Protein Alignment ATM and atm-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_000042.3
• Gene: ATM / 472
• HGNCID: 795
• Length: 3056
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001293214.1
• Gene: atm-1 / 3565793
• WormBaseID: WBGene00000227
• Length: 2378
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 3062
• Identity: 599/3062 - (19%)
• Similarity: 1063/3062 - (34%)
• Gaps: 999/3062 - (32%)

Human   276 KEVIIELFQLQIYIHHPKGAKTQEKGAYESTKWRSILYNLYDLLVNEISHIGSRGKYSSGFRNIA 340
            |:::.|:    :.::|..||:...:...|       :|:||||              |:...|:|
 Worm    27 KKIVDEV----VLLYHALGAEALSEDNQE-------IYDLYDL--------------SARIFNLA 66

Human   341 VKENLIELMADICHQVFNEDTRSLEISQSYTTTQRESSDYSVPCKRKKIELGWEVIKDHLQKSQN 405
            .||      .:..:|.|.::.:.        .|:|.......|.        :|:...||::...
 Worm    67 KKE------IEEANQQFEKERKK--------GTRRSEKPVPTPL--------FELSIQHLKRCCQ 109

Human   406 ---DFDLVPWLQIATQLISKYP-----ASLPNCELSPLLMILSQLLPQQRHGERTPYVLRCLTEV 462
               |.:.|||:....:|: ::|     .|:.| |:|.:|::.|
 Worm   110 QGIDHNQVPWIAYCLKLL-EFPITITEKSIEN-EISNVLLLSS---------------------- 150

Human   463 ALCQDKRSNLESSQKSDLLKLWNKIWCITFRGISSEQIQAENFGLLG------------------ 509
                 ..|.|..::.:.|..||..||         .:::..:.|.|.
 Worm   151 -----NASQLHWAEHAHLSSLWKWIW---------SRVETADIGALAMRNYMELAANLLENVDYV 201

Human   510 ----------AIIQGSL---VEV--DREFW-----------------------------KLF--T 528
                      |.:.|:|   ||:  .:|:|                             ::|  |
 Worm   202 VFEKSPIDLMAKVMGTLKKSVEMGNPKEYWCHYRKFSVVHILSYIVHRWGLEARDFILREIFELT 266

Human   529 GSACRPSCPA--------VCCLTL--------------------ALTTSIVPGTVKMGIEQNMCE 565
            ||.......|        .|.:.|                    .:|...:...||.||::::..
 Worm   267 GSLSNLISVAHKDGEQSKKCIMRLIDDLVKLAMIETVHGHRTMNEVTRGNIQKLVKTGIQESLKS 331

Human   566 VNRSFSLKES----------IMKWLLFYQLEGDLENSTEVPPILHSNFPHLVLEKILVSLTMKNC 620
            .:|:||...:          :.:|||       .|...|.|
 Worm   332 AHRNFSRSSTFSISEECVRYLTRWLL-------AERRLEQP------------------------ 365

Human   621 KAAMN-FFQSVPECEHHQKDKEELSFSEVEELFLQTTFDKMDFLTIVRECGIEKHQSSIGFSVHQ 684
            .|||| .|:...:..  .|.|::.:|..:.:|...:|..             .||:.:....|.|
 Worm   366 SAAMNESFELTGDSS--SKKKDDATFDSLIDLSFGSTIS-------------GKHKLNAWNGVMQ 415

Human   685 NLKESLD--RCLLGLSEQLL-------NNYSSEITNSETLVRCSRLLVGVLGCYCYMG-----VI 735
            .|.|.|.  |..|.::|:::       .:|::|...:   |.||.|...|.......|     .|
 Worm   416 ILNELLKSRRLELQVTEKIVTILWEKRKSYTTEPLRT---VFCSILSTVVCQADVRFGHRKVPTI 477

Human   736 AEEEAYKSELFQKAKSLMQCAG--ESITLFKNKTNEEFRIGSLRNMMQLCTRCLSNCTKKSPNKI 798
            .....|...|.....||...|.  |:|..|:..:.|     .|||            |..:.::.
 Worm   478 DSILKYSLSLMPNVASLPSAAALTETIVRFRTVSRE-----GLRN------------TWDTVSRT 525

