DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment dom and Ep400

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001286676.1 Gene:dom / 45655 FlyBaseID:FBgn0020306 Length:3233 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063127436.1 Gene:Ep400 / 304569 RGDID:1304733 Length:3168 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3565 Identity:1007/3565 - (28%)
Similarity:1509/3565 - (42%) Gaps:909/3565 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 GGHEGLSPAPPAVPDRVTP------------HSTEISVAPANSTSTTVRA--------------- 46
            ||::.::.||..:|:..:|            |.:...:...:..|..|:.               
  Rat    83 GGNQQITLAPLPLPNPTSPGFQFGAQQRRFEHGSPSYIQVTSPLSQQVQTQSPTQPNPGPGQTLQ 147

  Fly    47 ---AGSVGAAL------------------------PATRHHQHIATQVKGIASSSSKQQKQLASA 84
               ||:.|..|                        |::..| .:..:..|:...:...|.||..:
  Rat   148 NVRAGAPGPGLGICSSSPTGGFVDASVLVRQISLSPSSGGH-FVFQEAPGLTQMAQGAQVQLQHS 211

  Fly    85 QLPVPLSP--LPQQQQQT----------AEATAAA------AAPAHSNVSVSSSTIEASVLPPQ- 130
            ..|:.:..  |.|...|:          :.|||..      |:|.|         |..:.|||| 
  Rat   212 GAPITVRERRLSQPHAQSGGTIHHLGPQSPATAGGTGLQPLASPNH---------ITTASLPPQI 267

  Fly   131 ---------AKRQRLDDNE--------DRTSAASI--VGPAESSNIVSSLLPASVASSSEVGGLS 176
                     .::|::...:        :||....:  ||...:..:.|...|.|.:.::...|||
  Rat   268 SSIIQGQLIQQQQQVLQGQPMNRSLGFERTPGVLLPGVGGPSAFGMTSPPPPTSPSRTTMPPGLS 332

  Fly   177 STAL----------------------QDLNALKKRILQQKLQILRNLKERHLENVSEYFYLQN-G 218
            |..|                      |::..::|:.|....:.:..|||...|.:.|.|:||: .
  Rat   333 SVPLTSMGSSGIKKVPKKLEEIPPASQEMAQMRKQCLDYHYKEMEALKEVFKEYLIELFFLQHLQ 397

  Fly   219 GSMMDYPAWRKKTPTPQFISYSNANRID---------------QLIHED---------------- 252
            |:|||:.|::||...| ..:|...|.:|               ::|:::                
  Rat   398 GNMMDFLAFKKKHYAP-LQAYLRQNDLDIEEEEEEEEEEEEKSEVINDEVKVVTGKDGQTGTPVA 461

  Fly   253 ----KPSTSAAAAAAQNQKYTTQQTDSVESSLVSGIGT--------------------------- 286
                .|...:||.::|.|.:   |..::..|||.|.|:                           
  Rat   462 IATQLPPNVSAAFSSQQQPF---QHQALTGSLVVGPGSTTEADPFKRQQVMPPTEQSKRPRLEVG 523

  Fly   287 ---------GATKGAPL-------DGNISNSTVKTNTQSQVPSKIGSFTESTPAATESNSS---- 331
                     |...|.||       .|.:..:...|....|..|: ..:..||....::.:|    
  Rat   524 HPGVVFQHPGVNAGVPLQQLMPTVQGGMPPTPQATQLTGQKQSQ-QQYDPSTGPPVQNAASLHTP 587

  Fly   332 ----------TTVPGTATSGAATSTSATSAEASGNVLAVEA--EIKIPAV-----GATPVAISTK 379
                      .:||.|    |..||...|.::.    .|||  :::||..     ...|..:.::
  Rat   588 PPQLPARLPPASVPAT----ALPSTLQFSQQSQ----MVEAPTQLQIPVKTQQLNAPIPAPLPSQ 644

  Fly   380 LPAAVVQLTQQG-HIPGRPLGGRHGMVFGQIPAPPAAVGNPSVPLVPGGTPLLPCNTSAGSTALR 443
            |||...|..|.. |:   .:.|:..|...|:.:....|.:...||    ....||..|..:    
  Rat   645 LPAPSSQPAQPALHV---SMPGKAQMQTSQLSSQTQTVASTRPPL----ESAQPCQRSLPT---- 698

