DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH3 and myhz1.2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_002461.2 Gene:MYH3 / 4621 HGNCID:7573 Length:1940 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_005171981.1 Gene:myhz1.2 / 799300 ZFINID:ZDB-GENE-070705-73 Length:1937 Species:Danio rerio


Alignment Length:1930 Identity:1537/1930 - (79%)
Similarity:1745/1930 - (90%) Gaps:5/1930 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSDTEMEVFGIAAPFLRKSEKERIEAQNQPFDAKTYCFVVDSKEEYAKGKIKSSQDGKVTVETE 65
            ||:|.||.|:|.||.:|||.|||||||||:||||||.|:|||.||.|.||.|||...|||||.|.
Zfish     1 MSTDAEMAVYGKAAIYLRKPEKERIEAQNKPFDAKTACYVVDDKELYVKGTIKSRDGGKVTVITL 65

Human    66 DNR-TLVVKPEDVYAMNPPKFDRIEDMAMLTHLNEPAVLYNLKDRYTSWMIYTYSGLFCVTVNPY 129
            |.: ..|.|.:||:.|||||||:||||||:||||||:||||||:||.:|||||||||||.|||||
Zfish    66 DTKEERVAKEDDVHPMNPPKFDKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCATVNPY 130

Human   130 KWLPVYNPEVVEGYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQ 194
            ||||||:.|||..||||||.||||||||:||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
Zfish   131 KWLPVYDAEVVAAYRGKKRMEAPPHIFSVSDNAYQFMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQ 195

Human   195 YFATIAATGDLAKKKDS--KMKGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTG 257
            ||||:|..|...||:.:  ||:|:||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||:|
Zfish   196 YFATVAVQGPEKKKEQAAGKMQGSLEDQIIAANPLLEAYGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTSG 260

Human   258 KLASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQILSNKKPELIELLLITTNPYDYPFISQGEILVA 322
            |||||||||||||||||||||..||.||||||:::|.||||||:.||||||||:|..|||:|.||
Zfish   261 KLASADIETYLLEKSRVTFQLPDERGYHIFYQMMTNHKPELIEMTLITTNPYDFPMCSQGQITVA 325

Human   323 SIDDAEELLATDSAIDILGFTPEEKSGLYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKTAY 387
            ||||.|||:|||:|||||||..|||.|:||.||||:|:||||||||||||||||||||.|||..|
Zfish   326 SIDDKEELVATDTAIDILGFNNEEKMGIYKFTGAVLHHGNMKFKQKQREEQAEPDGTEEADKIGY 390

Human   388 LMGLNSSDLLKALCFPRVKVGNEYVTKGQTVDQVHHAVNALSKSVYEKLFLWMVTRINQQLDTKL 452
            |:||||:|:|||||:||||||||:|||||||.||:::|:|||||:||::|||||.||||.||||.
Zfish   391 LLGLNSADMLKALCYPRVKVGNEFVTKGQTVPQVYNSVSALSKSIYERMFLWMVVRINQMLDTKQ 455

Human   453 PRQHFIGVLDIAGFEIFEYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMD 517
            .|..|||||||||||||::||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Zfish   456 QRNFFIGVLDIAGFEIFDFNSMEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIVWEFIDFGMD 520

Human   518 LAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKVVKGRAEAHFSLIH 582
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||..||:|||||||:|
Zfish   521 LAACIELIEKPLGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKCNAFQKPKPAKGKAEAHFSLVH 585

Human   583 YAGTVDYSVSGWLEKNKDPLNETVVGLYQKSSNRLLAHLYATFATADADSGKKKVAKKKGSSFQT 647
            |||||||::||||:||||||||:||.||||||.:|||.||.  ...:...|.||..||||.|.||
Zfish   586 YAGTVDYNISGWLDKNKDPLNESVVQLYQKSSVKLLATLYP--PVVEETGGGKKGGKKKGGSMQT 648

Human   648 VSALFRENLNKLMSNLRTTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHSLVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPN 712
            ||:.|||||.|||:|||:||||||||:||||:||||.||:.||:||||||||||||||||||||:
Zfish   649 VSSQFRENLGKLMTNLRSTHPHFVRCLIPNESKTPGLMENFLVIHQLRCNGVLEGIRICRKGFPS 713

