DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment unc-13 and Unc13c

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001245427.1 Gene:unc-13 / 43841 FlyBaseID:FBgn0025726 Length:3186 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017450981.1 Gene:Unc13c / 286931 RGDID:628592 Length:2214 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2384 Identity:992/2384 - (41%)
Similarity:1347/2384 - (56%) Gaps:414/2384 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1032 SNLMPDLLTAQI----PNSISKHNKNTSVNIEYVRQKENKGMDRRSII-------EPNIYNG-KS 1084
            ::|...|:.|.|    ....:|...||:      ::|||:..::....       .|.:.|. ||
  Rat     3 ASLFKSLILAYIHKLCKGMFTKKLGNTT------KKKENRQQNKDQDFPTAGHTKPPKLSNALKS 61

  Fly  1085 EDQICRPCLTDKLVFYPSSNSITDHNSSHDFNCLSQQDQTRIIKEFG--SAHLNQDPTNYLDYTS 1147
            ..:....|.:.:      :.||.|.....||: ||.....|:....|  :|..|.|.....:.:|
  Rat    62 TVKKIAKCSSTR------NFSIEDEEGHKDFS-LSPTFSYRVAIANGLQTAVTNSDEDLLQELSS 119

  Fly  1148 --GTYSKAPPEVLTHETNSSHLEFNHESESLFNSPNTSSYCKQKFVPGTSPAKPS---------- 1200
              .:||::..|:  ..:..:.::..|......|..::||....:   |:|..:.:          
  Rat   120 IESSYSESFNEL--RSSTENQVQSTHTMPVRRNRKSSSSLAPSE---GSSDGERTLHTLKLGALR 179

  Fly  1201 --KVWKRLNTILADNLKLKRVSKFNRSLSLPGDVQSQGLQRQPRG------QAGSCPF-----IH 1252
              :.||:....::.:.:|..|.|       ...::|:.|.|..|.      :.|...|     .|
  Rat   180 KLRKWKKSQECVSSDSELSTVKK-------TWGIRSKSLDRTARNPKTNVLEPGFSSFGCISQTH 237

  Fly  1253 KRSNLAGSPVQLSKRIQKLPIRFIGRAKGVPFVRRSSSPDSAVSLDSAADKRFSSEKGLKKKTIS 1317
            ....:....:|...:|:.......|....:.:           |:|     ..||...:.:..|.
  Rat   238 DVMEMIFKELQGISQIETELSELRGHVNALKY-----------SID-----EISSSVEVVQSEIE 286

  Fly  1318 SKMSGLMQ-KAKTYKRHSFVLRRGCNMSDSELEMPDFVSSGNDNSSISTREILLNQSIEVEDEQE 1381
            ...:|.:| :.:|...|.::..                 .|:..|.:|.|  .||...|..:..|
  Rat   287 QLRTGFVQARRETRDIHDYIKH-----------------LGHMGSKVSLR--FLNVPEERHEYVE 332

  Fly  1382 DFNYKNRCDSKSVLGGSIEKLNGNLTNNLFPI-----VGDLKKIQS--PLPLAVLTEIPSYKDEY 1439
            ...|:       :|   ::|:..:...|...|     :|..:...:  |.|:.|..|.|..:|..
  Rat   333 SVVYQ-------IL---VDKMGFSDVPNAIKIEFAQRIGQQRDCPNAKPRPILVYFETPQQRDSV 387

  Fly  1440 SNKSDSIKNSPIEMPKILLETACNQELNLAHSDDDVDKNILANSAKDYVNAPTFSILKTVEDASE 1504
            ..||..:|.:.|.:...:|.....:.         .:|.:|.:|       .|:..:.......|
  Rat   388 LKKSYKLKGTGIAISTDILTYDIRER---------KEKGVLPSS-------QTYESMDMKLSTPE 436

  Fly  1505 PT------MTPLHTTTTTNSSLNVTSALWVTQQCLDLPNYPGWGSREDDDNRSQHSARTLSSSRR 1563
            |.      ::|..:.....|.|:.:|          ..:.|..||.....::| ||||:.:.:..
  Rat   437 PKAKKNAWLSPNDSDRELESDLSRSS----------YADSPAKGSSSKSSSKS-HSARSKNKAAN 490