Human   799 ASGFF--LRLLTSKLMNDIADICKSLASFIKKPFDRGEVESMEDDTNGNLMEVEDQSSMNLFNDY 861
            :||.|  :||:::.:         |:..|               |.|......|...|.:...|.
 Worm   526 SSGSFEVVRLISALI---------SVTEF---------------DENSRFANDERVRSWSFRKDI 566

Human   862 PDSSVSDANEPGESQSTIGAI---NP--LAEEYLSKQDLLFLDMLKFLCLCVTTAQTNTVSFRAA 921
            .:..:.|.|  ..|...:..:   :|  ..|...|..|...|..||...|..:.|..:.
 Worm   567 IEWVLLDPN--AHSHKLLYQLCQYHPTYCYESEASSSDDSLLQTLKLCKLACSPAPPSA------ 623

Human   922 DIRRKLLMLIDSSTLEPTKSLHLHMYLMLLKE--LPG----EEYPLPMEDVLELLKPLSNVCSLY 980
               .|.|..:::|..|..:.:|..:..:|..|  ||.    .|:.|...|
 Worm   624 ---PKALRPLEASIEEIVRYVHDKLKSILATEITLPAFVLCHEFALKYPD--------------- 670

Human   981 RRDQDVCKTILNHVLHVVKNLGQSNMDSENTRDAQGQFLTVIGAFWHLTK-ERKYIFSVRMALVN 1044
             |..:..|        :.|.|.|...|.|     :.:||.   :..|.:| .:.....::...:|
 Worm   671 -RSYEFNK--------MYKKLYQIMEDQE-----EDEFLQ---SARHFSKWPQNLTLPIQKQTIN 718

Human  1045 CLKTLLEAD------PYSKWAILNVMGKDFPVNEVFTQFLADNHHQVRMLAAESINRLFQDTKGD 1103
            |:....||:      ...:|:         ...:|..:.||:       |||         |:.:
 Worm   719 CMAVFFEANLDNQLVDLCQWS---------DRRKVLVEMLAE-------LAA---------TRSE 758

Human  1104 -SSRLLKALPLK--LQQTAFENAYLKAQEGMREMSHSAENPETLDEIYNRKSVLLTLIAVVLSCS 1165
             ..:|.|::|..  :::...||     :..:.||:...|....|..|.|   :::|.:.:....:
 Worm   759 IRDKLQKSMPFNKFVKECIMEN-----RGDLYEMTKRFEKYSFLLSIRN---LIVTRMIITNEAA 815

Human  1166 P--------------ICEKQALFALCKSVKEN------GLEPHLVKKVLEKVSETFGYRRLEDFM 1210
            .              |.||:.|....::|.|.      .|:|:.|...:..|
 Worm   816 RLLGDGETISETDIFIIEKRTLSTCIRNVSEGKELSGYTLDPYTVAANVHNV------------- 867

Human  1211 ASHLDYLVLE-WLNLQDTEYNLSSFPFILLNYTNIEDFYRSCYKVLIPHLVIRSHFDEVKSIANQ 1274
              |.|::.:| :|.|      |...||...|              ::.||:
 Worm   868 --HFDHINVEIYLEL------LKKSPFFAQN--------------IVRHLL-------------- 896

Human  1275 IQEDWKSLLTDCFPKILVNILPYFAYEGTRDSGMAQQRET----ATKVYDMLKSENLLGKQIDHL 1335
                                         |.:|...:.||    ||.:..::|.|.||.     :
 Worm   897 -----------------------------RQNGKEAEEETWHLHATVLKIVMKDEKLLA-----V 927

Human  1336 FISNLPEIVVEL-LMTLHEPANSSASQSTDLCDFSGDLDPAPN-------PPHFPSHVIKATFAY 1392
            .::.:|.:|..| :..:|....|:|::...|     |::...:       |....:.:..|.|..
 Worm   928 CVATIPNMVRYLKVYQIHFSPKSNAAKFLHL-----DMESISHCQSYLRKPTKSSNLITAANFLT 987

