DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH8 and LOC100493121

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_002463.2 Gene:MYH8 / 4626 HGNCID:7578 Length:1937 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012809641.1 Gene:LOC100493121 / 100493121 -ID:- Length:1935 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1931 Identity:1649/1931 - (85%)
Similarity:1806/1931 - (93%) Gaps:2/1931 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     5 SDAEMAVFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESYVKSTIQSKEGGKVTVKTEGG 69
            ||||||.:|.||.:|||||||||||||:||||||||||.:||:.|||..:|||||||.|||.|..
 Frog     2 SDAEMAAYGPAAQFLRKSEKERIEAQNRPFDAKTSVFVIDPKQMYVKGIVQSKEGGKATVKKEDM 66

Human    70 ATLTVREDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPGVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWL 134
            :|:||::|::||||||||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||.||||||||
 Frog    67 STVTVKDDEIFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCATVNPYKWL 131

Human   135 PVYKPEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 199
            |||.||||.|||||||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||||||||||
 Frog   132 PVYNPEVVNAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 196

Human   200 TIAVTGEKKKDES--GKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLA 262
            |||..|:|||:|:  ||:|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog   197 TIAAIGDKKKEEAAPGKIQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLS 261

Human   263 SADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQITSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSID 327
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||:|:||:||||||||||:.:||||||||.|||
 Frog   262 SADIETYLLEKSRVTFQLSAERSYHIFYQIMSNKRPELIDMLLITTNPYDFPYVSQGEITVASID 326

Human   328 DQEELMATDSAIDILGFTPEEKVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQS 392
            |||||||||||||||||..:||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
 Frog   327 DQEELMATDSAIDILGFNNDEKNGIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLMG 391

Human   393 LNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNAVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQ 457
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||.|:||||||||||.|||||||||||||
 Frog   392 LNSADLLKALCYPRVKVGNEFVTKGQTVQQVYNSVGALGKSVYEKMFLWMVIRINQQLDTKQPRQ 456

Human   458 YFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAA 522
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||
 Frog   457 HFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAA 521

Human   523 CIELIEKPLGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSANFQKPKVVKGKAEAHFSLIHYAG 587
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..||||||||||:||||
 Frog   522 CIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPGKGKAEAHFSLVHYAG 586

Human   588 TVDYNITGWLDKNKDPLNDTVVGLYQKSAMKTLASLFSTYASAEADSSAKKGAKKKGSSFQTVSA 652
            ||||||:|||||||||||:||:||||||::|.|:.|:|.|:..:||:..|||.||||||||||||
 Frog   587 TVDYNISGWLDKNKDPLNETVIGLYQKSSVKLLSFLYSAYSGTDADTGGKKGGKKKGSSFQTVSA 651

Human   653 LFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRIL 717
            ||||||||||.||||||||||||:|||||||||||:|.||:||||||||||||||||||||||||
 Frog   652 LFRENLNKLMANLRSTHPHFVRCLIPNETKTPGAMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRIL 716

Human   718 YGDFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDE 782
            |||||||||:||||||||||||||||||||||.|||:||||||||||||||||||||.|||||||
 Frog   717 YGDFKQRYKILNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDVDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDE 781

Human   783 KLAQIITRTQAVCRGFLMRVEYQKMLQRREALFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLKSAE 847
            :|||:||||||:|||:|||||:::|::|||::||||||||:||||||||||||:|||||||||||
 Frog   782 RLAQLITRTQAMCRGYLMRVEFRQMMERRESIFCIQYNVRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSAE 846

Human   848 TEKEMATMKEEFQKTKDELAKSEAKRKELEEKMVTLLKEKNDLQLQVQSEADSLADAEERCEQLI 912
            :||||..|||||:|||:.||||||||||||||||.:|:|||||.|||.||::||||||||||.||
 Frog   847 SEKEMQNMKEEFEKTKEALAKSEAKRKELEEKMVAILQEKNDLHLQVTSESESLADAEERCEGLI 911

Human   913 KNKIQLEAKIKEVTERAEEEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENK 977
            |.||||||||||..||.|:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   912 KAKIQLEAKIKEFNERLEDEEESNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENK 976

Human   978 VKNLTEEMAGLDETIAKLSKEKKALQETHQQTLDDLQAEEDKVNILTKAKTKLEQQVDDLEGSLE 1042
            |||||||||.||||||||:||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
 Frog   977 VKNLTEEMAILDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKTKLEQQVDDLEGSLE 1041

Human  1043 QEKKLRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDMENDKQQLDEKLEKKEFEISNLISKIEDEQAVEIQL 1107
            ||||||||:||||||||||||||||||||:|||:||||||::|||||||.|.||||||||:..||
 Frog  1042 QEKKLRMDMERAKRKLEGDLKLAQESTMDLENDRQQLDEKVKKKEFEISQLQSKIEDEQALAAQL 1106

Human  1108 QKKIKELQARIEELGEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQVELNKKREA 1172
            ||||||||||||||.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||
 Frog  1107 QKKIKELQARIEELEEEIEAERAARAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKREA 1171

Human  1173 EFQKLRRDLEEATLQHEAMVAALRKKHADSMAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMETDDLSSN 1237
            ||||:|||||||||||||..:|||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||.|||:||
 Frog  1172 EFQKMRRDLEEATLQHEATASALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLASN 1236

