DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYO7B and Myo7b

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016859658.1 Gene:MYO7B / 4648 HGNCID:7607 Length:2164 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001178870.1 Gene:Myo7b / 498834 RGDID:1561153 Length:2152 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2182 Identity:1701/2182 - (77%)
Similarity:1887/2182 - (86%) Gaps:86/2182 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSGFRLGDHVWLEPPSTHKTGVAIGGIIKEAKPGKVLVEDDEGKEHWIRAEDFGVLSPMHPNSVQ 65
            ||.|||||||||:|||::|||||||||:||.|.||.|:||||||||||.|||...|.||||||.|
  Rat     1 MSVFRLGDHVWLDPPSSNKTGVAIGGIVKETKLGKTLIEDDEGKEHWISAEDLSTLRPMHPNSAQ 65

Human    66 GVDDMIRLGDLNEAGMVHNLLIRYQQHKIYTYTGSILVAVNPFQVLPLYTLEQVQLYYSRHMGEL 130
            |||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||
  Rat    66 GVDDMIRLGDLNEAGVVHNLLIRYQQHKIYTYTGSILVAVNPFQMLPLYTLEQVQIYYSRHMGEL 130

Human   131 PPHVFAIANNCYFSMKRNKRDQCCIISGESGAGKTETTKLILQFLATISGQHSWIEQQVLEANPI 195
            |||||||||:|||:||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   131 PPHVFAIANSCYFNMKKNKRDQCCIISGESGAGKTETTKLILQFLATVSGQHSWIEQQVLEANPI 195

Human   196 LEAFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDIYFNPSGVIEGARIEQFLLEKSRVCRQAPEERNYHIFYCMLM 260
            ||||||||||||||||||||||||:||.|||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   196 LEAFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDIHFNSSGVIEGASIEHFLLEKSRVCRQAAEERNYHIFYCMLM 260

Human   261 GVSAEDKQLLSLGTPSEYHYLTMGNCTSCEGLNDAKDYAHIRSAMKILQFSDSESWDVIKLLAAI 325
            |:|.|:|.:|.||.||||||||||||||.|||:|||||||:|||||||||||||:||:.||||||
  Rat   261 GMSLEEKNMLGLGMPSEYHYLTMGNCTSYEGLSDAKDYAHVRSAMKILQFSDSENWDISKLLAAI 325

Human   326 LHLGNVGFMASVFENLDASDVMETPAFPTVMKLLEVQHQELRDCLIKHTILIRGEFVTRSLNIAQ 390
            ||||||||||:||||||:||||||||||..|||||||||.||||||||||.|.||||:|.|||||
  Rat   326 LHLGNVGFMAAVFENLDSSDVMETPAFPFAMKLLEVQHQALRDCLIKHTIPILGEFVSRPLNIAQ 390

Human   391 AADRRDAFVKGIYGHLFLWIVKKINAAIFTPPAQDPKNVRRAIGLLDIFGFENFENNSFEQLCIN 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|||||||||||||||||:||||||||||
  Rat   391 AADRRDAFVKGIYGHLFLWIVKKINAAIFTPQAQDPQNVRRAIGLLDIFGFENFQNNSFEQLCIN 455

Human   456 FANEHLQQFFVQHVFTMEQEEYRSENISWDYIHYTDNRPTLDLLALKPMSIISLLDEESRFPQGT 520
            |||||||||||:||||||||||.||||:|:|||||||:|.||:||||||||||||||||||||||
  Rat   456 FANEHLQQFFVKHVFTMEQEEYLSENITWNYIHYTDNQPILDMLALKPMSIISLLDEESRFPQGT 520

Human   521 DLTMLQKLNSVHANNKAFLQPKNIHDARFGIAHFAGEVYYQAEGFLEKNRDVLSTDILTLVYSSK 585
            |:||||||||:|||||:||:||:|||.|||||||||:|||||||||||||||||||||.|::|||
  Rat   521 DVTMLQKLNSIHANNKSFLRPKSIHDTRFGIAHFAGDVYYQAEGFLEKNRDVLSTDILILIHSSK 585

