DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kto and Med12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524786.1 Gene:kto / 44830 FlyBaseID:FBgn0001324 Length:2531 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001401664.1 Gene:Med12 / 679693 RGDID:1585896 Length:2190 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2693 Identity:904/2693 - (33%)
Similarity:1247/2693 - (46%) Gaps:691/2693 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 EKRPLKRTRLGPPDIYPQDAKQREDELTPTNVKHGFTTTPPLS-DEFGTAHNSNVNASKVSAFFS 70
            |.|||||.||||||:||||.||:|||||..|||.||...|.:| ||.|:|.|.|.|.:|:|:.||
  Rat    10 EHRPLKRLRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFNPAKISSNFS 74

  Fly    71 GVLAKKEELMTLPDTGRKKQQINCKDNFWPVSPRRKCTVDAWFKDLAGNKPLLSLAKRAPSFNKK 135
            .::|:|....||.||||:|..:|.|||||.|:.|.:..::.||.||||.|||..|||:.|.|:||
  Rat    75 SIIAEKLRCNTLSDTGRRKSLMNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTHLAKKVPIFSKK 139

  Fly   136 EEIFITLCENQVNMQRATWFIKLSAAYTLSFTESKNKKRSIYDPAAEWTGNMIKFMKELLPKLQE 200
            ||:|..|.:..|.:.||.|.||::.||..:.:|:|.||::..||..|||..:.|::.|.|.|:.|
  Rat   140 EEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAMSETKVKKKNTADPFTEWTQIITKYLWEQLQKMAE 204

  Fly   201 YYQQNHDKSSSNGTTSGSLTAAGNGPASNGSTGTSSINSVTGSSASTNVIPVPSMASPLPPIHSP 265
            ||:.                    |||.:|..|                    |...|||     
  Rat   205 YYRP--------------------GPAGSGVCG--------------------SAIGPLP----- 224

  Fly   266 ANGQQAAPGGGVNAGSVMPTTGSLGGVVGGPGSSVVGGAAGAGAAVPPGSTISGIGSQFEDSRNA 330
                                                                       .|...|
  Rat   225 -----------------------------------------------------------HDVEMA 230

  Fly   331 LKYWKYCHQLSKYMYEESLLDRQEFLNWILDLLDKMRTQASFDEPLKKLVLSFALQYMHDFVQSE 395
            ::.|.|..:|:.:|:::.:|||.|||.|:|:..:|:|..   ::.|.||:|...|:|..:||||.
  Rat   231 IRQWDYNEKLALFMFQDGMLDRHEFLTWVLECFEKIRPG---EDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSA 292

  Fly   396 RLCRKMAYIVSKKLAQLL-------NTVVEQQTIKELDEPKLQQDPY----ELALQEQMSCPHHR 449
            .|.|::||..:::||..|       :.|:..|:...|......|.|.    .....:.:.||.||
  Rat   293 YLSRRLAYFCTRRLALQLDGVNSHSSHVISAQSTSSLPTTPAPQPPTSNTPSTPFSDLLMCPQHR 357

  Fly   450 DIVLYLSTILQIITIECPTALVWS-GIAAHRAPSSLLGSPLDHLPLAPSVLPMPTRCPRTNHEIR 513
            .:|..||.|||.|.:.||:||||. .:...|..:   ||||||||:|||.||||........::|
  Rat   358 PLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIKT---GSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVR 419

  Fly   514 RQLRAAESDIVLRTQHAEQRWFAAKWLSAGKNQYT--SVLATLDHLDTHCFDRMEHNNSIDTLYA 576
            .:||..|..|..|.|..|.||...|...|... :|  .||.||:.||:|.|:|.:.:||:|:|..
  Rat   420 AKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAG-FTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCN 483

  Fly   577 QIF---PSPTVSRRREEDQVEPRPPYEPKQDKD-TVRILCEWAVSGQRWGEHRAMVVAILLDKRQ 637
            :||   ||              :..:|...|.| .|.:|||||||.:|.|.|||||||.||:|||
  Rat   484 RIFGLGPS--------------KDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGRHRAMVVAKLLEKRQ 534

