Protein Alignment jbug and shot

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001261140.1
• Gene: jbug / 43997
• FlyBaseID: FBgn0028371
• Length: 2990
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_725339.1
• Gene: shot / 36542
• FlyBaseID: FBgn0013733
• Length: 8805
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 3037
• Identity: 526/3037 - (17%)
• Similarity: 917/3037 - (30%)
• Gaps: 1135/3037 - (37%)

  Fly   188 CRI----TNLTTDWNSGVNLAALLDYCQPGLFPHWRS--LDPSQS-VRNCTQAMDLAQREFGVPK 245
            |.|    :|.|......||:...|:   .||....|.  :||..: |.|..||::        .|
  Fly  2472 CEILENTSNFTNPKGEVVNITEALN---TGLIDGRRGQVIDPQNNRVLNLRQAVE--------QK 2525

  Fly   246 VLEPE---YLASPWLDELSGMTYLSYFMKPGGPGYNATMRWVNTQVKDPVKNFTTDWNDG----- 302
            :::.|   ::..|....||                  ..|..:..:.||..........|
  Fly  2526 IIDSEQTNHILMPLAKSLS------------------VPRLADQGLIDPQTQTIVHPESGYPLSI 2572

  Fly   303 --RVMCEIIKGLGGSAPAPEKLSTD-------------PFHYEN---NIRKAVDAG--------- 340
              .::||::.. ......|||.:.:             .|:|:|   ||.:|::|.
  Fly  2573 HEAIVCEVLDP-HSKLHKPEKCTLEEAITKGIINADDSTFNYKNKTLNITEAIEAKLFDPSYDQQ 2636

  Fly   341 ------ARLG-VQPILTAKDMANPE------------------VEHLGIMAYAAHLQWVPPRPPL 380
                  ..:| :.|:...|.:..|.                  :|...||:.        |..|.
  Fly  2637 KSKVEIPPVGMIFPVAVEKSLVEPSKRVVLHPSTKKALPIKQAIEENFIMSI--------PYSPK 2693

  Fly   381 SDLVSVYLESTSGRVGEPTHFRIDVMSRDISLSSVRCHVVPPSGQPGQPVRLNAHGEGVFVPERY 445
            .|.:.|                :..|.:|:...:.:...||.:|:.              :|.|.
  Fly  2694 PDAIEV----------------VTAMEQDLIDVAAQTLTVPSTGER--------------IPLRQ 2728

  Fly   446 GMHEIVVEIGEDSLGGHFFRALPRLLQVAPPGMAPCALGSLVEVLVNATGAPKTEDI-LVTAVSP 509
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  Fly  2729 AMENGVL-----------------------------VVKNLSDFVITQKPIPKTEIMETVRAV-- 2762

  Fly   510 TGISHNCPLKKID--EGHSAIFKPDEAGIWEIAITYQGRHIQGGPFTCAVFDASGVSVHGLDGAM 572
                |....|.|:  :|:..|...:.            :::..|. .|::.:|..:      |.:
  Fly  2763 ----HTVTTKTIELMQGYVLISNNEV------------QNVNTGE-VCSLEEAKEL------GIL 2804

  Fly   573 PLRAHTFEVDARG---------VGVSGELHVDIVHDKHSLVCSVEKIVENKYRVTFMPRQNGKYR 628
            ...:.|.|..|..         ||.||:..|               |||.:.:...:.....|..
  Fly  2805 REESTTRETKAAAGESPESVGDVGTSGDQTV---------------IVEERTQTVVVSSDTRKQE 2854

  Fly   629 VYIYFNGYDVKGS--PFIMRVGTKGR---------------------------------SG---- 654
            :.:.......|.:  |.:..:.|||.                                 ||
  Fly  2855 MQVVSTTQSTKDTSVPSVSEIETKGSKEPSKTLQNVKDAAKLGALGVIAAPVLAGGAIVSGVKSL 2919

  Fly   655 -KTRSSPLHDSK--HRSESPSMHFVSTTNTRHNDYRNSSLSRHNTAERTNSYSPQYSPK------ 710
             |:..||..|:|  .:.:.|...|:.                   .||.....||..|.
  Fly  2920 IKSVKSPTEDAKSTEKPKEPQTSFIE-------------------QERRKELQPQQVPSEVDNLL 2965

