DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment poe and Ubr4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_476986.1 Gene:poe / 46243 FlyBaseID:FBgn0011230 Length:5322 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063143863.1 Gene:Ubr4 / 313658 RGDID:1563121 Length:5233 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5675 Identity:2122/5675 - (37%)
Similarity:3108/5675 - (54%) Gaps:820/5675 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 AHSGGTD----WNSVVKALILNRTGALNKNEVVNLLKAITRCEHDFFEEESNFTQFYTAFAALAA 63
            |.:.|.|    |...|:.|:.....|....|:..|:.::...|.:....|..:..||::|.||:.
  Rat    18 APATGQDTTPGWEVAVRPLLSASYSAFEMKELPQLVASVIESESEILHHEKQYEPFYSSFVALST 82

  Fly    64 DKLMQIKTIC----QTQICQLHDATAVLIRFIIYRL---PRVSVYETKWLLGALKMLCEGRECPA 121
            .   .|.|:|    :.|:..:..|..|||.|.:.||   ........|.|:..:|.||.|  |..
  Rat    83 H---YITTVCSLIPRNQLQSVAAACKVLIEFSLLRLENPDEACAVSQKHLILLIKGLCTG--CSR 142

  Fly   122 SASSSMFDYNAVANVLKSCKHPESTTKSIMPSSSSSGSGASNDKE--SPKS-EIKRSRSDLSSVI 183
            ...:.:..:.|   ::||.|.|: |.|::        |...:.||  ||.| |:::....::  .
  Rat   143 LDRTEIITFTA---MMKSAKLPQ-TVKTL--------SDVEDQKELASPVSPELRQKEVQMN--F 193

  Fly   184 LQQLIAPLEPGKMTWVPLSEEV--------TDCTEQ---------ILAANVEYFQEQNGVDTLLD 231
            |.||.:...|..:...|:|.:.        ...|||         .:|.||...||..|.:.||.
  Rat   194 LNQLTSVFNPRTVPSPPISPQALVEGENDEQSSTEQASAVKTKNVFIAQNVASLQELGGSEKLLR 258

  Fly   232 VCVSLPILNRYRSKYMETINGGKSLYLPLTQVEATAVKSSMNHMLTDLTILSQAQALIEMQPLTP 296
            ||::||...||.:::.:.:.......:|.|..:||||::..:.::.|:|:.....:|..::||.|
  Rat   259 VCLNLPYFLRYINRFQDAVVANSFFIMPATVADATAVRNGFHSLVIDVTMALDTLSLPVLEPLNP 323

  Fly   297 SRIERLSMCGIAALYNAVLTSIATSVLGMSQASSSQKQTASTSQGSGVGGSSGGQSNKDHDDFED 361
            ||::.:::..::.||..|  |:||.:..:...|:.|.:|.|||              ...:|:|.
  Rat   324 SRLQDVTVLSLSCLYAGV--SVATCMAILHVGSAQQVRTGSTS--------------SKEEDYES 372

  Fly   362 QACSIVNKALEIYSNIGHMFKTSARI---HVYQNHLCYGSWLLISGIQGAMGASGSG----GSSS 419
            .|.:||.|.||||..||....:|.|.   | :||....|:|.|::.:...:..|.:.    |...
  Rat   373 DAATIVQKCLEIYDMIGQAISSSRRAGGEH-FQNFQLLGAWCLLNSLFLILHLSPTALADKGKEK 436

  Fly   420 DSAS----KSASKATKSGSEAGTAPTTPIARVNLFKVQQGFGELNAAIANHSIKLLSELIEDLKV 480
            |..:    :.....||.|  .|:....|      .|..||||.|:..:|||:||||:.|.:||:|
  Rat   437 DPLAALRVRDILSRTKEG--VGSPKLGP------GKGHQGFGVLSVILANHAIKLLTSLFQDLQV 493

  Fly   481 EAACGQSLESTELPEPAQFDILQNYSSLERIVRVLNTATLHQLFTFLATVAYRKACTLKRASAKD 545
            ||.  .....|:.| ||...|:...:|.:|:.|::::..|..|...|.:.:|||||.|:| ..|.
  Rat   494 EAL--HKGWETDGP-PAVLSIMAQSTSTQRVQRLIDSVPLTNLLLTLLSTSYRKACVLQR-QRKG 554

  Fly   546 RTECEPISYSDSTTYFNDSLSCS--DNSEEDDSESYLGHWFKETLSP----------------ET 592
            ....:..:.:||.||:.|..|.:  |:|::||||..||.||:||:||                |:
  Rat   555 SMSSDASASTDSNTYYEDDFSSTEEDSSQDDDSEPILGQWFEETISPSKEKAAPPPPPPPPPLES 619

  Fly   593 HDDNANTSTQERAEQKSALVPKLDEPHEYLDLAADIFCFLDQFLAN-RHAYMQRYVKAGVSDQQM 656
            .....:.|.|...|:.:.|..:.| |..:|.||::|..|:...:.| |:.:::.|:...:|:|.|
  Rat   620 SPRVKSPSKQASGEKGNILASRKD-PELFLGLASNILNFITSSMLNSRNNFIRNYLSVSLSEQHM 683