Human   713 RILYGDFKQRYRVLNASAIPEGQFIDSKKACEKLLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEM 777
            ||||.||||||:|||||.||||||||:|||.||||.|||::|.:|:|||||||||||||||||||
Zfish   714 RILYADFKQRYKVLNASVIPEGQFIDNKKASEKLLGSIDVNHDEYRFGHTKVFFKAGLLGTLEEM 778

Human   778 RDDRLAKLITRTQAVCRGFLMRVEFQKMVQRRESIFCIQYNIRSFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLK 842
            ||::||.|:|.|||:||.:|||.||.||.:||::|:.||||:|||||||||||||:::|||||||
Zfish   779 RDEKLASLVTMTQALCRAYLMRREFVKMTERRDAIYTIQYNVRSFMNVKHWPWMKVYYKIKPLLK 843

Human   843 SAETEKEMATMKEEFQKTKDELAKSEAKRKELEEKLVTLVQEKNDLQLQVQAESENLLDAEERCD 907
            |||||||:|||||:|.|.|::|||:|||:||||||:|.|:||||||||.|.:|||||.||||||:
Zfish   844 SAETEKELATMKEDFVKCKEDLAKAEAKKKELEEKMVALLQEKNDLQLAVASESENLSDAEERCE 908

Human   908 QLIKAKFQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHAT 972
            .|||:|.|||||:||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   909 GLIKSKIQLEAKLKETTERLEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHAT 973

Human   973 ENKVKNLTEELSGLDETIAKLTREKKALQEAHQQALDDLQAEEDKVNSLNKTKSKLEQQVEDLES 1037
            ||||||||||::..||:|.|||:|||||||||||.||||||||||||:|.|:|:||||||:|||.
Zfish   974 ENKVKNLTEEMAAQDESIGKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKSKTKLEQQVDDLEG 1038

Human  1038 SLEQEKKLRVDLERNKRKLEGDLKLAQESILDLENDKQQLDERLKKKDFEYCQLQSKVEDEQTLG 1102
            |||||||||:||||.|||||||||||||||:||||||||.:|:|||||||..||.||:||||:||
Zfish  1039 SLEQEKKLRMDLERAKRKLEGDLKLAQESIMDLENDKQQSEEKLKKKDFETSQLLSKIEDEQSLG 1103

Human  1103 LQFQKKIKELQARIEELEEEIEAERATRAKTEKQRSDYARELEELSERLEEAGGVTSTQIELNKK 1167
            .|.|||||||||||||||||||||||.|||.||||:|.:|||||:|||||||||.|:.|||:|||
Zfish  1104 AQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERAARAKVEKQRADLSRELEEISERLEEAGGATAAQIEMNKK 1168

Human  1168 REAEFLKLRRDLEEATLQHEAMVAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLEIDDL 1232
            |||||.||||||||:||||||..||||||.|||||||||||||||||||||||||||:|:|||||
Zfish  1169 REAEFQKLRRDLEESTLQHEATAAALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEYKMEIDDL 1233

Human  1233 SSSMESVSKSKANLEKICRTLEDQLSEARGKNEEIQRSLSELTTQKSRLQTEAGELSRQLEEKES 1297
            ||:||:|:|:||||||:||||||||||.:.||:|..|.|::|:.|::|||||.||..|||||||:
Zfish  1234 SSNMEAVAKAKANLEKMCRTLEDQLSEIKSKNDENLRQLNDLSAQRARLQTENGEFGRQLEEKEA 1298

Human  1298 IVSQLSRSKQAFTQQTEELKRQLEEENKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRAL 1362
            :||||:|.|||||||.||||||:|||.|||||||||:||:||||||||||:|||||.||||||.:
Zfish  1299 LVSQLTRGKQAFTQQIEELKRQIEEEVKAKNALAHAVQSARHDCDLLREQFEEEQEAKAELQRGM 1363

Human  1363 SKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDSEEQVEAVNAKCASLEKTKQRLQGEVE 1427
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||::|||:||||:|||||||||||||||||
Zfish  1364 SKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEESKKKLAQRLQEAEEQIEAVNSKCASLEKTKQRLQGEVE 1428

