back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits

Protein Alignment sls and hmcn1

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001261304.1	Gene:	sls / 44013	FlyBaseID:	FBgn0086906	Length:	18468	Species:	Drosophila melanogaster
Sequence 2:	XP_005160777.1	Gene:	hmcn1 / 559150	ZFINID:	ZDB-GENE-041014-322	Length:	5623	Species:	Danio rerio

Alignment Length:	5068	Identity:	1055/5068 - (20%)
Similarity:	1674/5068 - (33%)	Gaps:	1600/5068 - (31%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

  Fly    83 DIS--PPVFEQIFKNARFAQGGNALFEGRLRGNPKPFVTWTRKGAPLLESQKFRMSYNEATGDVS 145
            |:|  ||.....| ||..:.|.|.:....:....:..:||.|.........:.|::.|     :|
Zfish   509 DVSEPPPAITVPF-NATASPGANVILTCLVTSTVRFNLTWQRGDVDARLDHRIRVTTN-----LS 567

  Fly   146 LLINQIGPGDEGEYTCTARNQYGEAICSVYIQPEGAPMPALQPIQNLEKNIYSNGYSYTSIEEEF 210
            |.|.::.|.|.|.|||.|.|:.|.:...||:..:..|:..:.|
Zfish   568 LEIQRVTPDDVGWYTCIAANEGGVSAARVYLNVQEPPVVTVDP---------------------- 610

  Fly   211 RVDTFEYRLLREVSFREAITRRSGYEQDSQLSQELDRNQGPAQAPQISQKPRSSKLIEGSDAVFT 275
            |..||:..  :|:..|   ....||
Zfish   611 RNQTFQTG--QEIWIR---CSAKGY---------------------------------------- 630

  Fly   276 ARVGSNPKPRLTWFHNGQRLVASQKYEISYSSGVATLRVKNATARDGGHYTLLAENLQGCVVSSA 340
                  |.|.:.|.||...::.|.::.::..   .||.:||...:|.|.|..||.|:.|....:|
Zfish   631 ------PSPMVVWTHNDMFIMGSSRHRMTPD---GTLIIKNTGLKDAGTYGCLASNVAGTDSQTA 686

  Fly   341 VLAVEPAAETAYEPKPVDVMAEQLEAGKALPPAFVKAFGDREITEGRMTRFDCRVTGNPYPEVFW 405
            :::                   .:|:.:...|     ..|..|..|:.|..:|||||.|:|::.|
Zfish   687 IVS-------------------YIESPQVTVP-----HSDLLIGLGQKTVMECRVTGVPHPDIMW 727

  Fly   406 LINGRQVRDDASHKILVNESGSHSLMITNVTRLDAGAVQCLARNKAGEVAIEAQLNVLEKEQVVA 470
            .....|::..:   :|..:....:|.|.......||...|:|.|.||.......|:|..     |
Zfish   728 YKGDLQLKPSS---VLSMDPQRGTLTIQQTQDTHAGQYTCVAVNSAGSAQGYITLDVGS-----A 784

  Fly   471 PQFVQRFSTMTVREGEPITMSANAIGTPQPRITWQK-DGVQI-------SSTAERFVGIDGGATC 527
            |||.::.|.::...|..||:...|.|.|:|:::|:: |.:.:       |:...|   :|||
Zfish   785 PQFTKKPSDLSADIGTNITLPCYAQGHPKPQLSWRREDNIALFTQRHGPSTVTHR---MDGG--- 843

  Fly   528 LEIPRVTANDAGWYQCTAQNIAGSTANRARLYVE---------VPREQPNYEQRRLNLPRPTKVI 583
            |.|..:...|...|.|.|||..|....:|::.|.         .|......|.:::.|  |..::
Zfish   844 LFITNLWVEDEATYVCEAQNHFGRIQVKAKVTVTGLVSPLIALSPTVVSVIEDQQVTL--PCVLL 906

  Fly   584 EPEPIPGPEIIYLRHVERAKPHLRPGEEDRVYPPPQFIIPLQNVQQTEGGR-------------- 634
            ...|:|....::...:..:.|::....:..::        ::.|.|.:||:
Zfish   907 AGNPLPERHWLHDNGLVTSSPYVTVRRDGSLH--------IEQVSQQDGGQYTCLTENVVGSSNR 963

