DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PMCA and mca-2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001014689.3 Gene:PMCA / 43787 FlyBaseID:FBgn0259214 Length:1255 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_500161.1 Gene:mca-2 / 177004 WormBaseID:WBGene00019875 Length:1158 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1131 Identity:671/1131 - (59%)
Similarity:814/1131 - (71%) Gaps:55/1131 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 YGISLKQLRELMEHRGREGVMKI-AENGGIHELCKKLYTSPNEGLSGSKADEEHRRETFGSNVIP 74
            |..|:.:|:.|||.||.|.:.|: :...|:..||:||.|.|..||.....:.||||..||.|.||
 Worm     7 YDCSISELKLLMELRGAEALEKVNSTYNGVEGLCRKLKTDPINGLPNDTKELEHRRTAFGKNEIP 71

  Fly    75 PKPPKTFLTLVWEALQDVTLIILEVAALVSLGLSFYKPADEDAPVLQEEEEHHGWIEGLAILISV 139
            |.|.|:|..|.||||||:||:||.||||||||||||||..|.|.....|.| .|||||:|||::|
 Worm    72 PAPSKSFFRLAWEALQDITLVILLVAALVSLGLSFYKPPAEHASNDSSESE-AGWIEGVAILVAV 135

  Fly   140 IVVVIVTAFNDYSKERQFRGLQNRIEGEHKFSVIRGGEVCQISVGDILVGDIAQVKYGDLLPADG 204
            :|||:|||.||::||:||||||::||.|||||||||||...|.|.:::|||||:|||||||||||
 Worm   136 LVVVLVTALNDWTKEKQFRGLQSKIETEHKFSVIRGGEPLDIVVNELVVGDIARVKYGDLLPADG 200

  Fly   205 CLIQSNDLKVDESSLTGESDHVKKGPDVDPMVLSGTHVMEGSGKMVVTAVGVNSQAGIIFTLLGA 269
            .||||||||:||||||||||.::|..:.||::|||||.|||||:.:|||||:|||.|||.:||||
 Worm   201 LLIQSNDLKIDESSLTGESDLIRKSEEFDPVLLSGTHAMEGSGRFLVTAVGLNSQTGIIMSLLGA 265

  Fly   270 AVDEQEAEIKKMKKEAKRANKQKNLTGEND----GRSQIKGSQAPSQRETVTSEITKSESEGNHL 330
            |         |.||:.|: .:...||..|.    |....|.::.|                   :
 Worm   266 A---------KEKKDDKK-EEPTTLTNGNHMNGLGNGVDKAAELP-------------------V 301

  Fly   331 PQSSSSGAAETGHKKEKSVLQAKLTKLAIQIGYAGSTIAVLTVIILIIQFCIKTFVIDEKPWKNT 395
            |:....|      :..|||||.||:.||:||||.||.:|..||:||||:.||..:.|:.|.::.:
 Worm   302 PEEEEVG------RMSKSVLQTKLSNLALQIGYIGSIVAAATVLILIIRHCISKYAIEGKSFEAS 360

  Fly   396 YANNLVKHLIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTLSLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDK 460
            ..::.|..:||||||||:|||||||||:||:|.||||||||||||||||||||||||||:|||||
 Worm   361 DISHFVNFIIIGVTVLVIAVPEGLPLAITLALTYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATSICSDK 425

  Fly   461 TGTLTTNRMTVVQSYICEKLCK-VLPTLSDIPQHVGNLITMGISVNSAYTSNIMAGHNPGDLPIQ 524
            ||||||||||.||.||..:..| ..|....:.....:::..||.:||.|.|.::...|||:...|
 Worm   426 TGTLTTNRMTCVQQYINSEFYKGNAPKYEQMDPSTRDILFNGIVINSGYNSTVVTPKNPGEQRGQ 490

  Fly   525 VGNKTECALLGFVQGLGVKYQSIRDEITEDKFTRVYTFNSVRKSMGTVIPRPNGGYRLYTKGASE 589
            :||||||:||||:...|..|:.:|.:..|:|..:||||||.||||.|||...:..||:|.|||||
 Worm   491 IGNKTECSLLGFIMDSGRSYEDLRRQFPEEKLYKVYTFNSSRKSMMTVIELGDKKYRIYAKGASE 555

