Protein Alignment GluRIID and grin3bb

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651982.1
• Gene: GluRIID / 44483
• FlyBaseID: FBgn0028422
• Length: 902
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017213803.2
• Gene: grin3bb / 100333101
• ZFINID: ZDB-GENE-131122-77
• Length: 1114
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 986
• Identity: 206/986 - (20%)
• Similarity: 400/986 - (40%)
• Gaps: 190/986 - (19%)

  Fly    28 ASSGQSIRLG-LITDDATDRIRQTFEHAISVV----NN----ELGVPLVGETEQVAYGNSVQAFA 83
            |..|.::||| |:....:.|:|.....|:|.:    ||    .|.:.:|....|  .|:....|.
Zfish    41 ARIGHTVRLGALLPPRQSVRVRAALHRALSGLAESGNNFLPYNLSLDVVAREAQ--SGDPESLFR 103

  Fly    84 QLCR-LMQSGVGAVFG-PAARHTASHLLNACDSKDIPF--IYPHLSWGSNPDGFNLHPS----PE 140
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Zfish   104 CVCQDIVVQGVSAVLAFPQTQEEIVQMEFMSSFLEIPFISIIEHGEPLKTQNRFHLQMTTRIPPS 168

  Fly   141 DIANALYDIVNQFEW--SRFIFC--YESAEYLKILDHLMTRYGIKGPVIKVMRYDLNLN------ 195
            .:...|..::.:..|  |..:.|  :|.|..|.:| .|..|:| .||....:|..|||:
Zfish   169 GLVELLLAVLQRSGWEESMAVLCHGWEDAGLLDLL-KLQGRFG-WGPSQWHLRAALNLSHSTARM 231

  Fly   196 ---GNYKSVLRRIRKSEDSRIVVVGSTTGVA-ELLRQAQQVGIMNEDYTYIIGN-LN---LHTFD 252
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Zfish   232 ANISDFLSEHFNLDHSPPASVLLFGADPECASSVLRSAHDLGLTLPTVHWIMGHPLSPDALHSIG 296

  Fly   253 LE--EYKYSEANITGIRMFSPDQEEVRDLMEKLHQELGESEPVNSGSTFITMEMALTYDAVRVIA 315
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Zfish   297 LPLGLLAYGEVD------HKPLDFYISDALQLINRAV-------TAATVVRPDLALIQNMVNCFD 348

  Fly   316 ETTKH-LPYQPQMLNCSERHDNVQPDGSTFRNYMRSLEIKEKTITGRIYFEGNVRKGFTFDVIEL 379
            :..|| ||                ..|.....::.:...  ..:||.:..:.|:.:..|...:.:
Zfish   349 KPNKHELP----------------SSGQYIARFLSNTSF--VGLTGPVIVQRNLSRVHTSHKVHI 395

  Fly   380 QT--------SGLVKVGTWEEGK-DFEFQRPPQAVNFNDIDDGSL------------VNKTFIVL 423
            .:        ...|.||:||.|: :.|.|...|..:.....:|.:            |:.:.:.:
Zfish   396 WSLRRDAVGQPTWVTVGSWEGGRLNVEEQGLWQGSSPRQRTEGQMGREGRRWRAGFPVSGSRLRV 460

  Fly   424 ISVATKPY----------------------ASLVESIDTLI-----GNNQF---------QGYGV 452
            :::...|:                      .:..|::|.|.     ||..|         .||.:
Zfish   461 VTLVEHPFVFTREVDEDGNCPAGQYCLDAGTNSSETLDHLYAERAQGNKSFLPPDYSKCCYGYCI 525

  Fly   453 DLIKELADKLGFNF-TFRDGGNDYGSFNKTTNSTSGMLKEIVEGRADLAITDLTITSEREEVIDF 516
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Zfish   526 DLLEKLSEDMNFEFDLYIVGDGKYGAVK--GGQWTGLVGDLLSGVADMAVTSFSINSARSKVIDF 588

  Fly   517 SIPFMNLGIAILYVKPQKAPPALFSFMDPFSSEVWLYLGIAYLGVSLCFFIIGRLSPIEWDNPYP 581
            :.||.:..:.||......|.| :.:||.|....:|:.:.:| |.::..|     |:..||.:|:.
Zfish   589 TSPFFSTSLGILVRSKDTAAP-IGAFMWPLHWSMWMGIFVA-LHITALF-----LTLYEWKSPFG 646

  Fly   582 CIEEPEELENQFTINNSLWFTTGALL-QQGSEIAPKALSTRTISAIWWFFTLIMVSSYTANLAAF 645
            ...........|:.:::|......|. :..|...||..:.|.:..:|..|.|:::|||||||||.
Zfish   647 MTPHGRNRVKVFSYSSALNLCYAILFGRTVSSKTPKCWTGRFLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAV 711

  Fly   646 LTIENPTSPINSVKD--LADNKDDVQYGAKRTGSTRNFFSTSEEPIYIKMNEYLNAHPEMLMENN 708
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Zfish   712 MVGEKTFEEVSGIHDAKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYMKKS----FPEMHEYMRKFNE---PTT 769

  Fly   709 QQGVDKVKSGTKY--AFLMESTSIEFNTV--RECNLTKVGDPLDEKGYGIAMVKNWPYRDKFNKA 769
            ..||..:|:....  ||:|:...:::...  .:|.|..||.|...:||||.:.:|.|.....::.
Zfish   770 PDGVATLKTDPPQLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNISEF 834

  Fly   770 LLELQEQGVLARLKNKWWNEVGAG--VCSAKSDDDGPSELGVDNLSGIYVVLVIGSIISIIISIL 832
            :...:..|.:..|.:||:..|..|  |.:...    ..::|:.:.||::|:|.:|...:::
Zfish   835 VSRYKSDGYMDMLHDKWYKVVPCGKRVFAVTE----TLQMGIRHFSGLFVLLCVGVTGALL---- 891

  Fly   833 CWCYFVYKKAKNYEVPFCDALAEE---FRIVIRFSENERPLK----SAQSIYSRSRNSSQSIESL 890
                               .||.|   :|:|:.....::..|    ::|.|:.....:.:.::..
Zfish   892 -------------------TLAGEHAFYRLVLPHIRRKQKFKYWLHTSQKIHRALNMTYEDVKRQ 937

  Fly   891 KTDSEENMPVE 901
            :.::|::..::
Zfish   938 RANTEKSCNIQ 948

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIID	NP_651982.1	PBP1_iGluR_Kainate	35..400	CDD:380605	84/411 (20%)
		PBP2_iGluR_Kainate	417..788	CDD:270432	98/414 (24%)
		Lig_chan	547..819	CDD:459656	66/280 (24%)
grin3bb	XP_017213803.2	Periplasmic_Binding_Protein_type1	39..427	CDD:471960	87/420 (21%)
		PBP2_iGluR_NMDA_Nr3	457..852	CDD:270438	97/410 (24%)
		Lig_chan	618..885	CDD:459656	67/283 (24%)