  Fly   444 RPQGQNNASSGSAAASGGGGSLTPTPLYTGNGPA-----ALGGSGGLTPGTPTSG--SLLSPALG 501
                 :::||.....||.|...:|......|.|:     ||......:||...|.  ...|||..
  Rat   699 -----SSSSSSLVPVSGSGPGPSPARSSPVNRPSSATNKALSPVTSRSPGVAVSAPPKPQSPAQN 758

  Fly   502 GGS---GTPNSAAQEFSFKAKQEVYVMQRISELQREGLWTERRLPKLQEPSRPKAHWDYLLEEMV 563
            ..|   |:.:..|::.:.    |..:.|||::|::||||:.||||||||..|||:|||||||||.
  Rat   759 AASSQDGSQDKLAEQITL----ENQIHQRIADLRKEGLWSLRRLPKLQEAPRPKSHWDYLLEEMQ 819

  Fly   564 WLAADFAQERKWKKNAAKKCAKMVQKYFQDKATAAQRAEKAQELQLKRVASFIAREVKSFWSNVE 628
            |:|.||||||:||..||||..:.|.::.::|....:|.:|.::.:|:|:|:..|||::.||||:|
  Rat   820 WMATDFAQERRWKLAAAKKLVRTVARHHEEKKLREERGKKEEQSRLRRIAATTAREIEYFWSNIE 884

  Fly   629 KLVEYKHQTKIEEKRKQALDQHLSFIVDQTEKFSQQLVEGMNKSVADTPSLNSSRL----TSPKR 689
            ::||.|.|.::|||||:||:         .:|.|::..|              |||    |||  
  Rat   885 QVVEIKLQVELEEKRKKALN---------LQKVSRRGKE--------------SRLKGFDTSP-- 924

  Fly   690 ESDDDFRPESGSEDDEETIAKAEEDAADVKEEVTALAKESEMDFDDFLNDLPPGYLENRDKLMKE 754
                                                  |..||..          :..|    |.
  Rat   925 --------------------------------------EHSMDLG----------ISGR----KR 937

  Fly   755 EQSSAIKTETPDDSDDSEFEAKEASDDDENTISKQEEAEQEIDHKKEIDELEADNDLSVEQLLAK 819
            :.|:::        .|.|.|      |:|.||.::|..|..:||..|:..|..:.:|.:..|:..
  Rat   938 KASTSL--------TDDEVE------DEEETIEEEEAHEGLVDHHTELSNLAKEAELPLIDLMKL 988

  Fly   820 YKSEQPPS---PKRRKLAPRDPELDSDDDSTAVDSTEESEDAATEDEEDLSTVKTDTDMEEQDEQ 881
            |:....|:   |:        ||.|.::.|    ..|::||..::.|....:|..|: :...|:.
  Rat   989 YEGAFLPNFQWPQ--------PEPDHEESS----GEEDAEDCPSDRESRRDSVLIDS-LFIMDQF 1040

  Fly   882 EDGLKSLMADADATSGAAGSGSTAGASGNKDDMLNDAAALAESLQPKGNTLSSTNVVTPVPFLLK 946
            :                |....:.|.|..||  :.:..|:||::.|||:...:|.|....|.||.
  Rat  1041 K----------------AAERMSIGKSNTKD--ITEVTAVAEAILPKGSARVTTAVKFSAPSLLY 1087

  Fly   947 HSLREYQHIGLDWLVTMNERKLNGILADEMGLGKTIQTIALLAHLACAKGNWGPHLIVVPSSVML 1011
            .:||:||.||||||..:..:.||||||||.|||||:|.||..|||||.:|||||||:|:.|..:|
  Rat  1088 GALRDYQKIGLDWLAKLYRKNLNGILADEAGLGKTVQIIAFFAHLACNEGNWGPHLVVMRSCNIL 1152