  Fly   657 LLMANIIKDFDRDVMRNESDQGSGNAPAASAGAGTSAGASTKWQTSMIRFSGAAGRYIHNLISTS 721
            ..:|:|||:.|:|.::..||:.                           |:.|...:.|:|:::.
  Rat   684 ATLASIIKEVDKDGLKGSSDED---------------------------FAAALYHFNHSLVTSD 721

  Fly   722 LLSEQLQSNLLQHLSISPWSTDTNTWPLQVYPSTLSVLVQILLLKPTQEKEAA--------CLSV 778
            |.|..||:.|||.|.::|.|  :..|||.::|..||||.::||:  .|.|..|        ||.|
  Rat   722 LQSPNLQNTLLQQLGVAPLS--SGPWPLYIHPQGLSVLSRLLLI--WQHKAGAQGDPDVPECLKV 782

  Fly   779 WHRLINTL----VEGVCSSNTASDSDYEDLNIEHAQLLLFLFHSLNLMQKKSILLLTAGGVIRCA 839
            |.|.:.|:    ::||..|.|      |||||||.||||.:|||.:...:::||......:    
  Rat   783 WDRFLTTMKQSALQGVVPSET------EDLNIEHLQLLLLIFHSFSEKGRRAILTTLVQSI---- 837

  Fly   840 EVCRGISEDRPVK-NSQIMLLSRLLLFLEYLMKHLYNAPPELLDQVRWNLFS-----VSSMPDTQ 898
               :.:|.:..|: .|..::|:||||..:||:.....||..|.:||:.||.|     .|...|:.
  Rat   838 ---QELSVNMEVQMRSAPLILARLLLIFDYLLHQYSKAPVYLFEQVQHNLLSPPFGWASGSQDSS 899

  Fly   899 KITDLLNCRTKLNSYCRH---DIEENFRKSAGEYGSSIRPTFYSLVMGDPEISYWAQE---FKLD 957
            ..:.    |..:..|  |   ::|||:.|.... .::.:|.||.:      :|..|.|   .:||
  Rat   900 SSSR----RANIPLY--HGFKEVEENWSKHFSS-DAAPQPRFYCV------LSTEASEEDLNRLD 951

  Fly   958 GLAWNFILCTPDKL-KYPLLVDALTDILSI-TDMSMYSKEKDKEASMHNLCAIQYCFTIAWKLNL 1020
            ..|...:.   .|| ||..|..:||.:|:. :.:....::::|..:....||:||.|.|.|:: |
  Rat   952 SEACEVLF---SKLVKYDELYSSLTALLAAGSQLDTVKRKENKNMTALEACALQYYFLILWRI-L 1012

  Fly  1021 G-LPPSTSHVESLKAERSPN------LHSLMWSIRLPLASSHYLVVSSLIKQGMYTQYAETLWTH 1078
            | ||||.:::..| |..||.      ||:|.||.||.::|....:...||:|||..::|.:|...
  Rat  1013 GILPPSKTYMNQL-AMNSPEMSECDILHTLRWSSRLRISSYVSWIKDHLIRQGMRPEHAGSLVEL 1076

  Fly  1079 VGDIGADIKYSLKQTILGVEAFNSQMNG------------NGTPRLSDLILFDSLVAHMQAVAWA 1131
            .....:.:||.::   :..|.|..|::.            :..|.|..:...|:.|:.:|.    
  Rat  1077 AASKCSSVKYDVE---IVEEYFARQISSFCSIDCTTVLQLHEIPSLQSIYTLDAAVSKVQV---- 1134

  Fly  1132 NKEGLKWPRKESEDAAGEQSAGTSLTSSSNDPELYSSNESIDD--QKLKQDDDGKLSSDLQKYNQ 1194
                                                   |:|:  .|:..:.|...||::.| |.
  Rat  1135 ---------------------------------------SLDEHFSKMAAETDPHKSSEITK-NL 1159

  Fly  1195 LVNELMVKLMNSYQLLSVIVRGQMLKQLSSSTPEKALNLIVPIVSDKPAIMLELH--AAFLKL-- 1255
            |...|  :|:::|   :...|..:|:.|:....           ::||: ..:||  ||.|.:  
  Rat  1160 LPATL--QLIDTY---ASFTRAYLLQNLNEEGS-----------TEKPS-QEKLHGFAAVLAIGS 1207

  Fly  1256 ---------------LPNEDKQLIANEWPKCLMVNDF--------AFNGKQHPVEPYILNVIDAH 1297
                           ||: ..|.:...|.. :..|:|        ||.....|.|.||..|..||
  Rat  1208 SRCKANTLGPTLVQNLPS-SVQSVCESWNN-INTNEFPNIGSWRNAFANDTIPSESYISAVQAAH 1270

