DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment na and nca-2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001096981.2 Gene:na / 45338 FlyBaseID:FBgn0002917 Length:2233 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_498054.2 Gene:nca-2 / 175674 WormBaseID:WBGene00003558 Length:1785 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1747 Identity:839/1747 - (48%)
Similarity:1141/1747 - (65%) Gaps:111/1747 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   308 IGLGI--ATGIGNKIMLGRKQSLKG---------GEPF------LADYGPEESLNESADIEWVNK 355
            :||..  |..:...::..||.|:.|         ||..      :.:..|...:|:|.::  :::
 Worm     9 LGLSACRAAALSTTMLTRRKSSIDGTKTERNRRRGESIGGAFTDMINIEPTSIINKSTEL--LHE 71

  Fly   356 LWVRRLMRLCALVSLTSVSLNTPKTFERYPSLQFITFASDTAVTLLFTAEMIAKMHIRGVLHGEV 420
            .::|.::|:..|:|:.|:.|:||:|.:.:|.|.:|..|:|..|||:|..|....::..|:...:.
 Worm    72 RFLRDMVRVACLLSMISLCLHTPETIKMWPPLNYIILANDVIVTLIFIGEAAVTINQNGLFDNQN 136

  Fly   421 PYLKDHWCQFDASMVSFLWISIILQIFEVLEI-VPK-----FSYLSIMRAPRPLIMIRFLRVFLK 479
            .||:|.|.||:..::....:|.::.|:|:..| .|.     :.:|..:|:.||.|.:||:|..::
 Worm   137 SYLRDRWYQFEFFLLINHILSCVIHIYELCSIWFPALNFVYYPWLGALRSARPFIFLRFIRSIVR 201

  Fly   480 FSMPKSRINQIFKRSSQQIYNVTLFFLFFMSLYGLLGVQFFGELKNHCVMNNTEYDLYKRPILTI 544
            |.:||:||..|.|||||||.|||:||:||:..|.::|||.||.|..|||:|.|:.:     .:||
 Worm   202 FKLPKNRIKLIIKRSSQQIQNVTIFFMFFVFSYAIMGVQLFGRLNYHCVVNGTDPN-----NVTI 261

  Fly   545 NSLAIPDTFCSMDPDSGYQCSPGMVCMKMDFLSSYVIGFNG-FEDIATSIFTVYQAASQEGWVFI 608
            ..||||||.||.....||:|...||||::. |.....||.| |.|.|:|:||||.||||||||::
 Worm   262 ADLAIPDTMCSQKGAGGYECPGNMVCMRLQ-LKPQEEGFYGQFSDFASSLFTVYLAASQEGWVYV 325

  Fly   609 MYRAIDSLPAWRAAFYFSTMIFFLAWLVKNVFIAVITETFNEIRVQFQQMWGARGHIQKTAASQI 673
            :|..:||||::.|.|||.|:||||||||||||||||||||.||||||.:||..|........:|.
 Worm   326 LYDCLDSLPSFLAFFYFVTLIFFLAWLVKNVFIAVITETFAEIRVQFSEMWQTREATTDHVYTQK 390

  Fly   674 LSGNDTGWRLVTIDD-NKHGGLAPETCHAILRSPYFRMLVMSVILANGIVTATMTFKHD--GRPR 735
            |..::.||:||.:|. |:.........|.|:.|..|:.::..:||||.|..||..|.||  .:.|
 Worm   391 LEKDEDGWKLVEVDKYNRAHSNNSLFLHTIVTSTAFQTVMQLLILANAIFHATFVFYHDESDQIR 455

  Fly   736 DVFYERYYYIELVFTCLLDLETLFKIYCLGWRGYYKHSIHKFELLLAAGTTLHIVPMFYPSGL-T 799
            .::   |||:|:.||.|.:.|.:.|||..||:.|.....|||:.:|..|::|:.:.:.|.:.: |
 Worm   456 KIW---YYYVEVGFTILFNTEVIIKIYAFGWKAYIARGQHKFDCILCVGSSLNAIWVLYETNIFT 517

  Fly   800 YFQVLRVVRLIKASPMLEGFVYKIFGPGKKLGSLIIFTMCLLIISSSISMQLFCFLCDFTKFESF 864
            ||||.|:.||||||||||.|||||||||||||.|:|||..|||::|:||:||||::....||.:|
 Worm   518 YFQVFRIARLIKASPMLEDFVYKIFGPGKKLGGLVIFTGILLIVTSAISLQLFCYVPKLNKFTNF 582

