DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Spt6 and Supt6h

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651962.2 Gene:Spt6 / 44000 FlyBaseID:FBgn0028982 Length:1831 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001178749.2 Gene:Supt6h / 303281 RGDID:1309290 Length:1725 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1877 Identity:862/1877 - (45%)
Similarity:1193/1877 - (63%) Gaps:202/1877 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MAEFLDSEAEESEEE--EELDVNERKRLKKLKAAVSDSSEEEEDDEERLREELKDLIDDNPI--- 60
            |::|::|||||||||  .|.:|..|...|.::....|..|||..|::..|..|||.|:|:..   
  Rat     1 MSDFVESEAEESEEEYNHEGEVVPRVTKKFVEEEDDDEEEEENLDDQDERGNLKDFINDDDDEEE 65

  Fly    61 -EEDDG--SGYDSDGVGSGKKRKKHEDDDLDDRLEDDDYDLIEENLGVKVERRKRFKRLRRIHDN 122
             |||:|  ||...|.||. ||||:   ...||||||||:|||||||||||:|.::::|::::.|:
  Rat    66 GEEDEGSDSGDSEDDVGH-KKRKR---TSFDDRLEDDDFDLIEENLGVKVKRGQKYRRVKKMSDD 126

  Fly   123 ESDGEEQHVDEGLVREQIAEQLF-DENDESIGHRSERSHREADDYDDVDTESDADDFIVDDNGRP 186
            :.|.||::..|...:|.||.::| ||..|......|......|:.::.|.|||.|||||||:|:|
  Rat   127 DEDDEEEYGKEEHEKEAIAGEIFQDEEGEEGQEAVEAPMAPPDEEEEDDEESDIDDFIVDDDGQP 191

  Fly   187 IAEKK-KKRRPIFTDASLQEGQDIFGVDFDYDDFSKYEEDDYEDDSEGD-EYDEDLGVGDDTRVK 249
            :.:.| :|:.|.:|||:|||.|:|||||||||:|.||.|  |:::.|.| ||::|...| :.||:
  Rat   192 LKKPKWRKKLPGYTDAALQEAQEIFGVDFDYDEFEKYNE--YDEELEEDYEYEDDEAEG-EIRVR 253

  Fly   250 KKKALKKKVVKKTIFDIYEPSELKRGHFTDMDNEIRKTDIPERMQLREVPVTPVPEGSDELDLEA 314
            .||..||:|.:::||::||||||:..|.||.|||||.||:|||.|||.:||....:  |||:.||
  Rat   254 PKKTTKKRVSRRSIFEMYEPSELESSHLTDQDNEIRATDLPERFQLRSIPVKAAED--DELEEEA 316

  Fly   315 EWIYKYAFCKHTVSEQEKPESREK-------MRKPPTTVNKIKQTLEFIRNQQLEVPFIAFYRKE 372
            :|||:.||...|:|.|:..:..::       .||.|:||.|||:.|.|:|||..|||||||||||
  Rat   317 DWIYRNAFATPTISLQDSCDYLDRGQPTSSFSRKGPSTVQKIKEALGFMRNQHFEVPFIAFYRKE 381

  Fly   373 YVKPELNIDDLWKVYYYDGIWCQLNERKRKLKVLFEKMRQFQLDTLCADTDQPVPDDVRLILDSD 437
            ||:|||:|:|||:|:.:|..|.||..||..|..|||||:.:|.:.:.||.|:|:.|.:|.:..:|
  Rat   382 YVEPELHINDLWRVWQWDEKWTQLRIRKENLTRLFEKMQAYQYEQISADPDKPLADGIRALDTTD 446

  Fly   438 FERLADVQSMEELKDVHMYFLLNYSHELPRMQ--AEQRRKAIQERREAKARRQAAAAENGDDAAE 500
            .|||.|||||:|||||:.:|||.|..::|:||  |:..||.::..:           |:||:..|
  Rat   447 MERLKDVQSMDELKDVYNHFLLYYGRDIPKMQNAAKASRKKLKRIK-----------EDGDEEGE 500

  Fly   501 AIVVPEPEDDDDPELIDYQLKQASNSSPYAVFRKAGICGFAKHFGLTPEQYAENLRDNYQRNEIT 565
            .      |:.:|.|....:|||||....|.:.:.||:.|.||.|||||||:.|||||:|||:|..
  Rat   501 G------EEAEDEEQRGPELKQASRRDMYTICQSAGLDGLAKKFGLTPEQFGENLRDSYQRHETE 559

