DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment na and Nalcn

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001096981.2 Gene:na / 45338 FlyBaseID:FBgn0002917 Length:2233 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001380622.1 Gene:Nalcn / 266760 RGDID:628710 Length:1770 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1825 Identity:984/1825 - (53%)
Similarity:1238/1825 - (67%) Gaps:106/1825 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   321 MLGRKQSLKGGEPFLADYGPEESLNESADIEWVNKLWVRRLMRLCALVSLTSVSLNTPKTFERYP 385
            ||.||||.:.....:.|:||:|||:::|||.|:||.||..|:|:||::|:.||.:|||.|||.||
  Rat     1 MLKRKQSSRVEAQPVTDFGPDESLSDNADILWINKPWVHSLLRICAIISVISVCMNTPMTFEHYP 65

  Fly   386 SLQFITFASDTAVTLLFTAEMIAKMHIRGVLHGEVPYLKDHWCQFDASMVSFLWISIILQIFEVL 450
            .||::||..||.:..|:||||||||||||::.|:..|:||.||.||..||..||:|::||:||:.
  Rat    66 PLQYVTFTLDTLLMFLYTAEMIAKMHIRGIVKGDSSYVKDRWCVFDGFMVFCLWVSLVLQVFEIA 130

  Fly   451 EIVPKFSYLSIMRAPRPLIMIRFLRVFLKFSMPKSRINQIFKRSSQQIYNVTLFFLFFMSLYGLL 515
            :||.:.|...::|.||||||||..|::.:|.:|::||..|.|||.:||::|::|.|||:.|||:|
  Rat   131 DIVDQMSPWGMLRIPRPLIMIRAFRIYFRFELPRTRITNILKRSGEQIWSVSIFLLFFLLLYGIL 195

  Fly   516 GVQFFGELKNHCVMNNTEYDLYKRPILTINSLAIPDTFCSMDPDSGYQCSPGMVCMKMD--FLSS 578
            |||.||....|||:|:|     |...:|.||||||||.||.:.:.||||.||..||.::  .||.
  Rat   196 GVQMFGTFTYHCVVNDT-----KPGNVTWNSLAIPDTHCSPELEEGYQCPPGFKCMDLEDLGLSR 255

  Fly   579 YVIGFNGFEDIATSIFTVYQAASQEGWVFIMYRAIDSLPAWRAAFYFSTMIFFLAWLVKNVFIAV 643
            ..:|::||.:|.|||||||:|:|||||||:|||||||.|.||:.|||.|:|||||||||||||||
  Rat   256 QELGYSGFNEIGTSIFTVYEASSQEGWVFLMYRAIDSFPRWRSYFYFITLIFFLAWLVKNVFIAV 320

  Fly   644 ITETFNEIRVQFQQMWGARGHIQKTAASQILSGNDT-GWRLVTIDDNKHGGLAPETCHAILRSPY 707
            |.|||.|||||||||||.|.....||.:|:...:.. ||:||.:|.||..|.||.....::||..
  Rat   321 IIETFAEIRVQFQQMWGTRSSTTSTATTQMFHEDAAGGWQLVAVDVNKPQGRAPACLQKMMRSSV 385

  Fly   708 FRMLVMSVILANGIVTATMTFKHDGRPRDVFYERYYYIELVFTCLLDLETLFKIYCLGWRGYYKH 772
            |.|.::|::..:.||.|:..:|.:...|.  |:.:|..|:.||.|.|||.|.||:|||:.||...
  Rat   386 FHMFILSMVTVDVIVAASNYYKGENFRRQ--YDEFYLAEVAFTVLFDLEALLKIWCLGFTGYISS 448

  Fly   773 SIHKFELLLAAGTTLHIVPMFYPSGLTYFQVLRVVRLIKASPMLEGFVYKIFGPGKKLGSLIIFT 837
            |:|||||||..|||||:.|..|.|..|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||::||
  Rat   449 SLHKFELLLVIGTTLHVYPDLYHSQFTYFQVLRVVRLIKISPALEDFVYKIFGPGKKLGSLVVFT 513

  Fly   838 MCLLIISSSISMQLFCFLCDFTKFESFPEAFMSMFQILTQEAWVEVMDETMIRTSKTLTPLVAVY 902
            ..|||:.|:||:|:|||:.:..:|.:||.||||||||||||.||:|||:|:........||||:|
  Rat   514 ASLLIVMSAISLQMFCFVEELDRFTTFPRAFMSMFQILTQEGWVDVMDQTLNAVGHMWAPLVAIY 578

