DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH9 and nmy-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002464.1 Gene:MYH9 / 4627 HGNCID:7579 Length:1960 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_508504.2 Gene:nmy-1 / 180581 WormBaseID:WBGene00003776 Length:1963 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1972 Identity:991/1972 - (50%)
Similarity:1398/1972 - (70%) Gaps:43/1972 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 KYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVENGKKVKVNKDDI 72
            :||.|.:..:.:|...|.||.:||.|||....||...|:|.|..:|.:||||:..::|.:::||:
 Worm     5 QYLQVQRAAVADPATLAAWAQRKLCWVPDQNEGFLIGSIKRETNDEVLVELVDTSRQVTISRDDV 69

Human    73 QKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKNLPIYSEEIVEM 137
            ||.|||||.|:|||:|||.|||||||||||:||||.|||||||||||||||||.||||||:::|.
 Worm    70 QKANPPKFDKIEDMSELTYLNEASVLHNLKDRYYSSLIYTYSGLFCVVINPYKKLPIYSEDLIEE 134

Human   138 YKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAYVASSHKSK- 201
            :||||||||||||:||.|||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||:||.:.::| 
 Worm   135 FKGKKRHEMPPHIFAIADTAYRSMLQEREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVAGATRNKS 199

Human   202 ----------------KDQGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIV 250
                            ...||||.||||||||||||||:||||||||||||||||||||::|||.
 Worm   200 LNAAAQQNIVQKPDVRNPIGELEHQLLQANPILEAFGNSKTVKNDNSSRFGKFIRINFDMSGYIS 264

Human   251 GANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQD 315
            |||||.|||||||.:|||::||:|||||.:|.|.....|::.|||..:.||||.|..:|:|...|
 Worm   265 GANIEFYLLEKSRVLRQAQDERSFHIFYQILRGCSAKEKSEYLLEGVDNYRFLVNRGITLPNVDD 329

Human   316 KDMFQETMEAMRIMGIPEEEQMGLLRVISGVLQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVSHLLGI 380
            ...|..|:.:|||||..::|...::||:|.||.|||:.|.:|:.:|||.:.|:...|||.||||:
 Worm   330 VQEFHSTINSMRIMGFADDEISSIMRVVSAVLLLGNLEFTQEKKSDQAMLQDDRVIQKVCHLLGL 394

Human   381 NVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGA 445
            .|.:..:..|.|||||||::|.|||.:|||:||:||:|||:|||:|:|||.||||:||:|.||||
 Worm   395 PVIELQKAFLRPRIKVGREFVNKAQNQEQAEFAVEAIAKASYERLFKWLVTRINKSLDRTHRQGA 459

Human   446 SFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQP 510
            |||||||||||||||:|||||:||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||
 Worm   460 SFIGILDIAGFEIFDINSFEQICINYTNEKLQQLFNNTMFILEQEEYQREGIEWDFIDFGLDLQP 524

Human   511 CIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAG 575
            .|||||||.   |:||||||||.||||.|||||||:.:....||||..| .::.|:.|.::||||
 Worm   525 TIDLIEKPM---GVLALLDEECLFPKANDKSFVEKLQKTHNKHPKFIVP-DMRSKSHFAVVHYAG 585

Human   576 KVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSSDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRK 640
            :|||.||:||||||||||:|:..|:..|:|.||:.:|||.: ..|: ..|.|:|||.  ..::||
 Worm   586 RVDYSADQWLMKNMDPLNENVVGLMQNSTDPFVAGIWKDAE-FAGI-CAAEMNETAF--GMRSRK 646

Human   641 GMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICR 705
            ||||||.||:||||.|||.|||||:|:||||||||||||:||::.:|||:|||||||||||||||
 Worm   647 GMFRTVSQLHKEQLTKLMTTLRNTSPHFVRCIIPNHEKKSGKINSNLVLEQLRCNGVLEGIRICR 711