  Fly  1298 IIELTRGSNYSTLHTLKHCLKSILQLF-ELLLPHRTANAEVETQLKQLLISSMLDMRTDYLQGHS 1361
            :..|. |.:.....:|||.|.|:::|. :|::.....|   ..|:.:.|:..:|:..|:.....|
  Rat  1271 LGTLC-GQSLPLAASLKHALLSLVRLTGDLIVWSDEMN---PAQVIRALLPLLLESSTESAAEIS 1331

  Fly  1362 EHCLREILSGLTQEAQKLLLYEHMVGYCYRMLKEFAADLRQPQSAGPSGGAPLDQDRAMFNESML 1426
            .:.|..||.....:.....:||.::..||.:|         ...|.||.|         .:||:|
  Rat  1332 SNSLERILGPAESDEFLARVYEKLITGCYNIL---------ANHADPSSG---------LDESVL 1378

  Fly  1427 FAVLKTMFKMLEKPVAVQAMRQFFKDQRSGSLTTLLLSFTGTSLPVSYARKMLQFVNRLFQLSLQ 1491
            ...|:.:.|.||...|.:||.:||.|  .|.|..::::.....|...:..::|:|..:||||:.:
  Rat  1379 EECLQYLEKQLESSQARKAMEEFFSD--GGELVQIMMATANEDLSAKFCNRVLKFFTKLFQLTEK 1441

  Fly  1492 A-DSQFQHEDLVECFSELATVDVARLKQWLGHIIYGPNVSTDVSTSEALDTTCRMLTSILQPSSS 1555
            : :....|  |....::||.|:..||:.||                      .||.||       
  Rat  1442 SPNPSLLH--LCGSLAQLACVEPVRLQAWL----------------------TRMTTS------- 1475

  Fly  1556 SSSNAQTPTNMATVSAMPSISDQLDPMEIEYDCGTAAGGGESNPGTGGAAANTSQILSLWQAAQP 1620
                            .|..||||:.:                                      
  Rat  1476 ----------------PPKDSDQLEVI-------------------------------------- 1486

  Fly  1621 NPSEESSQACDHSDSERNGALLLSFVKSLVKDQSKASQ-IAPPLFQALLQLGQTLISPPQEGCDF 1684
                           :.|..||......:|::.|:..: :...|...|..:...::: ..:|..|
  Rat  1487 ---------------QENRQLLQLLTTYIVRENSQVGEGVCAVLLGTLTPMATDMLA-NGDGTGF 1535

  Fly  1685 ADVLQIMITLADASPARGHVALFNTTLLWLELAKLQLPDK-----------HLKHA---ENVSAQ 1735
            .:::.:|.|||.|....||:.|.|..:.||...|..|..|           |.||.   |.....
  Rat  1536 PELMVVMATLASAGQGAGHLQLHNAAVDWLGRCKKYLSQKNVVEKLNANVMHGKHVMVLECTCHI 1600

  Fly  1736 LRYLSELLQSIGFRGSRQHNPPWDDELQTDIDE--------LYDELAEEGEQDSLLDDSDEDTLN 1792
            :.||:::..::.     |.|......|..|.:|        ..:|||.| |:||..:|||||:|.
  Rat  1601 MSYLADVTNALS-----QSNGQGPSHLSVDGEERAIEVDSDWVEELAVE-EEDSQAEDSDEDSLC 1659

  Fly  1793 NKLCTFSQTQKEFMNQHWYHCHTCNMINTVGVCSVCARVCHKGHDVSYAKYGNFFCDCGAKEDGS 1857
            ||||||:.||||||||||||||||.|::.||||:|||:||||.|::||||||:||||||||||||
  Rat  1660 NKLCTFTITQKEFMNQHWYHCHTCKMVDGVGVCTVCAKVCHKDHEISYAKYGSFFCDCGAKEDGS 1724

  Fly  1858 CQALSRRIG----SNEVRDSA-----GIGSYLPSHMSLL-AGKKRSSLPVGQPVLTRKDSLTNER 1912
            |.||.:|..    |:.:::||     .:...|..|.|.. |.|.:.::..|:.....|...::  
  Rat  1725 CLALVKRTPSSGMSSTMKESAFQSEPRVSESLVRHASTSPADKAKVTISDGKVADEEKPKKSS-- 1787

  Fly  1913 IAVLTKLLEPYRETLQHQDQWLLVVRCILEYFDLLLPSINENCMLYSIVGCHKRATAALERLHLL 1977
               |.:.:|..||.||:|..:.. ...:|:..:.|:.:|..|....|.||...||..||..||.:
  Rat  1788 ---LCRTVEGCREELQNQANFSF-APLVLDMLNFLMDAIQTNFQQASAVGSSSRAQQALSELHTV 1848

  Fly  1978 EQSFQVTDQLMFATLGSQEGAFENVRMNYSGDQGQTIKHLLSSGVVRRVAFCCLSSPHGRRQQLA 2042
            ::..::|||||..||||||||||||||||||||||||:.|:|:.|:||||.|.|||||||||.||
  Rat  1849 DKVVEMTDQLMVPTLGSQEGAFENVRMNYSGDQGQTIRQLISAHVLRRVAMCVLSSPHGRRQHLA 1913