  Fly   566 QESIGPTELAKQYLSPRFMTTDEVIHAAKYVVARQLAQEPLLRKTMREVYFDRARINIRPTKNGM 630
            |....|.||||.|:..:|.|.:.|:..|:|:||.|:|:|||:|:.:|:.:.:||::||.|||.|.
  Rat   560 QFPAEPLELAKDYVCSQFPTPEAVLEGARYMVALQIAREPLVRQVLRQTFQERAKLNITPTKKGR 624

  Fly   631 VLIDENSPVYSMKYVAKKPVSDLFGDQFIKLMMAEEEKLLEITFLEEFEGNACANGTPGD--YVE 693
            ..:||....||.||:..|||.:|..|||:|:.:||:|.||.|....:.:|   ..|...|  |.|
  Rat   625 KDVDEAHYAYSFKYLKNKPVKELRDDQFLKIGLAEDEGLLTIDISIDMKG---VEGYGNDQTYFE 686

  Fly   694 ESKALYQLDQFAKHVQEWNKLRAECVQLALQKWVIPDLIKELRSTLHEEAQQFVLRSCTGKLYKW 758
            |.|..|..|:|:..|||||:.|...::.|||:::...:.|||::.|..||::.|:::|:.|||.|
  Rat   687 EIKQFYYRDEFSHQVQEWNRQRTMAIERALQQFLYVQMAKELKNKLLAEARESVVKACSRKLYNW 751

  Fly   759 LKVAPYKP--QLPPDFGYEEWSTLRGIRVLGLAYDP--DHSVAAFCAVTTVEGDISDYLRLPNIL 819
            |:||||:|  |:..|..:.:.:..:||||||:|:..  ||.|  |||:...||:::|:||||:..
  Rat   752 LRVAPYRPDQQVEEDDDFMDENQGKGIRVLGIAFSSARDHPV--FCALVNGEGEVTDFLRLPHFT 814

  Fly   820 KRKNSYNLEEKAQKLADLRKLSDFIKMKKPHIVVIGAESRDAQNIQADIKEILHELETSEQFPPI 884
            ||:.::..||:.:|..|:..|..|:..||||:|.:..|:||||.:..|:|.|:|||:..:|...|
  Rat   815 KRRTAWREEEREKKAQDIETLKKFLVNKKPHVVTVAGENRDAQMLIEDVKRIVHELDQGQQLSSI 879

  Fly   885 EVEIIDNELAKIYANSKKGESDFKEYPPLLKQAASLARKMQDPLVEYSQLCDADDEILCLRYHPL 949
            .||::|||||.:|.||||.|::|::|||:|:||.||||::||||:|::|:|.:|::||||::|||
  Rat   880 GVELVDNELAILYMNSKKSEAEFRDYPPVLRQAVSLARRIQDPLIEFAQVCSSDEDILCLKFHPL 944

  Fly   950 QERVPREQLLEQLSLQFINRTSEVGLDINLMVQNSRTINLLQYICGLGPRKGQALLKLLKQSNQR 1014
            ||.|.:|:||..|..:||||.:|||:|:|..:.:..:..|:||:||||||||..|||:|||:|.|
  Rat   945 QEHVVKEELLNALYCEFINRVNEVGVDVNRAIAHPYSQALIQYVCGLGPRKGTHLLKILKQNNTR 1009

  Fly  1015 LENRTQLVTVCHLGPRVFINCSGFIKIDTSSLGDSTEAYVEVLDGSRVHPETYEWARKMAIDAME 1079
            ||:||||||:||:||:||:||:||:||||:||||||::|:||||||||||||||||||||:||:|
  Rat  1010 LESRTQLVTMCHMGPKVFMNCAGFLKIDTASLGDSTDSYIEVLDGSRVHPETYEWARKMAVDALE 1074

  Fly  1080 YDD--EETNPAGALEEILESPERLKDLDLDAFAVELERQGFGSKSITLYDIRNELSCLYKDYRTP 1142
            ||:  |:.|||||||||||:|||||||||||||.||||||:|.|.|||||||.||||.|||.||.
  Rat  1075 YDESAEDANPAGALEEILENPERLKDLDLDAFAEELERQGYGDKHITLYDIRAELSCRYKDLRTA 1139

  Fly  1143 YTKPSAEELFDMLTKETPDSFYVGKCVTAMVTGFTYRRPQGDQLDSANPVRLDSNESWQCPFCHK 1207
            |..|:.||:|:|||||||::||:||.:...|||..:|||||:..|.|  :|.|....||||||.:
  Rat  1140 YRSPNTEEIFNMLTKETPETFYIGKLIICNVTGIAHRRPQGESYDQA--IRNDETGLWQCPFCQQ 1202