  Fly   903 FILYHLFVTLIVLSLFVAVILDNLELDEDIKKLKQLKFREQSAEIKETLPFRLRIFEKFPDSPQM 967
            |||||||.|||:|||||||||||||||||:|||||||..|.:|:.||.||.|||||||||:.|||
  Rat   579 FILYHLFATLILLSLFVAVILDNLELDEDLKKLKQLKQSEANADTKEKLPLRLRIFEKFPNRPQM 643

  Fly   968 TILHRIPNDFMLPKVRESFMKHFV------------IELETEDSLVENCKRPMSECWESNVVFRK 1020
            ..:.::|:||.:||:||||||.|:            |...|..|..:|.|||..|  ::..:.:|
  Rat   644 VKISKLPSDFTVPKIRESFMKQFIDRQQQDTCCLFRILPSTSSSSCDNPKRPTVE--DNKYIDQK 706

  Fly  1021 QKPVRIMNKTAKVRAAGSSLRKLAITHIINDSNNQRLMLGDSAMLPVVGTKGGGGLKSQGTITHS 1085
                 :......:||.....::.|:|.|:.....||::.|.....|   .|....|..|..|   
  Rat   707 -----LRKSVFSIRARNLLEKETAVTKILRACTRQRMLSGSFEGQP---AKERSILSVQHHI--- 760

  Fly  1086 KPWRVDQKKFGSRSIRRSVRSGS----IKLKQTYEHLMENGDIAAAPRANSGR---ARPHDLDIK 1143
                        |..|||:|.||    |...::.|.|.::       .:|:.|   |:..|.:||
  Rat   761 ------------RQERRSLRHGSNSQRISRGKSLETLTQD-------HSNTVRYRNAQREDSEIK 806

  Fly  1144 LLQAKRQQAEMRRNQREEDLRENHPFFDTPLFLVPRESRFRKICQKIVHARYDARLKDPLTGKER 1208
            ::|.|::||||:|..:||:||||||:||.|||:|.||.|||..|:.:|.||::|...||:||..:
  Rat   807 MIQEKKEQAEMKRKVQEEELRENHPYFDKPLFIVGREHRFRNFCRVVVRARFNASKTDPVTGAVK 871

  Fly  1209 KVQYKSLHNFLGLVTYLDWVMIFATTLSCISMMFETPNYRVMDHPTLQIAEYGFVIFMSLELALK 1273
            ..:|..|::.||||||||||||..|..||||||||:|..|||..||||||||.||||||:||.||
  Rat   872 NTKYHQLYDLLGLVTYLDWVMITVTICSCISMMFESPFRRVMHAPTLQIAEYVFVIFMSIELNLK 936

  Fly  1274 ILADGLFFTPKAYIKDVAAALDVFIYVVSTSFLCWMPLNIPTNSAAQLLMILRCVRPLRIFTLVP 1338
            |:||||||||.|.|:|....:|:|||:||..||||||.|:|..|.|||||:|||:||||||.|||
  Rat   937 IMADGLFFTPTAVIRDFGGVMDIFIYLVSLIFLCWMPQNVPAESGAQLLMVLRCLRPLRIFKLVP 1001

  Fly  1339 HMRKVVYELCRGFKEILLVSTLLILLMFIFASYGVQLYGGRLARCNDPTISRREDCVGVFMRRVF 1403
            .|||||.||..|||||.|||.||:.||.:|||:||||:.|:||:||||.|.|||||.|:|...|.
  Rat  1002 QMRKVVRELFSGFKEIFLVSILLLTLMLVFASFGVQLFAGKLAKCNDPNIIRREDCNGIFRINVS 1066

  Fly  1404 VTK---MKLTPGPDESYPAMLVPRVWANPRRFNFDNIGDAMLTLFEVLSFKGWLDVRDVLIKAVG 1465
            |:|   :||.||  |..|...|||||||||.|||||:|:|||.||||||.|||::||||:|..||
  Rat  1067 VSKNLNLKLRPG--EKKPGFWVPRVWANPRNFNFDNVGNAMLALFEVLSLKGWVEVRDVIIHRVG 1129

  Fly  1466 PVHAVYIHIYIFLGCMIGLTLFVGVVIANYSENKGTALLTVDQRRWCDLKKRLKIAQPLHLPPRP 1530
            |:|.:|||:::||||||||||||||||||::|||||||||||||||.|||.||||||||||||||
  Rat  1130 PIHGIYIHVFVFLGCMIGLTLFVGVVIANFNENKGTALLTVDQRRWEDLKSRLKIAQPLHLPPRP 1194

  Fly  1531 DGRKIRAFTYDITQHIIFKRVIAVVVLINSMLLSITWIKGEVHTERLVIVSAVLTFVFVVEVVMK 1595
            |....||..||||||..|||.||::||..|:|||:.|...:..|..|..:|.|.||:||:||.||
  Rat  1195 DNDGFRAKMYDITQHPFFKRTIALLVLAQSVLLSVKWDVEDPVTVPLATMSVVFTFIFVLEVTMK 1259

