DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH6 and smyhc3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002462.2 Gene:MYH6 / 4624 HGNCID:7576 Length:1939 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001129995.1 Gene:smyhc3 / 100001337 ZFINID:ZDB-GENE-080930-1 Length:1938 Species:Danio rerio


Alignment Length:1942 Identity:1662/1942 - (85%)
Similarity:1799/1942 - (92%) Gaps:7/1942 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MTDAQMADFGAAAQYLRKSEKERLEAQTRPFDIRTECFVPDDKEEFVKAKILSREGGKVIAETEN 65
            |.||.||:|||||.|||||::|||||||||||::.||||||..||::||.::||:|.|...||..
Zfish     1 MGDAVMAEFGAAAPYLRKSDRERLEAQTRPFDMKKECFVPDADEEYLKATVISRDGDKATCETSK 65

Human    66 GKTVTVKEDQVLQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLFNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKW 130
            |.||||||..|..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 GTTVTVKECDVHPQNPPKFDKIEDMAMFTFLHEPAVLFNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKW 130

Human   131 LPVYNAEVVAAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYF 195
            |||||.|||.||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 LPVYNQEVVVAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLSDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYF 195

Human   196 ASIAAIGDRGKKDNANANKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLA 260
            |||||   ...|......||||||||||.||||||||||||:||||||||||||||||.|:||||
Zfish   196 ASIAA---SPTKKETTEKKGTLEDQIIQCNPALEAFGNAKTIRNDNSSRFGKFIRIHFAASGKLA 257

Human   261 SADIETYLLEKSRVIFQLKAERNYHIFYQILSNKKPELLDMLLVTNNPYDYAFVSQGEVSVASID 325
            ||||||||||||||.|||||||:|||||||||.||||||:|||:|.|||||||:||||..||||:
Zfish   258 SADIETYLLEKSRVTFQLKAERDYHIFYQILSQKKPELLEMLLITANPYDYAFISQGETQVASIN 322

Human   326 DSEELMATDSAFDVLGFTSEEKAGVYKLTGAIMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEDADKSAYLMG 390
            |::||||||.||||||||.|||..:|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Zfish   323 DADELMATDEAFDVLGFTQEEKNSIYKLTGAIMHYGNMKFKQKQREEQAEADGTEDADKSAYLMG 387

Human   391 LNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQSVQQVYYSIGALAKAVYEKMFNWMVTRINATLETKQPRQ 455
            ||||||:|.|||||||||||:|||||:||||||:||||:|:||||||.|||.|||.:|:||||||
Zfish   388 LNSADLIKALCHPRVKVGNEWVTKGQNVQQVYYAIGALSKSVYEKMFLWMVVRINQSLDTKQPRQ 452

Human   456 YFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQA 520
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   453 YFIGVLDIAGFEIFDFNTFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQA 517

Human   521 CIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLYDNHLGKSNNFQKPRNIKGKQEAHFSLIHYAG 585
            ||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||.:|||.||||||:||||
Zfish   518 CIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKASDATFKAKLYDNHLGKSNNFQKPRIVKGKPEAHFSLVHYAG 582

Human   586 TVDYNILGWLEKNKDPLNETVVALYQKSSLKLMATLFSSYATADT---GDSGKSKGGKKKGSSFQ 647
            ||||||..||.|||||||||||.|||||::|:::.||::||.|::   |..||:|..||||||||
Zfish   583 TVDYNINNWLVKNKDPLNETVVGLYQKSTMKMLSILFANYAGAESAAEGGGGKTKEKKKKGSSFQ 647

Human   648 TVSALHRENLNKLMTNLRTTHPHFVRCIIPNERKAPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFP 712
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||.|.||.|:|||||||||||||||||||||||||
Zfish   648 TVSALHRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMENPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFP 712

Human   713 NRILYGDFRQRYRILNPVAIPEGQFIDSRKGTEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEE 777
            ||||||||:||||||||.|||:|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||
Zfish   713 NRILYGDFKQRYRILNPAAIPDGQFIDSRKGAEKLLGSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEE 777

Human   778 MRDERLSRIITRMQAQARGQLMRIEFKKIVERRDALLVIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLL 842
            |||:||:.|||.:||:|||.|.|:||:|||:|||||||||||:||||||||||||||||||||||
Zfish   778 MRDDRLALIITNIQARARGLLSRVEFQKIVDRRDALLVIQWNVRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLL 842

Human   843 KSAETEKEMATMKEEFGRIKETLEKSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQAEQDNLNDAEERC 907
            :|||.|||||.|||||.::||...|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Zfish   843 RSAEAEKEMANMKEEFLKLKEAYAKSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLAVQTEQDNLCDAEERC 907

Human   908 DQLIKNKIQLEAKVKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHA 972
            :.|||||||||||.||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   908 EGLIKNKIQLEAKAKELTERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHA 972

