DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH9 and Myh9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002464.1 Gene:MYH9 / 4627 HGNCID:7579 Length:1960 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_037326.2 Gene:Myh9 / 25745 RGDID:3140 Length:1960 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1960 Identity:1898/1960 - (96%)
Similarity:1930/1960 - (98%) Gaps:0/1960 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKV 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSTKNGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKV 65

Human    66 KVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIY 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 KVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIY 130

Human   131 SEEIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAYVA 195
            |||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   131 SEEIVDMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVA 195

Human   196 SSHKSKKDQGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLE 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 SSHKSKKDQGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLE 260

Human   261 KSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEA 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 KSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEA 325

Human   326 MRIMGIPEEEQMGLLRVISGVLQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGIL 390
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 MRIMGIPEDEQMGLLRVISGVLQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGIL 390

Human   391 TPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 TPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAG 455

Human   456 FEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAG 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 FEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAG 520

Human   521 PPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWL 585
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 PPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVVQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWL 585

Human   586 MKNMDPLNDNIATLLHQSSDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLY 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 MKNMDPLNDNIATLLHQSSDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLY 650

Human   651 KEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQ 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 KEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQ 715

Human   716 EFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAGVLAHLEEERDLKIT 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 EFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAGVLAHLEEERDLKIT 780

Human   781 DVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEE 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||...|.|:
  Rat   781 DVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLRLRNWQWWRLFTKVKPLLNSIRHED 845

Human   846 EMMAKEEELVKVREKQLAAENRLTEMETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRARLTAKK 910
            |::|||.||.|||||.||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 ELLAKEAELTKVREKHLAAENRLTEMETMQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRARLTAKK 910

Human   911 QELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKK 975
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 QELEEICHDLEARVEEEEERCQYLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKK 975

Human   976 LEEEQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREE 1040
            |||:|||:|||||||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 LEEDQIIMEDQNCKLAKEKKLLEDRVAEFTTNLMEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREE 1040

Human  1041 KQRQELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAAQKNMALKK 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 KQRQELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAAQKNMALKK 1105

Human  1106 IRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVN 1170
            |||||:||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat  1106 IRELETQISELQEDLESERACRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVS 1170

Human  1171 ILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKV 1235
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
  Rat  1171 ILKKTLEDEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKATLEKAKQTLENERGELANEVKA 1235

Human  1236 LLQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKLT 1300
            ||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|||||||:|||||:||||||||||
  Rat  1236 LLQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFSEGERVRTELADKVSKLQVELDSVTGLLNQSDSKSSKLT 1300

Human  1301 KDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQVEDEKNSFREQLEEEEEAKHNLEKQIATLHAQ 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat  1301 KDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFREQLEEEEEAKRNLEKQIATLHAQ 1365

Human  1366 VADMKKKMEDSVGCLETAEEVKRKLQKDLEGLSQRHEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLD 1430
            |.||||||||.|||||||||.||:|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1366 VTDMKKKMEDGVGCLETAEEAKRRLQKDLEGLSQRLEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLD 1430

Human  1431 HQRQSACNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAEL 1495
            |||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1431 HQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAEL 1495

Human  1496 ERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEV 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1496 ERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEV 1560

Human  1561 NLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAVAARKKLEMDLKDLEAH 1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||
  Rat  1561 NLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSIAMAARKKLEMDLKDLEAH 1625

Human  1626 IDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELA 1690
            ||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1626 IDTANKNREEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELA 1690

Human  1691 AAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDRLKKA 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1691 AAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDRLKKA 1755

Human  1756 NLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASITALEAKIAQLE 1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||||||||.||||||||||
  Rat  1756 NLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKAKLQEMESAVKSKYKASIAALEAKIAQLE 1820

Human  1821 EQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLKDVLLQVDDERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEE 1885
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1821 EQLDNETKERQAASKQVRRAEKKLKDVLLQVEDERRNAEQFKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEE 1885

Human  1886 AQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDGSDEEVDGK 1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.||:.|||.||.||||||||
  Rat  1886 AQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGDMPFVVTRRIVRKGTGDCSDEEVDGK 1950

Human  1951 ADGAEAKPAE 1960
            ||||:||.||
  Rat  1951 ADGADAKAAE 1960

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH9NP_002464.1 Mediates interaction with LIMCH1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:28228547 2..838 828/835 (99%)
Myosin_N 27..72 CDD:460670 42/44 (95%)
Motor_domain 95..764 CDD:473979 664/668 (99%)
Actin-binding 654..676 21/21 (100%)
Myosin_tail_1 841..1921 CDD:460256 1034/1079 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1035..1057 21/21 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1118..1137 17/18 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1877..1960 74/82 (90%)
Myh9NP_037326.2 Myosin_N 27..72 CDD:460670 42/44 (95%)
Motor_domain 95..764 CDD:473979 664/668 (99%)
Myosin_tail_1 842..1921 CDD:460256 1034/1078 (96%)

Return to query results.
Submit another query.