DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH1 and LOC100493121

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_005954.3 Gene:MYH1 / 4619 HGNCID:7567 Length:1939 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012809641.1 Gene:LOC100493121 / 100493121 -ID:- Length:1935 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1937 Identity:1665/1937 - (85%)
Similarity:1819/1937 - (93%) Gaps:3/1937 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 SDSEMAIFGEAAPFLRKSERERIEAQNKPFDAKTSVFVVDPKESFVKATVQSREGGKVTAKTEAG 67
            ||:|||.:|.||.||||||:|||||||:||||||||||:|||:.:||..|||:||||.|.|.|..
 Frog     2 SDAEMAAYGPAAQFLRKSEKERIEAQNRPFDAKTSVFVIDPKQMYVKGIVQSKEGGKATVKKEDM 66

Human    68 ATVTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWL 132
            :|||||||::||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||.||||||||
 Frog    67 STVTVKDDEIFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLNEPSVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCATVNPYKWL 131

Human   133 PVYNAEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 197
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||||||||||
 Frog   132 PVYNPEVVNAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSVLITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 196

Human   198 TIAVTGEKKKEEVTSGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLA 262
            |||..|:|||||...||:|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog   197 TIAAIGDKKKEEAAPGKIQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLS 261

Human   263 SADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSID 327
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||:|:||:||||||||||:.:||||||||.|||
 Frog   262 SADIETYLLEKSRVTFQLSAERSYHIFYQIMSNKRPELIDMLLITTNPYDFPYVSQGEITVASID 326

Human   328 DQEELMATDSAIEILGFTSDERVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQN 392
            ||||||||||||:||||.:||:..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
 Frog   327 DQEELMATDSAIDILGFNNDEKNGIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLMG 391

Human   393 LNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNAVGALAKAVYDKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQ 457
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||.|:||:|||||||.|||||||||||||
 Frog   392 LNSADLLKALCYPRVKVGNEFVTKGQTVQQVYNSVGALGKSVYEKMFLWMVIRINQQLDTKQPRQ 456

Human   458 YFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAA 522
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||
 Frog   457 HFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAA 521

Human   523 CIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKSNNFQKPKPAKGKPEAHFSLIHYAG 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||.|||.||||||:||||
 Frog   522 CIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPGKGKAEAHFSLVHYAG 586

Human   588 TVDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSAMKTLALLFVGATGAEAEAGGGKKGGKKKGSSFQTVS 652
            ||||||:||||||||||||||:||||||::|.|:.|:...:|.:|:. |||||||||||||||||
 Frog   587 TVDYNISGWLDKNKDPLNETVIGLYQKSSVKLLSFLYSAYSGTDADT-GGKKGGKKKGSSFQTVS 650

Human   653 ALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRI 717
            |||||||||||.||||||||||||:|||||||||||:|.||:|||||||||||||||||||||||
 Frog   651 ALFRENLNKLMANLRSTHPHFVRCLIPNETKTPGAMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRI 715

Human   718 LYADFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRD 782
            ||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||||
 Frog   716 LYGDFKQRYKILNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDVDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRD 780

Human   783 EKLAQLITRTQAMCRGFLARVEYQKMVERRESIFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSA 847
            |:||||||||||||||:|.|||:::|:||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
 Frog   781 ERLAQLITRTQAMCRGYLMRVEFRQMMERRESIFCIQYNVRSFMNVKHWPWMKLYFKIKPLLKSA 845

Human   848 ETEKEMANMKEEFEKTKEELAKTEAKRKELEEKMVTLMQEKNDLQLQVQAEADSLADAEERCDQL 912
            |:||||.|||||||||||.|||:||||||||||||.::||||||.|||.:|::|||||||||:.|
 Frog   846 ESEKEMQNMKEEFEKTKEALAKSEAKRKELEEKMVAILQEKNDLHLQVTSESESLADAEERCEGL 910

Human   913 IKTKIQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATEN 977
            ||.||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   911 IKAKIQLEAKIKEFNERLEDEEESNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATEN 975

Human   978 KVKNLTEEMAGLDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDDLEGSL 1042
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
 Frog   976 KVKNLTEEMAILDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKTKLEQQVDDLEGSL 1040

Human  1043 EQEKKIRMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDIENDKQQLDEKLKKKEFEMSGLQSKIEDEQALGMQ 1107
            |||||:|||:||||||||||||||||||||:|||:||||||:||||||:|.|||||||||||..|
 Frog  1041 EQEKKLRMDMERAKRKLEGDLKLAQESTMDLENDRQQLDEKVKKKEFEISQLQSKIEDEQALAAQ 1105

Human  1108 LQKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKRE 1172
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1106 LQKKIKELQARIEELEEEIEAERAARAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMNKKRE 1170

Human  1173 AEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEIDDLAS 1237
            |||||||||||||||||||||:.||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
 Frog  1171 AEFQKMRRDLEEATLQHEATASALRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLAS 1235