  Fly   635 -----VHMEARIE------------PV-------GDPTMVVEWYLNGRPLAASARATSVFKFGFI 675
                 |::...|:            |:       |.|...:.|...|..|..|....|:.:.|
Zfish   964 TTILNVYVMPTIQHGPQIFSTIEGTPISLPCRAHGVPKPDITWSKRGELLDLSGSVFSLTEDG-- 1026

  Fly   676 ALDLLSIMGHDSGEYMCRVTNASGVAESRAILSVVQRPSIE---QSSQNPNSLQYINQLEDYSRY 737
            :|.:.|..|.:|||::|..|||:|.:..:..|:|..||.:.   ::..:.||
Zfish  1027 SLHIHSPSGEESGEFVCTATNAAGYSSRKVQLTVYVRPKLSGVGEADIHDNS------------- 1078

  Fly   738 QRTESIDEQLNQAPQFIRPLRDLGEFEEGKNVHFEAQVTPVNDPSMRVEWYKDGLPITASSRITA 802
                   |:|.:....:           |.::....:|..|..|.  :.|.||       .::.:
Zfish  1079 -------EKLLEMSVIV-----------GDDITLPCEVESVPPPI--ITWAKD-------KQLIS 1116

  Fly   803 IFNFGYV-----SLNILHLRAEDAGTYTVRAVNRIGEAISQSSIRVHSRSQVTADLGIPEQQRYI 862
            .|:..::     |:.|...|..|:|.|...|.|..|.......:.|.....::|
Zfish  1117 PFSPRHIQLPSGSMRITDTRVTDSGMYLCVATNIAGNFSQTVKLSVLVPPSISA----------- 1170

  Fly   863 EKVEELEDYRKSQQRRHVQEAAEAIAPPQFKTPIQNQLDLREHAHAHFEARLEPV---GDSTMRV 924
                                     .|...|..|.:.:||             |.   |.....|
Zfish  1171 -------------------------GPRAMKVQIGHAIDL-------------PCVTQGVPEPSV 1197

  Fly   925 EWLKDGQPLEASSRITTYHNFGYVALTIKQLTIYDAGTYTCRAYNAMGQDTTVAQLTV-ISKNEI 988
            .|||||..|:..||    :.....|||:.|:.:.|.|.|.|||.|..|::.|..||.| :.....
Zfish  1198 SWLKDGTVLQDGSR----YRISDGALTLNQVALTDEGIYVCRAVNIAGKEETAIQLHVQVPPVVE 1258

  Fly   989 VSESQHPGGLQKIQHLEDSSRYGRREEEETYITQAPRFLGPLKGTTKILEGQRAHFEARVEPQSD 1053
            |||......||                 |....|...|..|.|||.              ||
Zfish  1259 VSEPPFNSPLQ-----------------ERVANQQIAFPCPAKGTP--------------EP--- 1289

  Fly  1054 LGLVIEWYHNGRSITAANRIQTYYDFGYVALDISQVRAEDAGVYLVVARNKLGEAQQQATMIVET 1118
               ||:|:.||..:|......:..:.| ..|.::.|...|.|.|..:|.|..|..:::..:.|..
Zfish  1290 ---VIKWFRNGHELTGNEPGVSILEDG-TLLILASVSPLDNGEYTCMAVNDAGTTEKKYQLKVNV 1350

  Fly  1119 RSSIDTSSMHRGLYEKTQNLENKPFVEPQYDIEEISKSKPVFVTPLSDPKPIHDGKNIHLECRLE 1183
            ...|    ...||......:.|:|                                 .:|.|  :
Zfish  1351 PPDI----RDNGLLSNVSVVINQP---------------------------------TNLVC--D 1376

  Fly  1184 PMGDPTMRVEWFHNGRPVTVGSRFRTYYDFGFV----ALDIIKATAADSGEYTVRATNHLGTAHT 1244
            ..|.|...:.|:.:|..|...|      |...:    .|.::||...|:|.|..:|.|..|
Zfish  1377 VTGTPVPVITWYKDGVEVVPSS------DVQILQKGKTLKLLKAAVQDAGRYICKAINIAG---- 1431