  Fly   711 LDTTDYHSSSSRYYKRESEENHATPPPAPPPASGSPTVKYLNSADLYTETLNGRRDSKTSNSSST 775
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  Fly  2966 SETENFISSTTANF--IANEKQQDKPDTLPQESNLP-LEVESTSTLTTTTVTTITTSSTTTETGN 3027

  Fly   776 KNDYYYDKENELYSQRRAVTKPKLTPPREERELTSTTNTSSSSSFQQRHQQLATSTLTRSLSPIP 840
            ......:..:....:.:.|.||. |.|.::.|::..|.|.::.:..:      |.|:...:|.
  Fly  3028 LEPVVVEDVSTTVKEDKVVVKPS-TVPEDKTEVSKITETITTVTSNE------TDTVPEKISQ-- 3083

  Fly   841 SPTLNTRSSEVHTHSPLTIKTSNQYESSTRNITSSPRHASVSPVQRY-SPNSAYITTATHRMGSP 904
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  Fly  3084 ----KSASEESAKKDPVVTKDTSSRPAETE---TSPK-----PVQKEPTPDPAQNTEFPE---SI 3133

  Fly   905 LTSPVSKNGYESSRTVEKSSTYKSTSNYVTDSNIR-ASPSLYGTAERLRRTGSPE---------- 958
            ...|..:..|:.:.|.....|.|..|...|:.|.: |.|:  ...|.:.||...|
  Fly  3134 KKDPTPEPDYKETATEAAQITPKEASPAPTNKNEQSAEPT--SKPEPMPRTAKKEEISEIEPPFT 3196

  Fly   959 ----PRIDHSSNVRVSSMK-----PASARRDSWDVINKTKHMLSHNSLESLANMTEKQLNTELQY 1014
                |.:|..:..:::.:|     |.::.:....:....|.:..|..:|.:..:::.:
  Fly  3197 APLAPFVDQLAETKITEIKTEFKEPVTSSQTITTITTTVKTVDEHPIVEEVDEVSKSE------- 3254

  Fly  1015 NRPDLDHETHRNTQYNKFALHKQQQQQSDYRRDSPDDGERYKPS--------AITVKSHSNNTYT 1071
            ...|::..|          :|:|:..:.:   ::.||..|.:|:        .:||:..:....|
  Fly  3255 KIVDVEEPT----------VHQQEPIKVN---ETSDDSTRTEPTNEIVHEERVVTVEEPTITETT 3306

  Fly  1072 DKSGGYTKTVKESSEHVVTESNGHGPSPGYGYSSLSRFRPIDGNATGARAIRVQDIPNGSIGRPV 1136
            ..:...|.|...|||..:.:.|                     .||      |::.|   :..||
  Fly  3307 VTTTTITTTTTSSSEETLPQEN---------------------TAT------VKETP---LNEPV 3341

  Fly  1137 EFEIDGSRAGSGNLEILVNGGR-----VTSSVRSLGGQRFIASFTPHEHGTHTVQITFNGETVPG 1196
                ..|.|.:..:|...|..:     :..:.:....|:.:                   ||:|.
  Fly  3342 ----PSSPAETKEIEQTTNDDQKKPEEIVDTEKKTTEQKPV-------------------ETIPT 3383

  Fly  1197 SPWHAEIMSSPGLTALGESTRLVPANTPAVFE-ILPPPGQSLSKGECVATVLTPSKSKLNARVTH 1260
            .|     :|:...|.:..:|:     |..|.| .|.||..       :..::.|..:.    ..|
  Fly  3384 EP-----ISTSETTTVTLTTK-----TTIVDEGKLHPPSD-------IEQIIQPHSTS----DKH 3427

  Fly  1261 EAANGAARIEFVPTEVGTHVIDASINGTKIAGGPLIAKVYDSSLIQVTEVNGGVVGQACQFRVDA 1325
            ::.     ::|:..|.||...:        .|..::..|.|::.:....:.|..|
  Fly  3428 QSL-----VDFIEQEKGTQPAE--------GGSNILQNVKDAAKLGALAIVGAPV---------- 3469

  Fly  1326 SAAGEGQLEISINEGEVPNHVQVVGGGRCLVSFTPEQAKSHLIDIKFNGETVRGCPFVCAVADTS 1390
             .||:..::....|                .:..||.:.|.::.     |||.
  Fly  3470 -LAGKALVDALTTE----------------KTLKPEHSTSQVVT-----ETVE------------ 3500