Human   586 NKFLREIFNLELAETKLGHGTIRQ--AKAGNHLFKSADSNKRPSTLGSQFKQSLDQLMKILTNCQ 648
            ||||:|||||:|.:||||||||.|  .|.|..:||.:||.||..||.|||||||:||||||||||
  Rat   586 NKFLKEIFNLDLPQTKLGHGTICQVKTKTGGQIFKPSDSTKRSVTLSSQFKQSLEQLMKILTNCQ 650

Human   649 PYFIRCIKPNEYKKPLLFDRELCLRQLRYSGMMETVHIRKSGFPIRYTFEEFSQRFGVLLPNAMR 713
            |||:|||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||:||||||.||||:..|
  Rat   651 PYFVRCIKPNEYKKPLLFDRELCIQQLRYSGMMETVHIRKSGFPIRYTFDEFSQRFRVLLPSPER 715

Human   714 MQLQGKLRQMTLGITDVWLRTDKDWKAGKTKIFLRDHQDTLLEVQRSQVLDRAALSIQKVLRGYR 778
            :|.|.|.||||..|.|:.|.|||:||.|||||||:|||||:||:||||.||.||:.||:||||::
  Rat   716 VQFQNKHRQMTSRIADLCLGTDKEWKMGKTKIFLKDHQDTMLEIQRSQALDGAAIRIQRVLRGHK 780

Human   779 YRKEFLRQRRAAVTLQAWWRGYCNRRNFKLILVGFERLQAIARSQPLARQYQAMRQRTVQLQALC 843
            ||||||||:||||||||.|||:..|:||||||:|||||||||||..|.||:|.|||:.|||||.|
  Rat   781 YRKEFLRQKRAAVTLQAVWRGHNQRKNFKLILMGFERLQAIARSHLLMRQFQTMRQKIVQLQARC 845

Human   844 RGYLVRQQVQAKRRAVVVIQAHARGMAARRNFQQRKANGMQAPLVIPAEGQKSQGALPAKKRRSI 908
            |||||||||||||||||:||||||||.||:::.|:|::|   |.||.|:..|.||....:||:||
  Rat   846 RGYLVRQQVQAKRRAVVIIQAHARGMVARKSYWQQKSSG---PPVILAKEPKGQGVALDRKRKSI 907

Human   909 YDTVTDTEMVEKVFGFLPAMIGGQEGQASPHFEDLESKTQKLLEVDLDTVPMAEEPEEDVDGLAE 973
            |||||||.||||||||||||||||||.|...|||||.|||||.|||||||||.|.|.||||||||
  Rat   908 YDTVTDTAMVEKVFGFLPAMIGGQEGPAPTRFEDLEVKTQKLHEVDLDTVPMTEMPGEDVDGLAE 972

Human   974 YTFPKFAVTYFQKSASHTHIRRPLRYPLLYHEDDTDCLAALVIWNVILRFMGDLPEPVLYARSSQ 1038
            ||||||||||||||||||||::||||||||||:|||..|||.:|.:|||||||||||..|.|||.
  Rat   973 YTFPKFAVTYFQKSASHTHIQKPLRYPLLYHENDTDHSAALAVWIIILRFMGDLPEPQAYGRSSL 1037

Human  1039 QGSSVMRQIHDTLGREHGAQVPQHSRSAQRSGCKDKGTKDISSMKLKRSSRITGQVASQLNIGEE 1103
            .||||||||||.|.::...|.|||:||.                          |||||.|||||
  Rat  1038 TGSSVMRQIHDRLDKDSVTQGPQHNRST--------------------------QVASQQNIGEE 1076

Human  1104 ALEPDGLGADRPMSNLEKVHFIVGYAILRPSLRDEIYCQICKQLSENFKTSSLARGWILLSLCLG 1168
            ..:.||..:||||||||||||||||||:||.||||||||||||||||:||||.||||||||||||
  Rat  1077 VFKFDGPISDRPMSNLEKVHFIVGYAIMRPGLRDEIYCQICKQLSENYKTSSRARGWILLSLCLG 1141