  Fly  1245 SACVRVIDHTDVVTETQNEQSLEQIQLLEDSRRRHHQEEDITIMQAPQF--TRGLHNIETIEGTN 1307
                                          ||.|...   :.::..|..  |.|..::..:....
Zfish  1432 ------------------------------SRERDFY---LDVLVPPTIIGTVGSRDLSAVLNQE 1463

  Fly  1308 VHLECRLQPVGDPSMRIEWFVNGKPVKTGHRFRPAYEFDYVALDL------LGCYAIDSGVYTCQ 1366
            :.|||:::  |||...|:|:.:.|||..|.   |..|.......|      ||    |...|.|.
Zfish  1464 IVLECKVK--GDPFPTIQWYKDRKPVFLGD---PNIEVLNRGQQLKIKSARLG----DQARYQCS 1519

  Fly  1367 ARNQLGEAVTSCSVRIIAKNDLILETQNESGLQKIQYLEDSTRHRRSEFVDEVVNIRPRFLTHPK 1431
            |.|..|:.....::.|.....:                      :......||..:....:|
Zfish  1520 ATNAAGKQSKDFNLSIFVPPSI----------------------KGGNVSSEVTVLLGNLVT--- 1559

  Fly  1432 SLTNTREGGHAHFECKIEPVTDPNLKVEWFKNGRPITVGHRFRPIHDFGYVALDIVHLIAEDSGV 1496
                        .||::..|..|  .|.|:|||..|....:.:.: |.|.. |.|:.....|:|.
Zfish  1560 ------------LECEVRGVPLP--AVTWYKNGEVILSSRQAQYV-DRGQF-LKILRAQVSDAGQ 1608

  Fly  1497 YTCRAVNLIGSDETQVELQCRSGEQIVTVTQNEAGLEQIHYLEDRSRYTRREEIDESTKQAPVFT 1561
            ||||..::.|:.|..|||.......|.      ||                       ...|.
Zfish  1609 YTCRVTSVAGTAEKVVELDVYVPPSIT------AG-----------------------SDGPT-- 1642

  Fly  1562 TSLKNVEIKENQRAHFECRLIPVSDPSMRVEWYHNNLPLKSGSRFTETNNFGFV----ALDIMST 1622
                ::::..|:....||.......||:  .|      ||.||......:...:    .::|::.
Zfish  1643 ----DMKVVLNKSLILECEAEGHPPPSL--TW------LKDGSPVAVRESLRVLDQGRKIEILNA 1695

  Fly  1623 LPEDAGTYTCRAYNAVGEAITSAVAVVHTKKSIYLESQHETALPRLQHLEDGSKRQRISVQDEFV 1687
            |..|||.|.|.|.:..||.                |.:::.:: .:..:.||:.
Zfish  1696 LQSDAGRYVCVATSVAGEK----------------EIKYDVSV-LVPPVVDGAS----------- 1732

  Fly  1688 SQAPVFTMPVRDVRVAENQAVHFEARLIPVGDPKLTVEWLRNGQPIEASNRTTTMHDFGYVALNM 1752
                    ...|..|..|..:..|.  ...|.|..|:.||::|.|::.........:...:.::.
Zfish  1733 --------DTTDATVILNNILELEC--YATGRPTPTITWLKDGVPVKHGEGVRITSNGRRLVISR 1787

  Fly  1753 KYVNPEDSGTYTCRAVNELGQAVTSASLIVQSKTSIQLETQHEAAMHKIHQLEDHSRYQRREEEE 1817
            ..|:  |:..:.|.|.||.|:                                        :|.|
Zfish  1788 AQVS--DTALFHCVATNEAGE----------------------------------------QERE 1810

  Fly  1818 YTVTTAPVFVTKLIGPS--NLVEGQSAHYECRIEPYPDPNLKVEWFHNGKPLSTGHRFRTTYDFG 1880
            :.|:.......:..||:  ::|...|...:|.:...|.|:  ..|..:|:|:.|...|......|
Zfish  1811 FKVSVHVPPAIRSTGPAERSVVLHTSISLQCVVSGIPPPS--TTWLKDGRPVDTTQEFLKLESAG 1873

