DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH6 and Mhc

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002462.2 Gene:MYH6 / 4624 HGNCID:7576 Length:1939 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1917 Identity:1090/1917 - (56%)
Similarity:1444/1917 - (75%) Gaps:12/1917 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    15 YLRKSEKERLEAQTRPFDIRTECFVPDDKEEFVKAKILSREGGKVIAETENGKTVTVKEDQVLQQ 79
            ||..|.::|...|::|:|.:..|::||:||.::..:|.:.:|..|....:.|:|..:|:|.:.|.
  Fly    16 YLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRDLKKDLLQQV 80

Human    80 NPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLFNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNAEVVAAYRG 144
            ||||::|.|||:.||:|::.:||.||::||...:||||||||||.:||||..|||.......|||
  Fly    81 NPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAKMYRG 145

Human   145 KKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFASIAAIGDRGKKDN 209
            |:|:|.|||||:|||.||..|||:..|||:|||||||||||.|||:||.|||:   :|...|.|.
  Fly   146 KRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFAT---VGASKKTDE 207

Human   210 ANANKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRV 274
            |..:||:||||::|.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||:||
  Fly   208 AAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARV 272

Human   275 IFQLKAERNYHIFYQILSNKKPELLDMLLVTNNPYDYAFVSQGEVSVASIDDSEELMATDSAFDV 339
            |.|...||:|||||||:|...|.:.|:.|:|:|.|||..||||:|:||||||:||...||.|||:
  Fly   273 ISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHIVSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDI 337

Human   340 LGFTSEEKAGVYKLTGAIMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEDADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPR 404
            ||||.:||..||::|.|:||.|.|||||:.||||||.||.|:..:.:.|.|.::|:|.|.|..||
  Fly   338 LGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPR 402

Human   405 VKVGNEYVTKGQSVQQVYYSIGALAKAVYEKMFNWMVTRINATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIF 469
            :|||||:||:|::||||..|||||.|.|::::|.|:|.:.|.||:|:|.||:|||||||||||||
  Fly   403 IKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIF 467

Human   470 DFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQACIDLIEKPMGIMSI 534
            ::|.|||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||.|||||||||||:||
  Fly   468 EYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGIEWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPMGILSI 532

Human   535 LEEECMFPKATDMTFKAKLYDNHLGKSNNFQKPRNIK-GKQEAHFSLIHYAGTVDYNILGWLEKN 598
            ||||.|||||||.||..||.:.|||||..||||:..| |:|.|||::.||||.|.|||.||||||
  Fly   533 LEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKN 597

Human   599 KDPLNETVVALYQKSSLKLMATLFSSYATADTGDSGKSKGGK-KKGSSFQTVSALHRENLNKLMT 662
            |||||:|||..::||..||:..:|:.:| ..:|...::|||: |||..|.|||:.::|.||.|||
  Fly   598 KDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHA-GQSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMT 661

Human   663 NLRTTHPHFVRCIIPNERKAPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRIL 727
            .||:|.|||||||||||.|.|||:|..||||||.||||||||||||||||||::|.||:.||:|:
  Fly   662 TLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIM 726

Human   728 NPVAIPEGQFID-SRKGTEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRMQ 791
            .|..:   |.:: .:|.||.::..:|:..:||:.|:|||||:||:||.:||.|||||.:|::.||
  Fly   727 CPKLL---QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQYRLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQ 788

Human   792 AQARGQLMRIEFKKIVERRDALLVIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMATMKE 856
            |.|||.|.|..|||:.|:|.||.|:|.|:|.::.::.|||.||:.|:||||..:..|.|:|.::|
  Fly   789 AWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKYLQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEIARLEE 853

Human   857 EFGRIKETLEKSEAR-RKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQAEQDNLNDAEERCDQLIKNKIQLEAK 920
            :..:.:| |..:|.: |||||.....||.||..|...:..|:..|.|.:||..:|...|..||.:
  Fly   854 KAKKAEE-LHAAEVKVRKELEALNAKLLAEKTALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLENQ 917

Human   921 VKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMA 985
            ::::.|||..||:...:|..:|:|.:.|.|.|||||:||||.:.|.|::|...:::::||.:|:|
  Fly   918 LRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISGLKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEIA 982

Human   986 GLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQVEEDKVNSLSKSKVKLEQQVDDLEGSLEQEKKVRMDL 1050
            ..||:|.||.||||...|.:|:..::||..|||:|.|:|.|.||||.:|:||.|||:|||||.|:
  Fly   983 HQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAEDKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGDV 1047