  Fly   865 PEAFMSMFQILTQEAWVEVMDETMIRTSKTLTPLVAVYFILYHLFVTLIVLSLFVAVILDNLELD 929
            ..||||||||:|||.|.:|:.|.:...::...|.||:||:.|||.|||.||||||||||||||:|
 Worm   583 AVAFMSMFQIITQEGWTDVVIEILRACNEQAVPFVAIYFVAYHLLVTLFVLSLFVAVILDNLEMD 647

  Fly   930 EDIKKLKQLKFREQSAEIKETLPFRLRIFEKFPDSPQMTILHRIPNDFMLPKVRESFMKHFVIE- 993
            |::||:||||.|||.. ||.|||.|||||.:||.:|.|..:.::.::|.|||:|:||.:.|..| 
 Worm   648 EELKKVKQLKAREQDT-IKTTLPMRLRIFNRFPTAPTMVTMKKVSSEFPLPKIRDSFTRQFADEF 711

  Fly   994 LETEDSLVENCKRPMSECWESNVVFRKQKPVRIMNKTAKVRAAGSSLRKLAITHIINDSNNQRLM 1058
            :||.|..::...      ::...:...:.|.:....|..:|..|....|..:|.::.:||..|.:
 Worm   712 VETSDDTIQEIG------FKVRSMLSGRGPSKETRITTTIRHVGQLSNKTILTSMLTESNRNRAL 770

  Fly  1059 LGDSAMLPVVGTKGGGGLKSQGTITHSKPWRVDQKKFGSRSIRRSVRSGSIKLKQTYEHLMENGD 1123
            ..:|.......|:..         |.||..:.......|||..|.:  .|:|.|...|...||||
 Worm   771 FSESNQHLASLTRSN---------TSSKHGKSGALSTNSRSRTRGL--ASLKGKHMVEGFKENGD 824

  Fly  1124 IAAAPRANSGRARPH-DLDIKLLQAKRQQAEMRRNQREEDLRENHPFFDTPLFLVPRESRFRKIC 1187
            :  .|...:.:...| ::|.|.||.||..||:.||:.||::|||||.||.|||||.|||..|::|
 Worm   825 L--RPEDTARKVEKHGEIDFKALQMKRAHAEITRNRIEEEMRENHPMFDRPLFLVGRESSLRRMC 887

  Fly  1188 QKIVHARYDARLKDPLTGKERK--VQYKSLHNFLGLVTYLDWVMIFATTLSCISMMFETP----- 1245
            |.|.|:|:.....|   |:.||  .:||..|:||.::||:||.|:..|||||.||::|:|     
 Worm   888 QLIAHSRHSYDQND---GQHRKHSNKYKQFHDFLAIMTYMDWTMVLVTTLSCCSMLWESPWPTTG 949

  Fly  1246 NYRVMDHPTLQIAEYGFVIFMSLELALKILADGLFFTPKAYIKDVAAALDVFIYVVSTSFLCWMP 1310
            ...:.::..||||||.||:.||.||.:|.:|:||||||||.:.||...|.:|||:.|..||.|||
 Worm   950 ENLIFNNFYLQIAEYIFVLVMSFELIVKCIANGLFFTPKALVTDVGDILTIFIYITSLMFLIWMP 1014

  Fly  1311 LNIPTNSAAQLLMILRCVRPLRIFTLVPHMRKVVYELCRGFKEILLVSTLLILLMFIFASYGVQL 1375
            .:|..||.|||||:.|.:||||::.|:||:|:||.||||||:|||||:.||::|||||||:||||
 Worm  1015 NHIEINSWAQLLMVCRAMRPLRVYALIPHIRRVVVELCRGFREILLVTILLVVLMFIFASFGVQL 1079

  Fly  1376 YGGRLARCNDPTISRREDCVGVFMRRVFVTKMKLTPGPDE-SYPAMLVPRVWANPRRFNFDNIGD 1439
            .||:||.||||.|:.||:|.|::..::|||:|::....|. .:|:::|||||.|||.||||:||:
 Worm  1080 VGGKLASCNDPMITSRENCTGLYDVKLFVTRMEVYGKNDNLMHPSIIVPRVWTNPRNFNFDHIGN 1144

  Fly  1440 AMLTLFEVLSFKGWLDVRDVLIKAVGPVHAVYIHIYIFLGCMIGLTLFVGVVIANYSENKGTALL 1504
            |||.|||.||:|||..|||||....|....::||||:|:|||||||||||||:|||:||:|||||
 Worm  1145 AMLALFETLSYKGWNVVRDVLYLRHGAWAVLFIHIYVFIGCMIGLTLFVGVVVANYTENRGTALL 1209

