DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment rg and Lrba

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001284879.1 Gene:rg / 44531 FlyBaseID:FBgn0266098 Length:3785 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038958577.1 Gene:Lrba / 361975 RGDID:1311428 Length:2883 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3804 Identity:1509/3804 - (39%)
Similarity:2070/3804 - (54%) Gaps:1011/3804 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 LKFAVLIGLIEVGQVTNREVVNTVLHLLVGGEFDMELNFVIQDAQNIKHMLELLDHCPPNLQAEI 91
            :|||||.||:|||:|:||::|.||.:|||||:||:|:||:||:|::|..|:|||:.|....|||:
  Rat    46 MKFAVLTGLVEVGEVSNRDIVETVFNLLVGGQFDLEMNFIIQEAESITCMVELLEKCDITCQAEV 110

  Fly    92 WSVFIAILRKSVRNLQACTDVGLIEHVLVRLQRSETVVADLLIEMLGVLASYSITVKELKLLFGT 156
            ||:|.|||:||:||||.||:|||:|.||.::::.::::||||::||||||||::||:||||.|..
  Rat   111 WSMFTAILKKSIRNLQVCTEVGLVEKVLGKIEKVDSMIADLLVDMLGVLASYNLTVRELKLFFSK 175

  Fly   157 MKATNGKWPRHSAKLLNVLRQMPHRNGPDVFFSFPGRKGSAMVLPPLAKWPYENGFTFTTWFRLD 221
            ::...|:||.|:.|||:||:.||.:..||.||:|||:..:|:.|||:|:|||:|||||.||.|:|
  Rat   176 LQGDKGQWPPHAGKLLSVLKHMPQKYAPDAFFNFPGKSAAAIALPPIARWPYQNGFTFHTWLRMD 240

  Fly   222 PINSVNIEREKPYLYCFKTSKGVGYTAHFVGNCLVLTSMKVKGKGFQHCVKYEFQPRKWYMIAIV 286
            |:|::|::::|||||||:||||:||:|||||.||::||:|.||||||||||::|:|:||||:.||
  Rat   241 PVNNINVDKDKPYLYCFRTSKGLGYSAHFVGGCLIITSIKSKGKGFQHCVKFDFKPQKWYMVTIV 305

  Fly   287 YIYNRWTKSEIKCLVNGQLASSTEMAWFVSTNDPFDKCYIGATPELDEERVFCGQMSAIYLFSEA 351
            :|||||..||::|.|||:|||..|:.|||:|:|.||||::|::...|..|||||||:|:||||:|
  Rat   306 HIYNRWKNSELRCYVNGELASYGEITWFVNTSDTFDKCFLGSSETADANRVFCGQMTAVYLFSDA 370

  Fly   352 LTTQQICAMHRLGPGYKSQFRFDNECYLNLPDNHKRVSHFQLLPATLGASALSGGSGSGTGSGTG 416
            |...||.|:::||.|||..|:|..|..|.|.::|                               
  Rat   371 LNAAQIFAIYQLGLGYKGTFKFKAESDLFLAEHH------------------------------- 404

  Fly   417 NDASAAAAAAVAAGQQQQLQLQFQILAAEQEARAIDWSDEKLDLNAAFVKIRAVLTARNAVTLAG 481
                                                                             
  Rat   405 ----------------------------------------------------------------- 404

  Fly   482 SSSTGTTAVATAAAAAAAAGAGAGTTAAATSAAAAAAATQNENDAAVGQQQHATHHHATAATGSA 546
                                                                             
  Rat   405 ----------------------------------------------------------------- 404

  Fly   547 DDPLGHLPTGNASSSSSSFEQLRRMSSVSSLNSMVGSADTEEVNQLKAVLYDGKLSNAIVFMYNP 611
                                                          |.:|||||||:||.|.||.
  Rat   405 ----------------------------------------------KLLLYDGKLSSAIAFTYNA 423

