DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PMCA and atp2b1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001014689.3 Gene:PMCA / 43787 FlyBaseID:FBgn0259214 Length:1255 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009298531.1 Gene:atp2b1a / 378746 ZFINID:ZDB-GENE-030925-29 Length:1257 Species:Danio rerio


Alignment Length:1268 Identity:753/1268 - (59%)
Similarity:900/1268 - (70%) Gaps:116/1268 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 QYGISLKQLRELMEHRGREGVMKIAEN-GGIHELCKKLYTSPNEGLSGSKADEEHRRETFGSNVI 73
            ::|.|||:||.|||.||.||:.||.|. |.::.||.:|.||..:||||..:|.|.|:..||.|.|
Zfish    21 EFGCSLKELRSLMELRGAEGLQKIQETYGDVNGLCNRLKTSAVDGLSGQPSDIEKRKAAFGQNFI 85

  Fly    74 PPKPPKTFLTLVWEALQDVTLIILEVAALVSLGLSFYKPADE-DAPVLQ------EEEEHHGWIE 131
            |||.|||||.||||||||||||||||||:||||||||||.|. |...::      |||...||||
Zfish    86 PPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEVAAIVSLGLSFYKPPDAGDKNCVKGTGGEPEEEGETGWIE 150

  Fly   132 GLAILISVIVVVIVTAFNDYSKERQFRGLQNRIEGEHKFSVIRGGEVCQISVGDILVGDIAQVKY 196
            |.|||:||:.||:||||||:|||:||||||:|||.|.||||:|||:|.||.|.:|:||||||:||
Zfish   151 GAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEKQFRGLQSRIEQEQKFSVVRGGQVIQIHVAEIVVGDIAQIKY 215

  Fly   197 GDLLPADGCLIQSNDLKVDESSLTGESDHVKKGPDVDPMVLSGTHVMEGSGKMVVTAVGVNSQAG 261
            ||||||||.|||.||||:||||||||||||||..|.|.|:||||||||||||:||||||||||.|
Zfish   216 GDLLPADGILIQGNDLKIDESSLTGESDHVKKSLDKDAMLLSGTHVMEGSGKIVVTAVGVNSQTG 280

  Fly   262 IIFTLLGAAVDEQEAEIKKMKKEAKRANKQKN--LTGENDGRSQIKGSQ-APSQRETVTSE--IT 321
            ||||||||..|:.:.|.|:.|||.:|..::||  ..|..:.|.:.|... |..:.:.:.|:  ..
Zfish   281 IIFTLLGAGEDDDDEEEKEKKKEKERKKEKKNKKQDGSVENRKKAKAQDGAAMEMQPLNSDEGAD 345

  Fly   322 KSESEGNHLPQSSSSGAAETGHKKEKSVLQAKLTKLAIQIGYAGSTIAVLTVIILIIQFCIKTFV 386
            ..|....:||            ||||||||.||||||:|||.||..::.:|||||::.|.:.||.
Zfish   346 GEEKRKANLP------------KKEKSVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVVLFVVDTFW 398

  Fly   387 IDEKPWKN----TYANNLVKHLIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTLSLAYSVKKMMKDNNLVRHLDAC 447
            :|:.||.:    .|....||..||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Zfish   399 VDKIPWDSGCIPIYIQFFVKFFIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDAC 463

  Fly   448 ETMGNATAICSDKTGTLTTNRMTVVQSYICEKLCKVLPTLSDIPQHVGNLITMGISVNSAYTSNI 512
            ||||||||||||||||||.|||||||.:|.:|..:.:|....:|....:|:.:|||||.|||:.|
Zfish   464 ETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQVFIADKHYRKVPEPDVVPASTMDLLIVGISVNCAYTTKI 528

  Fly   513 MAGHNPGDLPIQVGNKTECALLGFVQGLGVKYQSIRDEITEDKFTRVYTFNSVRKSMGTVIPRPN 577
            |:....|.|..|||||||||||||...|...||::|:||.|:|..:|||||||||||.||:...:
Zfish   529 MSPEKEGGLNRQVGNKTECALLGFALDLKKDYQAVRNEIPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVLKNDD 593

  Fly   578 GGYRLYTKGASEIIMKKCAFIYGHEGTLEKFTRDMQERLIREVIEPMACDGLRTISVAYRDFVPG 642
            |.||:::||||||::|||..|....|..:.|....::.:::.||||||.:|||||.:||||| |.
Zfish   594 GSYRMFSKGASEILLKKCFKILTSTGEAKVFRPRDRDDMVKRVIEPMASEGLRTICLAYRDF-PA 657

