Protein Alignment Abcd1 and Abcd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651906.1
• Gene: Abcd1 / 43772
• FlyBaseID: FBgn0039890
• Length: 730
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_063117807.1
• Gene: Abcd4 / 299196
• RGDID: 1307273
• Length: 615
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 684
• Identity: 179/684 - (26%)
• Similarity: 314/684 - (45%)
• Gaps: 110/684 - (16%)

  Fly    68 PSTRDSSEEDFKLAEAEKLLVAQQLKKKATNNLVEPGLNKEFLKHLQMLAKIMIPQAFCYETGLL 132
            |:.|.|:.....|...:|.:..|::       ......::..|..:.:|...::.|...|:.||:
  Rat     6 PTARASARPRLDLQLVQKFIRIQKV-------FFPSWSSQNVLMFMTLLCVALLEQLVIYQVGLI 63

  Fly   133 SVHTFCLISRTFLSIYVAALEGALVKFIVRKDIKQF-ALVLLKWFGIAIPATFVNSMIR----FL 192
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  Rat    64 P------------SQYYGVLG--------NKDLDGFKALTFL-----AVALIVLNSTLKSFDQFT 103

  Fly   193 ESKLSLAFRTRLVRHSYRLYFKNQNYYRVSNLDGRIENADHRLTEDISVFANSVAHLYSSLTKPC 257
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  Rat   104 CNLLYVSWRKDLTEHLHQLYFRARVYYTLNVLRDDIDNPDQRISQDVERFCRQLSSVTSKLIISP 168

  Fly   258 FDLMLIGLALMRSSKKMKANIITGPALSIGVIALTAHILR-IVSPKFGQLVSEEANRYGYLRHIH 321
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  Rat   169 FTLAYYTYQCFQSTGWL------GPVSIFGYFILGTMVNKTLMGPIVTKLVQQE-KLEGDFRFKH 226

  Fly   322 SRIITNAEEIAFYGGHKVEMQQLRQAYNRLVNQMTTIFNQKLW-FIMLEQFFMKYVWSGTGMIMV 385
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  Rat   227 MQIRVNAEPAAFYRAGLVEHMRTDRRLQRLLQTQRELMSRELWLYIGINTF--DYLGSILSYVVI 289

  Fly   386 SLPILTGSDVGLGTVPNTAISESRVSERTQYLTTARNLLISAADAIERLMSSYKEIVSL------ 444
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  Rat   290 AIPIFRGV---YGDLSPTELS---------------TLVSKNAFVCIYLISCFTQLIDLSTTLSD 336

  Fly   445 -AGYTFRVAGMMDVFEETALGVYCKTSVMES-NQSNGIIEFRNGKPIAKGRIIYSDDPKNMSISL 507
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  Rat   337 VAGYTHRIGEL----QEALLDMSRKSHDCETLGESEWDLDKAPGWP--------TTEPSDTAFLL 389

  Fly   508 RAVPVVTPNCD-IVVPKLTLCIEPGVHLLITGPNGCGKSSLFRILSGLWPIYAGELHI-----PR 566
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  Rat   390 DRVSILAPSSDKPLIKDLSLKICEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWESMKGSVQMLADFGPH 454

  Fly   567 PVKDVPCMFYIPQRPYMSIGSLCDQIIYP-------DTREDMKRKHITENELRSI--LKMVSLEH 622
            .|      .::||:|:.:.|:|.:|:|||       ..|...:|:..:.::.|.:  |::..|..
  Rat   455 GV------LFLPQKPFFTDGTLREQVIYPLKEIYPDSERHPWRREAGSADDERIVRFLELAGLSS 513

  Fly   623 -IAQRDSFDVVRDWK--DILSGGEKQRMAIARLFYHRPRYALLDECTSAVSIDVESSIYEIAKGM 684
             :|:....|...||.  |:||.||.||::.|||||.:|:||:|||.|||::.:.||.:|.|.:.:
  Rat   514 LVARTGGLDQQVDWNWYDVLSPGEMQRLSFARLFYLQPKYAVLDEATSALTEEAESELYRIGQQL 578

  Fly   685 GITLLTITHRPTLWKYHTHILEFDGLGNWQFRKM 718
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  Rat   579 GMTFISVGHRPSLEKFHSWVLRLHGGGSWELTRI 612

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abcd1	NP_651906.1	3a01203	75..715	CDD:273360	176/672 (26%)
Abcd4	XP_063117807.1	None