Human  1393 ISNCHK-TKLKSIL---EILSKSPDSYQKILLAICEQAAETNNVYKKHRILKIYHLFVSLLLKDI 1453
            :..|.| |..:.||   .|..:.|....:.||...|:..|
 Worm   988 LFGCEKRTWKRPILRFWSIFKQQPAMCCEKLLIFAEECVE------------------------- 1027

Human  1454 KSGLGGAWAFVLRDVIYTLIHYINQRPSCIMDVSLRSFSLCCDLLSQVCQTAVTYCKDALENHLH 1518
               ||                 :|.|.:|:    ||:.:     .|:.|:.|:  |.:.|:....
 Worm  1028 ---LG-----------------LNHRIACL----LRALT-----TSEFCRKAL--CDEYLKIAFQ 1061

Human  1519 VIVGTLIPLVYEQVEVQKQVLDL-----LKYLVIDNK---------------DNENLYITIKLLD 1563
            :...::. |:..:.|.:.::::|     |:|.::.::               :.:..:...|.|.
 Worm  1062 LTYRSIF-LILSKNECRPEIVELCDDMNLRYDLLQHQIKHVAAHHLEHFERFETKIAFSVEKFLK 1125

Human  1564 PFPDHVVFKDLRITQQKIKYSRGPFSLLEEINHFLSVSVYDALPLTRLEGLKDLRRQLELHKDQM 1628
            ...|.:.|:||           |.....:::|..|:               :|..|..|.....:
 Worm  1126 SGIDGIDFEDL-----------GLVEFYKQLNENLT---------------EDAIRSNEARNIYI 1164

Human  1629 VDI-----MRASQDNPQDGIMVKLVVNLLQLSKMAIN-------HTGEKEVLEAVGSCLGEVGPI 1681
            |||     ::.....||   ::.::.....:|....|       .|.||..|
 Worm  1165 VDILSTIWLQLPSIRPQ---ILPILARFKHISPAWTNFPQPPHISTNEKSFL------------- 1213

Human  1682 DFSTIAIQHSKDASYTKALKLFEDKELQWTFIMLTYLNNTLVEDCVKVRSAAVTCLKNILATKTG 1746
                   ||.:...|.|.:.:.:.                      ..:....||:..:|.:...
 Worm  1214 -------QHLRFHLYLKMMNISKS----------------------MTQGEYATCIMMLLTSYDS 1249

Human  1747 HSFWEIYKMTTDPMLAYLQPFRTSRKKFLEVPRFDKENPFEGLDDINLWIPLSENHDIWIKTLTC 1811
            ..|  :..:.....|..|: .:..|.....:.|..|:....|.:|..:..|      |..|.:|.
 Worm  1250 SHF--VADLIEKKQLGKLK-LQQRRNVLCILSRLLKDQAVMGDEDETIIDP------ILFKAITK 1305

Human  1812 A---FLDSGGTKCEILQLLKPMCEVKTDFCQTVLPYLIHDILLQDTNESWRNLLSTHVQGFFTSC 1873
            |   |.|:..  |.:..|.|...:.|..:.:.|:                 |||         .|
 Worm  1306 ASAVFEDTAA--CIVPFLFKICVDFKGKYDKCVI-----------------NLL---------GC 1342

Human  1874 LRHFSQTSRSTTPANLDSESEHFFRC---CLDKKSQRTMLAVVDYMRRQKRPSSGTIFNDAFWLD 1935
            |:            .:::|.|...||   |:|...   :..:..|.|......|.......|.|.
 Worm  1343 LK------------GVNAEDEIVVRCLAECVDSIG---LNVIARYERLNIETHSEFGVKWFFKLS 1392

Human  1936 LNYLEVAKVAQSCAAHFTALLYAEIYADKKSMDDQEKRSLAFEEGSQSTTISSLSEKSKEETGIS 2000
            ..:|:......|.|  ...:|:..:.|.|::....::.||...:.||                 .
 Worm  1393 RLFLKHGFTTHSFA--IANILFDRLSARKRNTMMIDRTSLDRIDRSQ-----------------E 1438

