly   370 NEIKNYLNADVEVRRGDVLSAWSGIRPLVSDPNKDDTQSLARNHIVHVSPSNLITIAGGKWTTYR 434
            ||::|||:.||||||||||:|||||||||:||...:|||::|||:|.||.|.|||||||||||||
  Rat   377 NEVRNYLSCDVEVRRGDVLAAWSGIRPLVTDPKSANTQSISRNHVVEVSDSGLITIAGGKWTTYR 441

  Fly   435 AMAEHTIDAAIKACNLK--PERAEAVTSYLKIEGGQGWTPTMYIRLVQDFGLECEVAQHLAKSYG 497
            :|||.|::.|:|..||.  |.|    |..|.::||:.|:||:|||||||:|||.||||||||:||
  Rat   442 SMAEDTVNKAVKLHNLNAGPSR----TVGLFLQGGKDWSPTLYIRLVQDYGLESEVAQHLAKTYG 502

  Fly   498 DRAFAVSKMASLTGKRWPIIGNRIHPEFPYIDAEIRYGVREYACTAVDMIARRLRLAFLNVQAAQ 562
            |:||.|:||||:||||||::|.|:..|||||:||::||::||||||||||:||.||||||||||:
  Rat   503 DKAFDVAKMASVTGKRWPVVGVRLVSEFPYIEAEVKYGIKEYACTAVDMISRRTRLAFLNVQAAE 567

  Fly   563 EALPVIVDIMGEELGWSKDEKERQIKHATEFLANEMGHSVNRTSK--ERIPIKLSKEEIQTYIKR 625
            ||||.||::||.||.||:..|:.:::.||.||..|||:. :||.:  :...|.|...:|..|.||
  Rat   568 EALPKIVELMGRELNWSELRKQEELETATRFL
YYEMGYK-SRTEQLTDSTEISLLPPDIDRYKKR 631

  Fly   626 FQLIDKDKKGYVSINDIRRALKSFGDGDVSGEQLHEILREIDTNMNGQVELDEYLQMMSAIKTGD 690
            |.:.|:|:||:::|.|::|.|:|. :..:..:.|||||.|:|.|.||||||.|:||:|||:.||.
  Rat   632 FHMFDEDEKGFITIVDVQRVLESI-NVQMDEDTLHEILCEVDLNKNGQVELHEFLQLMSAVHTGR 695

  Fly   691 VAYSRFARMAELEEQKHEAANLKQ---ISVDRSGGGL 724
            |:.||.|.:.:..|:     ||.:   |.||||.|||
  Rat   696 VSGSRLAILMKTAEE-----NLDRRVPIPVDRSCGGL 727

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Gpo1NP_611063.1 DAO 9..594 CDD:477422 378/550 (69%)
EFh 624..684 CDD:238008 29/59 (49%)
Gpd2NP_036868.1 DAO 1..599 CDD:477422 378/550 (69%)
EFh 627..689 CDD:238008 30/62 (48%)

Return to query results.
Submit another query.