  Fly  1881 FAALDILTVYAEDSGEYTCRVTNNLGEAINSIVLNVTSRSSIIHETQHEEALTKIQHLEDTSRFQ 1945
             ..|.|.....||:|:|||..||..|||...|.|:|....||
Zfish  1874 -RVLHIKKARLEDAGKYTCVATNAAGEAQQHIRLSVHEPPSI----------------------- 1914

  Fly  1946 RKTDEEQFHAERPQFGRPLRNAKVNEGAPVHLEATLIPVNDPTMKVEWYCNGRPIQT-------- 2002
                         |:...:.|..:..|..:.|:..  ....|...|.||.:|||:.:
Zfish  1915 -------------QYAGEMLNETILAGFQIQLKCK--ATGSPLPAVTWYKDGRPLTSAAGVNILS 1964

  Fly  2003 -GHRFKTTYDFGFVALDILYAHAEDTGTYMCKAKNAIGEAVTTCAVNVTANKTLDLDTLDAQRLE 2066
             ||           .|:|..|...|.|.|.|.|.|..|....|.:
Zfish  1965 RGH-----------VLEIDRAQVSDAGFYKCVAINVAGSTELTYS-------------------- 1998

  Fly  2067 KIRQLETYAPPPKPVVEEKG-------QKPIFL------TPLSNLEHLKEGEHAHLECRVEPIND 2118
                |:.|.|   |.:..||       ..|:.|      .|:.:|..||||         .|::.
Zfish  1999 ----LQVYVP---PTISSKGGMVTVVVNDPVRLECEASGVPVPSLTWLKEG---------SPVSS 2047

  Fly  2119 PNLKIEWFCNGKQLPTGHRYRTTHDFGYVALDILYVYGEDTGTYICKATNQLGEAVNTCNVRVLN 2183
                   |.:|.|:.:|.|          .|..:.....|.|.|.|.|.|..||
Zfish  2048 -------FSDGIQVLSGGR----------VLSFISAQVSDAGHYTCVAVNAGGE----------- 2084

  Fly  2184 RRSMILDTQHPDALEKIQKLESKVPNARTEVGDAPISPPHFTAELRGSTEIYEGQTAHFEAQVAP 2248
                    ||       ::.|.:|           ..||:...|...:| :..||:.....|...
Zfish  2085 --------QH-------REYELRV-----------YVPPNIMGEEVNNT-VLMGQSVQLHCQSDA 2122

  Fly  2249 VHDPNLRIEFYHNGKPLPSASRFHITFDFGYVSLDITHAVAEDAGEYSVRAVNALGQAVSSTNLR 2313
            :..|.|  .:..:|:||.......::.|..:  |.|..|..:|.|.|:..|.|..|:.....||.
Zfish  2123 IPPPAL--SWRKDGRPLYRKPGLSVSEDGSF--LKIISAQVQDTGRYTCEATNVAGKTEKHYNLN 2183

  Fly  2314 V-IPRGTIISDTQHPEGLEKIRKLESTAPHQRQEPETPGTRQRPVFTQPLQNIDRINEHQTAHFE 2377
            | :|                              |...|:.:....|.               .|
Zfish  2184 VWVP------------------------------PSIRGSDEVSSLTV---------------IE 2203

  Fly  2378 ARLIPV-----GDPNLKVEWYRNEKIIEDSSRITKQHDFGFVSLDISHIRKEDEGVYMCRAVNPL 2437
            ..||.:     |.|...:.|.::...::..||:....  |...|.||...|.|...|.|.|.:..
Zfish  2204 GGLITLVCESSGIPPPSLIWKKDGSELKGDSRVRVLS--GGRQLQISSAEKADASSYTCLASSAA 2266

  Fly  2438 GEAVTTASMRVVSEASIQMDTQHPDSISR----IHQLEKPLAPRPTEPERLFEKPIFTQLLTGPS 2498
            |.|:...:::|....||....|..::::|    ..:.|....|||.
Zfish  2267 GSAIKEYNLQVYVRPSISSSAQDEETVTRGGDITLRCEADGVPRPA------------------- 2312