  Fly  1391 RVLLNLSNLELIPVNRPSSFHITVSGGGAAELAVSVRGPQGELPVRVTGDIHAGFTAEFTPTTVG 1455
                                                     |||..:.....|....:.|.||..
  Fly  3501 -----------------------------------------ELPTEIITTSTATLVTKVTTTTTT 3524

  Fly  1456 GHSINVEYNGFAVQGTPFLAKSYDASKVVVGSVSRGTMGRPVQFTVDAGDAGEGNLEITISAKGQ 1520
            ..:...|       |||. .::.|..|:....| ..::.|.|..|:..|||        ||.|
  Fly  3525 TTTSTSE-------GTPD-DEALDVVKLPAELV-ESSVKREVPRTLAIGDA--------ISQK-- 3570

  Fly  1521 NIPTQVHPQGSARFSVSFVPTESCEHTINVSFNKMPVPGCPITVSISGGVAGPQVSLGGPGPVHQ 1585
                             .:..:.|:         :.|.|...:.::|..:...|:|     |:.:
  Fly  3571 -----------------LISPDECQ---------VIVDGEQQSQTVSTLLKEEQLS-----PLDE 3604

  Fly  1586 T----NSFVINHNGGRLED----------IEVNVEGPAGQSVPAQVHQSADGVFKAEFVPRVVGE 1636
            .    :..::......|.|          .|:|:..|..|                .|:....|:
  Fly  3605 VQIIDDKLIVLQQVSYLVDADTELTPQNLYELNIYDPENQ----------------YFIDPSTGQ 3653

  Fly  1637 ----HRVNVTVNGLPTAGSPYAAKVYDVSAIKVKNVSSGTVGKAVTFLVETS--QAGPGNLEVTV 1695
                |.:...:|            |::...|.|||.|:|.. :.:|..:|..  ....|::....
  Fly  3654 KISFHTLVFDMN------------VFNPETILVKNFSTGKY-ETLTAALERPLLDRHTGHMVDPK 3705

  Fly  1696 NGGRVPTSAQAQGQHTYAISFTPREAESHTVELRFNSQDVPGSPFTCRVAAAARIQSPETMDKVS 1760
            .|.::|.......|  :.|...|.|                              |.|..::.|:
  Fly  3706 TGKKIPFFECVDRQ--WIIRANPEE------------------------------QKPSGIENVT 3738

  Fly  1761 VGRLFEFVVESDTKPTVEVLGPARRSVPVKIDALGSSTLGYNVKFEPMEVGDHSVEVRLPGGGHV 1825
            :          ||:....||...|  |...::|:.|..|..           .|:.||.|..|.|
  Fly  3739 I----------DTQTGQVVLDDGR--VCSIVEAINSGKLDI-----------QSISVRDPVSGEV 3780

  Fly  1826 EGSPFLLKAYSAEKVIVTDIRAGVVNKSVSFGINASQAGAGNLEIIVAVNGKNVPNFVQSEGNAR 1890
                  :....|.::.|.|::||.|                 ::|...   |.:|.      ...
  Fly  3781 ------IPLRMAIELGVVDMQAGTV-----------------IDIQTL---KEIPM------ELA 3813

  Fly  1891 FKVNF------KP--TEAATHSLSVRFNG--HPVPGSPF---SCHIAAAAASPSMGL--PRAMAM 1940
            |::.|      ||  .|||..      .|  .|..|..|   |.:......|..:||  |:...:
  Fly  3814 FQLGFLVPGARKPISLEAAVR------KGLYDPETGKLFDSESQNQVDVQKSIEIGLVDPKISLI 3872

  Fly  1941 GECLKQAAVKMDNTFELEGFDGVEPQIFVTSPSGDNEHCQLSQHDGGSYSASFRPTTVGRHLISV 2005
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  Fly  3873 VDTVTKKEVKLDCAIE---DDLVLP---ATGQIKDNKNNTLVPFDVGVQQCLLKTDNVTWSLPEL 3931

  Fly  2006 TANDQHINGSPFSCNVFDVSRVSISG----LEQ--QYGPANLGVPVTFSVD---------AAGAG 2055
            ...:.:   :|.:..|.:    .::|    |:|  :.|...|...:...||         ||..|
  Fly  3932 LQREYY---TPSTGKVLN----PVTGEEILLQQAIEMGFVELETTLVKDVDHDKILPGKEAAKVG 3989

