Protein Alignment trio and tiam2a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651960.2
• Gene: trio / 43974
• FlyBaseID: FBgn0024277
• Length: 2263
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073783731.1
• Gene: tiam2a / 100334442
• ZFINID: ZDB-GENE-030219-98
• Length: 1686
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1931
• Identity: 370/1931 - (19%)
• Similarity: 644/1931 - (33%)
• Gaps: 637/1931 - (32%)

  Fly    37 TPRRDRLKPEDLRRLLSYLISIPSDAAKNLGF------TVIIDMRGNGNCSTNVKTILKVLQEHF 95
            ||.|. |:.||:....|..:.|..|.:..:.|      .:|::     ||:..|: :||     |
Zfish   133 TPERS-LRLEDIEDQSSPRVVIKKDGSVRVEFNNSPNSALILN-----NCTEPVQ-LLK-----F 185

  Fly    96 SANIHNVVIIKPDNFWQKQRASISSHKYKFETTTVSIESLNKIVESHQLTGDFEGQQLYDHQQWT 160
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Zfish   186 SPTMESTCGLSAAG------PSLDSH----NGAAQAMSSL-KSSKGSSLSSD---GSLYD-LPW- 234

  Fly   161 DARLAIEDFFWQAGDMADRIDDLQE---DLNRNDFAEDVPLARHAIDHHNEMRKKITKLPIEDLD 222
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Zfish   235 --RTSVE-----LNDSDNASPDQQRQTVSTNTGFFDEQLP-AITTTDLYRDPRIASTFPTVKDLQ 291

  Fly   223 MQGKKLLAKINAMAPPGGQAPTNSGGPDMDSGPSSAG----QQ----SQPSQQSRSVGGNPDMSA 279
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Zfish   292 CSN-------------GSRSHHRSSFVSVMEGLSSEGVPEEQQYSSFTLPCRKSKASPENNGKKA 343

  Fly   280 AVNKALRQIELIHTGQEKLLMLWQHKKVKLDQCFQWRLFEQ--DC-EKMFDWILHNRDVFQMSYV 341
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Zfish   344 SIRSRFRRIS-DWTGS-----LTRKKK------FQEPRYNEPVDCFDSGVDGL--TADTSSPSQV 394

  Fly   342 E--------IGHNYSVAKSLQDEHQKFAVA-SMNVSVNIDRILAVAARLIESQHYAAQHIKTLAQ 397
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Zfish   395 SSLMATSNGMSQSCSLSRSL---HSRSGSAGALNLGNDILR----------------QNI----- 435

  Fly   398 RLDRTWKDFAAGLDERTAVLQLSVLFHHKAEQYCNSVASWAAACQASQPLPSDIQSLETAIRTHQ 462
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Zfish   436 -----YKNFM--MELKTARLPA----ERGAEDWCESSSEETGS--SSQEIPGSLEQLDLLFEKEQ 487

  Fly   463 SL--------YEAMCQAYTE--VHSTSKKLLYQLDHLVQVCNQPPPPGVPDHRKNSNNGSFNKYE 517
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Zfish   488 GVVRRAGWLSFKPLLTVHKDRKLELVSRRKWKQFWVTLKGC------------------TLLFYE 534

  Fly   518 RQNPAADYSEGASHVL----AVIHQILSHHRTLEAKWHQERLRLHQTLALRLFQEDVKQVLDWLK 578
            ....|:...|...:.|    .|:..:..|.:                          |:.:..|.
Zfish   535 TYGKASSEPESPCYALFAEDGVVQAVPEHPK--------------------------KENIFCLS 573

  Fly   579 N-HGEVFLRKNTGIGRNFHKARVYQ-TSHDNFENVAQNTYSNAQKLLAAADELARSGEADPNEIY 641
            | :|:|:|               :| :|..:.||.....:|.:..|.|     .|.|:.|
Zfish   574 NTYGDVYL---------------FQASSQTDLENWVTAIHSASASLFA-----KRYGKED----- 613

  Fly   642 SVARELELQVGSFAERVEQRRRRLDMAVIFYTHEKDVTAWIDKLRTDVSTDETRLSQENLEGIER 706
             ..|.|..|:....::::...:...||               :|:..|..|     .:|.:.||.
Zfish   614 -TLRLLRGQIRGLLQKIDMDGKMKKMA---------------ELQLSVVGD-----PKNRKAIEN 657