  Fly   612 VATDGQLCLQSSPKGNVSYFVHTPHALMLQDVKAVVTHSIHCTLNSIGGIQVLFPLFSQLDMAHE 676
            .|||.||||:||||.|.|.|||:||||||||||||:||||...::|:||:|||||||:|||. .:
  Rat   424 RATDAQLCLESSPKDNPSIFVHSPHALMLQDVKAVLTHSIQSAMHSVGGVQVLFPLFAQLDY-RQ 487

  Fly   677 GLGDIKRDPTLCSKLLGFICELVETSQTVQQHMIQNRGFLVISFMLQRSSREHLTLEVLGSFLNL 741
            .|.| :.|.|:|:.||.||.||::.|..:|:.|:..:|||||.:.|::||:.|::..||...|..
  Rat   488 YLSD-EVDLTICTTLLAFIMELLKNSVAMQEQMLACKGFLVIGYSLEKSSKSHVSRAVLELCLAF 551

  Fly   742 TKYLVTCLSANSDLLLKQLFCFSFLTWQLLDHVLFNPALWIYTPANVQARLYSYLATEFLSDTQI 806
            :|||...  .|...||||| |         ||||.|||:||:|||.||..||:||:|||:....|
  Rat   552 SKYLSNL--QNGMPLLKQL-C---------DHVLLNPAVWIHTPAKVQLMLYTYLSTEFIGTVNI 604

  Fly   807 YSNVRRVSTVLQTVHTLKYYYWVVNPRAKSGIIPKGLDGPRPAQKDILAIRAYILLFLKQLIMIG 871
            |:.||||.|||..:||||||||.|||:.:|||.|||||||||.||:||::||::|:|:|||:|..
  Rat   605 YNTVRRVGTVLLIMHTLKYYYWAVNPQDRSGITPKGLDGPRPNQKEILSLRAFLLMFIKQLVMKD 669

  Fly   872 NGVKEDELQSILNYLTTMHEDENLHDVLQMLISLMSEHPSSMVPAFDVKHGVRSIFKLLAAESQL 936
            :||||||||:|||||.|||||:||.||||:|::||:|||:||.||||.::|:|.|:||||::|:.
  Rat   670 SGVKEDELQAILNYLLTMHEDDNLMDVLQLLVALMAEHPNSMTPAFDQRNGLRVIYKLLASKSEG 734

  Fly   937 IRLQALKLLGFFLSRSTHKRKYDVMSPHNLYTLLAERLLLYEESLSLPTYNVLYEIMTEHISQQI 1001
            ||:||||.||:||.....|||.:||..|.|::||||||:|....:::..||||:||:.|.|..|:
  Rat   735 IRVQALKALGYFLKHLAPKRKAEVMLGHGLFSLLAERLMLQTNLITMTMYNVLFEILIEQICTQV 799

  Fly  1002 LYTRHPEPESHYRLENPMILKVVATLIRQSKQTESLIDVKKLFLQDMTLLCNSNRENRRTVLQMS 1066
            ::.:||:|:|..:::||.||||:|||:|.|.|....::|::.||.||..|.|::|||||::||.|
  Rat   800 IHKQHPDPDSTVKIQNPQILKVIATLLRNSPQCPESMEVRRAFLSDMIKLFNNSRENRRSLLQCS 864

  Fly  1067 VWQEWLIAMAYIHPKSSEEQKISDMVYSLFRMLLHHAIKHEYGGWRVWVDTLAIVHSKVSYEEFK 1131
            |||||::::.|.:||||:||||::|||::||:||:||:|:|:||||||||||:|.||||::|..|
  Rat   865 VWQEWMLSLCYFNPKSSDEQKITEMVYAIFRILLYHAVKYEWGGWRVWVDTLSITHSKVTFEIHK 929

