DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYO1D and Myo1d

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_056009.1 Gene:MYO1D / 4642 HGNCID:7598 Length:1006 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_037115.2 Gene:Myo1d / 25485 RGDID:621321 Length:1006 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1006 Identity:986/1006 - (98%)
Similarity:999/1006 - (99%) Gaps:0/1006 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGRDTIEQ 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat     1 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKVLNIYGRDTIEQ 65

Human    66 YKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIAAITNPSQRAE 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 YKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIMISGESGAGKTEASKYIMQYIAAITNPSQRAE 130

Human   131 VERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQ 195
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQ 195

Human   196 PGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSSINDAAEFRVVADAMKVIGFK 260
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   196 PGERSFHSFYQLLQGGSEQMLHSLHLQKSLSSYNYIRVGAQLKSSINDAAEFKVVADAMKVIGFK 260

Human   261 PEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRD 325
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   261 PEEIQTVYKILAAILHLGNLKFIVDGDTPLIENGKVVSVIAELLSTKADMVEKALLYRTVATGRD 325

Human   326 IIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIF 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   326 IIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTVHGKNTVIGVLDIYGFEIF 390

Human   391 DNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAI 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 DNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAI 455

Human   456 LDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKLGKHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFI 520
            |||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 LDDACMNVGKVTDGMFLEALNSKLGKHGHFSSRKTCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFI 520

Human   521 DKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPY 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPY 585

Human   586 YVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWPNH 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 YVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWPNH 650

Human   651 DLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKVWRGTLAR 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||
  Rat   651 DLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLVRVVLFLQKVWRGTLAR 715

Human   716 MRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKVLRRFEEALQTIF 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||:||
  Rat   716 MRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKNMRDYGKHVKWPTPPKVLRRFEEALQSIF 780

Human   781 NRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGTFVPVA 845
            ||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 NRWRASQLIKTIPASDLPQVRAKVAAMEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGTFVPVA 845

Human   846 NELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVS 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 NELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVS 910

Human   911 NGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLHGK 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 NGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLHGK 975

Human   976 KCTVSVETRLNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN 1006
            |||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 KCTVSVETRLNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN 1006

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYO1DNP_056009.1 MYSc_Myo1 24..682 CDD:276829 644/657 (98%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00782 572..594 21/21 (100%)
Myosin_TH1 803..996 CDD:461801 191/192 (99%)
Myo1dNP_037115.2 MYSc_Myo1 24..682 CDD:276829 644/657 (98%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00782 572..594 21/21 (100%)
Interaction with calmodulin. /evidence=ECO:0000269|PubMed:8034741 776..896 116/119 (97%)
Myosin_TH1 803..996 CDD:461801 191/192 (99%)

Return to query results.
Submit another query.