  Fly  2043 VSHEKGKVTILQLSALLKQADASKRKLTLTQLSSAPIACTVISLAANPCNEDCLAVCGLKECHIL 2107
            |||||||:|:|||||||||||:||||||||:|:|||:..||:||..|||.||.|||||||:||:|
  Rat  1914 VSHEKGKITVLQLSALLKQADSSKRKLTLTRLASAPVPFTVLSLTGNPCKEDYLAVCGLKDCHVL 1978

  Fly  2108 TFSSSGSTNEHIVVNPQLENGNYIKKAVWLPGSQTLLAVVTSDYVKIYDLAVDTYSPKYYYLVAV 2172
            |||||||.::|:|::|||..||:|.||||||||||.||:||:|:||||||:||..||.:|:|:..
  Rat  1979 TFSSSGSVSDHLVLHPQLATGNFIIKAVWLPGSQTELAIVTADFVKIYDLSVDALSPTFYFLLPS 2043

  Fly  2173 GKIRDCTFVYQDGNYNMLTFASS-GYIYTQQLDQQSLAVHGDFYVTNTLELSHQHIKDIAGHIGG 2236
            .||||.||::.:...|::...|| ||:|||.:::.|.|..|.|||||.||::|:.:||....:.|
  Rat  2044 SKIRDVTFLFNEEGKNIIVIMSSAGYMYTQLMEEASSAQQGPFYVTNVLEINHEDLKDSNSQVAG 2108

  Fly  2237 GGVSIYYSHTLQLLFYSYSCGRSFFSPLTNVSEGVKGIYHLDTNSASKSASKGPLQPLVQWTEVT 2301
            ||||:||||.||:||:|||.|:||.:.::..:..|..::.::..|::..:...|  .|.||:||.
  Rat  2109 GGVSVYYSHVLQMLFFSYSQGKSFAATVSRSTLEVLQLFPINIKSSNGGSKTSP--ALCQWSEVM 2171

  Fly  2302 GHPGLVYASMQTSNNPIILMITPERIYLQEIKAQSAKSRIMDVVGIRHAVAG-VEKTTLLLLCED 2365
            .|||||....||:..|:::|:.|:...:||||...||::|.|:|.|||.... .::||::|||||
  Rat  2172 NHPGLVCCVQQTTGVPLVVMVKPDTFLIQEIKTLPAKAKIQDMVAIRHTACNEQQRTTMILLCED 2236

  Fly  2366 GSLRIFSAQPEYTSFWLSPQVQPFGNQLYSSTLMAKGGGSGSTSKSKSNTASGKMTSRKASQQQK 2430
            |||||:.|..|.||:||.|.:||      ||.:        |..|......:..:|:|.:|    
  Rat  2237 GSLRIYMANVENTSYWLQPSLQP------SSVI--------SIMKPVRKRKTATITARTSS---- 2283

  Fly  2431 QPTAGGQPVFPIDFFEHCNMLADVEFGGNDLLQIYNKQKLKTRLFSTGMFVASTRSNGFTLEVIN 2495
                  |..||||||||...|.|||||||||||:||.|::|.||.||||:||:|:..|||:|:.|
  Rat  2284 ------QVTFPIDFFEHNQQLTDVEFGGNDLLQVYNAQQIKHRLNSTGMYVANTKPGGFTMEISN 2342

  Fly  2496 NDPNVVIVGIRVLIGTQDVQRAPQSVTILGRTIPTPVRRARWFDIPLTREEMLQSDKLLKVVFAK 2560
            |...:|:.|:|:.||||.::|||..:.|.|||:...:.|:||||.|.||||.||:|:.|.:....
  Rat  2343 NSSTMVMTGMRIQIGTQAIERAPSYIEIFGRTMQLNLSRSRWFDFPFTREEALQADRKLNLFIGA 2407

  Fly  2561 APDPEHVTLLDCIEVYGKSKELVGWPDE-SED--------VTVPG-----------SSAPAVSSS 2605
            :.||..||::|.:::|||:||..||||| .||        |..|.           |:|||.:|.
  Rat  2408 SVDPAGVTMIDAVKIYGKTKEQFGWPDEPPEDFPSASVSSVCPPNLNQSNSTGDSDSAAPATTSG 2472

  Fly  2606 QASSANFGEGFNCITQLDRMANHLLEVMDCALHLLGSGVPASMRQKAVKTASALLL-LPTPNPVQ 2669
            ....::..|.   :|:|||:....||.:: :...:|..:.....:.|.:..:.||| ||.|..||
  Rat  2473 TVLESSETES---LTKLDRLVVSSLEALE-SCFAVGPIIEKERNKHAAQELATLLLSLPAPASVQ 2533