  Fly   638 IDVTSTPADQQSSDKDDKDSLASGAGLIDGLPVFQHVLMHFLDHDAPVLDEHVSSPQQRTEFTNL 702
            .::.:.... :|...|:|.|:|||:......|:||.||:.|||..||:|.: ..|..:|.||.||
  Rat   535 AEIEAERCG-ESEAADEKGSVASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTD-PRSESERVEFFNL 597

  Fly   703 VQLFSALIRHDVFSHNAYMHTLISRGDLLLESVLVIKSGTTATKTSPPPPAPPP----------- 756
            |.||..||||||||||.|..||||||||..        ||...:  ||.|...|           
  Rat   598 VLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAF--------GTPGPR--PPSPFDDPADDPERKEAEG 652

  Fly   757 TTTHGFDDDGFGGGLDFKHNE---FDDSNVDDDLDKLVQNIKEKGQQHEAPDSPKI-----GPPG 813
            :::...:|.|....:|...:.   |:|.. ..|.......:..:|:...:|:.|.:     .||.
  Rat   653 SSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDME-KPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKDVKPPPK 716

  Fly   814 DGETNPGGSI---SRHYVYTKHFPIPQDDPSMSSYSSESNQRYILLFGVGKERDEKKHAVKKMSK 875
            :......|.:   .||..|..||||||::    |.|.|.|||.::||||||:||:.:||:||::|
  Rat   717 EKIEGTLGILYDQPRHVQYATHFPIPQEE----SCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITK 777

  Fly   876 EIGKLFTKKFSIDV------------------AAAGHVKKHSRNEF--NFEATTSKCQQMAYFDQ 920
            :|.|:..:|.:.:.                  ...|..::.:|.|.  ..|...:|.|.::::||
  Rat   778 DILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQ 842

  Fly   921 HVVTAQCAANVLEQLNGFALGNNNYLPVQEHVAFLFDLMELALNIYSLLELCDSLLKELPEVEHQ 985
            |.||||.:.|||||:..||||.:.:||:.:||.|:|||||.:|:|..|::....||.||..||.:
  Rat   843 HQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFVFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAE 907

  Fly   986 LQLKKSNLVRSYTTSLALYIVSILRRYHSCLLLSPEQTLSVFEGVCRTIRHVSNPSECTSAERCI 1050
            |.||.|:||.||||||.|.||::||.||:||:|:.:|...||||:|..::|..|.|:.:||||||
  Rat   908 LLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCI 972

  Fly  1051 IAYLSDLHESCVLLQGK--EQSTEYYQQLQCIKRFKDIFNTPEQLDLPPQG---YNPLLLQELFM 1110
            :|||.||:.||..|:.|  |..:::     |.|....|:...|    |.:.   :.|..:.:...
  Rat   973 LAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDF-----CSKVKNTIYCNVE----PSESNMRWAPEFMIDTLE 1028

  Fly  1111 APRRG-------GKLDPHWLGTLHESPANVYSFVSNALIAVC-RETDNERLNDVALACAELTASC 1167
            .|...       ||       :|.|:|||.||||.|||:.|| ...|.:|:||:|:.|||||..|
  Rat  1029 NPAAHTFTYTGLGK-------SLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYC 1086

  Fly  1168 NVLSEEWIYALQSLCSGSKSPR--YPHLGGQVDIGQLKTHNALAVFVCILVARHCFSLADFVSKF 1230
            ..||.||:..|::||..|.:..  :..|...||:..|..|::||.||.||:||.|..|.|.:...
  Rat  1087 KSLSAEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCA 1151

  Fly  1231 ALPTLARSVSAGGAELSVDAEAGARLTCHLVLKLFKTLEIPQPGMYSVSTSPNPLHAVGN--DFS 1293
            |:|:|..:..:     ..|:|.||||||.::|.||||.::            ||..:.||  ...
  Rat  1152 AIPSLLNAACS-----EQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQL------------NPCQSDGNKPTVG 1199