  Fly  1505 TVDQRRWCDLKKRLKIAQPLHLPPR-PDGRKIRAFTYDITQHIIFKRVIAVVVLINSMLLSITWI 1568
            |||||||.|||.|||:|||||:||: |:..|:|.:.||:|....||::.||:|::||..|.|.|.
 Worm  1210 TVDQRRWHDLKARLKMAQPLHVPPKPPESAKLRCYLYDLTTSRWFKQLFAVLVVVNSFTLVIPWN 1274

  Fly  1569 KGEVHTER-----LVIVSAVLTFVFVVEVVMKNIAFTPRGYWQSRRNRYDLLVTVAGVIWIILQT 1628
            ..|....:     |.::||:...:|.:|.::|.||||..|:|||||||.|.::|:.|:.||:...
 Worm  1275 VSEEQDRKTFLLCLTVISAICNILFTLECLLKMIAFTLSGFWQSRRNRIDFIITILGINWIVFHF 1339

  Fly  1629 ILR------------NDLSYFFGFMVVILRFFTITGKHTTLKMLMLTVGVSVCKSFFIIFGMFLL 1681
            :.:            ..|:|.:|::|||||||||.|:.:|||||||||.:|:.:|.|||..||||
 Worm  1340 LFQLPAYFAGGITEWKRLTYTYGYLVVILRFFTIAGRKSTLKMLMLTVVMSMVRSSFIIAAMFLL 1404

  Fly  1682 VFFYALAGTILFGTVKYGEGIGRRANFGSPVTGVAMLFRIVTGEDWNKIMHDCMVQPPYCTL--G 1744
            |.|||.||.:|||.||||:.:|:..||.:....:.:|||.|||||||.||||||..||:|..  |
 Worm  1405 VLFYANAGVVLFGMVKYGQAVGKHVNFRNGREALVVLFRSVTGEDWNDIMHDCMRAPPFCNWHPG 1469

  Fly  1745 NNYWETDCGNFTASLIYFCTFYVIITYIVLNLLVAIIMENFSLFYSNEEDALLSYADIRNFQNTW 1809
            .:||:|||||:..:::|||:||:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||..|
 Worm  1470 LSYWQTDCGNYVGAIVYFCSFYLIITYIVLNLLVAIIMENFSLFYSSEEDALLSYADIRNFQLVW 1534

  Fly  1810 NIVDIHQRGVIPVRRVKFILRLLKGRLECDPQKDRLLFKYMCYELDKLHNGEDVTFHDVINMLSY 1874
            |:|||.|:..||||||||:|||||||||.:.:.|.||||:||:|:::||||:||:||||:|||||
 Worm  1535 NMVDIEQKRSIPVRRVKFLLRLLKGRLEVNDESDGLLFKHMCHEMERLHNGDDVSFHDVLNMLSY 1599

  Fly  1875 RSVDIRKALQLEELLAREEFEYLVEEEVAKMTIRTWLEGCLKKIRAQNASKQQNSLIAGLRATNE 1939
            |||||||:|||||||.|||.||::||||||.|||.|||.|||.|:|    ||.|:|  |..::..
 Worm  1600 RSVDIRKSLQLEELLQREELEYIIEEEVAKHTIRAWLENCLKNIKA----KQNNTL--GKMSSIG 1658

  Fly  1940 QPVMRPNIQEDKAPLGAVDKSAISTISGAVAGACPPTSDAFSPTFSSTENEEKDGSS 1996
            .....|..||            :.| .|.|.....|..|:......|.:.:.:.|:|
 Worm  1659 STFAFPQSQE------------VLT-KGVVLTEASPEEDSLQGDKGSGKKKAQRGNS 1702

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
naNP_001096981.2 Ion_trans 373..654 CDD:278921 136/287 (47%)
Ion_trans 734..927 CDD:278921 105/193 (54%)
Ion_trans 1240..1497 CDD:278921 151/262 (58%)
Ion_trans 1571..1793 CDD:278921 126/240 (53%)
nca-2NP_498054.2 Ion_trans 95..371 CDD:278921 133/281 (47%)
Ion_trans 444..649 CDD:278921 111/207 (54%)
Ion_trans 959..1202 CDD:278921 148/242 (61%)
Ion_trans 1288..1518 CDD:278921 125/229 (55%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160158342
Domainoid 1 1.000 339 1.000 Domainoid score I582
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H21832
Inparanoid 1 1.050 1527 1.000 Inparanoid score I41
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG48327
OrthoDB 1 1.010 - - D16416at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004135
OrthoInspector 1 1.000 - - otm14300
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_104443
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR46141
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R175
SonicParanoid 1 1.000 - - X3959
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.940

Return to query results.
Submit another query.