Protein Alignment na and scn12aa

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001096981.2
• Gene: na / 45338
• FlyBaseID: FBgn0002917
• Length: 2233
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009297176.2
• Gene: scn12aa / 795688
• ZFINID: ZDB-GENE-060908-2
• Length: 1940
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 2023
• Identity: 393/2023 - (19%)
• Similarity: 709/2023 - (35%)
• Gaps: 652/2023 - (32%)

  Fly   361 LMRLCA-LVSLTSVSLNTPKTFERYPSLQFITFASDTAVTLLFTAEMIAKMHIRGVLHGEVPYLK 424
            |..:|. |.:...::::.|..:.:|  |:: ||      |.::|.|.:.|:..||.......:|:
Zfish   133 LFIMCTILTNCCFMAMSDPPLWTKY--LEY-TF------TGIYTFESLIKILARGFCTECFTFLR 188

  Fly   425 DHWCQFDASMVSFLWISIILQIFEVLEIVPKFSYLSIMRAPRPLIMIRFLRVFLKFSMPKSRINQ 489
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Zfish   189 DPWNWLDFSVI-------------VMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA 240

  Fly   490 IFKRSSQQIYNVTLFFLFFMSLYGLLGVQ-FFGELKNHCVMN-----------NTEYDLYKRPIL 542
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Zfish   241 LI-QSVKKLADVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGILRQKCVRSIGHCVNSTYPGNGSFVCNNKTWL 304

  Fly   543 TINS-LAIPDTF-----------CSMDPDSGYQCSPGMVCMKMDFLSSYVIGFNGFEDIATSIFT 595
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Zfish   305 SVKDFLTNEDNFYKIEGSKDALICGYSSDAG-KCPDGFDCLKTSRNPNY--GYTSFDTFGWAFLG 366

  Fly   596 VYQAASQEGWVFIMYRAIDSLPAWRAAFYFSTMIFFL-AWLVKNVFIAVITETFNE-IRVQFQQM 658
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Zfish   367 LFRLMTQDYWESLYHQTLRS--AGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAEA 429

  Fly   659 WG-------ARGHIQK------------------------------------------------- 667
            |.       |..|::|
Zfish   430 WAKEREFQLAMEHLRKEQRALAKQRRKEAEMALAADFCPSPFSRKDSIKCRTRTRSHRTLSEEIE 494

  Fly   668 --------------------TAASQILS----------------------GND------------ 678
                                |.:|..||                      .:|
Zfish   495 DSFLPKFEPLDEKPAHPLLATLSSHPLSTRRGSQMSIFTFRPRNSSEADFADDEHSVADYGRSRA 559

  Fly   679 ----TGW-----------------------RL-VTIDDNKHGGLA-------------------- 695
                |.|                       || ::::.|...|:.
Zfish   560 GSMATPWHKHRTGSIRSHSSQVFTPTLANGRLNISLEQNGITGIGLHTPTTGPKFSMEKVKEGTE 624

  Fly   696 PE-----------------------------------------------------------TC-- 699
            ||                                                           ||
Zfish   625 PECQNEQIKLTVDVQEEVPPPRRKRGLSSVSFFSDAMDELEEARQKCPPCWYEFAQKYLIWTCSP 689

  Fly   700 ---------HAILRSPYFRMLVMSVILANGIVTATMTFKHDGRP-RDVFYERYYYIELVFTCLLD 754
                     ..::..|:..:.:...|:.|   |..|..:|  .| .|.|........||||.:..
Zfish   690 AWLRVKEGLKVMVMDPFLDLAITICIVLN---TLFMALEH--YPMTDEFNSMLSIGNLVFTGIFT 749

  Fly   755 LETLFKIYCLGWRGYYKHSIHKFELLLAAGTTLHIVPMFYPSGLTY---FQVLRVVRLIKASPML 816
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Zfish   750 AEMVLKIFALDPYYYFQQGWNIFDGIIVC-LSLMELGLSNVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTL 813

