DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MTTP and Mttp

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000244.2 Gene:MTTP / 4547 HGNCID:7467 Length:894 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001156929.1 Gene:Mttp / 17777 MGIID:106926 Length:909 Species:Mus musculus


Alignment Length:895 Identity:752/895 - (84%)
Similarity:816/895 - (91%) Gaps:2/895 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MILLAVLFLCFISSYSASVKGHTTGLSLNNDRLYKLTYSTEVLLDRGKGKLQDSVGYRISSNVDV 65
            ::|...:.|.|.:..:....||||||||||:|||||||||||.||.||||.||||||:|||:|||
Mouse    16 LLLFYAVLLLFPTLCAMQNSGHTTGLSLNNERLYKLTYSTEVFLDGGKGKPQDSVGYKISSDVDV 80

Human    66 ALLWRNPDGDDDQLIQITMKDVNVENVNQQRGEKSIFKGKSPSKIMGKENLEALQRPTLLHLIHG 130
            .||||||||||||:||:|:..|||||..|||||||||:|||..||:||:||||||||.||||:.|
Mouse    81 VLLWRNPDGDDDQVIQVTITAVNVENAGQQRGEKSIFQGKSTPKIIGKDNLEALQRPMLLHLVRG 145

Human   131 KVKEFYSYQNEAVAIENIKRGLASLFQTQLSSGTTNEVDISGNCKVTYQAHQDKVIKIKALDSCK 195
            ||||||||:||.|.|||:|||||||||.||||||||||||||:|||||||.||||:||||||:||
Mouse   146 KVKEFYSYENEPVGIENLKRGLASLFQMQLSSGTTNEVDISGDCKVTYQAQQDKVVKIKALDTCK 210

Human   196 IARSGFTTPNQVLGVSSKATSVTTYKIEDSFVIAVLAEETHNFGLNFLQTIKGKIVSKQKLELKT 260
            |.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||..|.|||.|||.|||||||||||||
Mouse   211 IERSGFTTANQVLGVSSKATSVTTYKIEDSFVTAVLAEETRAFALNFQQTIAGKIVSKQKLELKT 275

Human   261 TEAGPRLMSGKQAAAIIKAVDSKYTAIPIVGQVFQSHCKGCPSLSELWRSTRKYLQPDNLSKAEA 325
            ||||||::.|||.|.:||||||||.||||||||.:..|||||||:|.|:|.||.|:|:|||||||
Mouse   276 TEAGPRMIPGKQVAGVIKAVDSKYKAIPIVGQVLERVCKGCPSLAEHWKSIRKNLEPENLSKAEA 340

Human   326 VRNFLAFIQHLRTAKKEEILQILKMENKEVLPQLVDAVTSAQTSDSLEAILDFLDFKSDSSIILQ 390
            |::||||||||||:::||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Mouse   341 VQSFLAFIQHLRTSRREEILQILKAEKKEVLPQLVDAVTSAQTPDSLEAILDFLDFKSDSSIILQ 405

Human   391 ERFLYACGFASHPNEELLRALISKFKGSIGSSDIRETVMIITGTLVRKLCQNEGCKLKAVVEAKK 455
            ||||||||||:||:|||||||:||||||..|:||||:||||.|.|||||||||||||||||||||
Mouse   406 ERFLYACGFATHPDEELLRALLSKFKGSFASNDIRESVMIIIGALVRKLCQNEGCKLKAVVEAKK 470

Human   456 LILGGLEKAEKKEDTRMYLLALKNALLPEGIPSLLKYAEAGEGPISHLATTALQRYDLPFITDEV 520
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||:||||||.|||||:.||||||
Mouse   471 LILGGLEKPEKKEDTTMYLLALKNALLPEGIPLLLKYAEAGEGPVSHLATTVLQRYDVSFITDEV 535

Human   521 KKTLNRIYHQNRKVHEKTVRTAAAAIILNNNPSYMDVKNILLSIGELPQEMNKYMLAIVQDILRF 585
            |||||||||||||||||||||.|||:|| .||||||||||||||||||:|||||||.:|||||.|
Mouse   536 KKTLNRIYHQNRKVHEKTVRTTAAAVIL-KNPSYMDVKNILLSIGELPKEMNKYMLTVVQDILHF 599

Human   586 EMPASKIVRRVLKEMVAHNYDRFSRSGSSSAYTGYIERSPRSASTYSLDILYSGSGILRRSNLNI 650
            ||||||::|||||||..|||||||:||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse   600 EMPASKMIRRVLKEMAVHNYDRFSKSGSSSAYTGYVERSPRAASTYSLDILYSGSGILRRSNLNI 664

Human   651 FQYIGKAGLHGSQVVIEAQGLEALIAATPDEGEENLDSYAGMSAILFDVQLRPVTFFNGYSDLMS 715
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   665 FQYIGKAELHGSQVVIEAQGLEGLIAATPDEGEENLDSYAGMSAILFDVQLRPVTFFNGYSDLMS 729

Human   716 KMLSASGDPISVVKGLILLIDHSQELQLQSGLKANIEVQGGLAIDISGAMEFSLWYRESKTRVKN 780
            |||||||||:||||||||||||||::|||||||||:|:||||||||||:||||||||||||||||
Mouse   730 KMLSASGDPVSVVKGLILLIDHSQDIQLQSGLKANMEIQGGLAIDISGSMEFSLWYRESKTRVKN 794

Human   781 RVTVVITTDITVDSSFVKAGLETSTETEAGLEFISTVQFSQYPFLVCMQMDKDEAPFRQFEKKYE 845
            ||.||||:|:|||:||||||:|:..|||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||
Mouse   795 RVAVVITSDVTVDASFVKAGVESRAETEAGLEFISTVQFSQYPFLVCMQMDKAEAPLRQFETKYE 859

Human   846 RLSTGRGYVSQKRKESVLAGCEFPLHQENSEMCKVVFAPQPDS-TSSGWF 894
            ||||||||||::||||::||||.||||||||||.|||.|||:| .|.|||
Mouse   860 RLSTGRGYVSRRRKESLVAGCELPLHQENSEMCNVVFPPQPESDNSGGWF 909

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MTTPNP_000244.2 Vitellogenin_N 28..584 CDD:460170 467/555 (84%)
MTP_lip_bd 592..886 CDD:466086 260/293 (89%)
MttpNP_001156929.1 Vitellogenin_N 43..597 CDD:460170 466/554 (84%)
MTP_lip_bd 606..900 CDD:466086 260/293 (89%)

Return to query results.
Submit another query.