  Fly  1596 NIAFTPRGYWQSRRNRYDLLVTVAGVIWIILQTILRNDLSYFFGFMVVILRFFTITGKHTTLKML 1660
            .||.:|.|:|||||||||||||..||:|::|...|.|..:|..|..|::.|||:|.|||.|||||
  Rat  1260 IIAMSPAGFWQSRRNRYDLLVTSLGVVWVVLHFALLNAYTYMMGACVIVFRFFSICGKHVTLKML 1324

  Fly  1661 MLTVGVSVCKSFFIIFGMFLLVFFYALAGTILFGTVKYGEGIGRRANFGSPVTGVAMLFRIVTGE 1725
            :|||.||:.||||||.|||||:..||.||.:|||||||||.|.|.|||.|....:.:||||||||
  Rat  1325 LLTVVVSMYKSFFIIVGMFLLLLCYAFAGVVLFGTVKYGENINRHANFSSAGKAITVLFRIVTGE 1389

  Fly  1726 DWNKIMHDCMVQPPYCTLGN-NYWETDCGNFTASLIYFCTFYVIITYIVLNLLVAIIMENFSLFY 1789
            ||||||||||||||:||... .||.|||||:..:|:|||:|||||.||:||||||||:|||||||
  Rat  1390 DWNKIMHDCMVQPPFCTPDEFTYWATDCGNYAGALMYFCSFYVIIAYIMLNLLVAIIVENFSLFY 1454

  Fly  1790 SNEEDALLSYADIRNFQNTWNIVDIHQRGVIPVRRVKFILRLLKGRLECDPQKDRLLFKYMCYEL 1854
            |.|||.||||.|:|:||..||:||..:.||||..||||:||||:||||.|..||:||||:||||:
  Rat  1455 STEEDQLLSYNDLRHFQIIWNMVDDKREGVIPTFRVKFLLRLLRGRLEVDLDKDKLLFKHMCYEM 1519

  Fly  1855 DKLHNGEDVTFHDVINMLSYRSVDIRKALQLEELLAREEFEYLVEEEVAKMTIRTWLEGCLKKIR 1919
            ::||||.|||||||::|||||||||||:||||||||||:.||.:||||||.|||.||:.|||:||
  Rat  1520 ERLHNGGDVTFHDVLSMLSYRSVDIRKSLQLEELLAREQLEYTIEEEVAKQTIRMWLKKCLKRIR 1584

  Fly  1920 AQNASKQQNSLIAGLRATNEQPVMR----PNIQEDKAPLGAVDKSAISTISGAVAGACPPTSDAF 1980
            |:  .:|..|:|..||.:.:|.:.|    |:|:..:                       |:.|  
  Rat  1585 AK--QQQSCSIIHSLRESQQQELSRFLNPPSIETTQ-----------------------PSED-- 1622

  Fly  1981 SPTFSSTENEEKDGSSSAVVQLPHSETSIAGTGSSATGAATATGTSSGLGVGPPTVQSTARHVMT 2045
              |.:::::......||:..||  ...:::..|.|...||........:|.......:.|.....
  Rat  1623 --TNANSQDHNTQPESSSQQQL--LSPTLSDRGGSRQDAADTGKPQRKIGQWRLPSAAIAEKTAP 1683

  Fly  2046 VGKRGYALNRSDSTGSSAGRKFLAPTSSDPQQRSTLSDKERL-HITSQQRKKNSMTTLPHAGQLG 2109
            |.|........:.......:.||||   .|...|..|...|. ..|:.:.....|..:|.....|
  Rat  1684 VNKMSSYSQDPEREEEEVSKGFLAP---KPISHSVSSVNLRFGGRTTMKSVVCKMNPMPDTASCG 1745

  Fly  2110 QLAKQ 2114
            ...|:
  Rat  1746 SEVKK 1750

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
naNP_001096981.2 Ion_trans 373..654 CDD:278921 164/282 (58%)
Ion_trans 734..927 CDD:278921 125/192 (65%)
Ion_trans 1240..1497 CDD:278921 177/259 (68%)
Ion_trans 1571..1793 CDD:278921 143/222 (64%)
NalcnNP_001380622.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 762..789 9/33 (27%)
PLN03223 <1336..1451 CDD:215637 80/114 (70%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166338312
Domainoid 1 1.000 390 1.000 Domainoid score I757
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H21832
Inparanoid 1 1.050 1841 1.000 Inparanoid score I54
OMA 1 1.010 - - QHG48327
OrthoDB 1 1.010 - - D16416at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004135
OrthoInspector 1 1.000 - - oto96464
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_104443
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR46141
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X3959
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.910

Return to query results.
Submit another query.