  Fly  1208 DDFPELSEVWNHFDANACPGQPSGVRVRLENGLPGFIHIKNLSDRQVRNPEERVRVSQMIHVRII 1272
            |:||||||||||||:.:||||..||:.||:||:.|||..|.|||:.|:.|||||:|...:|.||:
  Rat  1203 DNFPELSEVWNHFDSGSCPGQAIGVKTRLDNGVTGFIPTKFLSDKVVKRPEERVKVGMTVHCRIM 1267

  Fly  1273 KIDIDRFSVECSSRTADLKDVNNEWRPRRDNYYDYVTEEQDNRKVSDAKARALKRKIYARRVIAH 1337
            ||||::||.:.:.||:||.|.||||:..:|.|||:..|..|:::..|.| |..:|..|.:|||||
  Rat  1268 KIDIEKFSADLTCRTSDLMDRNNEWKLPKDTYYDFDAEAADHKQEEDMK-RKQQRTTYIKRVIAH 1331

  Fly  1338 PSFFNKSYAEVVAMLAEADQGEVALRPSSKSKDHLTATWKVADDIFQHIDVREEGKENDFSLGRS 1402
            |||.|.::.:...|:...|||:|.:|||||.::|||.||||:|.|:||:|||||||||.||||.:
  Rat  1332 PSFHNINFKQAEKMMETMDQGDVIIRPSSKGENHLTVTWKVSDGIYQHVDVREEGKENAFSLGAT 1396

  Fly  1403 LWIGTEEFEDLDEIIARHIMPMALAARELIQYKYYKPNMVTGDENERDVMEKLLREEKANDPKKI 1467
            |||.:|||||||||:||::.|||..||:|:.:|||: :...||   |..:|:||.:.|...|..|
  Rat  1397 LWINSEEFEDLDEIVARYVQPMASFARDLLNHKYYQ-DCSGGD---RKKLEELLIKTKKEKPTFI 1457

  Fly  1468 HYFFTASRAMPGKFLLSYLPKTKVRHEYVTVMPEGYRFRGQIFDTVNSLLRWFKEHWLDPT--AT 1530
            .||..|.:.:||||||.|.|:.|.|.|||||.|||:|:|||||.|||.|.||||:|:.||.  .|
  Rat  1458 PYFICACKELPGKFLLGYQPRGKPRIEYVTVTPEGFRYRGQIFPTVNGLFRWFKDHYQDPVPGIT 1522

  Fly  1531 PASASASNLTPLHLMRPPPTISSSSQTSLGPQAPYSVTGSVTGGTPRSGISSAVGGGGSSAYSIT 1595
            |:|:|.:. ||..:...|..|:.:..|......|.::|                    |..:|..
  Rat  1523 PSSSSRTR-TPASINATPANINLADLTRAVNALPQNMT--------------------SQMFSAI 1566

  Fly  1596 QSITGYGTSGSSAPGAGVSSSH-YGSS--STPSFGAINTPYTPSGQTPFMTPYTPHASQTPRYGH 1657
            .::||.|.:.::.|....||.: ||.|  .:.::....||    .|.|..||.     .||.|.:
  Rat  1567 AAVTGQGQNPNATPAQWASSQYGYGGSGGGSSAYHVFPTP----AQQPVATPL-----MTPSYSY 1622

  Fly  1658 NVPSPSSQSSSSQRHHYGSSSGTGSTPRYHDMGGGGGGGVGGGGGSNAYSMQP-----HHQQRAK 1717
            ..|   ||..::.::|...:|   :||:                 |.....||     ..||:.|
  Rat  1623 TTP---SQPITTPQYHQLQAS---TTPQ-----------------STQAQPQPSSSSRQRQQQPK 1664

  Fly  1718 EN----LDWQLANDAWARRRPQQHQSHQSYHAQQQHHHSQQQPHMGMSMNMGITMSLGRGTGGGG 1778
            .|    :||....:.|.:.:..:.:                                        
  Rat  1665 SNSHAAIDWGKMAEQWLQEKEAERR---------------------------------------- 1689

  Fly  1779 GGGYGSTPVNDYSTGGGHNRGMSSKASVRSTPRTNASP----HSMNL-GDATPLYDE 1830
                                    |...|.|||.:.||    ..|:: ||||||.||
  Rat  1690 ------------------------KQKQRLTPRPSPSPMIESTPMSIAGDATPLLDE 1722

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Spt6NP_651962.2 HTH_44 308..410 CDD:464230 57/108 (53%)
Tex 565..1278 CDD:441786 389/720 (54%)
RuvC-like 781..935 CDD:473878 76/155 (49%)
HHH_5 939..1042 CDD:473956 61/102 (60%)
SH2_2 1312..1522 CDD:464227 115/209 (55%)
Supt6hNP_001178749.2 None

Return to query results.
Submit another query.