DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment unc-13 and unc-13

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001245427.1 Gene:unc-13 / 43841 FlyBaseID:FBgn0025726 Length:3186 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001021873.1 Gene:unc-13 / 172497 WormBaseID:WBGene00006752 Length:2155 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2575 Identity:1000/2575 - (38%)
Similarity:1372/2575 - (53%) Gaps:556/2575 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   703 TLKKL-VGSSLDDFKIDNSH--ANMTTFHSLNPSHNSNDSSFSAHLLRNNSNLDEQLKILETQE- 763
            |:||. :..::|:|   ||:  ..:.|..|...:            :|.|....||..|.||.. 
 Worm    24 TIKKARLQGAVDEF---NSYVTVKLQTVKSTTVA------------VRGNLPCWEQEFIFETNRP 73

  Fly   764 -----IEIHRKKKI-DEIVS----GLSEETYTFNPDMEYKSQHSCTNSTDNIIGFSKNIYNEDEY 818
                 :|:..|..: |:::.    .|||..|:                  |..|..:.:..:.| 
 Worm    74 DDGMVLELWAKGVLWDKLIGVHYMPLSEIRYS------------------NAAGSGQWLQMDHE- 119

  Fly   819 IKSLRKSLERHNSMIFLLHLQNPEKHKVLADI----------NDAQMDSNRASLSPPPPAPTDTV 873
                   ||..|..  .:..:.|..|.:|.|:          :|..:.|...             
 Worm   120 -------LETRNGQ--TVGTRGPTGHNLLTDVRFELPFDVQGHDEDIQSRLL------------- 162

  Fly   874 YLNDAINQITYQQRNGKSD--------SGLSSMSGWSANSQVSVGLQNYDPACNNILENCSERLQ 930
                |:|.:....:.|.::        ||||..|.::::..|.|......|       |.|....
 Worm   163 ----ALNGLIEHDQLGPNNHHRAPFNHSGLSEDSDYTSDVSVPVNHHQLHP-------NSSAHQY 216

  Fly   931 TYHSFPLAENSNFHSFPLSHEQAQTTNQTEFVILEENLNYIYELSKNLPICSAYENKSIFDMKYE 995
            ..|..|             |...|..:..|.....|:....|. :::.|....|.::..:|....
 Worm   217 ESHLHP-------------HRTRQLLHTREGAASYEDEEDAYH-ARHQPESDDYNHQDTYDQHSS 267

  Fly   996 ICDSNEIGKFSTVDEMLEWDQLNEPDKQNFSGK-RLNSNLMPDLLT-------AQIPNSISKHNK 1052
            ..:          ||.......::..:|.:..: :.:.|:..|.:|       :.:|.:.|.   
 Worm   268 YYN----------DEYAPSGSSSQYQRQGYQDQDQQHQNIYEDTVTPVREFGESAVPPAASS--- 319

  Fly  1053 NTSVNIEYVRQKENKGMDRRSIIEPNIYNGKSEDQICRPCLTDKLVFYPSSNSITDHNSS---HD 1114
                             .||...:...|...||::...|..:.:|   |....|.:|:..   :|
 Worm   320 -----------------SRRQFDQVYGYASSSEERYDTPMSSGRL---PRDEPILEHSEPEYVYD 364

  Fly  1115 FNCLSQQDQTRIIKEFGSAHLNQDPTNYLDYTSGTYSKAPPEVLTHETNSSH-LEFNHESESL-F 1177
            .|...::|...|...:...|. :..||  || |.|:.:  |....::.|||: .|:.:|||.| :
 Worm   365 QNGYPEEDNYGINPTYSEDHF-EGQTN--DY-STTHQE--PNDFRNDYNSSYQREYWNESEPLSY 423

  Fly  1178 NS--PN----TSSYCKQKFVPGTSPAKP--SKVWK-RLNTILADNL-KLKRVSKFNRSLSLPGDV 1232
            ||  ||    |.:...::  |.|| ::|  |:.|. :.:|...|.: :..||| |.|:.|     
 Worm   424 NSRPPNGHIRTGANTWRE--PSTS-SRPTSSQAWNYQDDTHQYDEVDRGSRVS-FTRTPS----- 479

  Fly  1233 QSQGLQRQPRGQAGSCPFIHKRSNLAGSPVQLSKRIQKLPIRFIGRAKGVPFVRRSSSPDSAVS- 1296
                :.|..|.......|..:.|. :|.|               ||            |||..: 
 Worm   480 ----VDRTDRPSESGGGFYDEMSE-SGRP---------------GR------------PDSHHNW 512