  Fly   817 EGFVYKIFGPG-KKLGSLIIFTMCLLIISSSISMQLF--------C---FLCDFTKF--ESFPEA 867
            ...: ||.|.. ..||:|.:....::.|.:.:.||||        |   :.|...::  :.|..:
Zfish   814 NTLI-KIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYQDCVCKISYDCTLPRWHMKDFFHS 877

  Fly   868 FMSMFQILTQEAWVEVMDETMIRTSKTLTPLVAVYFILYHLFVTLIVLSLFVAVIL-----DNLE 927
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Zfish   878 FLIVFRVLCGE-WIETMWDCMEVAGQ---PLCILVFMLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLS 938

  Fly   928 LDEDIKKLKQLK---------FREQSAEIKETLPFRLRIFEKFPDSPQMTILHRIPNDFMLPKVR 983
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Zfish   939 APDEDGEMNNLQIAIARIHCGFSWLLNGIKDLFSGNLTRHRRKSKEAQVTLNHTECNGGL----- 998

  Fly   984 ESFMKHFVIELETEDSLVENCKRPMSEC-----WESNVVFRKQKPVRIMNKTAKVRAAGSSLRKL 1043
             ..::.:|.. |||||.:.|..  ::.|     .||:|.|.:::                  .:.
Zfish   999 -GSLEKYVFP-ETEDSYMTNPN--LTICVPIAPGESDVEFLEEE------------------EEE 1041

  Fly  1044 AITHIINDSNNQRLMLGDSAMLPVVGTKGGGGLKSQGTITHSKPWRVDQKKFGSRSIRRSVRSGS 1108
            ..|....|..                       :.|..|:.|:...||.:|.|..
Zfish  1042 EDTESSEDEE-----------------------EKQEVISLSEGSTVDLRKPGED---------- 1073

  Fly  1109 IKLKQTYEHLMENGDIAAAPRANSGRARPHDLDIKLLQAKRQQAEMRRNQREEDLRENHPFF--- 1170
               ::.|..:.::|                                      .|..|..|.|
Zfish  1074 ---EEEYSEMADDG--------------------------------------MDPEECFPEFCMQ 1097

  Fly  1171 -------DTPLFLVPRESRFRKICQKIVHARYDARLKDPLTGKERKVQYKSLHNFLGLVTYLDWV 1228
                   :|...|.....|.||.|.:||.                       |      ::.:..
Zfish  1098 RCKCCNINTTQGLGQMWWRLRKTCYQIVE-----------------------H------SWFETF 1133

  Fly  1229 MIFATTLSCISMMFET--PNYRVMDHPTLQIAEYGFVIFMSLELALKILADGLFFTPKAYIKDVA 1291
            :||...||..::.||.  ...|.:....|:.|:..|.....||:.||.:|.|.    |.|..:..
Zfish  1134 IIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKVVKVVLEYADKVFSYIFVLEMFLKWIAYGF----KKYFTNYW 1194

  Fly  1292 AALDVFIYVVSTSFLCWMPLNIPTNSAAQLLMILRCVRPLRIFTLVPHMRKVVYELCRGFKEILL 1356
            ..||..|..||...|....|......|.:.|..||.:||||..:....||.||..|......|:.
Zfish  1195 CWLDFLIVDVSLISLVANSLGYSDFGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMN 1259

  Fly  1357 VSTLLILLMFIFASYGVQLYGGRLARC--------NDPTISRREDCVGVFMRRVFVTKMKLTPGP 1413
            |..:.::...||:..||.|:.|:..:|        |...::.:.:|:.:...:.:.||:|:
Zfish  1260 VLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGKCVNRTGFIHNASIVNNKTECLSMNDTQFYWTKVKV---- 1320

  Fly  1414 DESYPAMLVPRVWANPRRFNFDNIGDAMLTLFEVLSFKGWLD----------VRDVLIKAVGPVH 1468
                               ||||:|...|:|.:|.:||||::          |.|..||.:....
Zfish  1321 -------------------NFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMEIMYAAVDSRGVEDQPIKEINLYM 1366