Human  2001 LQDLLLEIYRSIGEPDSLYGCGGGKMLQPITRLRTYEHEAMWGKALVTYDLETAIPSSTRQAGII 2065
            |.:||:|||.:.|...:|                                  :::|.:.:....:
 Worm  1439 LINLLVEIYVAEGNSVAL----------------------------------SSLPPAVQNRPDV 1469

Human  2066 QALQNLGLCHILSVYLKGLDYENKDWCPELEELHYQAAWR--NMQWDHCTSVSKEVEGTSYHESL 2128
            :.:.|               ..:|:|. :|...:...:|.  .:|| .|......:.|..|..|:
 Worm  1470 RQVMN---------------KSSKEWL-KLLSSNQMDSWELTIVQW-MCGIQFNAITGDKYLNSI 1517

Human  2129 ----YNALQSLRDREFSTFYESLKYARVK--EVEEMCKRSLESVYSLYPTLSRLQAIGELESIGE 2187
                :|......|......|..|.:....  |:||..     |...|.||:.:::.:
 Worm  1518 LRCNFNEYTKKIDSPLKFVYFQLFHLSTSTLEIEEAI-----SSMPLAPTIDQMRLM-------- 1569

Human  2188 LFSRSVTHRQLSEVYIKWQKHSQLLKDSDFSFQEPIMALRTVILEILMEKEMDNSQRE--CIKDI 2250
                                   ::.::..|| ||......|:..:...:|..|.::.  .:|.|
 Worm  1570 -----------------------IIANATASF-EPQSVEEHVVRAVRELRETSNRRKSGGNVKGI 1610

Human  2251 LTKHLVELSILARTFKNTQLPERAIFQIKQYNSVSCGVSEWQLEEAQVFWAK-KEQSLALSILKQ 2314
            ..|          |.:..:|.| .:.:.|.|::....:..|:.|..|  |.. ..:|:.:.:::
 Worm  1611 NEK----------TTRMVKLAE-MLTENKAYDAAINLLDTWEHECLQ--WTSVAAESIDIDLIR- 1661

Human  2315 MIKKLDASCAANNP-----SLKLTYTECLRVCGNWLAE--TCLENPAVIMQTYLEKAVEVA--GN 2370
             |.|...:|.:.:|     :|:..:.....:....:||  ..|....:..:..:|:.:.:.  |.
 Worm  1662 -ICKQHVTCRSGDPRMADINLRTMHPRVPVMSDLAIAEWSLALSKITIEYRNDMEEGIRILEFGC 1725

Human  2371 YDGESSDELRNGKMKAFLSLARFSDTQYQRIENYMKSSEFENKQALLKRAKEEV------GLLRE 2429
            ...::.|.:.. ::|..|.|......|..::|.|.::..:..||..:...::::      .|.|.
 Worm  1726 KHLQNKDSVET-RLKVLLKLHSVCIGQLSKLEEYRETRTYRMKQQAVTAFEQQIQNSCRTSLARG 1789

Human  2430 HKIQ--TNRYTVKVQRELELDELALRALKEDRKRFLCKAVENYINCLL--SGEEHDMWVFRLCSL 2490
            :...  |.:...:|::|.:.::..|..:.........|||.:..:.||  |..|.|....|..||
 Worm  1790 NSGDEWTKKTVQRVRKEHQFEKNDLEKVDNSLNSAARKAVSSGFDALLCISQLEDDDEAIRASSL 1854

Human  2491 ---------WLENSGVSEVNGMMKRDGMKIPTYKFLPLMYQLAARMGTKMMGGLGFHEVLNNLIS 2546
                     :...:.|..:..:.:....|:|:..::.....:|::..:.....:..|  |:.::.
 Worm  1855 IIFPLIDVIYKYETDVGVIALLKEHTKSKLPSKLWISATSHIASKCFSIEKSQITRH--LSQILC 1917

Human  2547 RISMDHPHHTLFIILAL---ANANRDE-FLTKPEVARRSRITKNVPKQSSQLDEDRTEAANRIIC 2607
            .:..|:|:|.|..||..   .||::.: ||.....||..:      :.||:|.|        |:.
 Worm  1918 HLIYDYPYHVLHTILMYDDEKNASKVKGFLKTIFDARADQ------RDSSKLKE--------IVI 1968

