DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYO5A and myo5aa

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001369277.1 Gene:MYO5A / 4644 HGNCID:7602 Length:1904 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017207607.1 Gene:myo5aa / 562188 ZFINID:ZDB-GENE-041027-2 Length:1854 Species:Danio rerio


Alignment Length:1881 Identity:1473/1881 - (78%)
Similarity:1643/1881 - (87%) Gaps:34/1881 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    27 LDETALKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELPHLRNPDI 91
            ||...:|:|||||||.||||:||||.|||:.||.||.|.||:|||||:.|||||..|||||||||
Zfish     5 LDFMFIKYARVWIPDDEEVWRSAELTKDYRQGDGVLQLQLEDGKDLEFKLDPKTNNLPHLRNPDI 69

Human    92 LVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYGEDIINAYSGQNM 156
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Zfish    70 LVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYETLPIYGADIINAYSGQNM 134

Human   157 GDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSASEANVEEKVL 221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   135 GDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSASEANVEEKVL 199

Human   222 ASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMRTYLLEKSRVVFQAEEERNYHIF 286
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||:||||||||
Zfish   200 ASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKKYHIIGANMRTYLLEKSRVVFQADEERNYHIF 264

Human   287 YQLCASAKLPEFKMLRLGNADNFNYTKQGGSPVIEGVDDAKEMAHTRQACTLLGISESHQMGIFR 351
            |||||||.|||||.|:||.|::|:|||||.:|||:||||||||:.||.|..||||:||:|||:|:
Zfish   265 YQLCASAHLPEFKALKLGKANDFHYTKQGRNPVIDGVDDAKEMSTTRNAFILLGINESYQMGLFQ 329

Human   352 ILAGILHLGNVGFTSRDADSCTIPPKHEPLCIFCELMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPIS 416
            |||.|||||||....||:||..|||.:..|.:|||||||.|::|.|||||:||.||||||||||.
Zfish   330 ILASILHLGNVDVKDRDSDSSIIPPNNGHLSVFCELMGVTYQDMSHWLCHKKLKTATETYIKPIP 394

Human   417 KLQATNARDALAKHIYAKLFNWIVDNVNQALHSAVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYA 481
            ||||.||||||||||||||||||||:||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   395 KLQAINARDALAKHIYAKLFNWIVDHVNKALHSTVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYA 459

Human   482 NEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTDDT 546
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||||||||:||:
Zfish   460 NEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIEAKMGILDLLDEECKMPKGSDDS 524

Human   547 WAQKLYNTHLNKCALFEKPRLSNKAFIIQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKM 611
            ||||||||||..||||||||:||||||||||||||||||:||||||||||.||||.|||:|||.:
Zfish   525 WAQKLYNTHLKTCALFEKPRMSNKAFIIQHFADKVEYQCDGFLEKNKDTVNEEQINVLKASKFDL 589

Human   612 LPELFQDDEKAISPTSAT--SSGRTPLTRTPAKPTKGRPGQMAKEHKKTVGHQFRNSLHLLMETL 674
            |.|||.|:|||.|||.|.  ..||   ||...||.||:..|.:||||||||.||||||.||||||
Zfish   590 LVELFHDEEKATSPTGAAPGPGGR---TRLSVKPDKGKSSQASKEHKKTVGLQFRNSLQLLMETL 651

Human   675 NATTPHYVRCIKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMK 739
            |||||||||||||||:|..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   652 NATTPHYVRCIKPNDYKHAFTFDPKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMK 716

Human   740 QKDVLSDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRGW 804
            |||||:|:|.|||||||||:.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Zfish   717 QKDVLTDKKMTCKNVLEKLVQDPDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRCW 781

Human   805 LLRKKYLRMRKAAITMQRYVRGYQARCYAKFLRRTKAATIIQKYWRMYVVRRRYKIRRAATIVLQ 869
            |.|||||||:.||.|:||:||||||||.|||||||:||.|||||.|||:.:..||.::||.:.:|
Zfish   782 LARKKYLRMKHAATTIQRFVRGYQARCLAKFLRRTRAAIIIQKYQRMYIQKTCYKRKQAAALAMQ 846

Human   870 SYLRGFLARNRYRKILREHKAVIIQKRVRGWLARTHYKRSMHAIIYLQCCFRRMMAKRELKKLKI 934
            ..||.::||..|:.:|||||||||||.|||||||..:|||:.||:|||||.|||.||||||||||
Zfish   847 CILRAYMARQLYKALLREHKAVIIQKMVRGWLARQWFKRSLKAIVYLQCCIRRMRAKRELKKLKI 911

Human   935 EARSVERYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLVEKLTNLEGIYNSETEKLRSDLERLQLSE 999
            ||||||.:|||:||||||||||||::|:|||:.:.:.|:|..||..:..|:|::|:::.||:.:|
Zfish   912 EARSVEHFKKLNIGMENKIMQLQRRIDDQNKENRSMSERLNTLETSHAVESERMRAEVTRLRGAE 976

Human  1000 EEAKVATGRVLSLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKCIEEHADRYKQETEQLVSNLKEENTLLKQEKEA 1064
            |:||....:|.||.||:.:|||||:.|:.|||.||:.|..|:.|.|:::|.|||:|.|||.||..
Zfish   977 EDAKNNANKVTSLLEELERLRKDLQNTQKEKKAIEDWAQTYQDEMEKMISELKEQNQLLKTEKNN 1041