Human  1169 CFPPSERFMKYLLNFIGQGPATYGPFCAERLRRTYANGVRAEPPTWLELQAVKSKKHIPIQVILA 1233
            ||||||||||||||||.||||:|||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1142 CFPPSERFMKYLLNFISQGPASYGPFCAERLQRTFANGVRAEPPTWLELQAVKSKKHIPIQVILA 1206

Human  1234 TGESLTVPVDSASTSREMCMHIAHKQGLSDHLGFSLQVAVYDKFWSLGSGRDHMMDAIARCEQMA 1298
            ||.|||:.|||||||||:|..||.||||.|.|||||||||||||||||:..||:|||:|:|||:|
  Rat  1207 TGRSLTISVDSASTSREICQQIAQKQGLRDKLGFSLQVAVYDKFWSLGNSCDHVMDAVAQCEQLA 1271

Human  1299 QERGESQRQSPWRIYFRKEFFTPWHDSREDPVSTELIYRQVLRGVWSGEYSFEKEEELVELLARH 1363
            .||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||:||||||||
  Rat  1272 WERGESQRQAPWRIYFRKEFFTPWHDSREDPVSTELIYHQVLRGVWSGEYNFEKEEDLVELLARH 1336

Human  1364 CYVQLGASAESKAVQELLPSCIPHKLYRTKPPDRPHTLRSKSHHWPCESRWWTPPACSGRCSSPG 1428
            |||||||:.:|.|||||||||:|.||||||.|::..:|...:|                      
  Rat  1337 CYVQLGATVKSNAVQELLPSCVPSKLYRTKSPEKWASLVIAAH---------------------- 1379

Human  1429 SSKSSHSQVMASDRGQGAGMGWAPRGPMQPSH-----CRLSWP-------------GPRLPKTQL 1475
             :|:.::|..|:              |::...     .||.||             |||||||||
  Rat  1380 -AKAPYTQSKAT--------------PLEVKEQTVEAARLLWPLLFSRLFEVTTLSGPRLPKTQL 1429

Human  1476 ILAVNWKGLCFLDQQEKMLLELSFPEVMGLATNREAQGGQRLLLSTMHEEYEFVSPSSVAIAELV 1540
            |||:||||:.||||:|:.||.|||.|||||..||:|.||:.|||||:||||||.|||||||||:|
  Rat  1430 ILAINWKGMYFLDQKERTLLGLSFAEVMGLIANRDAPGGKSLLLSTLHEEYEFASPSSVAIAEMV 1494

Human  1541 ALFLEGLKERSIFAMALQDRKATDDTTLLAFKKGDLLVLTKKQGLLASENWTLGQNDRTGKTGLV 1605
            ||||.||||||:|||||||||||||.|||.|||||||:|||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  1495 ALFLAGLKERSVFAMALQDRKATDDVTLLPFKKGDLLILTKKQGLLASENWVLGQNDRTGKTGLV 1559

Human  1606 PMACLYTIPTVTKPSAQLLSLLAMSPEKRKLAAQEGQFTEPRPEEPPKEKLHTLEEFSYEFFRAP 1670
            |.|||||||:|||||||||:|||||||||||||||.|.:||..||...|..:|||||||::||||
  Rat  1560 PTACLYTIPSVTKPSAQLLNLLAMSPEKRKLAAQEVQASEPPLEEQLTELPYTLEEFSYQYFRAP 1624

Human  1671 EKDMVSMAVLPLARARGHLWAYSCEPLRQPLLKRVHANVDLWDIACQIFVAILRYMGDYPSRQAW 1735
            ||:.:|.|.:|:||:||||||||.|||||||||.||....|.|.|||||:|||:|.|||||||:|
  Rat  1625 EKETISRAAMPMARSRGHLWAYSPEPLRQPLLKSVHDKAKLRDSACQIFLAILKYTGDYPSRQSW 1689

Human  1736 PTLELTDQIFTLALQHPALQDEVYCQILKQLTHNSNRHSEERGWQLLWLCTGLFPPSKGLLPHAQ 1800
            .:||||||:|:|||:.||||||:||||||||||||.|.||||.|||||||||||||.|.||||||
  Rat  1690 HSLELTDQMFSLALKEPALQDELYCQILKQLTHNSIRFSEERAWQLLWLCTGLFPPGKALLPHAQ 1754