  Fly  1294 IRLSCDRHLLVGAHKTIPIAAVLAVLKAILIVVDNAALKTPLASGSG-TSSGGL-------GGAF 1350
            ||.|||||||..:...|...||.|||||:.::.| |.||     ||| |..||.       ||..
  Rat  1200 IRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGD-AELK-----GSGFTVPGGTEELPEEEGGGG 1258

  Fly  1351 GSGKRSGFNTPVHPGSTPKSNEQRPADLSQILGTSDLQLGSSLTSEPEALQQPSVGGMEQISLLE 1415
            .||:|.|                                |.:::             :|..||..
  Rat  1259 SSGRRQG--------------------------------GRNIS-------------VETASLDV 1278

  Fly  1416 FAQAVLKQICAQEHVLERCLKNAEQLCDMIIDEMLTAKQAQRVLHMICYPEPEFNIISELD---- 1476
            :|:.||:.||.||.|.|||||:..:..:.:.|.:|::.||||::.:||||.   .::...|    
  Rat  1279 YAKYVLRSICQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPH---RLLDSEDGENP 1340

  Fly  1477 QRSMIVRILENLGQWTLRISWLDLQLMYRQSLSNNAELNVWLDTVARAAIDVFHMEEVV------ 1535
            ||..|.|||:||.|||:|.|.|:||||.:|  :.|.|:|..|:.:|:|.|:||......      
  Rat  1341 QRQRIKRILKNLDQWTMRQSSLELQLMIKQ--TPNTEMNSLLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGS 1403

  Fly  1536 ----LPGAVKATHKP------KPSTWLVAPLIAKLTPAVQGRILRVAGQVLESMNYFSKVSKSDC 1590
                :|.:.||  ||      :...||||||||||..:|||.:|:.||:.||...:.        
  Rat  1404 TASNMPSSSKA--KPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHL-------- 1458

  Fly  1591 NSSGSGDEREKSNSCHSSNSYGLGGVPARNKKMPLDYQPFLGLILTCLKGQDEYKENLLVSLYAQ 1655
               ||...:|:......|.|.             |..||||.|:|||||||||.:|.||.||::|
  Rat  1459 ---GSSSRKERDRQKQKSMSL-------------LSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLASLHSQ 1507

  Fly  1656 LSQCLQSFAELDTIGGIDEPQAREEILDALQLRFSLVGGMFEAIQKNSTPTTDWAILLAQLVCQG 1720
            :.|.:.::.|...   :|:.:.::.:.:||:||.:||||||:.:|:::..||:||.||.:::..|
  Rat  1508 VHQIVINWRENQY---LDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAQLLLEIIISG 1569

  Fly  1721 VVDLSCNRELFTTVVDMLATLVHSTLVSD-----------DERHYMNLMKKLKKEIGEKNNASIR 1774
            .||:..|.||||||:|||:.|::.||.:|           ::|.||||:|||:|::||:.:.|:.
  Rat  1570 TVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLQKDLGERQSDSLE 1634

  Fly  1775 VIRQLLPLYKQPTEVIACEHSG--MDTKGNKICDID----KKQLRISDKQRISVWDILEGHK-NP 1832
            .:.|||||.||..:||.||..|  :|||||||...|    |:.|::|.||:||.|::.||.| :.
  Rat  1635 KVHQLLPLPKQNRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWELFEGLKPST 1699

  Fly  1833 APLSWVWFGAVKLERKPLTYEEAHRNLKYHTHSLVKPSSYYYEPLPLPPEDIEPVPEKICIKDEM 1897
            |||||.|||.|:::|:....||..|.|.||||...:|.:||.|||||||||.|| |....::.|.
  Rat  1700 APLSWAWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEP-PAPALLEPEK 1763

  Fly  1898 KADTPSSVDQSPSAVVGGTGRGRGKGTTTRKRKPKNPKTPPVVNTQQQQPQLAQQPQQPQNVQQQ 1962
            ||..|...|:..:|           ..:|.:||.|:.|     ..::.||....           
  Rat  1764 KAPEPPKTDKPGTA-----------PPSTEERKKKSTK-----GKKRSQPATKS----------- 1801