  Fly  2670 TQARYVLATLYGTRALYHNYKDGVLLQFVNRELQSMQPKLEKLETLREIDPEAFYRLVLMVRGIA 2734
            .|::.:||:|:.:|:.||::||..||   ::.:|.:....::   .:::|||.|.|||:..|.||
  Rat  2534 QQSKSLLASLHSSRSAYHSHKDQALL---SKAVQCLNTSSKE---GKDLDPEVFQRLVITARSIA 2592

  Fly  2735 NARPQSLAKI----------------CVENNYDIVPTLMGIVLELHKVTPTLD------------ 2771
            ..||.:|...                |...|..||..|:|..||    ||:.:            
  Rat  2593 VTRPNNLVHFTESKLPQMETDCFSPRCACWNLGIVGILIGAPLE----TPSAEGAEEGKEPQKQV 2653

  Fly  2772 ---------------------EPVNIVKRGLCQP-----ETIVHCLVEIMYGFALADPGQVGRMT 2810
                                 :|.|......|.|     |..|:.||:|::|:...:...:...:
  Rat  2654 EGDGCSFITQLVNHFWKLHASKPKNAFLAPACLPGLTHIEATVNALVDIIHGYCTCELDCINTAS 2718

  Fly  2811 KYFIDLLKHDASVISHSAKEALILLLSPRMKRRKVAIVTPPACSTP---------TPSTSTMQAL 2866
            |.::.:|......:|.|.|:|||.:|.||.|||.|.:.:.|..:||         ..:...||:.
  Rat  2719 KIYMQMLLCPDPAVSFSCKQALIRVLRPRNKRRHVTLPSSPRSNTPMGDKDDDDDDDADEKMQSS 2783

  Fly  2867 --------------QAAASSAASDIIEEAAGVVVDGSVGGGGLPEPNADAEGAAVGVGGVGQQQM 2917
                          |:.......:::.|:..:....:|..|. |.|                   
  Rat  2784 GIPDGGHIRQESQEQSEVDHGDFEMVSESMVLETAENVNNGN-PSP------------------- 2828

  Fly  2918 LNLEAFMGG--GFPRLLGLPEDADDEAIMDIAIALSLQ--QHGGDANA--LQSLQQGLANLQGIR 2976
              |||.:.|  |||.:|.:|.|||||.::::|||||||  |.|..::|  ||||     .|.|..
  Rat  2829 --LEALLAGAEGFPPMLDIPPDADDETMVELAIALSLQQDQQGSSSSALGLQSL-----GLSGQA 2886

  Fly  2977 QATAMAAAVNAAANVSLGGSDDDEGSNVATDGSTLRTSPAEPAGSGGSESGGSGVESIGG---TS 3038
            .:::...|...:...:...:.|||||..||||||||||||:..||.|||||||.|:|:.|   .|
  Rat  2887 PSSSSLDAGTLSDTTASAPASDDEGSTAATDGSTLRTSPADHGGSVGSESGGSAVDSVAGEHSVS 2951

  Fly  3039 ARSSNFGDHANASPPRQGSTKDDQEQPGPSGVAGSGGVAVLSAMSSSEDNEANEDD--------- 3094
            .|||.:||......|           .||..|:.|.|  .:|..:..::.:.:|.:         
  Rat  2952 GRSSAYGDATAEGHP-----------AGPGSVSSSTG--AISTTTGHQEGDGSEGEGEGEAEGDV 3003

  Fly  3095 -KLSKLHDLRIAVLESIIQHLGTFDLCNGLQAIPLIQVILMLTTDLNGNNERDQQVLHDLLTALV 3158
             ..::||.:|:.:||.::|.|.......|::|||.:||||||||||:|.:|:|:..|.:||..|:
  Rat  3004 HTSNRLHMVRLMLLERLLQTLPQLRNVGGVRAIPYMQVILMLTTDLDGEDEKDKGALDNLLAQLI 3068

  Fly  3159 DYVEIGKRGAAARMETKCPGNEVRLALLSLFGVLMGKTKSKQTGTTSPPHQFKDNSSFVASTTAN 3223
            ..:.:.|:..:.:.| :...|||.|.::.|..|.|.:|||   |:.|   ...::||.::|.||.
  Rat  3069 AELGMDKKDVSKKNE-RSALNEVHLVVMRLLSVFMSRTKS---GSKS---SICESSSLISSATAA 3126

  Fly  3224 VLSKSGAFVYALEALNTLLVHWKNVLGDPYAAGGGLASQSAQASGGASGPGVQLLKPIKHGPKPD 3288
            .|..|||..|.|..|.:||.:||             ..||.:.....|    |||||......||
  Rat  3127 ALLSSGAVDYCLHVLKSLLEYWK-------------GQQSEEEPVTTS----QLLKPHTTSSPPD 3174

  Fly  3289 ISILIPHNYLKNY-PDIFESYDGLLTEIIVRLPYQILRLSSAHPDNYDSGFCEAMTFTLCEYMML 3352
            :|......|:|.: .|:||:|..||||:::||||||.:::..........|..:..:.|.||:|:
  Rat  3175 MSPFFLRQYVKGHAADVFEAYTQLLTEMVLRLPYQIKKIADTSSRIPPPVFDHSWFYFLSEYLMI 3239