  Fly  2499 ELWEGTHAHFEARVVPVGDPSLKFEWFINGVELQMGSRLRTTHDFGFVTLDITAVVPEDAGVYMC 2563
                                   ..|..:|..|..|.:.:..:: |.:...:.|.| .|.|.|.|
Zfish  2313 -----------------------VSWMKDGRPLSTGRKAQILNE-GRLLRILEAQV-ADTGRYTC 2352

  Fly  2564 RAYNAAGEAVSSTAMKVKTKSNIDGQPLIPESWEAIRLKEAAMNRVPEMFVDSTPQQAPVFTTHL 2628
            .|.|.||:|.....:.|.....|.||..:||:...:                   .:.||..|
Zfish  2353 IAINVAGQADRKYDVNVHVPPTIIGQTHMPENISVV-------------------VKNPVVLT-- 2396

  Fly  2629 QSYDKLHEGQHVLLEAQVEPRADPNLRIEWFKNGISLTTGSRIRSTFDFGLVTLSINGLR----- 2688
                             .|....|...|.|.|:|..::|.|.:|       |.....|||
Zfish  2397 -----------------CEASGMPPPAITWLKDGQPISTSSSVR-------VISGGRGLRLMHAA 2437

  Fly  2689 ADDSAIYTCKATNQVGEAVSTSSLKIEDRHWLQAESLHPDSLPRIGELEAPKEGRPEAPEPTYET 2753
            :.|:..|||..:|..||......|.:          |.|.|:...|.:|
Zfish  2438 SSDAGRYTCIVSNSAGEERKNFDLYV----------LVPPSIVNEGTVE---------------- 2476

  Fly  2754 PVFITHLNNIECKESDNVRFECNVEPARDPTMSIEWFYNGQPLQAAAKFKSIYDFGYCALDLTNS 2818
                    :::.||..|....|.|  ..:|...|.|..:||||.:..:.:.:.:..:  |.::.|
Zfish  2477 --------DVKVKERQNAILACEV--TGNPVPEITWLKDGQPLASDTRLQVMSNGRF--LQISAS 2529

  Fly  2819 YAENSGVYTCKATNSKG--------SATTSGTLKCTGGKTMFLDTQHPQGEAGLEAVQETEEELA 2875
            ...::|.|:|.|:||.|        :...|.|:..:|          |:|.|  |.|..|    .
Zfish  2530 QVADTGRYSCLASNSAGDRSRHFNLNVLVSPTIAGSG----------PEGSA--EEVTVT----L 2578

  Fly  2876 NRYTSKTTKPETQYPPPVWTKPLQAEFHLSEAQPIHLEANVEPKEDPNLFIEWYFNGKMLNHGSR 2940
            |..||...:.:: |||.:.|       .|.:..|.....||                ::|..|.
Zfish  2579 NSPTSLVCEAQS-YPPAIIT-------WLKDGTPFESSRNV----------------RVLPGGR- 2618

  Fly  2941 FKMTSEFGFVTMDMIEVYARDQGIYTCKAYNKAGEAFTS--TTIFCSSKENIIESTQHPKGAEGL 3003
                      |:.::.....|.|.|||.|.|:|||...:  ..:|.....|
Zfish  2619 ----------TLQILNAKEEDAGRYTCVATNEAGETLKNYEVKVFVPPVIN-------------- 2659

  Fly  3004 EQIQDLEDSLRKDGSKPEQPDLGIPPRFTTEFVNIADIGEGELAHFEANLIPVGDQSMVIEWFYN 3068
                  ::.:..:...|::..:.:....|.|              .||..||    :..:.|:.:
Zfish  2660 ------KNDIPGESLAPKEVKIKVNNTLTLE--------------CEAQAIP----TPTLVWYKD 2700

  Fly  3069 GKVLEASHRVRTIYAFGTVALEVLGTKIEDTGTYTCRATNKHGTAE--ISCNLECVDKPRG---Q 3128
            |::|:|...: ||.|.|.: :::..|::.|||.|||.|||..|..|  ...|::.....||   .
Zfish  2701 GQILKADGHL-TITANGRI-VQIKHTQVSDTGRYTCVATNIAGEDEKDFDVNIQVPPSFRGFGDS 2763