  Fly  1564 QSTEDSIDTDDEYFYYELRQLE--EQEKQRAHN-SAIPSCERQND--------NDVLFSQIGQLL 1617
            ..|....|       |..|..:  ..||...|. .|.|....|:|        ::..||::.|..
  Rat   491 SRTSQKSD-------YNKRPSKPPASEKPTPHYVEATPLWHSQSDFFTPKLSHSESDFSKLCQSY 548

  Fly  1618 QNDVNGGDGFRHSNGCNDGEDAIIFSPSESVKLRMSEVFKELKSVVSLNPSVNNDATFEGVPIV- 1681
            ..|.:....|..:||     .:::.|....:..|..|      .:.:|..|..:......:|.| 
  Rat   549 SEDFSESQFFCRTNG-----SSLLSSSDRELWQRKQE------GMTALYHSPQDQGLDGNIPTVP 602

  Fly  1682 -KPTYEKLETV-SDLHSAWQDVNGD-LQIAASDIDSNEDLV----------GNKGRETPTYNKQR 1733
             :...|..||| |.:.::....:|| ...:.|.:..:|||.          |..|.::.|   |.
  Rat   603 GQGEIENTETVDSGMSNSVVCASGDRSNYSGSQLSLHEDLSPWKEWNQAGHGTDGLDSST---QE 664

  Fly  1734 KLRRLKKKTRDRKINISKNATSSSSSCHSE----------------NEC----NTPLGQCTQK-- 1776
            ..........|:::::|.........|||:                :.|    |.|.||...:  
  Rat   665 PFDYDTNSLSDQQLDMSSKDLDDLGKCHSDLQDDSESYDLTQDDNSSPCPGLDNEPQGQWVGQYD 729

  Fly  1777 SVAEKDTNDI-SNKSEAS------SETSGPDTPA------------ELSD---------VDISET 1813
            |..:.::||: .|:|..|      ||....|:.|            :|||         ..:...
  Rat   730 SYQKTNSNDLYPNQSHPSMMYRSQSELQSDDSEAAQPKSWHSRLSIDLSDKTFKFPKFGSTLQRA 794

  Fly  1814 ENGLRADDGQNIDNMRG--NSGSLLKVNRKYLLQ-------FDVDHSLINQP------------- 1856
            ::.|.....::..::.|  :|||.|....:.|.|       ..:|..:..:|             
  Rat   795 KSALEVVWNKSTQSLSGCEDSGSSLMGRFRTLSQSTANESSTTLDSDIYTEPYYYKAEEEEDYCE 859

  Fly  1857 ---------LETSQYNTHMLENITSAS---------------IPSQNRQIDSKTLMSQSSHADGS 1897
                     :|..:.....|||.||.:               .|.:..|.:.....:....::|.
  Rat   860 PVADSETDYVEVMEQVLAKLENRTSVTEVDEHIKEYDHPSYETPYETPQDEGYDGQADDIISEGE 924

  Fly  1898 QAVGNETAVGLS------------------------SSKWKLLKTLKER--KIEEK---NNQDKI 1933
            ....||.||.:.                        |.|...|:..|::  ::|||   .:...:
  Rat   925 LETLNEPAVEMELVEDESQNLPVEPPEVMKPKRIRPSFKEAALRAYKKQMAELEEKILAGDSSSV 989

  Fly  1934 KEDEMI---KDRDKN---------GGGPGEVGLRTNGHPGDNPFYSNIDSMPDIRPRRKSIPLVS 1986
            .|...|   .|.|.:         |.|.|..|               ||||||:| |:|::|:|.
  Rat   990 DEKARIVSGNDLDASKFSALQVFGGAGRGLYG---------------IDSMPDLR-RKKTLPIVR 1038

  Fly  1987 ELVLKTMAATKRNAGLTSA-VPRATLNDEDLKMHVYKKALQALIYPISSTTPHNFLLWTATSPTY 2050
            ::.: |:||  |.:||:.| |.|.:||:|:|||||::|.||||||||||||||||.:||||:|||
  Rat  1039 DVAM-TLAA--RKSGLSLAMVIRTSLNNEELKMHVFRKTLQALIYPISSTTPHNFEVWTATTPTY 1100