  Fly  1132 LQFAQMYEHYERQRTDNITDPALRQARPISTISGWEREELHQQQNGGSAAAVATNQTAAVKGSVS 1196
            ...|.::.. |:.:.|                     ||:     |..:|:::...|...:    
  Rat   930 ENLANIFRE-EQGKGD---------------------EEI-----GPCSASLSPEGTGVTR---- 963

  Fly  1197 IASLEDVPPVVEEEVEELELEEVEIQEGP-------------ITEETEQKSVIANISDVYNEQLK 1248
                                 :|::.|||             .|..:::.|.|...|.:      
  Rat   964 ---------------------DVDVSEGPQHSDRKESLISPHFTTNSDENSSIGKASSI------ 1001

  Fly  1249 TDATCNGNLEDVKEEEPVQQQIGDLEKQPEPSTPLGALRETLQLGDDMDVEELELATAKDALNAE 1313
             |:..|..|:....|:.|:|...:|                      :|...:|           
  Rat  1002 -DSASNIELQTPGYEKKVEQGNQEL----------------------LDQAAME----------- 1032

  Fly  1314 QHVSRVLQASEAALNDCKMAVDDVLQESSSVLKDEEIELAVNEVVQGVLNNEKKTQSQDNKDNKE 1378
                      ||..|:.|.|.|  |:.||..::                                
  Rat  1033 ----------EATTNEAKHACD--LEASSDAVE-------------------------------- 1053

  Fly  1379 QPGEQDVNVSLLNSKNLLNNNNNNNNNSPSPTPTTATATAETEAETEVNANEIVSSTEAPKAETE 1443
                                            |.|.|:|:....:..|..:.:.:|..:|     
  Rat  1054 --------------------------------PVTLTSTSSEPGKDTVTISGVRASVSSP----- 1081

  Fly  1444 TSVAPEVETPETAKPSPIVPSPVLATNQKTEDAANKLNNNEKLAEISASPEPPIVVETPEADLLQ 1508
                                        ..:|||                      |.||  ||:
  Rat  1082 ----------------------------SEQDAA----------------------EMPE--LLE 1094

  Fly  1509 LSDSETKPNKETEAEDSVALAVRDIVEQLIDKVIDATEAESASETKTETNNNEIPKKEKQTSEEP 1573
            .|..|     |.:.:|       |.||..::.:..:...|:....:.:.....:| .|.|..|..
  Rat  1095 NSGVE-----EEDGDD-------DYVELKVEGIEGSPAEEARLPAERQAEEARLP-AEHQAEEAC 1146

  Fly  1574 EDVE-TAETLAAAAKEIVQEVVEAALVMVQEESTQEKPEKGANSEEEKNEIGKEEILL-----QL 1632
            :..| ..|:::.||.|                                   |:||:.:     :|
  Rat  1147 QPAERQGESVSVAASE-----------------------------------GREEVEVCGNGCEL 1176

  Fly  1633 EEKPASTEVQETKIEGDLKKPEDPKGHSSVEPKTPNLEEPKPQETEQQKSQEVAEELPQKPEEQV 1697
            :|:...|:.......||.|:...|...::....|.: |.|.||.|.|..|               
  Rat  1177 QEEAPITKSHNDPETGDSKESGFPTVATAGSLATSS-EVPVPQTTLQPDS--------------- 1225

  Fly  1698 VAIVNQVLDTLVDDTVKAVAAEQTTQTSPAPEEQSPQILAMESPATS-VRVKPTEVDSTTQTTPK 1761
                    |.::...||...|.:|...|...::.|      |:|||| .::...:|.|....|.:
  Rat  1226 --------DEMLGGGVKTDIAGETESVSDCADDVS------EAPATSEQKIAKLDVSSVASDTER 1276

  Fly  1762 NEAGSSLLVEQVQQVLQEDDAQQSAGMTIEDEDYSNQQAAAAVENANSSQLDANHYGPGNPESKQ 1826
            .|..:|...|..|        .|..|:.|     |.||.....|.|              |::..
  Rat  1277 FELKASTSTEAPQ--------PQRHGLEI-----SRQQEHPRQETA--------------PDTGD 1314

