Protein Alignment wb and lama3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_723870.1
• Gene: wb / 43946
• FlyBaseID: FBgn0261563
• Length: 3375
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005161783.1
• Gene: lama3 / 101882184
• ZFINID: ZDB-GENE-050208-475
• Length: 1711
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1881
• Identity: 440/1881 - (23%)
• Similarity: 746/1881 - (39%)
• Gaps: 425/1881 - (22%)

  Fly  1632 KRFDGLSCQDPGRSFYRWRNTTIVESVFIEDLIGRAAPCHCNGRSSDCDRETGVCQNCRGNTGGD 1696
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Zfish    67 KYCDSSHIKDCDRGYYRERSGPYK---------GRCVPCNCNGLSGDCDPHTGKCLNCQFNTAGD 122

  Fly  1697 HCHQCAEGFYGDPNSPHGCQACPCPETN--RNFARGCNVWDGEVSCVCKPGYTGRLCERCQAGYF 1759
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Zfish   123 HCERCMEGYYGSA-ILRTCRMCPCPLTDPAKSFAVGCLGVGDEFECLCKPGYSGVRCERCALGYY 186

  Fly  1760 GDPMRYPNTTCQPCNCHPDGIQTEGCDVETGRCYCREGVTGLKCDKCQAERHHLVDNGCKICDNC 1824
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Zfish   187 GSPLA-ERGSCQPCDCEHGYV----CDPLTGDCY---------------EADDPDTDNCFDCDIC 231

  Fly  1825 TLLLLDYMELVGNKLRRGMHNMDLTGIPAP----YRKLSEYESAYEKWNGRHWDFSQTKRRLQDY 1885
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Zfish   232 VVKLMDDLAAMDEEFAR---LIDQLGSFSPNATSYTGLEKLEDA----------IADTKVLVQKY 283

  Fly  1886 DSA------DILKLEAHAENLKFQ----SRKAVATIGKREFAIKSM-----REDAVTQQHSVGLL 1935
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Zfish   284 TESVFKLKPKISELESHLQNVKDDLTALNDKAIEMSCSAVQLLKSIDQTYQRGDNL-RSESVNLL 347

  Fly  1936 R--SEILQTLSDLHGYGKSAHYLSLPTALKQARFYLQAIREHDQMVQGIRSTNDCAWKHFYAMGN 1998
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Zfish   348 QKIQEFLDKLNRSNNTGGNTE--DATRMLKEAQRMLEKMRRQTCRVQRELVNEELRKAHILLSLI 410

  Fly  1999 ASDASFDESG--------RLEMLWR--DLNQTNHRVVDMRLQVDRVQEV----ENEAEDVLEH-- 2047
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Zfish   411 LKDLIFPLNGSLIAADRIRQDLMDRAEDLRDIQEAIIDAQLDVLKANGVNKLNEEQLKNILKHFK 475

  Fly  2048 ---------VRNLSIRVG------ESHQELDELNQRISDHLDPGYLEQGEGLLRLTVQRQIMLNG 2097
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Zfish   476 ALRKNQGNIIANLNMARGTLKDASDIQEMMDELKENMT-HL------------------AALIDG 521

  Fly  2098 HLNQLDGYRILLNTTLGVKTEQQREVRKHWLPKAEKHASHLLARSNEYARKFQPTRNGARI--AM 2160
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Zfish   522 AKYNLEAKLELLSNA----TAKQEVVR-----QAEEHAQELTKLAIDLQMVIMNIKNSTAVHKAI 577

  Fly  2161 LASSAHSNITEAINDARLASILAKERVYEAQRTLYPSD----GSSMIERAKHSLHRSKQ--LQQE 2219
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Zfish   578 EAINAFTAITAAINEAEAAAKLAKEAADHALKDVQKQDLQNKAKDLINNANALLVNAKEASIQLE 642

  Fly  2220 ALKQMHKSNVLKDKLHRQEQQVEGIKSTIYDSGLRTNNIS-GQLQGLSDGSARRQAKDSLEMADR 2283
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Zfish   643 DVAQ--KCEAYKNLIQQAEDKQKQLKQVMLDVLEKMNNIKRGDIDILIN-----QAKEGAAGVNA 700

  Fly  2284 TGEQMRAELQK-AKDMQKSIQNMRNSFSNLEPDWEIKLGMAQENISLTQTNLRLANVSLSYLEQQ 2347
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Zfish   701 TAADALTRMQNISEDLNK--VNISTQDQNL---YNLLDGVNKTLTELDQTFPSLID-KLNDVENQ 759