  Fly  2056 -----EGTLELV-VSTDSSTVKA---------EVVAC-ARGLYDVTFVPQSTEPHYVNITFNEVA 2104
                 .|||... :|.|.:.||.         .:|.| .|||||         |.....|.::..
  Fly  3990 LLDTVRGTLSSPNISLDEAFVKGYLISTKKPLSLVDCLLRGLYD---------PSTAKFTIDDKQ 4045

  Fly  2105 VDGSPFRVDIQQHTQHIQIGSLAAIDFPADDQIVEI----------------------------- 2140
            :|   .:..|.|  :.|....|..:| |..:.|:.|
  Fly  4046 LD---LKAAIAQ--KLINPEELVLLD-PKTESIISITEAIAKGYLDPIEGYVINPYASTKLSLHE 4104

  Fly  2141 -------FSPDQK-SVPYSINRQTAEFRTHMTGNYTLRFIDRETRQHIGSRTLCVFDPTLVKITE 2197
                   ..|.:| |:|.::.|...:.:|....|...|  ::.|.:....|.:...|.|:|.:
  Fly  4105 ALENRILIPPKRKRSLPDAVYRGLYDPKTGQFSNTVTR--EKLTTERAIRRGILDPDSTVVNV-- 4165

  Fly  2198 VSEAFCHRPASIGVSLNEAGQGDL---SALVRCGATEVPH-TIRGPS----------KTGVYEIV 2248
                               |.|.:   ......|..:..| |:|...          ..|:....
  Fly  4166 -------------------GSGQIIPFGVATETGIVDSKHGTVRDADDHPIDFKEAFDRGILVEA 4211

  Fly  2249 YQPTRVAPHKISILFNEV------PIS------LKPLEINVLPASAGKEISVSGLGLYQSRVGKT 2301
            .:|.|:....:..:::||      |.|      .:.|..|:|...: .:|.....|||:.   ..
  Fly  4212 KKPLRLIEAVVKNVYDEVDGHFVDPKSGEKLNFAEALNTNLLDEHS-VQIRDFKTGLYKQ---LN 4272

  Fly  2302 TSFAIDTVKRPAREFDVVVSGPGGQALPVRCYQTKNGHLQAEFTI------NKPGQCVIEVLHQS 2360
            .:.|.||         .::.....:.|    |..:...|:..|.|      |.| ..:...:||.
  Fly  4273 LTHAKDT---------GIIDAQNSKLL----YNNQTMTLKHAFDIGILMDVNAP-ISIQRAIHQG 4323

  Fly  2361 KPLPGSPFTCESFD--SSKVSTQGVTKEPLALHSPNSFTVRTDNAGTAELEAFAISPSNQSIPVL 2423
                       .||  :.|:|.....::...|.|..||.|                  |..:|..
  Fly  4324 -----------LFDDKTGKLSDPRTGRQITLLESMRSFVV------------------NPHLPCY 4359

  Fly  2424 ISEQSDGVYNV------------EFVPSQPGNYKLTLMYGGETIPSSPLNFTASSSGVRNDARAA 2476
            ..||::.:|.:            |.|..:||:....           ||. .|.|.|:..|...|
  Fly  4360 FDEQTEQMYTLSETCRNGIINRREGVFREPGSNSFV-----------PLG-EALSLGLIVDIENA 4412

  Fly  2477 GHGLEVCHRNKEASFVVYCPIAPNVQIERLDEYGERIEPKIKALGNNEWRISYTILSVGKYE--- 2538
            |.||                                                |.:||:|.||
  Fly  4413 GFGL------------------------------------------------YELLSMGFYETST 4429

  Fly  2539 --IRASCPNRG-SLPGSPWHISCVESNKVTPVGGWGTLVDH--DGRLILPARII----------- 2587
              :.....||. :|     :.:|||.    .|....:||.|  .|:.:..|..|
  Fly  4430 RKVLHPVTNRKLNL-----NEACVED----VVSLSSSLVKHHETGKYLRLANAIKEQLVDDSRGC 4485

  Fly  2588 -------FDVENAGPGKLVCS---IDGIEIPVDKLV----DGKMCLNITGENLAAGEHDLDLTWS 2638
                   .|::.|....|:.|   :..:|:.:.:.:    .||.|...|||.
  Fly  4486 YNLGNEQLDLQAARARGLIVSNRRLLSLELVLRQQLYRPETGKFCDPTTGEY------------- 4537

