Protein Alignment comt and Nsf2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524877.1
• Gene: comt / 47091
• FlyBaseID: FBgn0000346
• Length: 745
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_788676.1
• Gene: Nsf2 / 41694
• FlyBaseID: FBgn0266464
• Length: 752
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 742
• Identity: 627/742 - (84%)
• Similarity: 687/742 - (92%)
• Gaps: 3/742 - (0%)

  Fly     2 AYILKATKCPTDELSLTNRAIVNVGDFPEEIKYADISPAPGQHFIFALEKT--VEVPSGYVGFSL 64
            |:.::|.|||||||||||:|||||.||.||:||.||||.||.|:||||||.  .|:|.|:|||||
  Fly     6 AHRMRAIKCPTDELSLTNKAIVNVSDFTEEVKYVDISPGPGLHYIFALEKISGPELPLGHVGFSL 70

  Fly    65 VQRKWAMVSINQELEVRPYRFDASSDVITCVSFETDFLQKKTVSQEPYDSDQMAKEFIMQFAGMA 129
            ||||||.:|||||::|||||||||:|:||.||||||||||||.:|||||||:|||||:||||||.
  Fly    71 VQRKWATLSINQEIDVRPYRFDASADIITLVSFETDFLQKKTTTQEPYDSDEMAKEFLMQFAGMP 135

  Fly   130 LTVGQSLVFNFKDKKLLGLAVKSLEAIDPKSLGEGKDTAMRNVRFGRILGNTVVQFEKAENSSLN 194
            |||||:|||.|||||.||||||:|||:||:::|:..... ||||||||||||||||||||||.||
  Fly   136 LTVGQTLVFQFKDKKFLGLAVKTLEAVDPRTVGDSLPKT-RNVRFGRILGNTVVQFEKAENSVLN 199

  Fly   195 LQGKSKGKVVRQSIINPDWDFGKMGIGGLDKEFNSIFRRAFASRVFPPELVEQLGCKHVKGILLY 259
            |||:||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||||
  Fly   200 LQGRSKGKIVRQSIINPDWDFGKMGIGGLDKEFNAIFRRAFASRVFPPELVEQLGIKHVKGILLY 264

  Fly   260 GPPGTGKTLMARQIGTMLNAREPKIVNGPQILDKYVGESEANVRRLFAEAEEEEKRLGPNSGLHI 324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Fly   265 GPPGTGKTLMARQIGTMLNAREPKIVNGPQILDKYVGESEANIRRLFAEAEEEEKRLGPNSGLHI 329

  Fly   325 IIFDEIDAICKQRGSVAGNSGVHDTVVNQLLTKIDGVDQLNNILVIGMTNRRDMIDEALLRPGRL 389
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Fly   330 IIFDEIDAICKARGSVAGNSGVHDTVVNQLLAKIDGVEQLNNILVIGMTNRRDMIDEALLRPGRL 394

  Fly   390 EVQMEISLPNEQGRVQILNIHTKRMREFNKINDDVDNKEIAALTKNFSGAELEGLVRAAQSSAMN 454
            ||||||||||||||||||||||||||:||||..||||.||||.||||||||||||||||||:|||
  Fly   395 EVQMEISLPNEQGRVQILNIHTKRMRDFNKIASDVDNNEIAAKTKNFSGAELEGLVRAAQSTAMN 459

  Fly   455 RLIKADAKVTVDPEAMEKLKVNRDDFLHSLEHDIKPAFGTAQEILDNMLARGVINWGAPVSNLLE 519
            ||||||:||.|||||||||:|.|.||||:|::|||||||.|||:|:|:||||:||||.||:.|||
  Fly   460 RLIKADSKVHVDPEAMEKLRVTRADFLHALDNDIKPAFGAAQEMLENLLARGIINWGPPVTELLE 524

  Fly   520 DGMLYVQQAKAPESSGLVSVLVAGAPNSGKTALAAQLAKMSDFPFVKVCSPEDMVGYTESAKCLH 584
            ||||.||||||.|||||||||:.|||||||:||||.||::||||||||||||||||:||||||||
  Fly   525 DGMLSVQQAKATESSGLVSVLIEGAPNSGKSALAANLAQLSDFPFVKVCSPEDMVGFTESAKCLH 589

  Fly   585 IRKIFDDAYRSMLSCIVVDNVERLLDYGSIGPRYSNMTLQALLVLLKKQPPKGRKLLILCTSSRR 649
            |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   590 IRKIFDDAYRSTLSCIVVDNVERLLDYGPIGPRYSNLTLQALLVLLKKQPPKGRKLLILCTSSRR 654

  Fly   650 EVLEEMEMLTAFTSVLHVPNLSKPDHVLAVLENTDIFSKGEIQAIGKKMAGKRVFIGIKKLLGLI 714
            :||||||||:||||||||.|||.|::|||||:::|:||..|:|:|.:||||||:.|||||||.||
  Fly   655 DVLEEMEMLSAFTSVLHVSNLSTPENVLAVLDDSDLFSPEELQSIARKMAGKRLCIGIKKLLALI 719

  Fly   715 DMARQTEQSQRAIKFLSKMEEEGGLDM 741
            ||.||:|..||.|||||||||||||:|
  Fly   720 DMIRQSEPHQRVIKFLSKMEEEGGLEM 746

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
comt	NP_524877.1	CDC48_N	5..83	CDD:215012	57/79 (72%)
		CDC48_2	111..>158	CDD:215011	38/46 (83%)
		RecA-like_NSF-SEC18_r1-like	219..395	CDD:410912	169/175 (97%)
		CDC48	<220..>606	CDD:273521	347/385 (90%)
		SpoVK	<526..702	CDD:440232	148/175 (85%)
Nsf2	NP_788676.1	CDC48_N	9..89	CDD:215012	57/79 (72%)
		CDC48_2	117..>170	CDD:215011	41/52 (79%)
		RecA-like_NSF-SEC18_r1-like	224..400	CDD:410912	169/175 (97%)
		CDC48	<225..>611	CDD:273521	347/385 (90%)