  Fly  1012 NWEMEFKKWCPGFKILTYYGSQKERKLKRVGWTKPNAFHVCITSYKLVVQDQQSFRRKKWKYLIL 1076
            .||:|.|:||||.|.|:|.|:.:|.|.||..||:||.||:||||||...:...:|.|..||.|::
  Rat  1153 KWELELKRWCPGLKTLSYVGTHRELKAKRQEWTEPNNFHICITSYKQFFRGYTAFSRVHWKCLVV 1217

  Fly  1077 DEAQNIKNFKSQRWQLLLNFSTERRLLLTGTPLQNDLMELWSLMHFLMPYVFSSHREFKEWFSNP 1141
            ||.|.:|....:.|:.:....:::||||...||.|..:|||:::|||:|.:      .:.:.|.|
  Rat  1218 DEMQRVKGMTERHWEAIFKLQSQQRLLLIDVPLHNTFLELWTMVHFLIPGI------SRPYLSFP 1276

  Fly  1142 MTGMIEGNMEYNETLITRLHKVIRPFLLRRLKKEVEKQMPKKYEHVITCRLSNRQRYLYEDFMSR 1206
            :....|.|.:|...::.|||:|.:||:|||.|::||||:.:|||||:.||||:||:.||||.:.:
  Rat  1277 LKAPNEENQDYYHKMVIRLHRVTQPFILRRTKRDVEKQLTRKYEHVLKCRLSSRQKALYEDVILQ 1341

  Fly  1207 AKTRETLQTGNLLSVINVLMQLRKVCNHPNMFEARPTISPFQMDGITFHTPRLVCDIMEYDPFTQ 1271
            .:|:|.|::|:.:||::||.:|:::||||.:.|.|...|.:....:.:.:..|:..::|.:.:.:
  Rat  1342 PRTQEALKSGHFVSVLSVLTRLQRICNHPGLVEPRVPGSSYAAGSLQYKSASLILRVLEREFWKE 1406

  Fly  1272 INLETLNLLLLHLEQTMTAYVSHKSRLL---APPRKLIEDIDTAPLPAPRCPNGKYRFHIRVRSA 1333
            .:|...:  |:.||..::   .|::.||   ...|||:|::.|:|.|:.| |..     ::::::
  Rat  1407 TDLSMFD--LIGLENKIS---RHEAELLYKKKVTRKLMEEVFTSPPPSAR-PAA-----VKLKAS 1460

  Fly  1334 ELAQRIKLNAVKVGASPAMRLEGSKIM-----PMR-------NLLPSGRVLKR---VSASINPVN 1383
            .|.|     .|:.|..|    ||..:.     |.|       ...|.|:|..|   .:.|.||..
  Rat  1461 RLFQ-----PVQYGQKP----EGRTVAFPSTHPPRMANTNASTATPQGQVRGRPPIATFSANPDT 1516

  Fly  1384 MALKPVVINSVVTT-------TSSSTTASSPTGALSVLSNSKLLGARSQINAPTPAKVAKTMQDG 1441
            .|......||..:.       ||:|:||:.|       ::...|.|::.:.|.||         |
  Rat  1517 KAAAAPFQNSQASVGTPRHQPTSTSSTAAGP-------AHPSKLRAQTAVQASTP---------G 1565

  Fly  1442 KPFFYLTP------ATNSGAAGARLTLTSKT--------------TASASTTTSR-----TTVT- 1480
            .|   |.|      .....|...||.|||:.              .||.:...||     |.|| 
  Rat  1566 PP---LPPPQAPSLVAGQSAPPQRLVLTSQAQARLPSGEVVKIAQLASIAGPQSRVAQPETPVTL 1627

  Fly  1481 --------------ASTTSGQQL-----------------IR--DPIVKDLATH---VKSTVQKQ 1509
                          ...|:||.|                 :|  .|:|....:.   |.||:..:
  Rat  1628 QFQGNKFTLSHSQLRQLTAGQPLQLQGSVLQIVSAPGQPYLRAPGPVVMQTVSQAGAVHSTLGSK 1692