  Fly  2639 GLTITQCPRSAFVTGQQAADKVQLMGRGLAAAQAGEAAHFTI------DASNAPAGRPEVILTSQ 2697
             |.:.:...|.|:.......|.||.|:.|...:|.|.....:      |..:..|...:|.|
  Fly  4538 -LDLIEAIHSGFIDPATTVFKNQLTGKELPLTEAIENGDIDVSKGRVFDPKSKSAYNYDVAL--- 4598

  Fly  2698 DNTSLPVSLAQP--------RPSENIWLASYTPL-----KSTTGTLNLSVKWNGRLVKGCPLTVA 2749
             :..:.|::.:|        |..:::.|.:.||:     |....:|..::::|  ::.  |.|..
  Fly  4599 -SRGILVTITRPLTDRNDVVRRQDSVELLNQTPVSVVISKPREMSLEEAIRYN--IID--PKTAL 4658

  Fly  2750 VGSSMDASKVIVSGEGLRHGIVGKDIKSWIDTRRAGPGELTAHCAGVRKVAYCELYDHGDATFTL 2814
            | ...|:.|.:.....:..|:|....::.:|.:                    .||...|.|..:
  Fly  4659 V-RDFDSFKFLPYSVAVERGLVDTTKRTLVDPK--------------------ALYFAFDPTLIV 4702

  Fly  2815 NIK-----PQESGRHILTIK-----YGGQNVPGSPFALKVAGAPDAS 2851
            .::     .|.:....|.::     |...:||||..|   |.|.|.|
  Fly  4703 YVREPVTFDQAAESKCLDLQTGLLTYVPASVPGSATA---APASDDS 4746

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
jbug	NP_001261140.1	CH_jitterbug-like_rpt1	57..166	CDD:409076
		CH_jitterbug-like_rpt2	170..274	CDD:409078	21/95 (22%)
		CH_jitterbug-like_rpt3	275..373	CDD:409034	23/154 (15%)
		IG_FLMN	468..560	CDD:214720	15/94 (16%)
		IG_FLMN	560..648	CDD:214720	16/98 (16%)
		IG_FLMN	1119..1198	CDD:214720	12/83 (14%)
		IG_FLMN	1220..1302	CDD:214720	14/82 (17%)
		IG_FLMN	1310..1389	CDD:214720	11/78 (14%)
		IG_FLMN	1399..1480	CDD:214720	11/80 (14%)
		IG_FLMN	1480..1569	CDD:214720	15/88 (17%)
		IG_FLMN	1575..1659	CDD:214720	13/101 (13%)
		IG_FLMN	1661..1747	CDD:214720	15/87 (17%)
		IG_FLMN	1757..1837	CDD:214720	16/79 (20%)
		IG_FLMN	1837..1926	CDD:214720	21/101 (21%)
		IG_FLMN	1936..2023	CDD:214720	17/86 (20%)
		Filamin	2021..2111	CDD:395505	28/120 (23%)
		IG_FLMN	2198..2280	CDD:214720	16/107 (15%)
		IG_FLMN	2285..2375	CDD:214720	18/97 (19%)
		IG_FLMN	2376..2465	CDD:214720	18/100 (18%)
		Filamin	2474..2555	CDD:395505	13/86 (15%)
		IG_FLMN	2657..2751	CDD:214720	22/112 (20%)
		IG_FLMN	2756..2847	CDD:214720	17/100 (17%)
		IG_FLMN	2850..2944	CDD:214720	1/2 (50%)
shot	NP_725339.1	SAC6	204..>420	CDD:227401
		CH_PLEC-like_rpt2	223..327	CDD:409038
		SPEC	471..689	CDD:238103
		SPEC	690..866	CDD:238103
		SH3_10	864..929	CDD:407754
		SPEC	1047..1250	CDD:238103
		SPEC	1153..1390	CDD:238103
		PLEC	<1498..1526	CDD:197605
		Plectin	1949..1980	CDD:459901
		DUF5585	2860..>3198	CDD:465521	71/385 (18%)
		SMC_prok_B	<4936..>5564	CDD:274008
		SPEC	5304..5513	CDD:238103
		SPEC	<5658..5787	CDD:413338
		SPEC	5793..6007	CDD:238103
		SPEC	6011..6220	CDD:238103
		SPEC	6118..6330	CDD:238103
		PRK09039	<6279..6441	CDD:181619
		SPEC	6443..6660	CDD:238103
		SPEC	6663..6878	CDD:238103
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		SPEC	6986..7196	CDD:238103
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