DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment bel and Ddx3x

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262379.1 Gene:bel / 45826 FlyBaseID:FBgn0263231 Length:801 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001385681.1 Gene:Ddx3x / 317335 RGDID:1564771 Length:662 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:805 Identity:419/805 - (52%)
Similarity:500/805 - (62%) Gaps:151/805 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSNAINQNGTGLEQQVAGLDLNGGSADYSGPITSKTSTNSVTGGVYVPPHLRGGGGNNNAADAES 65
            ||:...:|..||:||.||||||.......|...||        |.|:|||||.........|.:|
  Rat     1 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQTGGSTASK--------GRYIPPHLRNREATKGFYDKDS 57

  Fly    66 QGQGQGQGQGFDSRSGNPRQETRDPQQSRGGGGEYRRGGGGGGRGFNRQSGDYGYGSGGGGRRGG 130
                          ||....:.:|...|.|..|:        .||.:...||          ||.
  Rat    58 --------------SGWSSSKDKDAYSSFGSRGD--------SRGKSSFFGD----------RGS 90

  Fly   131 GGRFEDNYNGGEFDSRRGGDWNRSGGGGGGGRGFGRGPSYRGGGGGSGSNLNEQTAEDGQAQQQQ 195
            |.|       |.||.|..||::     |.||||                                
  Rat    91 GSR-------GRFDDRGRGDYD-----GIGGRG-------------------------------- 111

  Fly   196 QPRNDRWQEPERPAGFDGSEGGQSAGGNRSYNNRGERGGGGYNSRWKEGGGSNVDYTKLGARDER 260
                ||       :||                .:.||||   ||||.:....: |::|.....||
  Rat   112 ----DR-------SGF----------------GKFERGG---NSRWCDKSDED-DWSKPLPPSER 145

  Fly   261 LEVELFGVGNTGINFDKYEDIPVEATGQNVPPNITSFDDVQLTEIIRNNVALARYDKPTPVQKHA 325
            ||.|||..|||||||:||:||||||||.|.||:|.||.||::.|||..|:.|.||.:||||||||
  Rat   146 LEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHA 210

  Fly   326 IPIIINGRDLMACAQTGSGKTAAFLVPILNQMYELGHVPPPQSTR------QYSRRKQYPLGLVL 384
            ||||...||||||||||||||||||:|||:|:|..|   |.::.|      :|.||||||:.|||
  Rat   211 IPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYADG---PGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVL 272

  Fly   385 APTRELATQIFEEAKKFAYRSRMRPAVLYGGNNTSEQMRELDRGCHLIVATPGRLEDMITRGKVG 449
            |||||||.||:|||:||:||||:||.|:|||....:|:|:|:|||||:|||||||.||:.|||:|
  Rat   273 APTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGAEIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIG 337

  Fly   450 LENIRFLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQLNMPPTGQRQTLMFSATFPKQIQELASDFLSNYIF 514
            |:..::||||||||||||||||||||||||..|||.|.|.|:||||||||:||.||.|||..|||
  Rat   338 LDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIF 402

  Fly   515 LAVGRVGSTSENITQTILWVYEPDKRSYLLDLLSSIRDGPEYTKDSLTLIFVETKKGADSLEEFL 579
            |||||||||||||||.::||.|.||||:|||||::.      .||||||:||||||||||||:||
  Rat   403 LAVGRVGSTSENITQKVVWVEEIDKRSFLLDLLNAT------GKDSLTLVFVETKKGADSLEDFL 461

  Fly   580 YQCNHPVTSIHGDRTQKEREEALRCFRSGDCPILVATAVAARGLDIPHVKHVINFDLPSDVEEYV 644
            |...:..|||||||:|::|||||..||||..|||||||||||||||.:||||||||||||:||||
  Rat   462 YHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYV 526

  Fly   645 HRIGRTGRMGNLGVATSFFNEKNRNICSDLLELLIETKQEIPSFMEDMSSDRGHGGAKRAGRGGG 709
            ||||||||:||||:|||||||:|.||..|||:||:|.|||:||::|:|:.:..:.|:.| ||...
  Rat   527 HRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAFEHHYKGSSR-GRSKS 590

  Fly   710 GRYGGGFGSRDYRQSSGGGGGGRSGPPPRSGGSGSGGGGGSYRSNGNSYGKFGGNSGGGGYYGGG 774
            .|:.||||:||||||||......|.  .|:..|.|||||     :|:|.|     .|||| |||.
  Rat   591 SRFSGGFGARDYRQSSGASSSSFSS--SRASSSRSGGGG-----HGSSRG-----FGGGG-YGGF 642

  Fly   775 AGGGSYGGSYGGGSASHSSNAPDWW 799
            .....|||:|       :|...|||
  Rat   643 YNSDGYGGNY-------NSQGVDWW 660

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
belNP_001262379.1 DEADc_DDX3 275..522 CDD:350809 174/252 (69%)
SF2_C_DEAD 527..663 CDD:350174 99/135 (73%)
Ddx3xNP_001385681.1 DEADc_DDX3 160..410 CDD:350809 174/252 (69%)
SF2_C_DEAD 415..545 CDD:350174 99/135 (73%)

Return to query results.
Submit another query.