DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NAGLU and Naglu

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_024306539.1 Gene:NAGLU / 4669 HGNCID:7632 Length:762 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001413972.1 Gene:Naglu / 360630 RGDID:1564228 Length:739 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:756 Identity:602/756 - (79%)
Similarity:669/756 - (88%) Gaps:21/756 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEAVAVAAAVGVLLLAGAGGAAGDEAREAAAVRALVARLLGPGPAADFSVSVERALAAKPGLDTY 65
            |.|..:||.:|.|||  |....||||:||.|||.||.|||||||||||.||||||||.:.|||||
  Rat     1 MGAAGLAAILGFLLL--ARDLVGDEAQEAEAVRELVVRLLGPGPAADFLVSVERALANESGLDTY 63

Human    66 SLGGGGAARVRVRGSTGVAAAAGLHRYLRDFCGCHVAWSGSQLRLPRPLPAVPGELTEATPNRAS 130
            ||.|||...|.||||:|||||||||||||||||||:|||.|||.||.||||||..||||||||  
  Rat    64 SLSGGGGVPVLVRGSSGVAAAAGLHRYLRDFCGCHIAWSSSQLHLPSPLPAVPDGLTEATPNR-- 126

Human   131 AGPPEKRKEDAYRAVLLYRYYQNVCTQSYSFVWWDWARWEREIDWMALNGINLALAWSGQEAIWQ 195
                             |||||||||.|||||||||||||:||||||||||||||||:|||||||
  Rat   127 -----------------YRYYQNVCTHSYSFVWWDWARWEQEIDWMALNGINLALAWNGQEAIWQ 174

Human   196 RVYLALGLTQAEINEFFTGPAFLAWGRMGNLHTWDGPLPPSWHIKQLYLQHRVLDQMRSFGMTPV 260
            ||||||||||:||:.:|||||||||||||||||||||||.|||:||||||||:||:|||||||||
  Rat   175 RVYLALGLTQSEIDNYFTGPAFLAWGRMGNLHTWDGPLPRSWHLKQLYLQHRILDRMRSFGMTPV 239

Human   261 LPAFAGHVPEAVTRVFPQVNVTKMGSWGHFNCSYSCSFLLAPEDPIFPIIGSLFLRELIKEFGTD 325
            |||||||||:|:|||||||||.::|:||||||||||||||||.||:||:||:||||||.||||||
  Rat   240 LPAFAGHVPKAITRVFPQVNVIQLGNWGHFNCSYSCSFLLAPGDPLFPLIGTLFLRELTKEFGTD 304

Human   326 HIYGADTFNEMQPPSSEPSYLAAATTAVYEAMTAVDTEAVWLLQGWLFQHQPQFWGPAQIRAVLG 390
            ||||||||||||||.|:||||||||.||||||..||.:|||||||||||||||||||:||:|||.
  Rat   305 HIYGADTFNEMQPPFSDPSYLAAATAAVYEAMVTVDPDAVWLLQGWLFQHQPQFWGPSQIKAVLE 369

Human   391 AVPRGRLLVLDLFAESQPVYTRTASFQGQPFIWCMLHNFGGNHGLFGALEAVNGGPEAARLFPNS 455
            |||||||||||||||:||||:|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||:||||||||
  Rat   370 AVPRGRLLVLDLFAETQPVYSRTASFHGQPFIWCMLHNFGGNHGLFGALEDVNQGPQAARLFPNS 434

Human   456 TMVGTGMAPEGISQNEVVYSLMAELGWRKDPVPDLAAWVTSFAARRYGVSHPDAGAAWRLLLRSV 520
            ||||||:|||||.||||||:|||||||||||||||.|||:|||:||||||.|||.||||||||||
  Rat   435 TMVGTGIAPEGIGQNEVVYALMAELGWRKDPVPDLVAWVSSFASRRYGVSQPDAVAAWRLLLRSV 499

Human   521 YNCSGEACRGHNRSPLVRRPSLQMNTSIWYNRSDVFEAWRLLLTSAPSLATSPAFRYDLLDLTRQ 585
            ||||||||.||||||||:||||||:|::|||||||||||||||.:||:|..||||||||||:|||
  Rat   500 YNCSGEACSGHNRSPLVKRPSLQMSTAVWYNRSDVFEAWRLLLRAAPNLTASPAFRYDLLDVTRQ 564

Human   586 AVQELVSLYYEEARSAYLSKELASLLRAGGVLAYELLPALDEVLASDSRFLLGSWLEQARAAAVS 650
            |||||||..|||||:|:|:::|..||||||:|.|:|||:|||:|||:|.||||:||:|||..|||
  Rat   565 AVQELVSSCYEEARTAFLNQDLDLLLRAGGLLTYKLLPSLDELLASNSHFLLGTWLDQAREVAVS 629

Human   651 EAEADFYEQNSRYQLTLWGPEGNILDYANKQLAGLVANYYTPRWRLFLEALVDSVAQGIPFQQHQ 715
            |:||.|||||||||:||||||||||||||||||||||:||.|||.|||..|..|:|:||||||||
  Rat   630 ESEAQFYEQNSRYQITLWGPEGNILDYANKQLAGLVADYYQPRWCLFLGTLAHSLARGIPFQQHQ 694

Human   716 FDKNVFQLEQAFVLSKQRYPSQPRGDTVDLAKKIFLKYYPR 756
            |:|:||.|||||:.:|:|||.||:||||||:||||||::|:
  Rat   695 FEKSVFPLEQAFINNKKRYPIQPQGDTVDLSKKIFLKFHPQ 735

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NAGLUXP_024306539.1 NAGLU_N 42..115 CDD:463762 58/72 (81%)
NAGLU 149..484 CDD:461545 293/334 (88%)
NAGLU_C 493..747 CDD:463763 197/253 (78%)
NagluNP_001413972.1 None

Return to query results.
Submit another query.