Protein Alignment mr and Cul6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611862.1
• Gene: mr / 45906
• FlyBaseID: FBgn0002791
• Length: 802
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_648620.1
• Gene: Cul6 / 39474
• FlyBaseID: FBgn0036332
• Length: 670
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 707
• Identity: 135/707 - (19%)
• Similarity: 246/707 - (34%)
• Gaps: 194/707 - (27%)

  Fly   103 LFTQFIDAINELHDSF-----QSLMQVKPRLIQLVGAE---TKPTAKTVKLMQEEGIKNCLRDCL 159
            |....:..:|::.|.:     |.||.:...:.:...||   ..|..|..:     .:...|.|||
  Fly    17 LIDNILQVVNQIFDDYTSFDGQKLMHLYHLIYKQCAAERNWNNPAQKNGR-----SLYIVLSDCL 76

  Fly   160 LA-----------QLPPNFSVVVGAFY---WVHFKLFTKASNLALTTVDSDVFDELLCVGCN--- 207
            :.           ||..|..:.:.|.|   ||.::...:..|||             |...|
  Fly    77 MKRLKNIAWVMENQLDDNKPIRLIAKYLEHWVPYQRSCEKLNLA-------------CYHFNRNW 128

  Fly   208 FEAEQCCCQRLTDMVNKTNM-----KLFEMNLIDRLTGSALTALIKLKIKEHISDTCMGIFDRSH 267
            .|.|:....:.|..:.:..|     .:||.::       .:.|.|:|.:.:         ..|.:
  Fly   129 VERERLKGDKETYPIYRLAMISWKELVFEPSV-------TILAAIRLILSQ---------MPREY 177

  Fly   268 LKQLETWLSDVIMSWLTNIFTEWKSKDSISDIEVPESV-KSFKVKLTYFMYETFAQSVIGQFFSI 331
            .|.||..:..|:.|     ..|..:.|...|:.:|..: |.|..|:..|    :..:.:.:|..|
  Fly   178 NKSLEYQVYQVLQS-----IVELYANDKYQDVSLPSRIDKIFTEKVMDF----YKSTTLHEFQKI 233

  Fly   332 II--DYPDSIPAIDDLKICMEKIDMRVYLTESLRNSLEARILHPGVNTMDILTGYVAAI-----K 389
            ::  ||.|....:....:.|.:|:........|:..|.||:....::..|.:..::...     :
  Fly   234 VVSNDYKDFKHFLRYACLAMPEIENGTQFKAILKRYLAARLQETRLSGKDYIQAFLGLCRGPLQR 298

  Fly   390 AIRHLDSTGVILEMVTAPIKDYLRKRN---DTVRRVVTGLTE------EGPTDLSEELAKGETIK 445
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  Fly   299 ALR--DHT-KLAEVVDAVCKEEINRKGQIIDPTRLLVTYANELMTKRQESEEAIIDELKR---IV 357

  Fly   446 ECKDSGTDEFSNWENWQPDPFGIDASIMQYNSSRKMRSADIISMVVDIYGSKELFMTEYRNLMAD 510
            :|.:..:||:.                                           |:..|...:..
  Fly   358 KCVEFLSDEYK-------------------------------------------FIDMYLKALRI 379

  Fly   511 RLLAQLDFNSEKEIRNLELLKIRFGESLLHSCEVMLKDV----TDSKRINAHIHSDGDRTENQLF 571
            |.:.:...:...|.....||..:....:.....|.|:||    |..|....|::|.|.:..   |
  Fly   380 RQINETSTSDGVESIMYSLLNKKMANFVTRCIYVQLRDVDKLRTLKKEFQDHLNSKGIKLG---F 441

  Fly   572 DISSLIVSAQFWP-------SFNKESLQLPEEIENEFKKYTKAYEAYKGNRTLNWRTVTGRVNIE 629
            |         |.|       ||...:|.||:|::..:|::...|||    |.|..:.:. ::|.|
  Fly   442 D---------FRPKCFKNDGSFENFNLTLPDELQQAWKEFRIFYEA----RKLQSKAII-QLNNE 492

  Fly   630 IEIGDRTME-------MVVSPILAVIIYHFQTKNEWTIEDLSSITKVPASALRRRLSFWQNHGLI 687
            :..|:.|..       :.||.:...::..|.....:|.::|.:...|....|:
  Fly   493 LSSGEITCHLNQSVYILEVSTLQMAVLMLFNRHERFTEQELVTALGVELETLQ------------ 545

  Fly   688 SETTPGIFTLLEKESEKSQYEDMSLAEAD-------EEDLESAMASASDQREEELQV 737
             |....|..|:..|..|..|.::::...:       .|.|...|....::.|.||::
  Fly   546 -EALKQIKFLVYIEVNKVNYIEINMDFTNRKRRLFCNEPLPRKMRKIEEKSEIELKI 601

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
mr	NP_611862.1	CULLIN	494..632	CDD:214545	33/148 (22%)
		ANAPC2	741..800	CDD:462556
Cul6	NP_648620.1	COG5647	25..670	CDD:227934	134/699 (19%)