  Fly  1827 QQQRSKSGSTRPMFSPGPTRPPFRIPEFKWSYIHQRLLSDVLFSLETDIQVWRSHSTKSVLDFVN 1891
            ||:|    .:||..        |||||||||.:|||||:|:|||:|||||:|||||||:|:||||
  Rat  1315 QQRR----DSRPTM--------FRIPEFKWSQMHQRLLTDLLFSIETDIQMWRSHSTKTVMDFVN 1367

  Fly  1892 SSENAIFVVNTVHLISQLADNLIIACGGLLPLLASATSPNSELDVLEPTQGMPLEVAVSFLQRLV 1956
            ||:|.|||.||:|||||:.||:::||||:||||::|||...||:.:||.||:.:|.:|:|||||:
  Rat  1368 SSDNVIFVHNTIHLISQVMDNMVMACGGILPLLSAATSATHELENVEPAQGLSIEASVTFLQRLI 1432

  Fly  1957 NMADVLIFATSLNFGELEAEKNMSSGGILRQCLRLVCTCAVRNCLECKERTRYNV-GALARDVPG 2020
            ::.||||||:||.|.|:||||||||||||||||||||..||||||||::.::... |..|:.:..
  Rat  1433 SLVDVLIFASSLGFTEIEAEKNMSSGGILRQCLRLVCAVAVRNCLECQQHSQLKARGEAAKSLKA 1497

  Fly  2021 AAHLQALIRGAQASPKNIVESITGQLSPVKDPEKLLQDMDVNRLRAVIYRDVEETKQAQFLSLAI 2085
            ...|..:.|.|..||   |:.:||.:|||:|.::||||||:||||||::||:|::||||||:||:
  Rat  1498 VHSLVPVGRSAAKSP---VDIVTGGISPVRDLDRLLQDMDINRLRAVVFRDIEDSKQAQFLALAV 1559

  Fly  2086 VYFISVLMVSKYRDILEPPAEPQIQRQSPVLQRTAGGEAASARPLFPQWSHHVYPQFLPESHQNH 2150
            ||||||||||||||||||                                               
  Rat  1560 VYFISVLMVSKYRDILEP----------------------------------------------- 1577

  Fly  2151 NSNMQHQQQQQQQQQHQQQQHYYQQQQQQQVVHNHSHHHMTAAYYQQQQHQQVAAGQQQHSPTPL 2215
                       |.::|.|...                                .||         
  Rat  1578 -----------QDERHSQSLK--------------------------------EAG--------- 1590

  Fly  2216 ATHSTSSSASSTATSQPASSSSLSSLASQSQQQSHRQLHKQQQQQQQQQQQQQPHYHPHQPHYGL 2280
            :.:.|.|...:..|:...||.:|||:....:                                  
  Rat  1591 SDNGTVSLPDAENTTAEFSSLTLSSVEESLE---------------------------------- 1621

  Fly  2281 INGHQQHPQLNGKHYAENGSTAGYHPHSHPHPHGGYMRNGDTSTLQQNGMPDYQAVGLMNGHGSG 2345
                                                   |.:||.:::                .
  Rat  1622 ---------------------------------------GTSSTRRRD----------------S 1631

  Fly  2346 GTGNNNNSSLMNNMRNLRNGGGANSSSSPPGSHQVIQGVATAGAVNANAAVGVGMG-GAVGVGMG 2409
            |.|....|.|          |.:.|.:||.                  |.:||..| .|:     
  Rat  1632 GLGEETASGL----------GSSMSVASPA------------------APLGVSTGPDAI----- 1663