  Fly  1510 SIANGKTEPEEETEAEDPYKV-------------------------QELIQMRKEQRLAALKRMA 1549
            ...:|.:.....|:...|.:|                         :|..::.||:    |.::.
  Rat  1693 PPTSGPSPAPLSTQVGVPGRVAVSAMAVGEPGLASKPASPAAGPTQEEKSRLLKER----LDQIH 1753

  Fly  1550 MINRRRTDATPIYGEDCREAIQRCMQATRSLKRSTWQ--------TRGYANCCTAMAHRNGWSLN 1606
            .||.||....|:||   |:.::.|....|..:...|.        .:| |:..|:::...|    
  Rat  1754 FINERRCSQAPVYG---RDLLRICSLPGRRKRPLCWSLDSNLGKGPKG-ADYDTSLSKSEG---- 1810

  Fly  1607 HLLKSFEERCADLKPVFANFVIYVPSVCAPRIRRYVQNLSSTHWQHEQRIENIVDQALRPKLALL 1671
            .|:.:..:|...|:.|.......:|.|.|.....:|:...|.:....:.:.    |.||......
  Rat  1811 DLILTLSQRQESLQDVLDRVACVIPPVVATPPSLWVERPPSLYSSRLRALR----QCLREHTGPY 1871

  Fly  1672 HPIISEMTT----KFPDPRLIQYDCGKLQTMDRLLRQLKVNGHRVLIFTQMTKMLDVLEAFLNYH 1732
            |..:.::|.    :||:.||:|:|.|||:.:..||::||..|.||||.:||..|||:||.|||:|
  Rat  1872 HRQLQQLTALRSLQFPELRLVQFDSGKLEALAILLQKLKSEGRRVLILSQMVLMLDILEMFLNFH 1936

  Fly  1733 GHIYLRLDGSTRVEQRQILMERFNGDKRIFCFILSTRSGGVGINLTGADTVIFYDSDWNPTMDAQ 1797
            ...|:|:|.:...||||.||..||.|:||||.:|||.|...||||..||||:|||:|.||.|||:
  Rat  1937 YLTYVRIDENANSEQRQELMRSFNRDRRIFCALLSTHSRATGINLVEADTVVFYDNDLNPVMDAK 2001

  Fly  1798 AQDRCHRIGQTRDVHIYRLVSERTIEVNILKKANQKRMLSDMAIEGGNFTTTYFKSSTIKDLFTM 1862
            ||:.|.|||:.:|:|||||||..:||..:||... |.::.::|.:|.:::..:....||::||.:
  Rat  2002 AQEWCDRIGRCKDIHIYRLVSGNSIEEKLLKNGT-KDLIREVAAQGNDYSMAFLTQRTIQELFEV 2065

  Fly  1863 EQSEQDESSQEKSENKDRIVATTTLSDTPSTVVETEKQSLRAFEHALAAAE---------DEQDV 1918
            .....|.....|:|.      ...||..||.......:..|.|..||.:.|         .|:.|
  Rat  2066 YSPMDDAGFPVKAEE------FVVLSQEPSVSETIAPKIARPFIEALKSIECLEEDAQRSTEEAV 2124

  Fly  1919 QATKTAKAEVAADLAEFDENIPIATEDPNAEGGPQVELSKADLEMQNLVKQLSPIERYAMRFVEE 1983
            ..:.|......:|.:.:|       |:|:     |:|      |:.:.::||:|||:||:.::|.
  Rat  2125 PGSSTVAVSSDSDGSRYD-------EEPS-----QLE------ELADFMEQLTPIEKYALNYLEL 2171

  Fly  1984 TGAAWTAEQLRAAEAELEAQKREWEANRLAAMHKEEELLKQETEAEEMLTYSRKDSSNQVWISRN 2048
            .......|:.|::|..:.|..::||.....|:.:.|..|:.|.|..|:|||:|:|:.:..::..:
  Rat  2172 FHTTTEQEKERSSEDLVMATMKDWETRNARALQEREAQLQLEQEEAELLTYTREDAYSMEYVYED 2236

  Fly  2049 T---MEQMPMWCPPTPPQDNDNDIYIDYSLSFMYELEPIAETDLPPVYVRKEHKRSRTDAGYDGS 2110
            .   .|.||:|.||||||| |||||||..:..|||..||.|..|||||||||.||.:||....| 
  Rat  2237 ADGQTEVMPLWTPPTPPQD-DNDIYIDSVMCLMYETTPIPEAKLPPVYVRKERKRHKTDPSAAG- 2299