Human  1238 AEAISKAKGNLEKMCRSLEDQVSELKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTEAGEYSRQLDEKDALVS 1302
            .|::||||.|||||||:||||.||:||||||..|:|||:.||||||.||.||:||||:||::::|
 Frog  1237 MESVSKAKSNLEKMCRTLEDQFSEVKTKEEEHLRVINDINAQRARLHTENGEFSRQLEEKESMIS 1301

Human  1303 QLSRSKQASTQQIEELKHQLEEETKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKA 1367
            ||||:|||.|||.||||.||||||||||||||.|||:||||||||||||||||.|.||||:||||
 Frog  1302 QLSRAKQAFTQQTEELKRQLEEETKAKNALAHGLQSARHDCDLLREQYEEEQEAKGELQRSLSKA 1366

Human  1368 NSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLM 1432
            ||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.:||||:||||||||||||||||||||
 Frog  1367 NSEVSQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEQIEAVNSKCASLEKTKQRLQNEVEDLM 1431

Human  1433 LDVERSNAACAALDKKQRNFDKVLSEWKQKYEETQAELEASQKESRSLSTELFKVKNVYEESLDQ 1497
            :||||||:|||||||||:||||||::||||:||:|||||||||||||||||:||:||.|||:|||
 Frog  1432 VDVERSNSACAALDKKQKNFDKVLADWKQKFEESQAELEASQKESRSLSTEVFKMKNSYEEALDQ 1496

Human  1498 LETLRRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKQIHELEKIKKQVEQEKCEIQAALEEAEASLEHEEGKIL 1562
            ||||:|||||||||||||||||||.||.|||:||.|||:||||.::|:||||||.||||||.|:|
 Frog  1497 LETLKRENKNLQQEISDLTEQIAESGKTIHEIEKAKKQIEQEKSDLQSALEEAEGSLEHEEAKVL 1561

Human  1563 RIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQLKRNHTRVVETMQSTLDAEIRSRNDALRVKKKMEGDLNE 1627
            ||||||||||.|||||||||||||:|||||..|.:|:|||||||||||||||||:||||||||||
 Frog  1562 RIQLELNQVKGEVDRKIAEKDEEIEQLKRNSQRALESMQSTLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLNE 1626

Human  1628 MEIQLNHANRLAAESLRNYRNTQGILKETQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAEIEELW 1692
            |||||:||||.||||.:..||.||:||:||||||||.||.:||||||||||||.||:.|||||:.
 Frog  1627 MEIQLSHANRQAAESQKQLRNVQGLLKDTQLHLDDAQRGNDDLKEQLAIVERRNNLMTAEIEEMR 1691

Human  1693 ATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLENDVSQLQSEVEEVIQESRNAEEK 1757
            :.||||||.||:|||||:|.:|||||||:|||||||||||:|:|||||||||||.:||:|||:||
 Frog  1692 SALEQTERGRKVAEQELIDVTERVQLLHSQNTSLINTKKKIESDVSQLQSEVEEAVQEARNADEK 1756

Human  1758 AKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARV 1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||||||
 Frog  1757 AKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLAMKGGKKQLQKLEARV 1821

Human  1823 RELEGEVENEQKRNAEAVKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNVLRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEE 1887
            ||||.|::.||||.::|:||:||.|||||||:||:|||:|||.||||||||||.|||:||||.|:
 Frog  1822 RELENELDAEQKRGSDAIKGVRKFERRVKELSYQSEEDKKNVFRLQDLVDKLQLKVKTYKRQTED 1886

Human  1888 AEEQSNANLSKFRKLQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTK 1933
            .|||:|.:||:|||.||||||||||||||||||||||.|||::..|
 Frog  1887 IEEQANVHLSRFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKSRDIGKK 1932

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH8NP_002463.2 Myosin_N 38..75 CDD:280832 23/36 (64%)
Myosin_head 90..769 CDD:278492 608/680 (89%)
MYSc_Myh8 102..769 CDD:276882 597/668 (89%)
Actin-binding 658..680 19/21 (90%)
Actin-binding 760..774 13/13 (100%)
Myosin_tail_1 849..1926 CDD:279860 909/1076 (84%)
eIF-4B <1042..1099 CDD:283846 49/56 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1126..1146 18/19 (95%)
COG6 1375..>1510 CDD:303003 119/134 (89%)
DUF342 <1505..1581 CDD:302792 62/75 (83%)
TMPIT 1741..>1828 CDD:285135 80/86 (93%)
LOC100493121XP_012809641.1 Myosin_N 35..72 CDD:280832 23/36 (64%)
Myosin_head 87..768 CDD:278492 608/680 (89%)
Motor_domain 99..768 CDD:277568 597/668 (89%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:279860 909/1076 (84%)
RILP-like 963..1096 CDD:304877 121/132 (92%)
DUF342 <1154..1239 CDD:302792 73/84 (87%)
MIT_CorA-like <1297..>1409 CDD:294313 95/111 (86%)
COG6 1374..>1535 CDD:303003 141/160 (88%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 1779 1.000 Domainoid score I142
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 3326 1.000 Inparanoid score I187
NCBI 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D12270at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 1 1.000 - - mtm10347
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X58
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
77.060

Return to query results.
Submit another query.