  Fly  2410 GVAGGLDGGVVYKTSAINNNYRYNGRNASAGTGGRQIQDSDYEIIVVDENNPSVLADNDSHSSGP 2474
                    ..|..|.::..|.....:|    .||.::...                         
  Rat  1664 --------SEVLCTLSLEVNKSQETKN----DGGNELDGK------------------------- 1691

  Fly  2475 PSIKANQTTTIATTTTTTATTHINNNNTKTTTSNAPTATIKIQQQPLSPPKPLVPQKLPKSVDSD 2539
                        .|.:...:.::|..:...:..|.|...:.:.           |..||.:....
  Rat  1692 ------------VTPSVPVSKNVNVKDILRSLVNMPADGVTVD-----------PALLPPACLGA 1733

  Fly  2540 VGSLNMNSTENEVPEVESSSEILIDDHKPSHSNDESWTDVNLNEDAAVQAASAGIVVGLVDNRGN 2604
            :|.|::                                      |..||..|....|.:...:.:
  Rat  1734 LGDLSV--------------------------------------DPPVQFRSFDRSVIIATKKSS 1760

  Fly  2605 VISDKHDPSHHNQQQQQQAGIIGQQQQHGSLGHSERGDKPDSEISVV------RVPDGYGGAGSG 2663
            |:     ||                        :.....|.:.:|||      :|||..|.:   
  Rat  1761 VL-----PS------------------------TLTASAPSNAVSVVSSVDSTQVPDAGGES--- 1793

  Fly  2664 GGVNSGQGQGVPSNQRPRPEELPMKAPALVAQLPLTTPSREASLTQKLEIALGPVCPLLREIMVD 2728
                       |.::.|..:...:.|...|.|.|:|    ..|:|::||.||....||||||.||
  Rat  1794 -----------PGSRSPNAKLPSVPAVGSVPQDPVT----HMSITERLEHALEKAAPLLREIFVD 1843

  Fly  2729 FAPFLSKTLVGSHGQELLMEGKGLTTFKNSHSVVELVMLLCSQEWQNSLQKHAGLAFIELINEGR 2793
            ||||||:||:||||||||:||..|...|:|.|||||||||||||||||:||:||||||||:||||
  Rat  1844 FAPFLSRTLLGSHGQELLIEGTSLVCMKSSSSVVELVMLLCSQEWQNSIQKNAGLAFIELVNEGR 1908

  Fly  2794 LLSHAMKDHIVRVANEAEFILNRMRADDVLKHADFESQCAQTLLERREEERMCDHLITAARRRDN 2858
            |||..||||:|||||||||||:|.||:|:.:||:|||.|||...::||||:||||||.||:.||:
  Rat  1909 LLSQTMKDHLVRVANEAEFILSRQRAEDIHRHAEFESLCAQYSADKREEEKMCDHLIRAAKYRDH 1973

  Fly  2859 VIASRLLEKVRNIMCNRHGAWGDSSSTSSGGAIVGAVQKSPYWKLDAWEDDARRRKRMVQNPRGS 2923
            |.|::|::||.|::.::|||||..:.:          :...:|:||.||||.|||:|.|:||.||
  Rat  1974 VTATQLIQKVINLLRDKHGAWGSCAVS----------RPREFWRLDYWEDDLRRRRRFVRNPLGS 2028

  Fly  2924 SHPQATLKAALENGGPEDAILQTRDEFHTQIAVSRTHPSGQHNGE---LL---DDAELLIEDREL 2982
            :||:||||.|:|:...||.:.:.:....:|..       |..|.|   ||   ||....:::::|
  Rat  2029 THPEATLKTAVEHAADEDILAKGKQSIKSQAL-------GNQNSENEALLEGDDDTLSSVDEKDL 2086