  Fly  3129 KPRFTSHIQPLEGLKDGQSAHFECTLIPVNDPDLKVEWYHNGKLMRHSNRIKTVSDFGYVVLDIS 3193
            .|.....::.:. |.:..|.:.|...:|   |.: :.||.:|.|:..::::..:.  |..||.|.
Zfish  2764 GPGNNGEVKDVI-LNNPISLYCETNAVP---PPV-LTWYKDGHLLTSNDKVLILP--GGRVLQIP 2821

  Fly  3194 YLQDHDSGEYVCRAWNKYGEDFTRTTLNCGGRGGVFYDSLQPDSLQRIRELECPQGQQADTSAPL 3258
            ..|..|:|.|.|.|.|:.||                 ||:|.|    :|.|..|..:.||
Zfish  2822 RAQVDDTGRYTCVAVNEAGE-----------------DSIQYD----VRVLLPPSIRGAD----- 2860

  Fly  3259 VAEPPKFITQIVDVTKLVEGQSAHFEARLTPITDPDLVVEWYFNGKKL--PHGHRF----RTFHD 3317
             .|.|..:|.:|:.|.|:|.|   .:...||      .:.|..:.:.|  .:.||.    ||
Zfish  2861 -GELPDEVTVLVNKTMLLECQ---VDGSPTP------KISWVKDSQPLTQDNTHRLLSNGRT--- 2912

  Fly  3318 FGIVILDILYCYEENSGVYEARARNKYG---------------------EDVT-----RASLKC- 3355
                 |.||.....::|.|...|:|..|                     |:||     ..||.|
Zfish  2913 -----LQILNAQVTDTGRYVCVAQNLAGTAEKSFNLHVHVSPTIVGIREENVTVVLNNFVSLNCE 2972

  Fly  3356 -------------------ASKSSLILDSQLPRG----------MEGGLEKIANLEYSMVRTREE 3391
                               ||.::||    :|.|          .:||       :||.|.....
Zfish  2973 ATGLPPPTLRWFKDRRPVQASTNALI----MPGGRTLQILKAKMSDGG-------KYSCVAVNPA 3026

  Fly  3392 TTEETKGKAPVFTVP--------LENIENLREGENAHFEARITPADDPKLKVEWYWNGRPLKAGS 3448
            ...:......|:..|        |..:.|::.|::...|........|  .:.||.||||:...:
Zfish  3027 GEAQKLIYLTVYVPPSIRHNSGDLPVVLNVQVGKSVMLECESNAVPPP--VITWYKNGRPIAETA 3089

  Fly  3449 RFRTFCDFGFVILEISPVYPEDSGEYSCRAINEYGEAVTTATMKIQGKRSIIMESQLPKGMEGTI 3513
            ..|...|  ..:|::......|:|:|.|:|.|..|          |..::..:...:|..::|..
Zfish  3090 NLRILAD--GQMLQLKETEVSDTGQYVCKATNVAG----------QVDKNFHLNIHVPPRLDGPA 3142

  Fly  3514 -DRIAELEGLGSRSTEFVPDDDTGKPPEFITSPFDMVIGENALAHFECRLQPINDPSMRVDWFHN 3577
             :|:.|.                      |::|          ..|.|....|..||:  .|..|
Zfish  3143 EERVVET----------------------ISNP----------VTFACDATGIPPPSL--TWLKN 3173

  Fly  3578 GKALWAGSRIKTINDFGFVILEIAGCYQRDSGLYTCKATNKHGEATVSCKLQVKGRQGIVMEPQL 3642
            |:.:.....::.....|...|:|:.....|||.|||.|:|..|:|..:..|.:          .:
Zfish  3174 GRVIENSESLEMHILSGGSKLQISRSQLSDSGTYTCVASNVEGKAQKNYHLVI----------HV 3228

  Fly  3643 PSNFRTGTESLQKLEETMHKREELVTEDEQPNPPKFTEEIKDNLDVPEGGPIHFDCRVEPVGDPT 3707
            |.|. .|:|...::...::...:||                              ||.|  |.||
Zfish  3229 PPNI-IGSELPSEMSVLLNDSVQLV------------------------------CRAE--GTPT 3260

