DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NEK1 and Nek1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001186326.1 Gene:NEK1 / 4750 HGNCID:7744 Length:1286 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038950287.1 Gene:Nek1 / 290705 RGDID:1309375 Length:1261 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1319 Identity:1015/1319 - (76%)
Similarity:1098/1319 - (83%) Gaps:91/1319 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQ 65
            ||||||||||||||||||:|||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAVLVKSTEDGRHYVIKEINISRMSDKEREESRREVAVLANMKHPNIVQ 65

Human    66 YRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIK 130
            |:||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 YKESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGTLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIK 130

Human   131 SQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYE 195

Human   196 LCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAK 260
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LCTLKHAFEAGNMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLLSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAK 260

Human   261 RIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYG 325
            |||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||...|.:||||||||:||||:|:.|||||
  Rat   261 RIEKFLSPQLIAEEFCLKTVSKFGPQPIPGKRPASGQGVSSFVPAQKITKPSAKYGVPITYKKYG 325

Human   326 DKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQM 390
            ||||.||||..|||||||.|.|::|:||||:|:|||||:|||||||||||||||| |..:||||:
  Rat   326 DKKLLEKKPPPKHKQAHQIPVKKMNSGEERKKMSEEAAKKRRLEFIEKEKKQKDQ-IRFLKAEQL 389

Human   391 KRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHYHAIFDQMQQ 455
            |||||:|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||.::||..|.||||||||||||||||
  Rat   390 KRQEKQRLERINRAREQGWRNVLRAGGSGEVKASFFGSGGAVSPSPCSPRGQYEHYHAIFDQMQQ 454

Human   456 QRAEDNEAKWKREIYGRGLPERGILPGVRPGFPYGAAGHHHFPDADDIRKTLKRLKAVSKQANAN 520
            .|||||||:||..||||.|||                                            
  Rat   455 LRAEDNEARWKGRIYGRWLPE-------------------------------------------- 475

Human   521 RQKGQLAVERAKQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHMGILQNLAAMYGGRPSSSRGGKPRNKEEEVY 585
            ||||.|.||||||||||||||:||||||||||||:|||||||::|||||||||||||||||||||
  Rat   476 RQKGHLGVERAKQVEEFLQRKQEAMQNKARAEGHVGILQNLASLYGGRPSSSRGGKPRNKEEEVY 540

Human   586 LARLRQIRLQNFNERQQIKAKLRGEKKEANHSEGQEGSEEADMRRKKIESLKAHANARAAVLKEQ 650
            |||||||||||||||||||||||||.|||..::||:.:||||||.||:|||||.|||||||||||
  Rat   541 LARLRQIRLQNFNERQQIKAKLRGENKEAGGTKGQDATEEADMRLKKMESLKAQANARAAVLKEQ 605

Human   651 LERKRKEAYEREKKVWEEHLVAKGVKSSDVSPPLGQHETGGSPSKQQMRSVISVTSALKEVGVDS 715
            |||||||||||||||||||||.: ||||||.|.:..||.|||||:|||:.||||||||||||:|.
  Rat   606 LERKRKEAYEREKKVWEEHLVVR-VKSSDVPPSMEHHEAGGSPSQQQMKPVISVTSALKEVGLDG 669

Human   716 SLTDTRETSEEMQKTNNAISSKREILRRLNENLKAQEDEKGKQNLSDTFEINVHEDAKEHEKEKS 780
            |||:::||||||:|:|||||||||||||||||||||||||.|.:.:|:.|...|.|.:|:|||.:
  Rat   670 SLTESQETSEEMEKSNNAISSKREILRRLNENLKAQEDEKEKHHHADSCETVGHRDEREYEKENA 734

Human   781 VSSDRKKWEAGGQLVIPLDELTLDTSFSTTE---------------------------------R 812
            :||||||||.||||||||||:|||.|||.:|                                 .
  Rat   735 ISSDRKKWEMGGQLVIPLDEVTLDASFSASESVYEYVNVMTWLISHINSDPGHPKEPTCGWLERE 799

Human   813 HTVGEVIKLGPNGSPRRAWGKSPTDSVLKILGEAELQLQTELLENTTIRSEISPEGEKYKPLITG 877
            |||||||||..:||||:.||||||||||||||||||||||||||||..:||:..|.|.||||:||
  Rat   800 HTVGEVIKLDSSGSPRKVWGKSPTDSVLKILGEAELQLQTELLENTPFKSEVCVEEENYKPLLTG 864

Human   878 EKKVQCISHEINPSAIVDSPVETKSPEFSEASPQMSLKLEGNLEEPDDLETEILQEPSGTNKDES 942
            |:.:||||.|:||||.||:  ||.||:|::.||.||   |||:|||||||||:|||||....|.|
  Rat   865 EENLQCISKEVNPSATVDT--ETNSPKFAKVSPAMS---EGNVEEPDDLETEVLQEPSAIPSDGS 924

Human   943 LPCTITDVWISEEKETKETQSADRITIQENEVSEDGVSSTVDQLSDIHIEPGTNDSQHSKCDVDK 1007
            ||..:.:||    ...|.|...|.|.:|:|:|.|:.:..||||....||||..|||..|.||.:|
  Rat   925 LPPVVNEVW----TRAKATGLEDSIAVQQNDVCEERIPGTVDQSCKDHIEPAGNDSPQSGCDEEK 985

Human  1008 SVQPEPFFHKVVHSEHLNLVPQVQSVQCSPEESFAFRSHSHLPPKNKNKNSLLIGLSTGLFDANN 1072
            |||||.||.|||||:.|||   |||...||||:...||||..|||.|:|||||||||||||||||
  Rat   986 SVQPELFFQKVVHSKDLNL---VQSAHRSPEEAIPIRSHSDSPPKAKSKNSLLIGLSTGLFDANN 1047

Human  1073 PKMLRTCSLPDLSKLFRTLMDVPTVGDVRQDNLEIDEIEDENIKEGPSDSEDIVFEETDTDLQEL 1137
            ||||||||||||||||||||||||||||.||:|||:|:|||:|||||||.|||||||||||||||
  Rat  1048 PKMLRTCSLPDLSKLFRTLMDVPTVGDVHQDSLEIEELEDEHIKEGPSDCEDIVFEETDTDLQEL 1112

Human  1138 QASMEQLLREQPGEEYSEEEESVLKNSDVEPTANGTDVADEDDNPSSESALNEEWHSDNSDGEIA 1202
            |||||||||||||:|||||||||||:|:||..|.||||.||:|||||||||||||||||||.|..
  Rat  1113 QASMEQLLREQPGDEYSEEEESVLKSSNVERAARGTDVPDEEDNPSSESALNEEWHSDNSDAETT 1177

Human  1203 SECECDSVFNHLEELRLHLEQEMGFEKFFEVYEKIKAIHEDEDENIEICSKIVQNILGNEHQHLY 1267
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.|.||:||||.||||||
  Rat  1178 SECEYDSVFNHLEELRLHLEQEMGFEKFFEVYEKVKAIHEDEDENIEISSTIVENILGTEHQHLY 1242

Human  1268 AKILHLVMADGAYQEDNDE 1286
            |||||||||||||||||||
  Rat  1243 AKILHLVMADGAYQEDNDE 1261

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NEK1NP_001186326.1 STKc_Nek1 3..258 CDD:270858 247/254 (97%)
Nek1XP_038950287.1 STKc_Nek1 3..258 CDD:270858 247/254 (97%)

Return to query results.
Submit another query.