  Fly  2111 RRPNKMRREDNYVPPRSLFDRPTPQLARLRRELKSQRFRGSFKPNMPIPGLKPQLPT--KPLTEP 2173
             |..|.|..:..|||||||||.||.:.::|||.|.|:.....|...|.  .|| |||  |...||
  Rat  2300 -RKKKQRHGEAVVPPRSLFDRATPGMLKIRREGKEQKKNLLLKQQTPF--AKP-LPTYVKSSGEP 2360

  Fly  2174 -EAMAEWCVFEDMAILHVLVNLQGLPCSLMLLSPGQTPNWDLVSEMVNFCSKTYRSARQCRWRYE 2237
             :...:|.:.||.|:|..:..|..||.:|.::||..||||||||::||.||:.|||::|||.|||
  Rat  2361 AQDSPDWLIGEDWALLQAVKQLLELPLNLTIVSPAHTPNWDLVSDVVNSCSRIYRSSKQCRNRYE 2425

  Fly  2238 THIQPREEGKVV--ESPKKQKKLKPTLRTEYLKSPLRYLRTTQLYVSDNNASFYKTMRSRFDSIK 2300
            ..|.||||||::  .:|||:      .:..|.....|.|||:|:|..|.||:..:...|.|:.:|
  Rat  2426 NVIIPREEGKLICEANPKKK------AQNIYKSKNNRPLRTSQIYAQDENATHTQLYTSHFELMK 2484

  Fly  2301 TAYLKKAPPPKRQFSA-PSLMNPKHMEVLQEFGILNYDQPVSPQNIAAMKANKIREKQRG----Q 2360
            ....|::||.|..... |...||||..||.|.|| |||:|:.|..:|:::|.:|.::::.    |
  Rat  2485 MTAGKRSPPIKPLLGMNPFQKNPKHASVLAESGI-NYDKPLPPIQVASLRAERIAKEKKALADQQ 2548

  Fly  2361 QMSQPPVGVGVVQQMQQQSQ--QQQQPAPPPLPQQQQPQQVVQQVQQQQQQQQQQQQQQVVQQQL 2423
            :..||||.....||..||.|  ||||..|||.|||..|     .|.|.|....|....|.|.|  
  Rat  2549 KAQQPPVTQPPPQQQPQQQQPPQQQQQQPPPPPQQPPP-----PVPQPQAASSQTPAGQPVVQ-- 2606

  Fly  2424 PTVSNVQQTLPVQQTVELVQQQPTTTTTVAVPAAGGQLQQLQIQHLTSSNVSPGQQTAILLHQPQ 2488
            |.|....|..|||..   .:.|.|.||..:.....|.::    ..:|.:::..|..:.       
  Rat  2607 PQVQAQPQPPPVQAQ---SKGQATMTTVGSAAVLAGTIK----TSVTGTSIPTGTVSG------- 2657

  Fly  2489 QQLRTHPGQGGQSNTQQLVKTIVG---TSSSLTAGQLQQLAQQSAVASGGQSSVSVVLTTPVQTL 2550
                           ..:|.||.|   |..|:.......:|..:...|||.:...||.|.     
  Rat  2658 ---------------NVIVNTIAGVPATFQSINKRLASPVAPGALTTSGGSAPAQVVHTQ----- 2702

  Fly  2551 PSVVQPQIGSGAQIVSISSQTLPVNSSPQLGSIVQTQSLPQVVSVSTLPTVGTVLTTTANQPQQQ 2615
                |..:||            |..::..|.|:..||.:..|.||:....|.|.||..  |...:
  Rat  2703 ----QRAVGS------------PATATTDLVSMTTTQGVRAVTSVTASAVVTTNLTPV--QTPTR 2749