  Fly   590 IIMKKCAFIYGHEGTLEKFTRDMQERLIREVIEPMACDGLRTISVAYRDFVP--GKAAINEVHID 652
            ||:.:|.:|:|..|.:|:|.......:.:.||||||.||||||.:|::|.||  .|....|...|
 Worm   556 IILTRCNYIFGKSGKIEQFGPKEAAVMTKNVIEPMASDGLRTIGLAFKDLVPAGSKKYEYEEEYD 620

  Fly   653 GEPNWDDEENIMTNLTCLCVVGIEDPVRPEVPDAIRKCQRAGITVRMVTGDNINTARSIASKCGI 717
            ||.:|:|||.|....|.:.|:||:||||||||.||.|||:||||||||||||||||||||::|||
 Worm   621 GEIDWEDEEKIREGQTVIAVMGIQDPVRPEVPAAIAKCQKAGITVRMVTGDNINTARSIATQCGI 685

  Fly   718 LRPNDDFLILEGKEFNRRIRDSNGDIQQHLIDKVWPKLRVLARSSPTDKYTLVKGIIDSTVSENR 782
            ::|..|||.|||||||.||||::|.:.|...|.:|||||||||:.|:|||.||||||:|||::||
 Worm   686 MQPGGDFLALEGKEFNARIRDADGKVNQQKFDAIWPKLRVLARAQPSDKYVLVKGIIESTVTKNR 750

  Fly   783 EVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFSSIVKAVMWGRNVYDSIAK 847
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm   751 EVVAVTGDGTNDAPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFSSIVKAVMWGRNVYDSIAK 815

  Fly   848 FLQFQLTVNVVAVIVAFIGACAVQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEFPTPDLLLRKPYGR 912
            |||||||||||||.:|||||||:.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||
 Worm   816 FLQFQLTVNVVAVTIAFIGACAISDSPLKAVQMLWVNLIMDTLASLALATEMPTEDLLNRKPYGR 880

  Fly   913 TKPLISRTMMKNILGQALYQLIIIFGLLFVGD-VILDIESGRGQELNAGPTQHFTIIFNTFVMMT 976
            ||.||||||:|||:|.|:|||.|:|.::|.|| :|.:..|||..||.:.|:.|||||||.||:||
 Worm   881 TKSLISRTMVKNIVGHAVYQLAILFAIMFWGDKLIPNTPSGRNAELGSPPSAHFTIIFNAFVLMT 945

  Fly   977 LFNEINARKIHGQRNVIEGLLTNPIFYTIWIFTMISQVLIIQYGKMAFSTKALTLDQWLWCIFFG 1041
            |.||||||||||:|||.:|:.|||||..|||.|:||.:||:|:|...|||..|.|.||:.||..|
 Worm   946 LVNEINARKIHGERNVFKGIFTNPIFCVIWITTLISHILIVQFGGQWFSTAPLDLTQWIICICCG 1010

  Fly  1042 IGTLVWGQLITSVPTRKLPKILSWGRGHPEEYTDGMNLGEERFDSIDSD---------KKPRAGQ 1097
            :|.|.|||:|..:|...|||...:|:|..:. |..|..||....|..|.         ...||||
 Worm  1011 VGELFWGQIINCIPASILPKSFRFGKGDVQP-TSIMLSGEYDMPSTASTLPMKDGAAADHQRAGQ 1074

  Fly  1098 ILWIRGLTRLQTQLRVIRAFRSTLED 1123
            .||:.||||||||:||::||:|..:|
 Worm  1075 SLWLLGLTRLQTQIRVVKAFQSVNDD 1100

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PMCANP_001014689.3 P-type_ATPase_Ca_PMCA-like 62..921 CDD:319776 541/865 (63%)
Cation_ATPase_C 873..1051 CDD:376368 121/178 (68%)
ATP_Ca_trans_C 1096..1141 CDD:463575 18/28 (64%)
mca-2NP_500161.1 P-type_ATPase_Ca_PMCA-like 58..889 CDD:319776 541/866 (62%)
Cation_ATPase_C 841..1020 CDD:376368 121/178 (68%)
ATP_Ca_trans_C 1073..>1096 CDD:463575 16/22 (73%)

Return to query results.
Submit another query.