Protein Alignment CG11155 and grid1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651941.2
• Gene: CG11155 / 43822
• FlyBaseID: FBgn0039927
• Length: 910
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_021323097.2
• Gene: grid1a / 793756
• ZFINID: ZDB-GENE-120411-28
• Length: 1044
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 914
• Identity: 257/914 - (28%)
• Similarity: 447/914 - (48%)
• Gaps: 117/914 - (12%)

  Fly    30 LSILVISNAL----------PPVIRVGAIFTEDE-RESSIESAFKYAIYRINKEKTLLPNTQLVY 83
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Zfish     1 MELLVISLSLWILQCRSARADSIIHIGAIFEQNAIRDDEV---FQLAISDLSLNDDILQSERITH 62

  Fly    84 DIEYVPRDDSFRTTKKVCSQLEAGVQAIFGPTDALLASHVQSICEAYDIPHIEGRIDLEYNS--- 145
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Zfish    63 SIKLIEPNNPFQAVQEACELMNQGILALVSSTGCAAANALQSLTDAMHIPH----LFIQRNGDGT 123

  Fly   146 --KEFSINLYPSHTLLTLAYR------DIMV----YLNWTKVAIIYEEDY---GLFNLMHSSTET 195
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Zfish   124 PRAECQLNPSPDGERYTLAARPPVRLNDVMITLVSELRWHKFIVFYDSEYDVRGLRGFLDQASRM 188

  Fly   196 KAEMYIRQASP------------------DSYRQVLRAIRQKEIYKIIVDTNPSHIKSFFRSILQ 242
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Zfish   189 GLDVSLQQVDRNVTKVFSTLFSTMRMEELNRYRDTLR--------RAILLLSPRTAQVFIHQAVE 245

  Fly   243 LQMNDHRYHYMFTTFDLETYDLEDFRYNSV-NITAFRLV-----DVDSKRYLEVINQMQKLQHNG 301
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Zfish   246 TNLASKDSHWVYANEEVSDTEIMELVHSALGRMTVIRQIFPLWRDTN----IRCMRNNHRISSLL 306

  Fly   302 LDTINGSPYIQT---ESALMFDSVYAFANGLHFLNLDNHQNFYIKNLSC--TSDQTWNDGISLYN 361
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Zfish   307 CDPQEG--YLQSLEVSSLYLYDSVLMLANAF-YRKLEDRKWHSMASLNCMRKSTKPWNGGWSMLD 368

  Fly   362 QINAAITDGLTGTVQF-VEGRRNIFKLDILKLKQEK-----IQKVGYWHPDDGVNISDPTAFYDS 420
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Zfish   369 TIQKGRISGLTGLMDFRSNGANSHVQFEILGTSYSETFGKDVKRLATWDSDRGLNGSLRENRADH 433

  Fly   421 NIANITLVVMTREERPYVMVKEDKNLTGN-LRFEGFCIDLLKAIATQVGFQYKIELVPDNMYGVY 484
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Zfish   434 GMQGITLKVVTLLEEPFVMVAE--NILGQPKRYKGFSIDVLDALAKILGFKYEMYQVADAKYG-- 494

  Fly   485 IPETN-SWNGIVQELMERRADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKVPTSQPTRLFSF 548
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Zfish   495 SPQANGSWNGMIGELIGKRADVAISAITITPERENVVDFSKRYLDYSVGILM-TKTEERLNIFSL 558

  Fly   549 MNPLAIEIWLYVLAAYILVSFALFVMARFSPYEWKNPHPCYKETDIVENQFSISNSFWFITGTFL 613
            :.|..:.:|..:.||..:|...:|::.|......:||...::...:..   |..::.|.:.|.|:
Zfish   559 LAPFDLAVWACIAAAIPVVGVMVFLLRRVQSVRSQNPPGPHQPASVTT---SFQSAIWIVYGAFV 620

  Fly   614 RQGSGLNPKATSTRIVGGCWFFFCLIIISSYTANLAAFLTVERMISPIESASDLAEQTEISYGTL 678
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Zfish   621 QQGGESFMSSMALRIAMGSWWLFTLIVCSSYTANLAAYLTVSRMDNAIRTFQDLSKQSEINYGTV 685

  Fly   679 EGGSTMTFFR---------DSKIGIYQKMWRYM-ENRKTAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMEST 733
            ...:...:||         ||   .:.::||.: :|:.....|.:..:||::|....||||.:..
Zfish   686 RESAVFEYFRVKGTNPLEQDS---TFAELWRTINKNQGQDNSVTSPAEGIRKVKRDPYAFLWDMA 747

  Fly   734 MLDYA--VQRDCNLTQIGGLLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTG 796
            :|:||  ...||.|...|..:.|||||:|...|||:||..|..||:|||||.:.||..|||...|
Zfish   748 VLEYAALTDDDCTLVVTGNGMSSKGYGLALQHGSPYRDLFSQKILDLQEKGDLDILKQKWWPRKG 812

  Fly   797 DVCNRDDKSK-ESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWN----SRKNLNTENQSLC 856
            . |:.|..:: :::..||.:.:..|||.:|..||.||.:||..|..||    .|.....:.:...
Zfish   813 R-CDLDKHAEPQTEGRALRLHSFAGVFCILAAGLLLACLVAALESWWNGPRCQRAQPKEDTKGCA 876

  Fly   857 SEMA 860
            .|||
Zfish   877 LEMA 880

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG11155	NP_651941.2	PBP1_iGluR_Kainate	44..413	CDD:380605	82/422 (19%)
		PBP2_iGluR_Kainate	424..793	CDD:270432	144/382 (38%)
		Lig_chan	554..828	CDD:459656	99/286 (35%)
grid1a	XP_021323097.2	None