  Fly  1963 QLQQQQQQQQHMQQQHMQQQQMQPNQMGQMPMNMPMNMQQFAPNPNNMMQQNAMLQQQQQQQMQQ 2027
                             :...|.|.:.|...:.:|.::...| ||.::    :.|..:|    ..
  Rat  1802 -----------------EDYGMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHA-NPGSI----SHLSYRQ----SS 1840

  Fly  2028 MGNNPMQQQLNVGGGNGQPNPQMNFMQQGPGGGGAGPQGMPGQQQQWHNAPQQQQPPQPYHNQYA 2092
            ||.....|.|..||....|...:..                         |.|:.|.:|.:....
  Rat  1841 MGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRL-------------------------PMQKLPTRPTYPGVL 1880

  Fly  2093 PHQQNMQSNRIERPPLNANSKQALSQMLRQRQP-------FQQQAQ-----QGPGGGFNPMQQQP 2145
            |........      |..:|.:  :.:.||:||       .:||.|     ||..|..:..|..|
  Rat  1881 PTTMTTVMG------LEPSSYK--TSVYRQQQPTVPQGQRLRQQLQAKIQSQGMLGQSSVHQMTP 1937

  Fly  2146 QAS------------------QQQPGPQQQMNP---NQMRQQQMNPQQNPQSVAAFNAMQQQPQQ 2189
            .:|                  ||..||...|.|   :....|..:|..||..|.....:||:|..
  Rat  1938 SSSYGLQSSQGYTSYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSG 2002

  Fly  2190 NAQQQQMNPNQQQQQQFMRGGNMRPGMAPNQMNQMNMGGQGMSQNPMMQQQIPQN--MVGMVNPN 2252
            ...||                      ||..       |.|::.......|..|.  |:|.:.|.
  Rat  2003 YVHQQ----------------------APTY-------GHGLTSTQRFSHQTLQQTPMMGTMTPL 2038

  Fly  2253 ANQMMQSGGAQGGNGVGVGVGVGVGGAGNNPNMGMGGMPQQGMIQQQPQQQPQQQVQFQNFQNQY 2317
            :.|               ||..||......|.            |||.|||.|||.|.|..|.|.
  Rat  2039 SAQ---------------GVQAGVRSTSILPE------------QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 2076

  Fly  2318 QQQQQQGMQQQGGGAGVGVGVGMAPNQQQQQQANMMGNFNPQMQQGNRNNPDFMAAAAVAQQQQQ 2382
            ||||||..|||           ....||||||..:.     |.||               |||||
  Rat  2077 QQQQQQQQQQQ-----------YHIRQQQQQQQILR-----QQQQ---------------QQQQQ 2110

  Fly  2383 QQQQQRVVPGGMMAGNRNQYMNQAPNVTMSTMMGPGPGGVVGQVPPYARQQSAGGGKPGVLNTQQ 2447
            |||||                                                          ||
  Rat  2111 QQQQQ----------------------------------------------------------QQ 2117

  Fly  2448 QFQQQQQQQQQLRHQMMQLQGMGGGAGGGMGAGPQQGGGAVGGGAGGGMVPQ------------Q 2500
            |.|||||.|||..||..|           ..|.||               ||            |
  Rat  2118 QQQQQQQPQQQQPHQQQQ-----------QAAPPQ---------------PQPQSQPQFQRQGLQ 2156

  Fly  2501 QSMNQQQTPNLVAQLQRQNMMGQQQYQP 2528
            |:..||||..||.|||:|  :...|.||
  Rat  2157 QTQQQQQTAALVRQLQQQ--LSNTQPQP 2182

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ktoNP_524786.1 Med12 97..157 CDD:462818 29/59 (49%)
Med12-LCEWAV 390..856 CDD:463472 183/505 (36%)
Med12NP_001401664.1 Med12 106..161 CDD:462818 25/54 (46%)
Med12-LCEWAV 287..758 CDD:463472 183/505 (36%)
Med12-PQL 1821..2027 CDD:463471 53/276 (19%)

Return to query results.
Submit another query.