  Fly  1297 -LDSAADKRFSSEKGLKKKTISSKMSGLMQKAKTYKR---HSFVLRRG-CNMSDSELEMPDFVSS 1356
             .||..::  .:||...|:.:.....|..:|.|..::   ||....:. .:.|||..:. ||   
 Worm   513 RYDSIQEE--DNEKDNWKQHVEGYEEGQEEKQKDNQKPNDHSAASPQDHYHRSDSTAQQ-DF--- 571

  Fly  1357 GNDNSSISTREILLNQSIEVEDEQEDFN------YKNRCDS---KSVLGGSIEKLNGNLTNNLFP 1412
            ||:         ::.|:|:.|:|:.::.      ||..|..   ||.....:....|.|..||| 
 Worm   572 GNN---------IVRQTIQEEEEKRNYQELWHNAYKRVCADLGIKSSQASLVATTGGTLLQNLF- 626

  Fly  1413 IVGDLKKIQSPLPLAVLTEIPSYKDEYSNKSDSIKNSPIEMPKILLETACNQELNLAHSDDDVDK 1477
                                 .|:.:.:........|..:.|........|...|    :::|.|
 Worm   627 ---------------------LYRPKLAPAGHGATASQFQSPAGATRFYANHNNN----NNNVSK 666

  Fly  1478 NILANSAKDYVNAPTFSILKTVEDASEPTMTPLHTTTTTNSSLNVTSALWVTQQCLDLPNYPGWG 1542
            |.|.:               |.|...:|:.||      :.||:|...:|.|       |..||..
 Worm   667 NELDS---------------TTETPPDPSRTP------STSSMNPVPSLAV-------PMSPGPY 703

  Fly  1543 SREDDDN---------RSQHSARTLSSSRRQSTEDSIDTDDEYFYYELRQLEEQEKQRAHNSAIP 1598
            ...|..:         ||.:..:.....|....|....|:....|.|..:..::.::.:..|.  
 Worm   704 LNSDPPSPVSPNPQIKRSIYRIKESYEDRNGGRERIYTTNLVSVYLEKMKPPDELEEGSSGSM-- 766

  Fly  1599 SCERQNDNDVLFSQIGQLLQNDVNGGDGFRHSNGCNDGEDAIIFSPSESVKLRMSEVFKELK--S 1661
               |:..|::   :.|..|.|        ..||         ||.|.:||...:|.....||  |
 Worm   767 ---RETQNEI---KNGTQLHN--------AESN---------IFFPQDSVPKSISYNAGNLKNTS 808

  Fly  1662 VVSLNPS--VNNDATFEGVPIVKPTYEKLETVSDLHSAWQDVNGDLQIAASDIDSNEDLVGNKGR 1724
            :.:...|  :.|.::....|..||                        |:.|.|..:.|:     
 Worm   809 ITTSKTSSAITNHSSLPPQPPSKP------------------------ASRDSDPMKQLL----- 844

  Fly  1725 ETPTYNKQ-RKLRRLK----KKTRDRKINISKNATSSSSSCHSENECNTPLGQCTQKSVAEKDTN 1784
               |::|. :|:||::    ::.:.:::.|.|     |.||        |:...|:|        
 Worm   845 ---TFSKSFKKVRRVRSAMPRRRKRKRVKIKK-----SRSC--------PILWKTEK-------- 885

  Fly  1785 DISNKSEASSETSGPDTPAELSDVDISETENGLRADDGQNIDNMRGNSGSLLKVNRKYLLQFDVD 1849
                            ||                       ..|:..|.:.:::.:|.::     
 Worm   886 ----------------TP-----------------------HPMKSKSMTCIRIPKKTVI----- 906

  Fly  1850 HSLINQPLETSQYNTHMLENITSASIPSQNRQIDSKTLMSQSSHADGSQAVGNETAVGLSSSKWK 1914
                 .||...       ..|.....|:...:.|||      :|                     
 Worm   907 -----APLRKE-------IKIVRMKPPAARCESDSK------AH--------------------- 932

  Fly  1915 LLKTLKERKIEEKNNQDKIKEDEMIKDRDKNGGGPGEVGLRTNGHPGDNPFYSNIDSMPDIRPRR 1979
                      ::||..|      :.||..|:      ..|..||....|.||.:||:.|::...|
 Worm   933 ----------KKKNLLD------VYKDMGKS------TVLDGNGSSAANAFYKSIDAAPNMNVAR 975

  Fly  1980 --KSIPLVSELVLKTMAATKRNAGLTSAVPRATLNDEDLKMHVYKKALQALIYPISSTTPHNFLL 2042
              .||||||||||||||..:..|||.:|. |.|.:|.:||.|||||.|||||||||:||||||..
 Worm   976 TKTSIPLVSELVLKTMATKRAQAGLANAA-RTTFSDTELKTHVYKKTLQALIYPISATTPHNFAT 1039