Human  1428 DLMVDVERANSLAAALDKKQRNFDKVLAEWKTKCEESQAELEASLKESRSLSTELFKLKNAYEEA 1492
            |||:||||||:|||.||||||||||||||||.|.||.|||||.:.||:|||||||||:||:|||.
Zfish  1429 DLMIDVERANALAANLDKKQRNFDKVLAEWKQKYEEGQAELEGAQKEARSLSTELFKMKNSYEET 1493

Human  1493 LDQLETVKRENKNLEQEIADLTEQIAENGKTIHELEKSRKQIELEKADIQLALEEAEAALEHEEA 1557
            ||||||:|||||||:|||:||||||.|.||:|||||||:|.:|.|||:||.||||||..|||||:
Zfish  1494 LDQLETLKRENKNLQQEISDLTEQIGETGKSIHELEKSKKAVETEKAEIQTALEEAEGTLEHEES 1558

Human  1558 KILRIQLELTQVKSEIDRKIAEKDEEIEQLKRNYQRTVETMQSALDAEVRSRNEAIRLKKKMEGD 1622
            ||||:||||.|||||||||:|||||||||:|||.||..::|||.||:||||||:|:|:|||||||
Zfish  1559 KILRVQLELNQVKSEIDRKLAEKDEEIEQIKRNSQRITDSMQSTLDSEVRSRNDALRIKKKMEGD 1623

Human  1623 LNEIEIQLSHANRQAAETLKHLRSVQGQLKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAEVE 1687
            |||:|||||||||||||..|.||:||.||||.|||||||:|||||:|||:|:||||..|:|:|:|
Zfish  1624 LNEMEIQLSHANRQAAEAQKQLRNVQAQLKDAQLHLDDAVRGQEDMKEQVAMVERRNTLMQSEIE 1688

Human  1688 ELRATLEQTERARKLAEQELLDSNERVQLLHTQNTSLIHTKKKLETDLMQLQSEVEDASRDARNA 1752
            ||||.||||||.||:|||||:|::|||.|||:|||||::||||||.||:|:||||||..::||||
Zfish  1689 ELRAALEQTERGRKVAEQELVDASERVGLLHSQNTSLLNTKKKLEADLVQIQSEVEDTVQEARNA 1753

Human  1753 EEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLE 1817
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||:||||||:||||
Zfish  1754 EDKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEVTVKDLQHRLDEAENLAMKGGKKQLQKLE 1818

Human  1818 TRIRELEFELEGEQKKNTESVKGLRKYERRVKELTYQSEEDRKNVLRLQDLVDKLQVKVKSYKRQ 1882
            :|:||||.|:|.||::..::|||:|||||||||||||:|||:|||.||||||||||:|||:||||
Zfish  1819 SRVRELESEVEAEQRRGADAVKGVRKYERRVKELTYQTEEDKKNVNRLQDLVDKLQLKVKAYKRQ 1883

Human  1883 AEEADEQANAHLTKFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKTRD 1927
            :|||:||||:||:|.||.||||||||||||||||||||||||:||
Zfish  1884 SEEAEEQANSHLSKLRKVQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKSRD 1928

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH3NP_002461.2 Myosin_N 36..73 CDD:280832 21/37 (57%)
Myosin_head 88..767 CDD:278492 547/680 (80%)
MYSc_Myh3 100..767 CDD:276878 536/668 (80%)
Actin-binding 656..678 17/21 (81%)
Actin-binding 758..772 12/13 (92%)
GrpE 843..>962 CDD:295646 96/118 (81%)
Myosin_tail_1 847..1924 CDD:279860 868/1076 (81%)
BAR <956..1063 CDD:299863 90/106 (85%)
MIT_CorA-like <1296..>1408 CDD:294313 94/111 (85%)
COG6 1373..>1506 CDD:303003 113/132 (86%)
TMPIT 1739..>1850 CDD:285135 89/110 (81%)
myhz1.2XP_005171981.1 Myosin_N 35..74 CDD:308391 22/38 (58%)
MYSc_class_II 101..768 CDD:276951 536/668 (80%)
SMC_N 848..1925 CDD:330553 868/1076 (81%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 1198 1.000 Domainoid score I239
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0161
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
NCBI 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D12270at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100110
Panther 1 1.100 - - O PTHR45615
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X58
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
ZFIN 00.000 Not matched by this tool.
98.820

Return to query results.
Submit another query.