  Fly   707 ILQQYQRDQQESSVNV----C-LTTISQGEALLQEMRSLEYADNTGSIAALEATLEKLNKQKVEL 766
            .:||::::.:..::::    | |.::..||  |...:|            |.||..:..|..:..
Zfish   658 QIQQWEQNLERFNMDLFRMRCYLASLQGGE--LPNPKS------------LLATASRRTKAALAR 708

  Fly   767 EELWSARKFRADLILRLRYFERDARLLSVQMEMWSEELQHADLS----------------RDYQK 815
            ..::|...|.| ||.     .||    ...|...|..|.|...|                |.::|
Zfish   709 LGIFSVSSFHA-LIC-----SRD----EATMRKRSLSLSHRGRSKKGVFSSLKGLDTLTKRGHEK 763

  Fly   816 AEQLIRMHNESVTEIQNATYEVVQQGQDLLQLFENAGFISMADATHTAQARIEYLLDFLREREID 880
            ...|    ::.::|:...:|      ..|.|:|::.|...:...||
Zfish   764 KHSL----SQDLSELSCCSY------SGLPQVFDSDGGAQLNSVTH------------------- 799

  Fly   881 LEEMSEAKRAKLEQAVQLCQFQNDANQVISWIRNGEAMLVASFVTPN-----------------S 928
                              |.|:          |.|....|.|.|.|.                 :
Zfish   800 ------------------CSFK----------RLGSLTNVYSIVPPEGSQWDCSRESTTCIYMPN 836

  Fly   929 LQEAEQLRKGHEQFQIAIEKT--------HTSAVQVKY-----------RADALINANHYDPLSI 974
            .|....|.|.|......:.:|        .|..::::.           .|..|:....||.|.:
Zfish   837 CQTVTVLLKSHHTVMDVLAETCMLVGLDPSTHCLRLRRFTGDKMEISTPSAHELLQGLPYDELEV 901

  Fly   975 DEISDDVTKKWQQLVTYAEERHKLVTASINFYKTAEQVCSVLDSLEREYKREDDWCDGGGGSDKA 1039
            .::         |:.|....|..| |....|     .|...:|||:..:
Zfish   902 SQL---------QVYTLHMSRPSL-TGDFGF-----AVTGYVDSLKNSH---------------- 935

  Fly  1040 QAIVQLISKHQEQKEAFLKACTLARRTAETFLKYANRSQQCYQYKGNCEGHVKSKLDKLLTQENQ 1104
                .::|:......||.|..    |..:..:           ....||   .|.||..|
Zfish   936 ----IIVSEVLPDGLAFSKGL----RPGDEIV-----------VLNGCE---VSSLDLTL----- 973

  Fly  1105 VLDYWTLRKKSLDQCQQFVLFERSAKQAIEWIHNTGEAYLSSRSNLVGISKE-ETEGLLKEHNEF 1168
                                        |:.:.|.....|:::.:|..|..: :|..:...:.:.
Zfish   974 ----------------------------IQTLFNEQNLQLTAKRHLPSIPHDSDTANVQSPYRDI 1010

  Fly  1169 RSTAKETRERVKL---------LIQLADSLVEKGHAHASDIKQWVASVDQRYKDFSNRMDSYCEQ 1224
            .    :.|:|.|.         .:.:.|.|.:..|.|             |....|..:|:.|
Zfish  1011 H----QNRQRAKSSTDVSCVTETLSVNDGLQDSYHNH-------------RQVHHSKSVDTVC-- 1056

  Fly  1225 LEKSLGMSQQQLLLGSDGNSSISSSSGDRHSDPTLEAKLNSSNKENKEINEEKRKSARRKEFIMA 1289
               ||..|.|:   ||.|    ...|.:..:.|  |..:......:....|..||       ::.
Zfish  1057 ---SLYHSYQE---GSGG----LMESQEEQTGP--EPAILRPCPRHMSATERLRK-------VIQ 1102

  Fly  1290 ELMQTERAYVNDLATCIKCFLEEFRAGKSVPSALIGQEDV--IFGNIKEIHHFHQKIFLRELEK- 1351
            ||:.||::||.||....:.:|:..:     ....:.|:::  :||::.|:..| ||:||:.||:
Zfish  1103 ELVDTEKSYVKDLNCLFEIYLKPLQ-----KETFLTQDEMESLFGSLPEMLDF-QKVFLQTLEEK 1161