  Fly  3353 NLNTLLRRQVRKLLMYICGSKEKFRMYRDGHSLDAHFRVVKRV---------CNIVSSKTGAPYN 3408
            .....:||||||||::|||||||:|..||.|:||:|.|.:|::         .::|::.:|:   
  Rat  3240 QQTPFVRRQVRKLLLFICGSKEKYRQLRDLHTLDSHVRGIKKLLEEQGIFLRASVVTASSGS--- 3301

  Fly  3409 ANPPMLSYDALVELTEHLRTCQEISQMRTGNWQKFCVVHEDALAMLMEIACYQLDDGVSPIIIQL 3473
                .|.||.|:.|.|||:.|.||:..||.||||||:..:..|..|:::: :.:|:||||:::||
  Rat  3302 ----ALQYDTLISLMEHLKACAEIAAQRTINWQKFCIKDDSVLYFLLQVS-FLVDEGVSPVLLQL 3361

  Fly  3474 LQAAVC-------------------NLPPPSGSKQAQPQPSTSSASGKLRTDREKSEDTDAYYSK 3519
            |..|:|                   :.||.:.|.|...|..:|:...| :.::||.::.::..|:
  Rat  3362 LSCALCGSKVLAALAASTGSSSVASSAPPAASSGQTTTQSKSSTKKSK-KEEKEKEKEGESSGSQ 3425

  Fly  3520 FDPAQCGTFVHQIFRYACDALIIRFVRIFLLENNITQLRWQAHSFMTGLFEHANERQREKLLNIF 3584
            .|.. |...|:|:.|:|....:|:|:|.||||:|.:.:|||||.....::.::|:.|:|.||::.
  Rat  3426 EDQL-CTALVNQLNRFADKETLIQFLRCFLLESNSSSVRWQAHCLTLHIYRNSNKAQQELLLDLM 3489

  Fly  3585 WNLWPLVPTYGRRTAQFVDLLGYLTLSTRSITERLPEFVSRAVDVLRQQNELLCKHPNAPIYTTL 3649
            |::||.:|.|||:.|||||||||.:|.|....::|.|:..:||::||.||.:|..|||:.||.||
  Rat  3490 WSIWPELPAYGRKAAQFVDLLGYFSLKTAQTEKKLKEYSQKAVEILRTQNHILTNHPNSNIYNTL 3554

  Fly  3650 ESILQVNGYYLESEPCLVCNNPEVPMANIKLPSVKSDSKYTTTTMIYKLVQCHTISKLIVRIADL 3714
            ..:::.:||||||:|||||||||||...|||.|:|.|::||||..:.||:..|||||:.|:|.||
  Rat  3555 SGLVEFDGYYLESDPCLVCNNPEVPFCYIKLSSIKVDTRYTTTQQVVKLIGSHTISKVTVKIGDL 3619

  Fly  3715 KRTKMVRTINVYYNNRSVQAVVELKNRPALWHKARSVSLQSAQTELKIDFPLPITACNLMIEFAD 3779
            ||||||||||:|||||:|||:|||||:||.||||:.|.|...|||:|||.||||.|.||||||||
  Rat  3620 KRTKMVRTINLYYNNRTVQAIVELKNKPARWHKAKKVQLTPGQTEVKIDLPLPIVASNLMIEFAD 3684

  Fly  3780 FFETVSGSSENLQCPRCSAAVPAYPGVCGNCGENVFQCHKCRAINYDEKDPFLCHSCGFCKYAKF 3844
            |:|....|:|.||||||||:|||.|||||||||||:||||||:|||||||||||::|||||||:|
  Rat  3685 FYENYQASTETLQCPRCSASVPANPGVCGNCGENVYQCHKCRSINYDEKDPFLCNACGFCKYARF 3749

  Fly  3845 DFSMYARVCCAVDPIESAEDRVKTVSLIHSSLERADRNYRQLLTNKQMLELLIQKVAEHRSSDRM 3909
            ||.:||:.||||||||:.|||.|.||.|::.|::|||.|.||:.::..||.|:.||.| .:.::.
  Rat  3750 DFMLYAKPCCAVDPIENEEDRKKAVSNINTLLDKADRVYHQLMGHRPQLENLLCKVNE-AAPEKP 3813

  Fly  3910 VEDN--MASVHSTS-QVNKIIQLLAQKYCVESRTSFEELSKIVQKVKACRSELVAYDRQQQD--- 3968
            .||:  ...:.||| .||:.|..|||:||.:.:.||:|||||:|||.|.|.||:.||.||::   
  Rat  3814 QEDSGTAGGISSTSASVNRYILQLAQEYCGDCKNSFDELSKIIQKVFASRKELLEYDLQQREAAT 3878