  Fly  2983 DLDLTGPVNISTKARLIAPGLVAPGTVSITSTEMFFEVDEEHPEFQKIDGEVLKYCDHLHGKWYF 3047
            : :|.|||::||.|:|:||.:|..||:|:||:|::||||||.|.|:|||.::|.|.:.|||||.|
  Rat  2087 E-NLAGPVSLSTPAQLVAPSVVVKGTLSVTSSELYFEVDEEDPNFKKIDPKILAYTEGLHGKWLF 2150

  Fly  3048 SEVRAIFSRRYLLQNVALEIFLASRTSILFAFPDQHTVKKVIKALPRVGVGIKYGIPQTRRASMM 3112
            :|:|:||||||||||.|||||:|:|.:::|.|||..|||||:..|||||||..:|:|||||.|:.
  Rat  2151 TEIRSIFSRRYLLQNTALEIFMANRVAVMFNFPDSATVKKVVNYLPRVGVGTSFGLPQTRRISLA 2215

  Fly  3113 SPRQLMRNSNMTQKWQRREISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPIFPWVLTNYESKDLDLSLPSN 3177
            :||||.:.|||||:||.||||||||||||||||||:||||||||:||||:|||||::|||:||||
  Rat  2216 TPRQLFKASNMTQRWQHREISNFEYLMFLNTIAGRSYNDLNQYPVFPWVITNYESEELDLTLPSN 2280

  Fly  3178 YRDLSKPIGALNPSRRAYFEERYESWDSDTIPPFHYGTHYSTAAFTLNWLVRVEPFTTMFLALQG 3242
            :||||||||||||.|.|:|.||:|||:.|.:|.||||||||||:|.|.||:|:|||||.||.|||
  Rat  2281 FRDLSKPIGALNPKRAAFFAERFESWEDDQVPKFHYGTHYSTASFVLAWLLRIEPFTTYFLNLQG 2345

  Fly  3243 GKFDYPDRLFSSVSLSWKNCQRDTSDVKELIPEWYFLPEMFYNSSGYRLGHREDGALVDDIELPP 3307
            ||||:.||.|||||.:|:|.||||||:||||||:|:|||||.|.:.|.||..:||.:|.|:||||
  Rat  2346 GKFDHADRTFSSVSRAWRNSQRDTSDIKELIPEFYYLPEMFVNFNNYNLGVMDDGTVVSDVELPP 2410

  Fly  3308 WAKSPEEFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAIRATNVFYYLTYEGSVDLDGVLD 3372
            |||:.||||||||:|||||||||||||||||||||||:||||:||.||||||||||:|.|:.:.|
  Rat  2411 WAKTSEEFVRINRLALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQQGPEAVRALNVFYYLTYEGAVSLNSITD 2475

  Fly  3373 PVMREAVENQIRNFGQTPSQLLMEPHPPRSSAMHL-----SPMMFS-AMPEDLCQMLKFYQNSPV 3431
            ||:|||||.|||:|||||||||:||||||.|||..     ||:||: ...:|:..:|||..||||
  Rat  2476 PVLREAVEAQIRSFGQTPSQLLIEPHPPRGSAMQAYLLLQSPLMFTDQAQQDVIMVLKFPSNSPV 2540

  Fly  3432 IHISANTYPQLSLPSVVTVTAGHQFAVNRWNCNYTASVQSPSYAESPQSPGSNQPLTIDPVLAVH 3496
            .|::|||.|.|::|:|:||||...||||:|:       ..|::..:.|......|:.|||::|. 
  Rat  2541 THVAANTQPGLAVPAVITVTANRLFAVNKWH-------SLPAHQGAVQDQPYQLPVEIDPLIAC- 2597

  Fly  3497 GTNNNSNAASRRHLGDNFSQMLKIRSNCFVTTVDSRFLIACGFWDNSFRVFATETAKIVQIVFGH 3561
            ||..:     ||.:.|...|.:::.|.|||.|.|:|.::.|||||.||||::|:|.|::|:||||
  Rat  2598 GTGTH-----RRQVTDLLDQSIQVHSQCFVITSDNRHILVCGFWDKSFRVYSTDTGKLIQVVFGH 2657