  Fly  2616 HQTTAVTTLNTTMLRGQRIVSTAAGNTLQQRTTAGGQ----------SIVSMPNL-GQGASPSQF 2669
            ...|.|:......|.|:.|...|....|:|:.....|          |.|.:|.| ||..||:|.
  Rat  2750 SLVTQVSQATGVQLPGKTITPAAHFQLLRQQQQQQQQQQQQQQQQQTSQVQVPQLQGQAQSPAQM 2814

  Fly  2670 QTQLRLA------------AVPTSPATQTTQLVTTKGIPVSALQQGGKTTVIPVTQQSGGAHIQL 2722
            :...:||            .:|..|.....|    .|.|....|...:|...|..|||.      
  Rat  2815 KAVGKLAPEHIIKMQKQKMQLPPQPPPPQAQ----PGPPQQPAQVQVQTAQPPQQQQSP------ 2869

  Fly  2723 YRQRSLKVLQTTTQAVPSGSAGATGAT-ANLVQAGGTIIQASNMATHVTSQKVAVSGMPGTSTTV 2786
                     |.||...|...|..||.| |||..|..|.:..|                       
  Rat  2870 ---------QLTTVTAPRPGALLTGTTVANLQVARLTRVPTS----------------------- 2902

  Fly  2787 QAGNVVSSVQMHGQARTQFIKQMAAGKQQLQRQVVSADGTTTTTAAGDMLLVKRHNILAAQKAQQ 2851
                                        |||.|                                
  Rat  2903 ----------------------------QLQAQ-------------------------------- 2907

  Fly  2852 ASGALFTTTTGQQQQQQQQQGQLPVAGQPQQVTQHQIASLVKASTAAAASGSSV-----NAGGVT 2911
                      ||.|.|..|..|:.:|..|           |.:..||..|...|     |..|::
  Rat  2908 ----------GQMQTQTPQPAQVALAKPP-----------VVSVPAAVVSSPGVTTLPMNVAGIS 2951

  Fly  2912 VSATNPTVQAGSVNMTLPQLKPGSQIKVTMPNQMRH-LQMQQQLTMPRKI--SRMTQLVSASGQP 2973
            |:...|...||             |..|..|..::. |:::||....:|.  .::.|..:|..|.
  Rat  2952 VAIGQPQKTAG-------------QTVVAQPVHVQQLLKLKQQAVQQQKAIQPQVAQGQAAVQQK 3003

  Fly  2974 TATNIITTTGPQQQQQGVTVSGGGT--LPTVASQQQQQQHQQKVGGGNSVQAQLLHIQNTKGLSN 3036
            ..|..|||.||||:..........|  |.|..||      .||:.|...||.|:...:..:.:..
  Rat  3004 LTTQQITTQGPQQKVAYAAQPALKTQFLTTPISQ------AQKLAGTQQVQTQIQVAKLPQVVQQ 3062

  Fly  3037 SVTMQQIQQVMRSGQQGTLATTNLVLGKTSVG---RVIP-VSVASQANQRQTI--QVVSAASAQA 3095
            ...:..||||..:.||.:..|..|... |:.|   ::|| |:..:|..|::.|  |||:.|||..
  Rat  3063 QTPVASIQQVASASQQASPQTVTLTQA-TAAGQQVQMIPTVTATAQVVQQKLIQQQVVTTASASL 3126

  Fly  3096 LAAGNLRTHVAGPSIASTLKVAAPGSAGGQTTQQTLIAALQHNQRQNASPVRLQT 3150
            ...|       |||.|.     .|.|:.....|..|        :.....|||:|
  Rat  3127 QTPG-------GPSPAQ-----LPTSSDSPNQQPKL--------QMRVPAVRLKT 3161

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
domNP_001286676.1 HSA 543..614 CDD:214727 37/70 (53%)
HepA 692..>1235 CDD:440319 189/545 (35%)
DEXQc_SRCAP 949..1171 CDD:350761 105/221 (48%)
SF2_C_SNF 1685..1817 CDD:350180 75/131 (57%)
DISARM_DrmD_b <1702..>1936 CDD:468472 97/242 (40%)
HEC1 <1858..>2031 CDD:444066 43/181 (24%)
SP1-4_N 2486..>2819 CDD:425404 77/359 (21%)
Ep400XP_063127436.1 None

Return to query results.
Submit another query.