  Fly  3969 -------QPPVNPG-----STTGAENPTTNRCYGCALASTEQCLTLLRAMAYNYDCRVCLYSQGL 4021
                   ||.....     |..|..:.::.:|||||.|.||.|:|||||:|.|...|..|.||||
  Rat  3879 KSSRTSVQPTFTASQYRALSVLGCGHTSSTKCYGCASAVTEHCITLLRALATNPALRHILVSQGL 3943

  Fly  4022 VSELAEHNLRRGTPLIQEEVRNLLVVLTKDNAEACMHLLQLVTTRVKNALMGSIPLISLEAAVHQ 4086
            :.||.::|||||...|:||||.|:.:||:||.||...:..|:..:|..||.|......|.:::..
  Rat  3944 IRELFDYNLRRGAAAIREEVRQLMCLLTRDNPEATQQMNDLIIGKVSTALKGHWANPDLASSLQY 4008

  Fly  4087 EMTLLEVLLGQDDICWEYKLKVIFELFISNCRLPRGPVTA--VLHPCLRIMQNLICPVLPGSKPN 4149
            ||.||...:.::|.|||.:|:....||:....: :.||..  :...||||:|.||.|..|.||.|
  Rat  4009 EMLLLTDSISKEDSCWELRLRCALSLFLMAVNI-KTPVVVENITLMCLRILQKLIKPPAPTSKKN 4072

  Fly  4150 QKVATTDLCSMKMFEGNTVDYRA--WLNSDRNHEYAAWSKRMPSNNQAKLKNAKDQNVAASGGSD 4212
            :.|....|.::|.: .|.:..:|  ||..|....|.||.|.:|..             ...|...
  Rat  4073 KDVPVEALTTVKPY-CNEIHAQAQLWLKRDPKASYEAWKKCLPIR-------------GVDGNGK 4123

  Fly  4213 APPKSRREVRVAFLSEKYGKRWRERVLDKQRVIKPL---VFNAKWIQPLLFNANSRFGRQLACSL 4274
            :|.||  |:...:|:|||..||::.:..:.:...||   :.:..|::.:||...::..||.||::
  Rat  4124 SPSKS--ELHRLYLTEKYVWRWKQFLSRRGKRTTPLDLKLGHNNWLRQVLFTPATQAARQAACTI 4186

  Fly  4275 LSSLSRTNERRQQALNMLTSFLKHVGEAGEASAEYLMLYKNMATEQPWLQYLVLKGVLSQISQLL 4339
            :.:|:....|:||.|::|||:|..:..|||.:||||.||:.:.....|..||..:|||..:..|:
  Rat  4187 VEALATVPSRKQQVLDLLTSYLDELSVAGECAAEYLALYQKLIASCHWKVYLAARGVLPYVGNLI 4251

  Fly  4340 AIEISKVHRMEEYSLSSDLSLGYALRQYVELLWLLLECPNIRRTYKTRMLGPVLESYLALRSLVV 4404
            ..||:::..:||.:||:||..||||:....||...:|..:|:|.:|:|::|.||..||.||.||:
  Rat  4252 TKEIARLLALEEATLSTDLQQGYALKSLTGLLSSFVEVESIKRHFKSRLVGTVLNGYLCLRKLVL 4316

  Fly  4405 QRTRLIDDAQEKLLEMLEDMTSGTEEETRAFMEILIDTVEKTRMNDIKTPVFVFERLYSIIHPEE 4469
            |||:|||:.|:.|||||||||:|||.||:|||.:.|:|.::..::|.:||||:||||.|||:|||
  Rat  4317 QRTKLIDETQDMLLEMLEDMTTGTESETKAFMAVCIETAKRYNLDDYRTPVFIFERLCSIIYPEE 4381

  Fly  4470 HDESEFYMTLEKDPQQEDFLQGRMLGNPYPSSEMGLGPLMRDVKNKICTDCELIALLEDDNGMEL 4534
            ::.:||::||||||||||||||||.||||.|:|.|:||||||:|||||.||:|:||||||:||||
  Rat  4382 NEVTEFFVTLEKDPQQEDFLQGRMPGNPYSSNEPGIGPLMRDIKNKICQDCDLVALLEDDSGMEL 4446

  Fly  4535 LVNNKIISLDLPVKDVYKKVWLA--EGGDRDAMRIVYRMRGLLGDATEEFVETLNNKSQEQVDTE 4597
            |||||||||||||.:||||||..  ||   :.||||||||||||||||||:|:|::.:.|:.|.|
  Rat  4447 LVNNKIISLDLPVAEVYKKVWCTTNEG---EPMRIVYRMRGLLGDATEEFIESLDSTTDEEEDEE 4508

  Fly  4598 QLYRMANVLADCNGLRVMLERIGSLQRISRNRELIQVLLKLFLICVKVRRCQEVLCQPEIGAINT 4662
            ::||||.|:|.|.||:.||.|:..::...:.|.|:.||||||..||||:..::.|.:.|:..:|.
  Rat  4509 EVYRMAGVMAQCGGLQCMLNRLAGVKDFKQGRHLLTVLLKLFSYCVKVKVNRQQLVKLEMNTLNV 4573