Human  2608 TIRSRRPQMVRSVEALCDAYIILANLDAT-QWKTQRKGIN------IPADQPITKLKNLEDVVVP 2665
            |||...           .||..:|.||.. ..:.||..||      .|.|..|.|.| |..:.:|
 Worm  1969 TIREAH-----------QAYREIAMLDVRGNVRIQRVEINGKTMYRWPHDLKIFKCK-LRQLPIP 2021

Human  2666 TMEIKVDHTGEYG--NLVTIQSFKAEFRLAGGVNLPKIIDCVGSDGKERRQLVKGRDDLRQDAVM 2728
            |:..|:...|:|.  :|:|.:.:|..|.:|.|::.|||.:..|||||..:.:.| :||:|||.::
 Worm  2022 TISQKIGCPGDYSTTDLITWKRWKDVFTIADGISTPKIWEIEGSDGKWYKTVWK-KDDVRQDVLV 2085

Human  2729 QQVFQMCNTLLQRNTETRKRKLTICTYKVVPLSQRSGVLEWCTGTVPIGEFL--VNNEDGAHKRY 2791
            :|:|.:.|.:|:        |..:.||.||||....||:|:|.|||.:.|.:  |..|.|.|:.:
 Worm  2086 EQMFDVTNNMLE--------KAMLRTYNVVPLDTECGVIEFCGGTVSLKEVMCGVTREGGLHREF 2142

Human  2792 RPNDFSAFQCQKKMMEVQKKSFEEKYEVFMDVCQNFQPVFRYFCMEKFLDPAIWFEKRLAYTRSV 2856
            ...:.||.:....|.:||.:|.|.:.:||:::||.:.||||:|....|....||.:|.:.|.:|:
 Worm  2143 NSEEVSASKVSSMMRQVQTESTETRRQVFVEICQQYSPVFRHFFYTNFSTAQIWRQKIINYRQSL 2207

Human  2857 ATSSIVGYILGLGDRHVQNILINEQSAELVHIDLGVAFEQGK-ILPTPETVPFRLTRDIVDGMGI 2920
            ||.|||.||:||||||..|||.:::....||||||:..|..| .||.||.||||:|||::|.:.|
 Worm  2208 ATWSIVCYIVGLGDRHASNILFDQKLCTFVHIDLGMILEYSKRTLPVPEQVPFRITRDVLDPILI 2272

Human  2921 TGVE-GVFRRCCEKTMEVMRNSQETLLTIVEVLLYDPLFDWTMNPLKALYLQQRPEDETELHPTL 2984
            .|:| |.....|.:.||.::.:.:.:|.:...||
 Worm  2273 EGIENGQLAEECTQIMEKLKENGKVILGVASALL------------------------------- 2306

Human  2985 NADDQECKRNLSDIDQSFNK---VAERVLMRLQEKLKGVEEG-TVLSVGGQVNLLIQQAIDPKNL 3045
                :|...|..:.:|:..:   ::|..:.||:|||:|.::| |..|...|:..|:::|....||
 Worm  2307 ----RETMTNFREAEQAAGRPSYISEMAIGRLREKLRGTDDGVTAQSSNLQIRRLLREATSADNL 2367

Human  3046 SRLFPGW 3052
            ||:|.||
 Worm  2368 SRMFCGW 2374

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ATM	NP_000042.3	TAN	8..165	CDD:463317
		Interaction with ABL1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:9168117	1373..1382		1/15 (7%)
		FAT	2097..2489	CDD:396714	72/421 (17%)
		PIKKc_ATM	2683..2962	CDD:270715	109/282 (39%)
		G-loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269	2692..2698		2/5 (40%)
		Catalytic loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269	2867..2875		6/7 (86%)
		Activation loop. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00269	2887..2911		15/24 (63%)
		FATC	3026..3055	CDD:460514	11/27 (41%)
		Microbody targeting signal, atypical. /evidence=ECO:0000269|PubMed:26344566	3046..3048		1/1 (100%)
atm-1	NP_001293214.1	PIKKc_ATM	2041..2313	CDD:270715	110/315 (35%)
		FATC	2353..2378	CDD:460514	10/22 (45%)