  Fly  2043 WTATSPTYCYECEGLLWGIARQGVRCTECGVKCHEKCKDLLNADCLQRAAEKSSKHGAEDKANSI 2107
            .|..:||:||||||||||:||||:|||:|.||.|:||::||:|||||||||||:|||..|:..|:
 Worm  1040 TTFQTPTFCYECEGLLWGLARQGLRCTQCQVKVHDKCRELLSADCLQRAAEKSTKHGEADRTQSL 1104

  Fly  2108 ITAMKDRMKQREREKPEIFELIRAVFSVEEKSHAGHMKAVKQSVLDGTSKWSAKIAITVICAQGL 2172
            :..::||||.:|:.|||:|::||.||.|:|......:|.||.|:|:|:|||||||.:||:|||||
 Worm  1105 VNVIRDRMKIQEQNKPEVFQMIRTVFDVDENIQKETLKTVKASILEGSSKWSAKITLTVLCAQGL 1169

  Fly  2173 IAKDKSGTSDPYVTVQVSKVKKRTRTMPQELNPVWNEKFHFECHNSSDRIKVRVWDEDNDLKSKL 2237
            |||||:|.||||||.||.|.|:||||:.||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
 Worm  1170 IAKDKTGKSDPYVTAQVGKTKRRTRTIHQELNPVWNEKFHFECHNSTDRIKVRVWDEDNDLKSKL 1234

  Fly  2238 RQKLTRESDDFLGQTIIEVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQ 2302
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||||
 Worm  1235 RQKLTRESDDFLGQTVIEVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLHINVEIKGEEKLAPYHVQ 1299

  Fly  2303 YTCLHENLF--HYLCEENTGMVKLPTQKGDDAWKLYFDEIPEEIVDEFSMRYGIENIYQAMTHFH 2365
            ||||||:||  |.:.||    ||||..:|:|:||:.|.|..:||.:||:||||||:||||||||.
 Worm  1300 YTCLHEHLFAAHCVDEE----VKLPKVRGEDSWKVCFQETGQEIAEEFAMRYGIESIYQAMTHFA 1360

  Fly  2366 CLSAKYLCPGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASSAVSASDRFAASNFGKEKFVKLLDQLHNSLRID 2430
            ||..:|:|.|||||:||||||||||||||||:|||||.|||||||||||:|||||||||||||||
 Worm  1361 CLCTRYMCAGVPAVLSTLLANINAYYAHTTATSAVSAPDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRID 1425

  Fly  2431 LSMYRNNFPASSPEKLMDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELSSPPRASTVVKDCVKACLRSTYQFLF 2495
            ||.|||:||:|||.||.|||||||||||||||||||.||:|||||||||::|.|||::.|||.:|
 Worm  1426 LSAYRNHFPSSSPAKLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVLELASPPRASTVVRECAKACMQQTYQLMF 1490

  Fly  2496 ENCYELYNREFQVDPNEAKRAPDDHEPKLD-SVDFWHKLIALIVSVIDEDKNSYGTVLNQFPQEL 2559
            |:|.|.:                   |.|| ||.||::.|..|:.||:||:.:|...||||||||
 Worm  1491 ESCAEQF-------------------PILDTSVQFWYEFIDYIMRVIEEDQKNYTPALNQFPQEL 1536

  Fly  2560 NIGQLSASSMWHLFAVDMKYALEEHEQHRLCKSSAYMNLHFRVKWLYSNYVKEVPPYKGAVPDYP 2624
            |:|.|||.::|.::..|:|.|||||.|.:.||:..||||:|:||..|..||.::..||.::|::|
 Worm  1537 NVGNLSAETLWSMYKNDLKMALEEHAQKKRCKTPEYMNLYFKVKGFYFKYVADLSTYKSSIPEFP 1601

  Fly  2625 AWFEPFVMQWLNENDDVSLEYLHGAFKRDKKDGFQKSSEHALFSNSVVDVFTQLTQCFDVVSKLE 2689
            |||.||||.||||||:.|::.|..|:..||.|.|.::|||..||||||||||||.....::.:::
 Worm  1602 AWFIPFVMDWLNENDEHSMDILRNAYNVDKADNFPQTSEHTKFSNSVVDVFTQLNAALKLLKQMD 1666

