DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH1 and Myh1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_005954.3 Gene:MYH1 / 4619 HGNCID:7567 Length:1939 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_109604.1 Gene:Myh1 / 17879 MGIID:1339711 Length:1942 Species:Mus musculus


Alignment Length:1942 Identity:1879/1942 - (96%)
Similarity:1915/1942 - (98%) Gaps:3/1942 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSDSEMAIFGEAAPFLRKSERERIEAQNKPFDAKTSVFVVDPKESFVKATVQSREGGKVTAKTE 65
            ||||:|||:||||||:|||||:|||||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MSSDAEMAVFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKSSVFVVDAKESFVKATVQSREGGKVTAKTE 65

Human    66 AGATVTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYK 130
            .|.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 GGTTVTVKDDQVYPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYK 130

Human   131 WLPVYNAEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQY 195
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 WLPVYNAEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQY 195

Human   196 FATIAVTGEKKKEEVTSGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGK 260
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 FATIAVTGEKKKEEATSGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGK 260

Human   261 LASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPS 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 LASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPS 325

Human   326 IDDQEELMATDSAIEILGFTSDERVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYL 390
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 IDDQEELMATDSAIDILGFTSDERVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYL 390

Human   391 QNLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNAVGALAKAVYDKMFLWMVTRINQQLDTKQP 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||
Mouse   391 QNLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNSVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQP 455

Human   456 RQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDL 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Mouse   456 RQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDL 520

Human   521 AACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKSNNFQKPKPAKGKPEAHFSLIHY 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:||
Mouse   521 AACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKSNNFQKPKPAKGKVEAHFSLVHY 585

Human   586 AGTVDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSAMKTLALLFVG-ATGAEAEA--GGGKKGGKKKGSS 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.||.| |..||||:  ||||||.||||||
Mouse   586 AGTVDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSSMKTLAYLFSGAAAAAEAESGGGGGKKGAKKKGSS 650

Human   648 FQTVSALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKG 712
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 FQTVSALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKG 715

Human   713 FPSRILYADFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLL 777
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 FPSRILYADFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLL 780

Human   778 EEMRDEKLAQLITRTQAMCRGFLARVEYQKMVERRESIFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLYFKIKP 842
            |||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 EEMRDDKLAQLITRTQAMCRGYLARVEYQKMVERRESIFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLYFKIKP 845

Human   843 LLKSAETEKEMANMKEEFEKTKEELAKTEAKRKELEEKMVTLMQEKNDLQLQVQAEADSLADAEE 907
            ||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||.|||||||||||||:||||||||||
Mouse   846 LLKSAETEKEMANMKEEFEKAKENLAKAEAKRKELEEKMVALMQEKNDLQLQVQSEADSLADAEE 910

Human   908 RCDQLIKTKIQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEK 972
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 RCDQLIKTKIQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEK 975

Human   973 HATENKVKNLTEEMAGLDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDD 1037
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 HATENKVKNLTEEMAGLDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDD 1040

Human  1038 LEGSLEQEKKIRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDIENDKQQLDEKLKKKEFEMSGLQSKIEDEQ 1102
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||
Mouse  1041 LEGSLEQEKKIRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDVENDKQQLDEKLKKKEFEMSNLQSKIEDEQ 1105

Human  1103 ALGMQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEM 1167
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1106 ALGMQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEM 1170

Human  1168 NKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEI 1232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1171 NKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEI 1235

Human  1233 DDLASNMETVSKAKGNLEKMCRALEDQLSEIKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTESGEYSRQLDE 1297
            ||||||||.:||:|||||||||.||||:||:||||||||||||:|||||.|||||||||||||||
Mouse  1236 DDLASNMEVISKSKGNLEKMCRTLEDQVSELKTKEEEQQRLINELTAQRGRLQTESGEYSRQLDE 1300

Human  1298 KDTLVSQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQ 1362
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1301 KDSLVSQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQ 1365

Human  1363 RAMSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQN 1427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1366 RAMSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQN 1430

Human  1428 EVEDLMIDVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELEASQKESRSLSTELFKIKNAY 1492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1431 EVEDLMIDVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEETHAELEASQKESRSLSTELFKIKNAY 1495

Human  1493 EESLDQLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEKIKKQVEQEKSELQAALEEAEASLEH 1557
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
Mouse  1496 EESLDHLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEKIKKQIEQEKSELQAALEEAEASLEH 1560

Human  1558 EEGKILRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQMKRNHIRIVESMQSTLDAEIRSRNDAIRLKKKM 1622
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1561 EEGKILRIQLELNQVKSEIDRKIAEKDEEIDQLKRNHIRVVESMQSTLDAEIRSRNDAIRLKKKM 1625

Human  1623 EGDLNEMEIQLNHANRMAAEALRNYRNTQAILKDTQLHLDDALRSQEDLKEQLAMVERRANLLQA 1687
            |||||||||||||:|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Mouse  1626 EGDLNEMEIQLNHSNRMAAEALRNYRNTQGILKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAMVERRANLLQA 1690

Human  1688 EIEELRATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQIQGEMEDIIQEA 1752
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Mouse  1691 EIEELRATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQIQGEMEDIVQEA 1755

Human  1753 RNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQ 1817
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1756 RNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQ 1820

Human  1818 KLEARVRELEGEVESEQKRNVEAVKGLRKHERKVKELTYQTEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSY 1882
            ||||||||||||||:||||||||:||||||||:||||||||||||||:|||||||||||:|||:|
Mouse  1821 KLEARVRELEGEVENEQKRNVEAIKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNVLRLQDLVDKLQSKVKAY 1885

Human  1883 KRQAEEAEEQSNVNLSKFRRIQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTKIISEE 1939
            |||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1886 KRQAEEAEEQSNVNLAKFRKIQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTKIISEE 1942

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH1NP_005954.3 Myosin_N 36..73 CDD:280832 32/36 (89%)
Myosin_head 88..770 CDD:278492 666/684 (97%)
MYSc_Myh1_mammals 100..770 CDD:276875 654/672 (97%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 659..681 21/21 (100%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 761..775 13/13 (100%)
Myosin_tail_1 850..1927 CDD:279860 1042/1076 (97%)
RILP-like 965..1098 CDD:304877 130/132 (98%)
MIT_CorA-like <1299..>1411 CDD:294313 110/111 (99%)
DUF342 <1506..1582 CDD:302792 73/75 (97%)
DUF342 <1670..1767 CDD:302792 95/96 (99%)
TMPIT 1744..>1853 CDD:285135 104/108 (96%)
Myh1NP_109604.1 Myosin_N 35..73 CDD:367160 33/37 (89%)
MYSc_Myh1_mammals 100..773 CDD:276875 654/672 (97%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 662..684 21/21 (100%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 764..778 13/13 (100%)
Myosin_tail_1 853..1930 CDD:366712 1042/1076 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1156..1175 18/18 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83954888
Domainoid 1 1.000 1985 1.000 Domainoid score I318
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0161
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H133718
Inparanoid 1 1.050 3652 1.000 Inparanoid score I350
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S1265
NCBI 1 1.000 - -
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D41153at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 1 1.000 - - oto112047
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100110
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45615
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R2660
SonicParanoid 1 1.000 - - X58
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1818.240

Return to query results.
Submit another query.