  Fly  3708 MRIEWFYNGHVMATGSRVHQLN-----DFGFIALDVDYIYARDSGEYTCRATNKWGTATTSAKVT 3767
            ..|:|..:|   .|.||..|.|     |..  .|.|..::..|||:|||.|||:.|.......:.
Zfish  3261 PEIQWLKDG---MTISRTAQKNIKISPDGS--TLTVTAVHTSDSGKYTCVATNQAGEEDRIFNLN 3320

  Fly  3768 CKGKHNIVYESQLPEGMTSEKLKELERGRIPEAPKVVEEVFGPPKFTTQITSVTVDEAEAVRFEC 3832
                   ||...|.:| .....|||                     ||.:.|       ::..||
Zfish  3321 -------VYVPPLIQG-NGPAAKEL---------------------TTVLDS-------SINIEC 3349

  Fly  3833 QVEPKTDPSLRVEWYRNGKPLPSGHRYRNIFDMGFVSLDILYVYGEDSGEYVCRAINNYGEDRTR 3897
            .......|.|  .|.:||.|||...:.| :...|.| |.|......|.|.|.|.|.|..|.|...
Zfish  3350 VASGSPPPQL--NWLKNGLPLPVSSQIR-LLSAGQV-LRIARAQVSDGGSYTCVASNRAGVDNRH 3410

  Fly  3898 ATVSCKKLPT--------------------ILLQNQVPRGM---KRSDALTQMEATIK------- 3932
            .|:.....|:                    |.:.:..|..:   .|:.|....:|.|.
Zfish  3411 YTLQVYVPPSLDGAGSTEEVTVVKGSTASFICIADGTPSPVIIWLRTGASVSKDAHISLLNQNST 3475

  Fly  3933 ------------KYTSEVHLTEDDL---FDPDRKQPPRF-VTQIKEQLTLTEMAVTKFECQLAPV 3981
                        :||...|....|.   |......|||. .:.:..::::....|.:..|:..
Zfish  3476 MQIVNVLVNHTGRYTCTAHNQAGDASRHFSLKVLDPPRINGSGVPAEVSVVVNHVLELLCEAD-- 3538

  Fly  3982 GDPNMKVEWFFNGKPLLHKNRFQPIYDFGYVAMNFGWVYPEDSGEYVCRATNLYGKDETRAIIKV 4046
            |.|...:.|..:|:||......:.:.|...:.:....|  |::|.|.|.|::..|.|:...:::|
Zfish  3539 GIPLPTLTWLKDGRPLPQTENIRLLRDGQMLRVASAQV--ENTGRYTCLASSPAGDDDKEFLVRV 3601

  Fly  4047 SGKPGIVYDSQLPAHMQSIDRIREMEASWQVVPDEVDP--------DAKPRTKP---VFVS---- 4096
            ...|.|..|    ..:|.:..::..:.:.:...|.|.|        ||..:..|   |..|
Zfish  3602 HVPPNIAGD----RGVQDVSVLQNRQVTLECKSDAVPPPTLTWLKDDAPLKMSPRVRVLSSGRYL 3662

  Fly  4097 ----------------------------KLE---PQTVEEG---------DPARF-CVRVTGHPR 4120
                                        ||.   |.|:::|         .|... || |.|.|.
Zfish  3663 QINNAVLGDGAQYSCVASNVAGETRRHFKLSVNVPPTIKDGPQSVSVHINQPVVLECV-VNGVPA 3726

  Fly  4121 PRVMWLINGHTVVHGS--RYKLTNDGMFHLDVPKTRQYDTGKVEVIARNSVGESIATTELKV--- 4180
            ||:.|...| :::.|:  |||...||  .|.:...:..|||:...:|.|..|......:|:|
Zfish  3727 PRITWRKQG-SILAGNNPRYKFGEDG--SLRILSAQVTDTGRYLCMATNQAGTERKRVDLQVYVP 3788

  Fly  4181 --VARSDDYRNVLKNSPRPWYDYELAAYQKERQENELEKVFDERKQVLSEQSSHTLKGVEHLKPK 4243
              :|.......|..|.                            :..||.:::    |:    ||
Zfish  3789 PSIAEGPTNITVTVNV----------------------------QTTLSCEAT----GI----PK 3817