  Fly  2348 AEKEQQVFEVWNNSMAQQLQQLRDQIAKARHAAEAI--------DVSLESLGPKCI---RSYLPA 2401
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Zfish   760 TEHLP-----GPTNLSSSIERIKVLIEQTRDAANRIRGPILFSGNAHIELRPPKDLEDFRTFTAL 819

  Fly  2402 SYGLSTSN-------KIRMSFA-------LSNHLESSPLIHLASSEGRHITLELYKRRVRLVWNL 2452
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Zfish   820 NFTLHQPNTRGDGRRRRQLDYTDGQFVLYLGNKHEVKDFIGLVVRNG--VLFCLYK--------L 874

  Fly  2453 GGTTATVTHPMVVHTRDPK-----------YDDA---WYHVEANRTLNLGSLVVR-----RMNNY 2498
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Zfish   875 GGQLHEIETSEITKSSNDKAFMDRVDFRRVYQDAQVIYTHTFTSTEPN--ELPARINQPKTMNGL 937

  Fly  2499 GELTPPNPVIITGSTDTEHTRFYQSRSDRISLGGFASKDLQFTPGLNVVVHQVEVDNKPLGLWNF 2563
            .:|.|.:.|:..|....:.|               ...:||: .|....:....::::.|||:||
Zfish   938 LDLDPNDVVLYVGGYPRDFT---------------PPVELQY-QGFKGCIEFSSINDQILGLYNF 986

  Fly  2564 -----VTSEGSCGGSMVGAKESSASSTARHFNGLGYAQL-MKTRPRPTRKNLFSVQMTFRTLDEN 2622
                 :|....|       :.....:...:|:|.|:.:: :.::....:..:.|.||       :
Zfish   987 QRAVNITKNDLC-------QRGKVRTLGDYFDGTGFGKVDILSQNSFIKFFVLSHQM-------D 1037

  Fly  2623 ALLFLAVDDKNNRSVSVTLSRGRIMFRIDYGDESKLEINTTKKYNVGQWIKIEAAREFSAKRSTE 2687
            |:||...::  |....:||..|.|:.|....|....|.:..|.:....:|:|.
Zfish  1038 AVLFYMGNE--NSYFFITLEGGYIVLRGVNNDAIIFERSNVKVFPQTNFIQIR------------ 1088

  Fly  2688 NGMLRVNNDRPISGAPTLPVNIHL--LPDLSKTVYYLGGVPPGFTSGTSKAPGADNPFL----GC 2746
               |.:|:.||::...|..|||.|  :..|.:.. |:||||.....       ..|.||    ||
Zfish  1089 ---LTMNDVRPVTITVTDYVNIFLGYVKGLFREA-YIGGVPAAIQE-------KYNVFLPSLRGC 1142

  Fly  2747 MKDVQVNGETYDPLESSSYYGVEPSCKNMI---TKAGFSGNGYLELPSQSLRKRSN----TALVF 2804
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Zfish  1143 FKNIQVDVTTTFTEEN----GIVRGCPNPLLGSREATFEFGSSLSM--SPIVKDTDLGTMVSLGF 1201

  Fly  2805 RTLQPDCLLLLAAYPPEILGDYDAKDIKGNFSISLVDGQLHVWVNSGRSFIKMS------SNSSQ 2863
            :|.:.:..:|:           ....:|..|.:||.||           |::||      ::|::
Zfish  1202 KTSEENVAVLI-----------QTGGMKNEFLLSLKDG-----------FVEMSDSKEKLTSSTK 1244

  Fly  2864 MNDGEFHVVHLIKTGRKLELMVDDELQEIRNLNGNPTVVSLPRDAGGLYIGGA------------ 2916
            ...|::|.:...::...::|.||:     .::...|:..:.|..|..:.:|..
Zfish  1245 CETGKWHYITAFRSSAGMQLNVDN-----TDVGDPPSPSTFPEFAESVILGDGLFGGCLRNLYMR 1304

  Fly  2917 PPHESYTPLAPTFVNLEGAIRDVVFNNRTINFNDALTFANVQIGRNGPLMGSLKGGLYDVLLKTE 2981
            .....|||...:..|..|::              :|.|...::    ||.        |:.:|..
Zfish  1305 SIQSDYTPADLSSFNQTGSV--------------SLGFCKAEL----PLQ--------DITMKRA 1343