  Fly  2690 CPDPEIWKRYMRRFAKTIVKVLIAYADIVKLEFPEHMKDERIACILMNNIQQLRVQLEKMFESMG 2754
            ||:||:....|:||:||:.|||:||||:|:.:||:...||::|||||||:|||||||||::|:||
 Worm  1667 CPNPEVAADMMKRFSKTLNKVLLAYADMVQKDFPKFAHDEKLACILMNNVQQLRVQLEKIYETMG 1731

  Fly  2755 GDKLEEDAANILKELQQNLNSALDDLASQFAISLEPRITQSVRELGDMLLSIKGGSGTLAAGNLA 2819
            |.:|:|....:|..||:.|||.||.|:::|..:|||.|.:...:||.:|:.|||..         
 Worm  1732 GAELDEHIGQVLTVLQKKLNSVLDRLSAEFVTTLEPHIHEQTIKLGMLLVKIKGPQ--------- 1787

  Fly  2820 AQRNAVAVEADEVLRPLMDLLDGSLTLYAQSCEKTVLKRLLKELWKIVMRILEKTIVLPPMTDKT 2884
            .|:..|..|||.||.||||||:|||..||..|||||||.:|||||||.:..:||.:||||::||.
 Worm  1788 LQKTQVQPEADAVLEPLMDLLEGSLRRYADQCEKTVLKYILKELWKITIVNMEKRVVLPPLSDKA 1852

  Fly  2885 MMFKHLTDNAKNLASNAKIEDMGRLFKSHMAGKQDVK--SALSGVMDISKEVEKNLSPKQCAVLD 2947
            ::        |.| .||||.|:.:|..:::   |.:|  :::..:||:::|.||:|:|:||.|||
 Worm  1853 LL--------KQL-PNAKIGDVTKLMSTNI---QSIKGMNSVKDMMDMARESEKSLTPRQCTVLD 1905

  Fly  2948 VALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEKSPELQSLRYALSLYTQMTDTLIKTFISSQVHEVDLENSEES 3012
            .|||.||..|||.|.||||:|.|||||||||:||||||||.|:.||||||:|| .:.||.:.|:.
 Worm  1906 CALDAIKDSFHASGKGLKKSFFEKSPELQSLKYALSLYTQTTEQLIKTFITSQ-RQQDLPSQEQP 1969

  Fly  3013 VGEISVQIDLFSHPGTGEHKVNVKVVAANDLKWQIPSGMFRPFVDINLIGPHLQEKKRKFATKSK 3077
            |||:|||:||||||||||.||.||::|||||:|| .|..|:|||:::|:||||.:||||::||:|
 Worm  1970 VGEVSVQVDLFSHPGTGEQKVTVKILAANDLRWQ-TSSAFKPFVEVHLVGPHLSDKKRKWSTKTK 2033

  Fly  3078 SNNWSPKYNESFSFTIGNEEQLDFFELHICVKDYCFARDDRLVGVAVIPLKD-ISEKGSVACWLP 3141
            :.||:||:||:|.|.:|||.:.:.:||...|||||||||||:|||.|:.|.. :.:.||.|.|:.
 Worm  2034 AGNWAPKFNETFHFFLGNEGEPEHYELMFQVKDYCFARDDRVVGVGVLQLSSVVDQAGSCAMWVQ 2098

  Fly  3142 LMRRIEMDETGWTILRILSQRNNDEVAKEFVKLKSEIRQE 3181
            |..|:.:||||..:|||||||..|||||:||:||:|.|.|
 Worm  2099 LGTRLHIDETGLILLRILSQRQTDEVAKDFVRLKTECRYE 2138

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
unc-13NP_001245427.1 C1 2038..2087 CDD:237996 32/48 (67%)
C2B_Munc13 2160..2286 CDD:175993 112/125 (90%)
DUF1041 2477..2584 CDD:283860 47/107 (44%)
Membr_traf_MHD 2832..2992 CDD:287505 89/161 (55%)
C2C_Munc13 3032..3152 CDD:176041 65/120 (54%)
unc-13NP_001021873.1 C2A_Munc13 18..144 CDD:176040 26/133 (20%)
C1 1035..1084 CDD:237996 11/53 (21%)
C2B_Munc13 1157..1283 CDD:175993 18/125 (14%)
DUF1041 1472..1561 CDD:283860 73/88 (83%)
Membr_traf_MHD 1800..1950 CDD:287505 67/150 (45%)
C2C_Munc13 1989..2109 CDD:176041 64/119 (54%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160167932
Domainoid 1 1.000 328 1.000 Domainoid score I627
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 1 1.000 - - H11279
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001626
OrthoInspector 1 1.000 - - oto19648
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103034
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10480
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R10279
SonicParanoid 1 1.000 - - X1191
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1110.870

Return to query results.
Submit another query.