  Fly  1469 AVYIHIYIFLGCMIGLTLFVGVVIANYSENK-----GTALLTVDQRRWCDLKKRLKIAQPLHLPP 1528
            .:|..|:|..|....|.||:||:|.|:::.|     ....:|.:|:::.:..|:|...:|....|
Zfish  1367 YLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKRMIGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIP 1431

  Fly  1529 RPDGRKIRAFTYDITQHIIFKRVIAVVVLINSMLLSITWIKGEVHTERLV-IVSAVLTFVFVVEV 1592
            || ...::.|.:|:.....|...|.:::::|.:.:.:...:.....|.:: .::.....:|..|.
Zfish  1432 RP-MNILQGFFFDLVSKQAFDITIMMLIILNMITMMVETDEQSARMETILNNINLAFIVIFTTEC 1495

  Fly  1593 VMKNIAFTPRGY-----WQSRRNRYDLLVTVAGVI--------WIILQTILRNDLSYFFG---FM 1641
            ::|  .|..|.|     |    |.:|.:|.:..::        .|:|..|:.   .||..   |.
Zfish  1496 LIK--IFALRCYFFTISW----NIFDFVVVILSIVGKCTTFQSGIVLADIIE---KYFVSPTLFR 1551

  Fly  1642 VVIL----RFFTITGKHTTLKMLMLTVGVSVCKSFFIIFGMFLLVFFYALAGTILFGTVKYGEGI 1702
            |:.|    |...:......::.|:..:.:|:...|.|...:||::|.||:.|...|..||...||
Zfish  1552 VIRLARIGRVLRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMANFAYVKKQGGI 1616

  Fly  1703 GRRANFGSPVTGVAMLFRIVTGEDWNKIMHDCMVQPP------YCTLGNNYWETDCGNFTASLIY 1761
            ....||.:....:..||:|.|...||.::...:...|      :...|.| .:.:||:.:..:.:
Zfish  1617 DDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWNNLLDPILNNSPEECSSSFANTGTN-TKGNCGHPSVGITF 1680

  Fly  1762 FCTFYVIITYIVLNLLVAIIMENFSLFYSNEEDALLSYADIRNFQNTWNIVDIHQRGVI------ 1820
            |.::.:|...||:|:.:|||:||||: .:.|....||..|...|...|...|:.....|
Zfish  1681 FVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSV-ATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKFDVEATHFIEYAKLS 1744

  Fly  1821 --------PVR-----RVKFI---LRLLKG-RLEC------------------DPQKDRLLFKYM 1850
                    |:|     ::|.|   |.::.| |:.|                  |..|.::..|:|
Zfish  1745 NFADSLSEPLRIAKPNKIKLIHMDLPMVNGDRIHCLDILFAFTKRVLGETGEMDALKQQMEEKFM 1809

  Fly  1851 CYELDKLHNGEDVT---------FHDVINMLSYRSVDIRKALQLEELLAREEFEYLVEEEVAKMT 1906
            .....|:.: |.:|         ....:...:||:..||:.::....|.|.     :.:|.
Zfish  1810 VTNPSKISH-EPITTTLRRKQEEISATLIQRAYRAHLIRRQMKQASYLYRH-----INQET---- 1864

  Fly  1907 IRTWLEGCLKKIRAQNASKQQNSLIAGLRATNEQPVMRPNIQEDKAPLGAVDKSAISTISGAVAG 1971
              .|.|        ::::.:|..|||.:            |:|:..|     :..:.|:..|
Zfish  1865 --PWSE--------EDSAPEQEGLIASM------------IKENYGP-----EKTVGTLCYA--- 1899

  Fly  1972 ACPPTSDA 1979
            :.||:.:|
Zfish  1900 SSPPSYEA 1907

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
na	NP_001096981.2	Ion_trans	361..654	CDD:459842	66/319 (21%)
		Ion_trans	705..927	CDD:459842	65/244 (27%)
		Ion_trans	1224..1497	CDD:459842	79/292 (27%)
		Ion_trans	1545..1793	CDD:459842	63/274 (23%)
scn12aa	XP_009297176.2	None