Human  1801 KFIDTRRGKLLAPDCSRRIQKVLRTGPRKQPPHQVEVEAAEQNVSRICHKIYFPNDTSEMLEVVA 1865
            ||||:|:.|.||.|||||:.::||.||||||||.|||:|||||||::.|::|.||||::.|||.:
  Rat  1755 KFIDSRKKKPLALDCSRRLHRILRVGPRKQPPHHVEVKAAEQNVSKLHHEVYLPNDTNKTLEVSS 1819

Human  1866 NTRVRDVCDSIATRLQLASWEGCSLFIKISDKVISQKEGDFFFDSLREVSDWVKKNKPQKEGAPV 1930
            ::||||:|:.||||||||||:||||||||:|||||.|||||||||||:||||||||:||||||..
  Rat  1820 SSRVRDLCEGIATRLQLASWDGCSLFIKITDKVISLKEGDFFFDSLRQVSDWVKKNRPQKEGAST 1884

Human  1931 TLPYQVYFMRKLWLNISPGKDVNADTILHYHQELPKYLRGFHKCSREDAIHLAGLIYKAQFNNDR 1995
            ||||||:||||||||::||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||.||.:||
  Rat  1885 TLPYQVFFMRKLWLNVTPGKDVNADTILHYHQELPKYMRGFHKCSREDAIYLAGLIYKIQFGSDR 1949

Human  1996 SQLASVPKILRELVPENLTRLMSSEEWKKSILLAYDKHKDKTVEEAKVAFLKWICRWPTFGSAFF 2060
            ||:|||.|||:||||:||||||||||||||:||..||||:|:|.||||.|||.|.||||||||||
  Rat  1950 SQMASVSKILKELVPQNLTRLMSSEEWKKSLLLECDKHKNKSVAEAKVEFLKRIYRWPTFGSAFF 2014

Human  2061 EVKQTSEPSYPDVILIAINRHGVLLIHPKTKDLLTTYPFTKISSWSSGSTYFHMALGSLGRGSRL 2125
            ||||||||||||::||||||||:||||||||:||.|:|||||||||||:|||||||||||:||||
  Rat  2015 EVKQTSEPSYPDILLIAINRHGLLLIHPKTKELLDTFPFTKISSWSSGNTYFHMALGSLGQGSRL 2079

Human  2126 LCETSLGYKMDDLLTSYVQQLLSAMNKQRGSKAPALA 2162
            ||||||||||||||||||||:|||:||.||.:|||.|
  Rat  2080 LCETSLGYKMDDLLTSYVQQILSAVNKHRGFRAPAPA 2116

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYO7BXP_016859658.1 None
Myo7bNP_001178870.1 MYSc 60..761 CDD:214580 603/700 (86%)
MYSc_Myo7 79..750 CDD:276832 577/670 (86%)
IQ 787..809 CDD:197470 15/21 (71%)
MyTH4 991..1194 CDD:214535 162/228 (71%)
B41 1201..1414 CDD:214604 150/249 (60%)
FERM_B-lobe 1304..1405 CDD:271216 62/137 (45%)
FERM_C1_MyoVII 1408..1504 CDD:270019 64/95 (67%)
SH3 1505..1565 CDD:302595 53/59 (90%)
MyTH4 1646..1793 CDD:214535 111/146 (76%)
B41 1802..2014 CDD:214604 169/211 (80%)
FERM_M 1912..2014 CDD:278785 83/101 (82%)
FERM_C2_MyoVII 2010..2105 CDD:270020 85/94 (90%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83691102
Domainoid 1 1.000 1207 1.000 Domainoid score I989
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG4229
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H81947
Inparanoid 1 1.050 3512 1.000 Inparanoid score I336
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG39495
OrthoDB 1 1.010 - - D10152at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001409
OrthoInspector 1 1.000 - - oto135238
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100101
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR13140
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1286
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.