  Fly  1352 ---------YETMPE------DVGHCFVTWASKFDMYVHYCKNKPTSNNLL--VQHGGSFFEELQ 1399
                     :||..:      .:|..|:.:|..|.:|..:|.|......:|  .:...||.|.|.
Zfish  1162 ISSSPNFNTFETPVQFKKLLFSLGGSFLYYAEHFKLYSGFCANHIKVQKVLERAKTDRSFKEFLD 1226

  Fly  1400 RRLEVDHP-------LPAYLIKPVQRITKYQLLLKDLLSCCE---ESHGEIKEGLEVMLNVPKKA 1454
            .|    :|       |.:||||||||:.||.|||::|:|..:   |.|..:.|.|:.|..|....
Zfish  1227 AR----NPTKQHSTTLESYLIKPVQRVLKYPLLLRELVSLTDTDSEEHYHLTEALKEMEKVASHI 1287

  Fly  1455 NDAMHLSLLENCDVSVDKL----------------GEVVLQDA---FQAWDTKQIIRKGRERRVF 1500
            |:..  .:.|:.....|:|                |:.::..:   ...:.:...::|..|..||
Zfish  1288 NEMQ--KIYEDYGAVFDQLVAEQSGTEKEVTEISMGQFLMHSSVIWLNPFPSLGRMKKDPELTVF 1350

  Fly  1501 LFE--LYLLFAKEVKESNVVKYQFKSKLMTTDMGITEHIEGDETKFAVWTGRSPMLSDCRIVLKA 1563
            :|:  :.||:    :|:|.|:     |.|.|..  :.|.:.|..||. |.  .| ||..::.|..
Zfish  1351 VFKRAVILLY----RENNKVR-----KKMVTSR--SAHGDQDSFKFR-WL--IP-LSALQVRLGN 1400

  Fly  1564 TSLETKQIW----VKKLREVMQETCFSGTSLTLPKSPA---KHSGSSQRSSRDLDEQLTENDHDR 1621
            |: :|..:|    .|..:|...||.|...|.| |:...   |...|..|.:...:.|..|.....
Zfish  1401 TA-DTDCLWELIHTKSQKEGRPETVFQLCSST-PECKVNIIKVMRSILRENLRRNMQRVEQSERT 1463

  Fly  1622 CSLASFGSGNTTDSDNKLGNQEATWVVADYIATSGSNELSVSKGQQVEIVEPPTAGEPDFCLVRL 1686
            |.........:..:..::|:..|.|     :|...||:            .|..:.:|    :||
Zfish  1464 CKKRLTPLRKSLPASARIGSSRAFW-----LAKQPSND------------SPVPSNDP----LRL 1507

  Fly  1687 NPQHDDAAVQEGLVPVSVLKP--PPGSHKHG--SGTAANAASSAGSQKSDMQDQSNRSKADALSS 1747
            :....|:|........|...|  ||...:.|  ..:..:.....||:.:|..|..|     |:..
Zfish  1508 SLADSDSASASSGTTSSASAPLDPPSQQQSGLRESSIISDEDEDGSEPADWTDAPN-----AIEV 1567

  Fly  1748 STKRRGFSGRNWLPLMNRKGTDKPPSSKPLVKKPSEKNLRTPQKHA 1793
            ..::.|.:            .:...::.|.| :|....:.||::.|
Zfish  1568 QFRKLGLT------------EETSQAAAPRV-QPESGEVDTPERKA 1600

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
trio	NP_651960.2	SEC14	13..152	CDD:214706	26/120 (22%)
		SPEC	314..>468	CDD:238103	31/173 (18%)
		SPEC	563..778	CDD:238103	41/221 (19%)
		SPEC	782..997	CDD:238103	40/266 (15%)
		SPEC	897..1119	CDD:238103	40/257 (16%)
		SPEC	1125..1226	CDD:197544	17/110 (15%)
		RhoGEF	1287..1455	CDD:459876	58/197 (29%)
		PH1_Kalirin_Trio_like	1462..1584	CDD:270060	32/146 (22%)
		SH3_Kalirin_1	1643..1707	CDD:212786	12/63 (19%)
		RhoGEF	1945..2121	CDD:459876
		PH2_Kalirin_Trio_p63RhoGEF	2130..2260	CDD:270061
tiam2a	XP_073783731.1	None