  Fly  4244 QYKPPTPDWQQNVKAKKSEDYYNKLQTLETEQLLKETNLRRDTHQYAIPGEKVVSS-----SQAK 4303
                |:..|.:|.:|..::...|..:.|.:..|:.......||..|    |.|||:     |:|.
Zfish  3818 ----PSVSWTKNTQALNTDQNQNMYRLLSSGSLVVIAPSVEDTALY----ECVVSNEAGQESRAI 3874

  Fly  4304 GMAQSYEENLQEKTSTTEVQAAPPKGIAQPSESSVHGREVHMNKQQQVQKEIQ-------GDLEI 4361
            .:......::.::.:...|....|..|...:....|..........::.|:.:       |.|||
Zfish  3875 QLTVHVPPSIADEATELVVSRLSPVVIGCTASGVPHPVLYWSKDGLRLAKDGEGFTILPSGPLEI 3939

  Fly  4362 TRKITATETTEVEHKGTIQ----------ERVVQGPVKPAKAPVFTKKIQPCRVFENEQAKFEVE 4416
            |       ..::.|.|...          .|.||..|.  ::||.........|..|........
Zfish  3940 T-------AADLSHSGRYSCVAKNAAGTAHRHVQLTVH--ESPVIQSHPSTLDVILNNHVTLPCR 3995

  Fly  4417 FEGEPNPTVKWYRESFPIQNSPDLQIHTFSGKSILI------IRQVFVEDSAVFSCVAENRGGTA 4475
            ..|.|.||:.|.:|.        :.|.|..|...::      |.:..||||..:.|||:|..|||
Zfish  3996 ATGSPRPTITWQKEG--------INIFTTGGGFTVLPNGGLQISKAKVEDSGTYMCVAQNPAGTA 4052

  Fly  4476 KCSANLVVEERRRAGKGGIQPPSFVTTIQSTTVATGQLARFDAKVTGTRPLDVYWLKNGMKIQPS 4540
            .....|.|:          .||...:.|::.|||............|.....|.|.|:|..:..|
Zfish  4053 LGKTKLRVQ----------VPPVITSDIRAYTVALDVSVTLQCNSEGFPTPSVSWHKDGQLLSES 4107

  Fly  4541 IKFKMLEEDSVHTLLIIEPFAE--DSGRYECVAVNAAGEARCDGDCIVQSPSKPEKPTTPGSEKA 4603
            ::.::|...::..     .||:  |:|||.|...|.||.:..|....||.|
Zfish  4108 VRQRVLSTGALQI-----AFAQPGDTGRYTCTVANVAGSSSLDISLTVQIP-------------- 4153

  Fly  4604 PHIVEQLKSQTVEEGSKVIFRCRVDGKPTPTARWMRGE-NFVKPSRYFQMSRQGEYYQLVISEAF 4667
            |.|.......:|.|.::.:..|..||.|.||..|.:.: .....:..:.:...|:   |:|..|.
Zfish  4154 PSIRVGESEVSVVENTQALLTCVADGVPQPTITWEKDDIPLTDTTAEYTILPTGD---LLIDTAQ 4215

  Fly  4668 PEDEGTYKCVAENKLGSIQTSAQLKVRPIENLDAPPTIT-ALKDVSVTEGMPAQFKTTVTGKVKA 4731
            |||.|:|.||..|.:|....:..|.:.      ..|..| .|.||::.:.........||| :..
Zfish  4216 PEDSGSYTCVGTNSMGQDSRTISLSIH------THPAFTELLGDVALNKRERLLMVCGVTG-IPP 4273

  Fly  4732 TSVQWFREGQLIPETPDFQMIFDGNSAVLLIGTTYEEDSGIFTVRVTSSTGQVESSAKLTVKK 4794
            ..:.|.....::|...|.   ::|:|. |:|....::|||.:|....:|.|.::|...:.||:
Zfish  4274 PKITWTFNNNIVPAQYDH---YNGHSE-LVIERVSKDDSGTYTCMAENSVGSIKSLGFVYVKE 4332

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 591.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.