Human   706 QGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAGVLAH 770
            |||||||.|||||.|||||||:.|||.|:|||::...||.||::|:|||||||||||||.|||||
 Worm   712 QGFPNRVPFQEFRHRYEILTPDVIPKNFIDGKESVRKMITALDIDTNLYRIGQSKVFFRTGVLAH 776

Human   771 LEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVK 835
            ||||||||:|.:|:.|||.|||:|:|:.:.:||||.:|::::|||..||||||||||||||||||
 Worm   777 LEEERDLKLTALIMNFQAQCRGFLSRRLYTRRQQQSSAIRIIQRNGLAYLKLRNWQWWRLFTKVK 841

Human   836 PLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAENRLTEMETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAE 900
            |||||:|.::|:.||::||...:|:.|..|:...|.|....|::.|:..:|||||.|:|..||.:
 Worm   842 PLLQVTRTDDEIRAKDDELRATKERLLKMEHDFRENEKKLDQVIVERAVIQEQLQQESENSAELD 906

Human   901 ELRARLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLE 965
            ::|.||..:.||||.|.:|:..|:.|||::.:....|::|..:.:::||||||:||.|||||.|:
 Worm   907 DIRGRLQTRNQELEYIVNDMRDRLSEEEQQNEKNNDERRKQMETVRDLEEQLEQEEQARQKLLLD 971

Human   966 KVTTEAKLKKLEEEQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMIT 1030
            |...:.:|:.|||..:.|:|...||.|||:|||:::...||.|.:.||::|...|.|.:.|..:.
 Worm   972 KTNVDQRLRNLEERLVELQDAYDKLLKEKRLLEEKVEGLTTQLLDHEERAKHGVKAKGRLENQLH 1036

Human  1031 DLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEE 1095
            :||:.|.||.:.:.|||:.:|||..:..|..|.:||...::.||..||.|::||||..|.|.:||
 Worm  1037 ELEQDLNRERQYKSELEQHKRKLLAELEDSKDHLAEKMGKVEELNNQLMKRDEELQHQLTRYDEE 1101

Human  1096 AAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQE 1160
            :|...:..|::|::::.|.||:||:|:||.:|||||..:|::..:||.:|.::.|.:|.....|:
 Worm  1102 SANVTLMQKQMRDMQTTIDELREDMETERNARNKAEMTRREVVAQLEKVKGDVLDKVDEATMLQD 1166

Human  1161 LRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENE 1225
            |.|::::|||..|:.:|:...|.|.:|:|.:.|.|:.||||.:|:||.|:.::.|||.:...:.|
 Worm  1167 LMSRKDEEVNATKRAIEQIQHTMEGKIEEQKAKFSRQVEELHDQIEQHKKQRSQLEKQQNQADQE 1231

Human  1226 RGELANEVKVLLQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTGLLS 1290
            |.::|.|:.:|...:.|.:.|||..||.|.|:|....|.:..:..|.|::.:.:.|||::..:..
 Worm  1232 RADMAQEIALLQASRADIDKKRKIHEAHLMEIQANLAESDEHKRTLIDQLERSRDELDHLNRVRE 1296

Human  1291 QSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQVEDEKNSFREQLEEEEEAKHNL 1355
            :.:...:.:.:..:..|.|:|:..|.:|||.|.|::...:.:|:|||||:..::.||.|..:.:|
 Worm  1297 EEEHAFANMQRRLATAEGQIQELNEQIQEETRLKIANINRARQLEDEKNALLDEKEEAEGLRAHL 1361

Human  1356 EKQIATLHAQVADMKKKMEDSVGCLETAEEVKRKLQKDLEGLSQRHEEKVAAYDKLEKTKTRLQQ 1420
            ||:|........:.::|.|:||.  :..||:::|..:|:|.|.::.||...|.:::.::|.::||
 Worm  1362 EKEIHAARQGAGEARRKAEESVN--QQLEELRKKNLRDVEHLQKQLEESEVAKERILQSKKKIQQ 1424