Human   973 TENKVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQVEEDKVNSLSKSKVKLEQQVDDLE 1037
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||:|:|:|.||||||||||
Zfish   973 TENKVKNLTEEMAALDEIIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQSEEDKVNTLTKAKAKLEQQVDDLE 1037

Human  1038 GSLEQEKKVRMDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKLQLEEKLKKKEFDINQQNSKIEDEQVL 1102
            ||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||.||||:||||:|:|:|.:|:|||||.:
Zfish  1038 GSLEQEKKLRMDLERAKRKLEGDLKLTQESVMDLENDKQQLEERLKKKDFEISQLSSRIEDEQAM 1102

Human  1103 ALQLQKKLKENQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNK 1167
            |.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|:||||||||||||||||||||:.||||||
Zfish  1103 AAQLQKKLKELQARIEELEEELEAERAARAKVEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATAAQIEMNK 1167

Human  1168 KREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDD 1232
            ||||||||:|||||||||||||||:.|||||||||::|||||||||||||||||||||.:|||||
Zfish  1168 KREAEFQKLRRDLEEATLQHEATASTLRKKHADSVSDLGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELRLELDD 1232

Human  1233 VTSNMEQIIKAKANLEKVSRTLEDQANEYRVKLEEAQRSLNDFTTQRAKLQTENGELARQLEEKE 1297
            |.||||||.||||||||:.||||||.:|||.|.||.|||:||||.::||||||||||:||||||:
Zfish  1233 VVSNMEQIAKAKANLEKMCRTLEDQMSEYRTKYEEGQRSINDFTMKKAKLQTENGELSRQLEEKD 1297

Human  1298 ALISQLTRGKLSYTQQMEDLKRQLEEEGKAKNALAHALQSARHDCDLLREQYEEETEAKAELQRV 1362
            :|:|||||||.|||||:||||||||||.|||||||||:||||||.:|||||||||.||||||||.
Zfish  1298 SLVSQLTRGKQSYTQQIEDLKRQLEEEVKAKNALAHAVQSARHDAELLREQYEEEQEAKAELQRS 1362

Human  1363 LSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEI 1427
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1363 LSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEDAKKKLAQRLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEI 1427

Human  1428 EDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEE 1492
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Zfish  1428 EDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKVLAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNSYEE 1492

Human  1493 SLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGEGGKNVHELEKVRKQLEVEKLELQSALEEAEASLEHEE 1557
            ||:|||:.|||||||||||:|||||:||.|||:|||||:|||||.||.|:|:||||||.||||||
Zfish  1493 SLDHLESMKRENKNLQEEIADLTEQIGESGKNIHELEKMRKQLEQEKAEIQTALEEAEGSLEHEE 1557

Human  1558 GKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHQRVVDSLQTSLDAETRSRNEVLRVKKKMEG 1622
            ||||||||||||:||:|||||:||||||||||||.||::|:||:||::|||||||.||:||||||
Zfish  1558 GKILRAQLEFNQVKADIERKLSEKDEEMEQAKRNQQRMIDTLQSSLESETRSRNEALRLKKKMEG 1622

Human  1623 DLNEMEIQLSHANRMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAEL 1687
            ||||||||||.|||.|:|||||:|||...|||.|:|||||:|.||||||||||||||||||||||
Zfish  1623 DLNEMEIQLSQANRQASEAQKQLKSLHGHLKDAQLQLDDALRGNDDLKENIAIVERRNNLLQAEL 1687

Human  1688 EELRAVVEQTERSRKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMESDLTQLQSEVEEAVQECRN 1752
            :|||::||||||.||||||||::.||||||||||||||:|||||:|.|.||||:|||||||||||
Zfish  1688 DELRSLVEQTERGRKLAEQELMDVSERVQLLHSQNTSLLNQKKKLEGDNTQLQTEVEEAVQECRN 1752

Human  1753 AEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKL 1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||
Zfish  1753 AEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIAMKGGKKQVQKL 1817

Human  1818 EARVRELEGELEAEQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDKKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKR 1882
            ||||||||.|:|.||::.::||||:||.||||||||||||||:|||.||||||||||||||:|||
Zfish  1818 EARVRELESEVEMEQRKASDSVKGVRKYERRIKELTYQTEEDRKNLARLQDLVDKLQLKVKSYKR 1882

Human  1883 QAEEAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRDIGAKQKMHDEE 1939
            .|||||||||:||.||||:|||||||||||||||||||||||||||.|:| |.||||
Zfish  1883 TAEEAEEQANSNLGKFRKLQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRDTGSK-KGHDEE 1938

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH6NP_002462.2 Myosin_N 32..76 CDD:460670 24/43 (56%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 582/671 (87%)
Actin-binding 657..679 20/21 (95%)
Actin-binding 759..773 13/13 (100%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 933/1076 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1826..1849 12/22 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1909..1939 25/29 (86%)
smyhc3NP_001129995.1 Myosin_N 32..76 CDD:460670 24/43 (56%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 582/671 (87%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 933/1076 (87%)

Return to query results.
Submit another query.