  Fly  2051 CYECEGLLWGIARQGVRCTECGVKCHEKCKDLLNADCLQRAAEKSSKHGAEDKANSIITAMKDRM 2115
            |||||||||||||||::|.||||||||||:|||||||||||||||||||||||..:||||||:||
  Rat  1101 CYECEGLLWGIARQGMKCLECGVKCHEKCQDLLNADCLQRAAEKSSKHGAEDKTQTIITAMKERM 1165

  Fly  2116 KQREREKPEIFELIRAVFSVEEKSHAGHMKAVKQSVLDGTSKWSAKIAITVICAQGLIAKDKSGT 2180
            |.|||.:||:||:|:.:|.:.::....:.||.|||||||||||||||.|||:.||||.||||:|:
  Rat  1166 KIRERNRPEVFEVIQEMFQISKEDFVQYTKAAKQSVLDGTSKWSAKITITVVSAQGLQAKDKTGS 1230

  Fly  2181 SDPYVTVQVSKVKKRTRTMPQELNPVWNEKFHFECHNSSDRIKVRVWDEDNDLKSKLRQKLTRES 2245
            |||||||||.|.|:||:|:...|||||:|||:||||||:|||||||||||:|:||:::|...:||
  Rat  1231 SDPYVTVQVGKNKRRTKTIFGNLNPVWDEKFYFECHNSTDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQHFKKES 1295

  Fly  2246 DDFLGQTIIEVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENL 2310
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||||||||:|||||||||
  Rat  1296 DDFLGQTIVEVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLKINVEIKGEEKVAPYHIQYTCLHENL 1360

  Fly  2311 FHYLCE-ENTGMVKLPTQKGDDAWKLYFDEIPEEIVDEFSMRYGIENIYQAMTHFHCLSAKYLCP 2374
            ||||.| ::.|.||:|..|||:|||::||:..:||||||:||||:|:||||||||.|||:||:||
  Rat  1361 FHYLTEVKSNGSVKIPEVKGDEAWKVFFDDASQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFSCLSSKYMCP 1425

  Fly  2375 GVPAVMSTLLANINAYYAHTTASS--AVSASDRFAASNFGKEKFVKLLDQLHNSLRIDLSMYRNN 2437
            |||||||.|||||||:|||||.|:  .|||||||||:|||:|||:|||||||||||||||.||.|
  Rat  1426 GVPAVMSALLANINAFYAHTTVSTNVQVSASDRFAATNFGREKFIKLLDQLHNSLRIDLSKYREN 1490

  Fly  2438 FPASSPEKLMDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELSSPPRASTVVKDCVKACLRSTYQFLFENCYELY 2502
            ||||:.|:|.|||||||||||||||||||.||.|||:||.||||||:|||.|||:::|:||:|||
  Rat  1491 FPASNSERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVLELQSPPKASAVVKDCVRACLDSTYKYIFDNCHELY 1555

  Fly  2503 NREFQVDPNEAKRAP-DDHEPKLDSVDFWHKLIALIVSVIDEDKNSYGTVLNQFPQELNIGQLSA 2566
            ::  .:||::.:..| ::..|...::|||.:||.|:|::|||||.:|..||||||||||:|::||
  Rat  1556 SQ--LIDPSKKQDVPREEQGPTTKNLDFWPQLITLMVTIIDEDKTAYTPVLNQFPQELNMGKISA 1618

  Fly  2567 SSMWHLFAVDMKYALEEHEQHRLCKSSAYMNLHFRVKWLYSNYVKEVPPYKGAVPDYPAWFEPFV 2631
            ..||.|||:||||||||||:.|||||:.||||||:|||.|:.||:|:|.:|.|||:|..||||||
  Rat  1619 EIMWSLFALDMKYALEEHEKQRLCKSTDYMNLHFKVKWFYNEYVRELPAFKDAVPEYSLWFEPFV 1683

  Fly  2632 MQWLNENDDVSLEYLHGAFKRDKKDGFQKSSEHALFSNSVVDVFTQLTQCFDVVSKLECPDPEIW 2696
            ||||:||:|||:|:||||..||||||||::|:|||||.||||||.||.|.|:::.|||||:||..
  Rat  1684 MQWLDENEDVSMEFLHGALGRDKKDGFQQTSDHALFSCSVVDVFAQLNQSFEIIKKLECPNPEAL 1748