Human  1051 ERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKLQLEEKLKKKEFDINQQNSKIEDEQVLALQLQKKLKENQA 1115
            |::|||:|||||||||::.|||.:|.:||:.:::|:.:::...:|:|||||:.|:.|:::||.||
  Fly  1048 EKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQTIQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQA 1112

Human  1116 RIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNKKREAEFQKMRRDL 1180
            ||||||||:||||.||||.||.|:||:|||||:.|||||||||||.|||:|||||||..|:||||
  Fly  1113 RIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELEELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRDL 1177

Human  1181 EEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDDVTSNMEQIIKAKA 1245
            |||.:|||:|.|.|||||.|:|||:.||:|.|.::|.|.||||:|:..:|:|:.:.::.|...||
  Fly  1178 EEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQLNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEKA 1242

Human  1246 NLEKVSRTLEDQANEYRVKLEEAQRSLNDFTTQRAKLQTENGELARQLEEKEALISQLTRGKLSY 1310
            ..||:::.|:...||.:.||:|..|:||||...:.||..||.:|.|||||.|:.:|||::.|:|.
  Fly  1243 AQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFDASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKISL 1307

Human  1311 TQQMEDLKRQLEEEGKAKNALAHALQSARHDCDLLREQYEEETEAKAELQRVLSKANSEVAQWRT 1375
            |.|:||.||..:||.:.:..|....::..||.|.||||.|||.|.||:|||.|||||:|...||:
  Fly  1308 TTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHDLDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWRS 1372

Human  1376 KYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAA 1440
            |||:|.:.|:|||||||:||..||.:|||.:|::|.||..|||||.||..|:|||.::|:|:||.
  Fly  1373 KYESDGVARSEELEEAKRKLQARLAEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANAI 1437

Human  1441 AAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEESLEHLETFKRENK 1505
            |.|.:|||:.||||:.|||.|.::..:||::||||.|:.|||||:||.||||..|.||..:||||
  Fly  1438 ANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKVDDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENK 1502

Human  1506 NLQEEISDLTEQLGEGGKNVHELEKVRKQLEVEKLELQSALEEAEASLEHEEGKILRAQLEFNQI 1570
            ||.:|:.||.:|:||||:|:||:||.||:||.||.|||:|||||||:||.||.|:||||||.:|:
  Fly  1503 NLADEVKDLLDQIGEGGRNIHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQV 1567

Human  1571 KAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHQRVVDSLQTSLDAETRSRNEVLRVKKKMEGDLNEMEIQLSHAN 1635
            :.||:|::.||:||.|..::||||.:||:|.||:||.:.:.|.||:|||:|.|:||:||.|.|||
  Fly  1568 RQEIDRRIQEKEEEFENTRKNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHAN 1632

Human  1636 RMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVVEQTERS 1700
            :..|||||.:|..|..|||.|..|::..||.||.:|.:.|.|||.|.||.||||.|.::||.:|.
  Fly  1633 KANAEAQKNIKRYQQQLKDIQTALEEEQRARDDAREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRG 1697

Human  1701 RKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMESDLTQLQSEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAA 1765
            |:.|||||.:..|::..:.:||.|:...|:|:||:|..|.|:::|.:.|.:|:|||||||:.|||
  Fly  1698 RRQAEQELADAHEQLNEVSAQNASISAAKRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDAA 1762

Human  1766 MMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELEGELEA 1830
            .:|:||:.|||.:...|:::|.:||.||:||.||||||..|||||||.:||||.||||||.||:.
  Fly  1763 RLADELRAEQDHAQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELDG 1827

Human  1831 EQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDKKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTNL 1895
            ||:|:|::.|.:||||||:|||::|:|||:||..|:||||||||.|:|.||||.|||||.|..||
  Fly  1828 EQRRHADAQKNLRKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALNL 1892

Human  1896 SKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSR 1927
            :||||.|.||:|||||||:||..::|.|||.|
  Fly  1893 AKFRKAQQELEEAEERADLAEQAISKFRAKGR 1924

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH6NP_002462.2 Myosin_N 32..76 CDD:460670 13/43 (30%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 431/671 (64%)
Actin-binding 657..679 17/21 (81%)
Actin-binding 759..773 8/13 (62%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 583/1077 (54%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1826..1849 12/22 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1909..1939 12/19 (63%)
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 12/41 (29%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 431/671 (64%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 583/1080 (54%)

Return to query results.
Submit another query.