Human  1065 LNHRIVQQAKEMTETMEKKLVEETKQLELDLNDERLRYQNLLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMVHV 1129
            ||..|.:|:::.|:.|::.|.|||:|||.|||:||.||||||.|..||||:|||||||:||.|:|
Zfish  1042 LNQLIQEQSQQWTDKMQRALKEETQQLENDLNEERSRYQNLLTEHLRLEEKYDDLKEEITLAVNV 1106

Human  1130 PKPGHKRTDSTHSSNESEYIFSSEIAEMEDIPSRTEEPSEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQ 1194
            |||||:||||||||||||..::||.||.|: .||..|...|.: |||||||||||||:|||||||
Zfish  1107 PKPGHRRTDSTHSSNESECTYNSEFAESEE-GSRVGEDVSKSI-LDMSLFLKLQKRVSELEQEKQ 1169

Human  1195 VMQDELDRKEEQVLRSKAK-EEERPQIRGAELEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKSA 1258
            .:|:||||:|||..|::|: :||..:.|||||||||||||||||||||||::||::|::|.....
Zfish  1170 SLQNELDRREEQFQRARARDDEEHKKARGAELEYESLKRQELESENKKLKHDLNQMRQSLRGSVE 1234

Human  1259 PEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELDVRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDV 1323
            ....|||:|||.||::||.:.:|||:|||||||||||||||||||:|.||:|.|||:....:|||
Zfish  1235 AGSGAPGSPAYTVLLDQLNASNEELEVRKEEVLILRSQLVSQKEAMQHKDEKTTMTEPLPYIEDV 1299

Human  1324 QKMKDKGEIAQAYIGLKETNRSSALDYHELNEDGELWLVYEGLKQANRLLESQLQSQKRSHENEA 1388
            ||:.|..||:|||:|||:||||...|||:|||||||||||||||:.|||||||||:|:|||:||.
Zfish  1300 QKLTDAKEISQAYMGLKDTNRSPFPDYHKLNEDGELWLVYEGLKETNRLLESQLQAQRRSHDNEV 1364

Human  1389 EALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENLYFEELYADDPKKYQSY 1453
            |.||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Zfish  1365 EVLRGELHSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENL---------------- 1413

Human  1454 RISLYKRMIDLMEQLEKQDKTVRKLKKQLKVFAKKIGELEVGQMENISPGQIIDEPIRPVNIPRK 1518
                     |||||||||||||||||||||||||||.:||.|||: :||||..|||:.||||||:
Zfish  1414 ---------DLMEQLEKQDKTVRKLKKQLKVFAKKINDLEGGQMD-VSPGQTADEPVHPVNIPRR 1468

Human  1519 EKDFQGMLEYKKEDEQKLVKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQKVRSLLT 1583
            |||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||
Zfish  1469 EKDFQGMLEYKKEDELKLVKNIILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCLRHADYINDDQKVRSLLT 1533

Human  1584 STINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHCLKQYSGEEGFMKHNTSRQNEHCLTNFDLAEYR 1648
            |.||||||:|||||||||||||||:||||||||||||||:|.|||||:.:||||||:||||||||
Zfish  1534 SVINSIKKILKKRGDDFETVSFWLANTCRFLHCLKQYSGDEQFMKHNSPKQNEHCLSNFDLAEYR 1598

Human  1649 QVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLRKRTSSIADEGTYTLDSI 1713
            ||||||||||||||::.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1599 QVLSDLAIQIYQQLIKCMENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLRKRTSSIADEGTYTLDSI 1663

Human  1714 LRQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIIGAITLNNLLLRKDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEW 1778
            :||||:|||:||.||.|||||||||||.||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1664 IRQLNTFHSIMCHHGTDPELIKQVVKQQFYIIGAVTLNNLLLRKDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEW 1728

Human  1779 LRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAICSMCNALTTAQIVKVLNLYTPVNEFEE 1843
            |||||||..|||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||||||||||.|||
Zfish  1729 LRDKNLMTCGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDEDAEAICSMCNALSTAQIVKVLNLYTPVNAFEE 1793

Human  1844 RVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPVTFPFNPSSLALETIQIPASLGLGFISRV 1904
            ||||.||||||.||||||:|||||||.|.|:|||||||||||||||||||:||.|.|::||
Zfish  1794 RVSVLFIRTIQTRLRDRKESPQLLMDTKLIYPVTFPFNPSSLALETIQIPSSLNLAFLTRV 1854

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYO5ANP_001369277.1 COG5022 35..1472 CDD:227355 1087/1439 (76%)
MYSc_Myo5 107..775 CDD:276831 572/669 (86%)
Myo5a_CBD 1530..1904 CDD:271262 333/373 (89%)
myo5aaXP_017207607.1 MYSc_Myo5 85..752 CDD:276831 572/669 (86%)
IQ 766..787 CDD:197470 18/20 (90%)
IQ 789..811 CDD:197470 15/21 (71%)
SMC_N <920..1279 CDD:330553 217/360 (60%)
SMC_N <1156..>1445 CDD:330553 216/313 (69%)
Myo5a_CBD 1480..1854 CDD:271262 333/373 (89%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C194329303
Domainoid 1 1.000 1181 1.000 Domainoid score I255
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H20100
Inparanoid 1 1.050 2905 1.000 Inparanoid score I173
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG52542
OrthoDB 1 1.010 - - D19269at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 1 1.000 - - oto43028
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100101
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR13140
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R4210
SonicParanoid 1 1.000 - - X244
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
ZFIN 1 1.500 - -
1717.440

Return to query results.
Submit another query.