  Fly  2982 PMIG---KSFT-ASPEGCKRIGSYSYEPNAFKFGDDIYSYSQLKL---PERHFWQRNFHLSFDFR 3039
            ...|   .|:: :|.:.|:       .|.:.|....|.|.|:::.   ||.  .....|.|.|.:
Zfish  1344 RHAGITSNSYSESSTQDCR-------NPKSIKHTYHIGSRSKMQFELDPEE--LNNRPHFSLDVQ 1399

  Fly  3040 SFYPNGMLYLSPGSKEKPKHYVALV---LKDGQLVLVVRGRRREELQLTAKLNDGEWHRVTISCH 3101
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Zfish  1400 TTSSEGLLLHLSG-----KHGVPLVVLYLYEGKVKLSV---GEDEIVSSRRINDGQWHSIQFTVK 1456

  Fly  3102 DRKVTMSVEIGRTDQKTSAQMKLPKKIGASQLLLVGGLPQSPVKVSSDLYVRLEPFK-------- 3158
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Zfish  1457 KRSSHLAVDDLRT---LNGQ---PLK-GFTQDL------QSPVYV-GQLQTRHQTYKNVPQKSII 1507

  Fly  3159 GCLRRVSINNNTQDLARPGKHSNVGQCFP-TVERGSYFPGD-AYAIYKKNFNVGKYLDLETEFRT 3221
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Zfish  1508 GCIRELRVSKLL--LMNPAVNQGATPCFKGRTEKGAYFAGNGAHLVLEKYFISGSTYDLTFELRP 1570

  Fly  3222 SELSGILLSVSDPNGFPALSLELHNGNIIFSCDPGNGAPMRVESSLPTKYALCDNKWHNISALYD 3286
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Zfish  1571 RNLTGLIFHKRDNLG-QTVTLFLKKGKVVVKVNDGK---QRYSTAVTPTRPLC-GAFHNVSVSIR 1630

  Fly  3287 GEQIVLRIDQLPAVISVGNQGNAGKVQTRSPLYIGGLPESAPSGSLISRENFKGCIRHVSI 3347
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Zfish  1631 QKSIELRVDDAKSRI---RRRSIARLSVHEEIYIGGLSENRSEG-VEMQTSYEGCLRNIRI 1687

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
wb	NP_723870.1	Laminin_N	153..398	CDD:459653
		EGF_Lam	401..450	CDD:238012
		EGF_Lam	505..552	CDD:238012
		Laminin_EGF	550..597	CDD:395007
		Laminin_B	660..813	CDD:459652
		EGF_Lam	851..900	CDD:238012
		Laminin_EGF	<943..971	CDD:395007
		Laminin_EGF	974..1018	CDD:395007
		EGF_Lam	1017..1065	CDD:238012
		Laminin_EGF	1065..>1105	CDD:395007
		EGF_Lam	1150..1197	CDD:238012
		Laminin_EGF	1199..1247	CDD:395007
		EGF_Lam	1247..1292	CDD:238012
		Laminin_EGF	1294..1342	CDD:395007
		Laminin_EGF	1340..1392	CDD:395007
		Laminin_B	1486..1626	CDD:459652
		EGF_Lam	1669..1716	CDD:238012	25/46 (54%)
		Laminin_EGF	1718..1767	CDD:395007	25/50 (50%)
		EGF_Lam	1772..1819	CDD:238012	10/46 (22%)
		YhaN	<1907..2141	CDD:443752	56/271 (21%)
		SMC_prok_B	<2123..>2390	CDD:274008	66/284 (23%)
		Laminin_II	2279..2400	CDD:368703	25/132 (19%)
		LamG	2399..>2492	CDD:473984	21/120 (18%)
		LamG	2586..2753	CDD:238058	42/173 (24%)
		Laminin_G_2	2804..2944	CDD:460494	27/157 (17%)
		LamG	3018..3167	CDD:238058	45/162 (28%)
		LamG	3192..3347	CDD:238058	41/155 (26%)
lama3	XP_005161783.1	EGF_Lam	95..141	CDD:238012	25/46 (54%)
		Laminin_EGF	143..196	CDD:395007	25/53 (47%)
		TNFRSF	167..231	CDD:473981	30/83 (36%)
		Laminin_I	268..495	CDD:310534	51/239 (21%)
		HEC1	<442..806	CDD:444066	87/409 (21%)
		Laminin_II	691..819	CDD:368703	27/138 (20%)
		Laminin_G_2	847..979	CDD:460494	30/159 (19%)
		LamG	1009..1149	CDD:238058	42/171 (25%)
		LamG	1197..1303	CDD:238058	23/132 (17%)
		LamG	1384..1515	CDD:238058	44/154 (29%)
		LamG	1540..1688	CDD:238058	42/157 (27%)