  Fly  3562 FGVVTCMARSECNITSDCYIASGSADCTVLLWHWNARTQSIVGEGDVP-----TPRATLTGHEQA 3621
            :.||||:||||..|..:|||.|||.|.|:|||:||.::..|   ||.|     ||||.||||:..
  Rat  2658 WDVVTCLARSESYIGGNCYILSGSRDATLLLWYWNGKSSGI---GDNPGSETTTPRAILTGHDYE 2719

  Fly  3622 VTSVVISAELGLVVSGSSNGPVLIHTTFGDLLRSLDPPAEFHSPELITMSREGFIVINYDKGNVA 3686
            :|..|:.||||||:|||..||.|||:..|||||:|:.|.....|:||..||||..||.|:.|...
  Rat  2720 ITCAVVCAELGLVLSGSQEGPCLIHSMNGDLLRTLEGPENCLKPKLIQASREGHCVIFYENGCFC 2784

  Fly  3687 AYTINGKKLRHETHNDNLQCMLLSRDGEYLMTAGDRGIVEVWRTFNLAPLYAFPACNAGIRSLAL 3751
            .:::|||.......:|:::.:.|||||:||:|.||.|:|.|.:..:|..|:|:|.|:||||::||
  Rat  2785 TFSVNGKLQATVETDDHIRAIQLSRDGQYLLTGGDNGVVIVRQVSDLKQLFAYPGCDAGIRAMAL 2849

  Fly  3752 THDQKYLLAGLSTGSIIVFHIDFNRWHHEYQQRY 3785
            :.||:.:::|:::|||::|:.||||||||||.||
  Rat  2850 SFDQRCIISGMASGSIVLFYNDFNRWHHEYQTRY 2883

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rgNP_001284879.1 LamG 210..358 CDD:304605 94/147 (64%)
DUF4704 634..918 CDD:292415 164/283 (58%)
MARCKS 1434..1751 CDD:280269 57/323 (18%)
DUF1088 2791..2972 CDD:284000 90/186 (48%)
PH_BEACH 2996..3093 CDD:291510 58/96 (60%)
Beach 3125..3401 CDD:280327 211/275 (77%)
WD40 repeat 3524..3560 CDD:293791 20/35 (57%)
WD40 <3526..3729 CDD:295369 106/207 (51%)
WD40 <3530..3773 CDD:225201 122/247 (49%)
WD40 repeat 3566..3617 CDD:293791 29/55 (53%)
WD40 repeat 3622..3657 CDD:293791 21/34 (62%)
WD40 repeat 3669..3699 CDD:293791 11/29 (38%)
WD40 repeat 3704..3739 CDD:293791 15/34 (44%)
LrbaXP_038958577.1 LamG 229..376 CDD:419873 93/146 (64%)
DUF4704 451..711 CDD:406270 156/273 (57%)
PRK13108 <1020..1162 CDD:237284 44/320 (14%)
DUF1088 1906..2073 CDD:399463 90/183 (49%)
PH_BEACH 2099..2196 CDD:405526 58/96 (60%)
Beach 2228..2504 CDD:396627 211/275 (77%)
WD40 repeat 2620..2656 CDD:293791 20/35 (57%)
WD40 <2625..2825 CDD:421866 103/202 (51%)
WD40 repeat 2662..2715 CDD:293791 29/55 (53%)
WD40 repeat 2720..2755 CDD:293791 21/34 (62%)
WD40 repeat 2760..2789 CDD:293791 11/28 (39%)
WD40 repeat 2796..2836 CDD:293791 16/39 (41%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 472 1.000 Domainoid score I425
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 2588 1.000 Inparanoid score I26
OMA 1 1.010 - - QHG46555
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002549
OrthoInspector 1 1.000 - - oto95838
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103326
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR13743
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1939
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1110.970

Return to query results.
Submit another query.