Human  1238 NMETVSKAKGNLEKMCRALEDQLSEIKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTESGEYSRQLDEKDTLV 1302
            |||:|||||.|||||||.||||.||:||||||..|:|||:.||||||.||:||:||||:||::::
 Frog  1236 NMESVSKAKSNLEKMCRTLEDQFSEVKTKEEEHLRVINDINAQRARLHTENGEFSRQLEEKESMI 1300

Human  1303 SQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRAMSK 1367
            |||||.|||||||.||||||||||.|||:||||.|||:||||||||||||||||||.||||::||
 Frog  1301 SQLSRAKQAFTQQTEELKRQLEEETKAKNALAHGLQSARHDCDLLREQYEEEQEAKGELQRSLSK 1365

Human  1368 ANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDL 1432
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||.:||||:|||||||||||||||||||
 Frog  1366 ANSEVSQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEQIEAVNSKCASLEKTKQRLQNEVEDL 1430

Human  1433 MIDVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELEASQKESRSLSTELFKIKNAYEESLD 1497
            |:||||:|:|||||||||:||||:||:||||.||:.||||||||||||||||:||:||:|||:||
 Frog  1431 MVDVERSNSACAALDKKQKNFDKVLADWKQKFEESQAELEASQKESRSLSTEVFKMKNSYEEALD 1495

Human  1498 QLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEKIKKQVEQEKSELQAALEEAEASLEHEEGKI 1562
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||:||.|||:|||||:||:||||||.||||||.|:
 Frog  1496 QLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAESGKTIHEIEKAKKQIEQEKSDLQSALEEAEGSLEHEEAKV 1560

Human  1563 LRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQMKRNHIRIVESMQSTLDAEIRSRNDAIRLKKKMEGDLN 1627
            |||||||||||.|||||||||||||:|:|||..|.:|||||||||||||||||:|||||||||||
 Frog  1561 LRIQLELNQVKGEVDRKIAEKDEEIEQLKRNSQRALESMQSTLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLN 1625

Human  1628 EMEIQLNHANRMAAEALRNYRNTQAILKDTQLHLDDALRSQEDLKEQLAMVERRANLLQAEIEEL 1692
            ||||||:||||.|||:.:..||.|.:|||||||||||.|..:|||||||:||||.||:.|||||:
 Frog  1626 EMEIQLSHANRQAAESQKQLRNVQGLLKDTQLHLDDAQRGNDDLKEQLAIVERRNNLMTAEIEEM 1690

Human  1693 RATLEQTERSRKIAEQELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQIQGEMEDIIQEARNAEE 1757
            |:.||||||.||:|||||:|.:|||||||:|||||||||||:|:|:||:|.|:|:.:||||||:|
 Frog  1691 RSALEQTERGRKVAEQELIDVTERVQLLHSQNTSLINTKKKIESDVSQLQSEVEEAVQEARNADE 1755

Human  1758 KAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEAR 1822
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||
 Frog  1756 KAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLAMKGGKKQLQKLEAR 1820

Human  1823 VRELEGEVESEQKRNVEAVKGLRKHERKVKELTYQTEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAE 1887
            |||||.|:::||||..:|:||:||.||:||||:||:|||:||:.||||||||||.|||:||||.|
 Frog  1821 VRELENELDAEQKRGSDAIKGVRKFERRVKELSYQSEEDKKNVFRLQDLVDKLQLKVKTYKRQTE 1885

Human  1888 EAEEQSNVNLSKFRRIQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTKIISEE 1939
            :.|||:||:||:||:.||||||||||||||||||||||.|||::..|  :||
 Frog  1886 DIEEQANVHLSRFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKSRDIGKK--AEE 1935

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH1NP_005954.3 Myosin_N 36..73 CDD:280832 23/36 (64%)
Myosin_head 88..770 CDD:278492 611/681 (90%)
MYSc_Myh1_mammals 100..770 CDD:276875 600/669 (90%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 659..681 19/21 (90%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 761..775 13/13 (100%)
Myosin_tail_1 850..1927 CDD:279860 914/1076 (85%)
RILP-like 965..1098 CDD:304877 123/132 (93%)
MIT_CorA-like <1299..>1411 CDD:294313 94/111 (85%)
DUF342 <1506..1582 CDD:302792 64/75 (85%)
DUF342 <1670..1767 CDD:302792 73/96 (76%)
TMPIT 1744..>1853 CDD:285135 90/108 (83%)
LOC100493121XP_012809641.1 Myosin_N 35..72 CDD:280832 23/36 (64%)
Myosin_head 87..768 CDD:278492 611/681 (90%)
Motor_domain 99..768 CDD:277568 600/669 (90%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:279860 914/1076 (85%)
RILP-like 963..1096 CDD:304877 123/132 (93%)
DUF342 <1154..1239 CDD:302792 80/84 (95%)
MIT_CorA-like <1297..>1409 CDD:294313 94/111 (85%)
COG6 1374..>1535 CDD:303003 139/160 (87%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 1779 1.000 Domainoid score I142
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 3326 1.000 Inparanoid score I187
NCBI 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D12270at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 1 1.000 - - mtm10347
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X58
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
66.060

Return to query results.
Submit another query.