Protein Alignment g and ap4e1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524785.2
• Gene: g / 44819
• FlyBaseID: FBgn0001087
• Length: 1034
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_699042.2
• Gene: ap4e1 / 570467
• ZFINID: ZDB-GENE-061221-3
• Length: 1121
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1019
• Identity: 209/1019 - (20%)
• Similarity: 395/1019 - (38%)
• Gaps: 245/1019 - (24%)

  Fly    17 KNLTDLVRGIRNNKDNEAKYISTCIEEIKQELRQDNISVK--CNAVAKLTYIQMLGYDISWAGFN 79
            |::|:|     .:|.:|...|...:..:|:::...:.|:|  ...:.:..|.:|||||.|::..:
Zfish    34 KSITEL-----TSKHDEESLIKQELSAMKEQVSAPSTSMKQMREIMVRSMYCEMLGYDASFSYIH 93

  Fly    80 IIEVMSSSRFTCKRIGYLAASQCFHPDSELLMLTTNMIRKDLNSQNQYDAGVALSGLSCFISPDL 144
            .|::........||:||||.|.......|||:|..|.:.|||.|.|..:|.:||:    .::...
Zfish    94 AIKLAQQGGVMEKRVGYLAVSLFLSEGHELLLLLVNTVLKDLQSTNLIEACMALT----VVAQVF 154

  Fly   145 SRDLANDIMTL----MSSTKPYLRMKAVLMMYKVFLRYPEALRPAFPKLKEKLEDPDPGVQSAAV 205
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Zfish   155 PKDMIPAVLPLVEDKLSHPKEIIRRKAVLALYKFYLIAPNQVQHIHAKFRKALCDKDPGVMTSSL 219

  Fly   206 NVICELARKNPKNYLPLAPIFFKLMTTSTNN--------------WMLIKIIKLFGALTPLEPRL 256
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Zfish   220 HIYLQLIQESPDAYKDLTGSFVTILKQVVGGKLPLDFNYHSVPAPWLQIQLLRILSLLGRDDQST 284

  Fly   257 GKKLIEPLTNLIHSTS-----AMSLLYECINTVIAVLISISSGMPNHSASIQLCVQKLRIL---I 313
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Zfish   285 SELMYEVLDESLRRAEMNHNITYAILFECVKAVYTI----------HPKA-ELLEKAARCIGNFV 338

  Fly   314 EDSDQNLKYLGLLAMSKILKTHPKSVQAHKDLILACLDDKDESIRLRALDLLYGMVSKKNLMEIV 378
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Zfish   339 LSPKINLKYLGLKALTYVVQHDAKLALQHQMTIIECLDHSDFTIKRETLELLFRITNAQNVSVIV 403

  Fly   379 KRLLGHMERAEGSAYRDELLYKVIEICAQSSYLYVTNFEWYLTVL-------VELIQLEAGSRHG 436
            :::|..:...........|..||.|:..:    :..:..|::..:       .:|:|.:..:...
Zfish   404 EKMLDFLRSCSDEHTIIHLAGKVAELAEK----FAPDNSWFIQTMNDVFSIGGDLLQQDISNNFL 464

  Fly   437 RLIAE---------QLLDVAIRVPVVRQFAVNEMTNLLDTFTVSAQSNSMYEVLYAAAWIVGEFA 492
            ||:||         ||          |.:||:....||:    ...|:.....:...:|:|||::
Zfish   465 RLLAEGSESKEEDDQL----------RLYAVDSYLTLLN----GDASHLPQRFIQVMSWVVGEYS 515

  Fly   493 GELEDAEKTLNILLRPRLLPGHIQGVYVQN-VIKLFARLATTCLELQD---------LPGLVTLC 547
                                 |:|....|: ||:|..:|    ||.:.         |..|..:.
Zfish   516 ---------------------HLQECVDQSEVIRLLMKL----LEQKSVSSETRVWILSALTKIS 555

  Fly   548 DH----VLDKLQHFNGSSDIEVQERANSACMLIEMLRNQLSTSTDAMAMDTTTEGGIPPLA---- 604
            |.    :|:..:..:.|.|..::::|:.       ||:        :::|:.....:.|..
Zfish   556 DGQTDLILELAESISSSQDTILRQQAHE-------LRH--------LSLDSKLHEWVLPRGAAWD 605

  Fly   605 -IEIVQEMTLL--FTGELI-----PVAPKAQRKVPLPD--GLDLDEWINAPPPEDAASSSSSEHD 659
             :|:...::.|  |..|.:     |..|..||:..|.:  .|:|:.:..:.|...::.|.:..|.
Zfish   606 DMEVDSSLSFLDGFVSEALAAGAAPYKPPHQRQEELCEQRALNLEPYSFSLPVSLSSCSITDRHS 670

  Fly   660 KDELFVSATQAGTGADGGEKRRQSLELTPEQLERQRMARLIEQSNNPHYLKSTPTASGASNAD-- 722
            ...|.||:..:|...:..:|...| .|..|.::|        ......||....||..||..|
Zfish   671 PTLLSVSSGLSGNSTELSQKAGAS-TLILEGVKR--------VWGKDGYLPQKETAVTASPVDEP 726

  Fly   723 --------QYDNIDDI-----PITELPLDMEGVAALRVGITKRSDKYLQEQQAAQGSKDGKKKHK 774
                    |.:..:.:     |.|:.....:..::|.||::.:|...|..:..|...:..||...
Zfish   727 SAAVQPVGQQEAAERLEPQPEPSTQTNDKQQLASSLFVGLSTQSSTSLLGKSEAPPPRFRKKPRP 791

  Fly   775 KGKKSKKAKNKVAYNSSSESEGEPKPLHIVNTTLDMPEGVSMSDSEDKDGKYDPNDPHRALDIEL 839
            .|.....:.:    :.:||.....:..|  |||.....|   |..|::...:|
Zfish   792 HGSSLSSSSS----SGTSEKSSSSRTSH--NTTDSFLYG---SLLEEEPAGFD------------ 835

  Fly   840 DITEFEAPAVRSASKKSAADKENLKTPADSAGGGNAAKKDRKKDKDKDKERKVKREHRESKRERK 904
                                    .||......|....||.|:|                :|...
Zfish   836 ------------------------HTPKSITANGLGQNKDVKED----------------RRTNT 860

  Fly   905 EAAVQSVIDLIDADTPTPSPSHISATSNNNNTSTVLP----DAP 944
            ...:.|.:.::..:|...:|      |.:::.:|:||    |.|
Zfish   861 SQILGSDMVIVRPNTIQHNP------STSSDLTTLLPADLKDLP 898

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
g	NP_524785.2	Adaptin_N	33..578	CDD:396262	132/602 (22%)
		AP3D1	687..840	CDD:461889	31/167 (19%)
ap4e1	XP_699042.2	Adaptin_N	45..592	CDD:396262	135/619 (22%)
		AP4E_app_platf	1016..1117	CDD:464326