  Fly  4663 LLKVLQMCLQSENDSIQS---AVTEQLLEIMETILSKAASDTLDSFLQFSLTFGGPEYVSALISC 4724
            :|..|.:.|.:|.:|..|   ||.||:|.|||.||.::.::.|.......|..|..:.:..|:..
  Rat  4574 MLGTLNLALVAEQESKDSGGAAVAEQVLSIMEIILDESNAEPLSEDKGNLLLTGDKDQLVMLLDQ 4638

  Fly  4725 TDCPNVRNNPSVLRHLIRVLAALVYGNEVKMALLCEHFKDTLNFNRFDNERTPEEEFKLELFCVL 4789
            .:...||:|||||:.|:|::..|.:|...||.:|.|.||...:|:::|.:.:.:::..|:.||.:
  Rat  4639 INSTFVRSNPSVLQGLLRIIPYLSFGEVEKMQILVERFKPYCSFDKYDEDHSGDDKVFLDCFCKI 4703

  Fly  4790 TNQIEHNCIGGTLKDYIVSLGIVERSLAYITEHAPCVKPTLLRTDSDELKEFISRPSLKYILRFL 4854
            ...|::|..|..|||.|:..||.:.:|.|:.:|.|..|    ..|:|..|:|:|||:|.:|||.|
  Rat  4704 AAGIKNNSNGHQLKDLILQKGITQSALDYMKKHIPSAK----NLDADIWKKFLSRPALPFILRLL 4764

  Fly  4855 TGLSNHHEATQVAISKDIIPIIHRLEQVSSDEHVGSLAENLLEALSTDSATAARVQQVRDFTRAE 4919
            .||:..|.||||.|..|.|..:|:||||||||.:|:|||||||||........::...|..||||
  Rat  4765 RGLAMQHPATQVLIGTDSITSLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAE 4829

  Fly  4920 KKRLAMATREKQLDALGMRTNEKGQVTAKGSILQKIEKLRDETGLTCFICREGYACQPDKVLGIY 4984
            |||:|||.|:|.|..|||.|||||||..|.::|:::|:|.:|.||||.||||||..||.||||||
  Rat  4830 KKRMAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIY 4894

  Fly  4985 TFTKRCNVEEFELKSRKTIGYTTVTHFNVVHVDCHTSAI------------RLTRGRDEWERASL 5037
            |||||..:||.|.|.||..||:||:|||:||.|||.:|:            ||.|||:|||.|:|
  Rat  4895 TFTKRVALEEMENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVSCLSLLSSLSPSRLARGREEWESAAL 4959

  Fly  5038 QNANTRCNGLLPLWGPAVGEAAFSACMTRHSSYMQESTQRCDISYTSSVHDLKLLLVRFAWERSF 5102
            |||||:||||||:|||.|.|:||:.|:.||::|:||.|.:.:.:|..::||:|||.:|||.|:||
  Rat  4960 QNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFATCLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDIKLLFLRFAMEQSF 5024

  Fly  5103 HDDAGGGGPQSNMHFVPYLLFYSVYLLLSSRSAARDSKTLLTYLQAPPSEKWLECGYEVDGPLFM 5167
            ..|.||||.:||:|.:||::...:|:|.::|:.:|:.|.|..:|: .|.|||.|..::||||.:.
  Rat  5025 SADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTTRATSREEKNLQGFLE-QPREKWTESAFDVDGPHYF 5088

  Fly  5168 ATISLSLHSRELWNKHKLAHLKRMIAVAQGRHVSPAVLCKALLAPADRQVKDYTVYKPFLMMWAL 5232
            ..::|.:...|.|...::..|:|::..:..|.|:|....:.    .|:.||||:.|:..|:.|||
  Rat  5089 TILALHVLPPEQWKATRVEILRRLLVASHARAVAPGGATRL----TDKAVKDYSAYRSSLLFWAL 5149

  Fly  5233 VDLIYDNLFKTVSTPKEE-DWPISLFDYLRKNDEALLKSTDSILQTLTEEFLPCTSFVEFCDVAG 5296
            ||||| |:||.|.|...| .|..||.:|:|.||..:.::.|..|:|..|||:|..:|.||.|.||
  Rat  5150 VDLIY-NMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPIYEAADKALKTFQEEFMPVETFSEFLDAAG 5213

  Fly  5297 LLHLIEHPDNFIEEILAALP 5316
            ||..|..|::|::::|.::|
  Rat  5214 LLSEITDPESFLKDLLNSVP 5233

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
poeNP_476986.1 E3_UBR4_N 51..1726 CDD:466074 465/1819 (26%)
UBR-box_UBR4 1794..1864 CDD:439078 55/69 (80%)
DZR 3793..3837 CDD:432773 37/43 (86%)
E3_UbLigase_R4 4493..5296 CDD:433459 391/820 (48%)
Ubr4XP_063143863.1 None

Return to query results.
Submit another query.