  Fly  2697 KRYMRRFAKTIVKVLIAYADIVKLEFPEHMKDERIACILMNNIQQLRVQLEKMFESMGGD----- 2756
            ...||||||||.|||:.||.||..:|..:...|.:.|||||||||||||||||||||||.     
  Rat  1749 SHLMRRFAKTINKVLVQYAAIVSSDFSSYCDKETVPCILMNNIQQLRVQLEKMFESMGGKEKKEG 1813

  Fly  2757 -----KLEEDAANILKELQQNLNSALDDLASQFAISLEPRITQSVRELGDMLLSIKGGSGTLAAG 2816
                 :|:.:|:.||||||..||..||.|:..:..|.:..|.:.::::|..|..::      |.|
  Rat  1814 ERFSYELDPEASTILKELQIKLNGVLDALSVTYGESFQLVIEECIKQMGAELNQMR------ANG 1872

  Fly  2817 NLAAQRNAVAVEADEVLRPLMDLLDGSLTLYAQSCEKTVLKRLLKELWKIVMRILEKTIVLPPMT 2881
            |.||.:|..|::|:.|||||||.||.:|:|.|:.||||||||:||||||:|:..:||.|||||:|
  Rat  1873 NSAANKNNAAMDAEIVLRPLMDFLDKTLSLSAKICEKTVLKRVLKELWKLVLNKIEKQIVLPPLT 1937

  Fly  2882 DKT---MMFKHLTDNAKNLASNAKIEDMGRLFKSHMAGKQDVKSALSGVMDISKEVEKNLSPKQC 2943
            |:|   |:|    ..||.|...:|:       |.||.                ::..|.|:|:||
  Rat  1938 DQTGPQMIF----IAAKELGQLSKL-------KEHMI----------------RDDAKGLTPRQC 1975

  Fly  2944 AVLDVALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEKSPELQSLRYALSLYTQMTDTLIKTFI---SSQVHEVD 3005
            |:::|.|.|||||||||||||||.||||||:|.|||||||||||.||.|||.||   .||.|   
  Rat  1976 AIMEVVLATIKQYFHAGGNGLKKNFLEKSPDLHSLRYALSLYTQTTDALIKKFIETQGSQSH--- 2037

  Fly  3006 LENSEESVGEISVQIDLFSHPGTGEHKVNVKVVAANDLKWQIPSGMFRPFVDINLIGPHLQEKKR 3070
              :|:::||:|||.:|:.:.||||||||.|||:|.|||.|| .:.||||||::.::||.|.:|||
  Rat  2038 --SSKDAVGQISVHVDVTTTPGTGEHKVTVKVIAINDLNWQ-TTAMFRPFVEVCMLGPSLGDKKR 2099

  Fly  3071 KFATKSKSNNWSPKYNESFSFTIGNEEQLDFFELHICVKDYCFARDDRLVGVAVIPLKDISEKGS 3135
            |..||:|||.|||||||:|.|.:|||.:...:|||:.||||||||:||::|:.||.|::|:||||
  Rat  2100 KQGTKTKSNTWSPKYNETFQFILGNENRPGAYELHLSVKDYCFAREDRIIGMTVIQLQNIAEKGS 2164

  Fly  3136 VACWLPLMRRIEMDETGWTILRILSQRNNDEVAKEFVKLKSEIR 3179
            ...|.||::.:.|||||.|||||||||.:|:||||||:||||.|
  Rat  2165 YGAWYPLLKNLSMDETGLTILRILSQRTSDDVAKEFVRLKSETR 2208

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
unc-13NP_001245427.1 C1 2038..2087 CDD:237996 41/48 (85%)
C2B_Munc13 2160..2286 CDD:175993 98/125 (78%)
DUF1041 2477..2584 CDD:283860 60/107 (56%)
Membr_traf_MHD 2832..2992 CDD:287505 89/162 (55%)
C2C_Munc13 3032..3152 CDD:176041 69/119 (58%)
Unc13cXP_017450981.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 303 1.000 Domainoid score I1343
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001626
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45699
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103034
Panther 1 1.100 - - O PTHR10480
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1191
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
87.910

Return to query results.
Submit another query.