  Fly   643 KAAINEVHIDGEPNWDDEENIMTNLTCLCVVGIEDPVRPEVPDAIRKCQRAGITVRMVTGDNINT 707
            .        :|||:||:|.:|:|.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Zfish   658 S--------EGEPDWDNEADILTRLTCVCVVGIEDPVRPEVPDAIRKCQRAGITVRMVTGDNLNT 714

  Fly   708 ARSIASKCGILRPNDDFLILEGKEFNRRIRDSNGDIQQHLIDKVWPKLRVLARSSPTDKYTLVKG 772
            ||:||:|||||:..||||.|||||||||||:..|:|:|..|||:|||||||||||||||:|||||
Zfish   715 ARAIATKCGILQVGDDFLCLEGKEFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKG 779

  Fly   773 IIDSTVSENREVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFSSIVKAVMW 837
            ||||||.|.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   780 IIDSTVVEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFSSIVKAVMW 844

  Fly   838 GRNVYDSIAKFLQFQLTVNVVAVIVAFIGACAVQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEFPTP 902
            ||||||||:||||||||||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||||||||.||.
Zfish   845 GRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEPPTE 909

  Fly   903 DLLLRKPYGRTKPLISRTMMKNILGQALYQLIIIFGLLFVGDVILDIESGRGQELNAGPTQHFTI 967
            .|||||||||.||||||||||||||.|:|||||||.|||.|:.:.:|:|||..:|:|.|::|:||
Zfish   910 SLLLRKPYGRNKPLISRTMMKNILGHAVYQLIIIFTLLFAGEKMFNIDSGRYADLHAPPSEHYTI 974

  Fly   968 IFNTFVMMTLFNEINARKIHGQRNVIEGLLTNPIFYTIWIFTMISQVLIIQYGKMAFSTKALTLD 1032
            :|||||||.||||||||||||:|||.||:..|.||.||...|.:.|::|:|:|...||...|.::
Zfish   975 VFNTFVMMQLFNEINARKIHGERNVFEGIFNNMIFCTIVFGTFVIQIVIVQFGGKPFSCVGLNIE 1039

  Fly  1033 QWLWCIFFGIGTLVWGQLITSVPTRKLPKILSWGRGHPEEYTDGMNLGE-ERFDSID-SDKKPRA 1095
            |||||||.|.|.|:|||:|:::||.:|..:.:.|.|..:|......|.| |..|.|| ::::.|.
Zfish  1040 QWLWCIFLGFGCLLWGQVISTIPTSRLTFLKTAGHGTQKEEIPDEELEELEDLDEIDHAERELRR 1104

  Fly  1096 GQILWIRGLTRLQTQ-----------------------------LRVIRAFRSTL---EDLNERR 1128
            |||||.|||.|:|||                             :||:.||||:|   |.|.:..
Zfish  1105 GQILWFRGLNRIQTQMDVVSAFQSGISFQAAVRRQPSSGSQQHDIRVVNAFRSSLSPYEGLEKPE 1169

  Fly  1129 SMHSLHSLRSPRTGIPVAVGGGHPLYNFNLLNPNYIKHQQQQEPKLPPQTQLNVSSGMMSPDISY 1193
            |..|:|:..:            ||.:..           :..||.:|           :..|...
Zfish  1170 SRTSIHNFMT------------HPEFRI-----------EDSEPHIP-----------LIDDTDA 1200

  Fly  1194 IDEDPQQQQRTLHNGLTSQRSSMPSNVPSSNQS 1226
            .|:.|.::..|          ..|...||.||:
Zfish  1201 EDDAPTKRNAT----------PTPPPPPSPNQN 1223

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PMCANP_001014689.3 P-type_ATPase_Ca_PMCA-like 62..921 CDD:319776 594/874 (68%)
Cation_ATPase_C 873..1051 CDD:376368 123/177 (69%)
ATP_Ca_trans_C 1096..1141 CDD:463575 24/76 (32%)
atp2b1aXP_009298531.1 ATPase-IIB_Ca 10..1064 CDD:273668 703/1063 (66%)
ATP_Ca_trans_C 1105..1182 CDD:463575 25/88 (28%)

Return to query results.
Submit another query.