Human  1421 ELDDLLVDLDHQRQSACNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARAL 1485
            ||:|..::|::.|.|..:.||:||||:..:|||:....|...:||....|.|::||:.|||...:
 Worm  1425 ELEDSSMELENVRASHRDSEKRQKKFESQMAEERVAVQKALLDRDAMSQELRDRETRVLSLLNEV 1489

Human  1486 EEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELEDELQA 1550
            :...|...|.:|:.:..:.|::|.:|:|||.||:||||||:||:||.::.:|:.|:|||||.||.
 Worm  1490 DIMKEHLEESDRVRRSLQQELQDSISNKDDFGKNVHELEKAKRSLEAELNDMRVQMEELEDNLQI 1554

Human  1551 TEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAVAARKKL 1615
            .|||:|||||..||:|::.:|.:..:|.::|||::.|::|:|::|.|||:|::.:|.||:.|||:
 Worm  1555 AEDARLRLEVTNQALKSESDRAISNKDVEAEEKRRGLLKQIRDLENELENEKRGKSGAVSHRKKI 1619

Human  1616 EMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEA 1680
            |..:.:||..::.||:.::|..|||:|.|..:|:...|.::.|.::|:|.|..:|.::|.:::||
 Worm  1620 ENQIGELEQQLEVANRLKEEYNKQLKKNQQIIKEYQIECEEARQAKEDIAALLREADRKFRAVEA 1684

Human  1681 EMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEEEQGNT 1745
            |..||:|......:|::|.:.|.|||.:..|..   |.::.||||||||:||||||||||||.|.
 Worm  1685 EREQLREANEGLMQARKQLELENDELEELRAKG---GGISSEEKRRLEAKIAQLEEELEEEQSNC 1746

Human  1746 ELINDRLKKANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASIT 1810
            ||..|:.:||.:|::||.|||::||:..||.|..:|.|||.|::.|.|:.|:|...:|:.:|.:.
 Worm  1747 ELAIDKQRKAQVQLEQITTDLSMERTLNQKTEAEKQSLERSNRDYKAKITELESGAQSRARAQMA 1811

Human  1811 ALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLKDVLLQVDDERRNAEQYKDQADKASTRLKQL 1875
            |||||:..||:||:.|.:|:.||.:..||.||:|.|...|.:||:|..||.|:..:|::.:.:.|
 Worm  1812 ALEAKVQYLEDQLNVEGQEKTAANRAARRLEKRLNDTTQQFEDEKRANEQAKELLEKSNLKNRNL 1876

Human  1876 KRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLK-NKLRRGDL----PFVVPRRMA 1935
            :|||:|||:|..|.....|.:|||.:|..:..:.:.||:.:|: |..||.|:    .|.||    
 Worm  1877 RRQLDEAEDEMSRERTKHRNVQREADDLLDANEQLTRELMNLRGNNRRRADMRLRRGFDVP---- 1937

Human  1936 RKGAGD--GSDEEVDGKADGAE 1955
              |:.|  ..:||.:....|:|
 Worm  1938 --GSSDNLAREEENESNVSGSE 1957

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH9NP_002464.1 Mediates interaction with LIMCH1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:28228547 2..838 556/846 (66%)
Myosin_N 27..72 CDD:460670 18/44 (41%)
Motor_domain 95..764 CDD:473979 462/685 (67%)
Actin-binding 654..676 17/21 (81%)
Myosin_tail_1 841..1921 CDD:460256 419/1080 (39%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1035..1057 9/21 (43%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1118..1137 11/18 (61%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1877..1960 29/86 (34%)
nmy-1NP_508504.2 Myosin_N 26..69 CDD:460670 17/42 (40%)
MYSc_class_II 92..770 CDD:276951 462/685 (67%)
Myosin_tail_1 847..1919 CDD:460256 417/1076 (39%)

Return to query results.
Submit another query.