DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PlexB and plx-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524616.2 Gene:PlexB / 43766 FlyBaseID:FBgn0025740 Length:2051 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001294554.1 Gene:plx-1 / 246019 WormBaseID:WBGene00004047 Length:1956 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2137 Identity:653/2137 - (30%)
Similarity:1021/2137 - (47%) Gaps:376/2137 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    63 ASSYGNRSIGNNIESVRDS--------QSKNYFTHMSFDFMHNVLFAGATNKILKL-NENLRVLA 118
            |::.|::    |:.|:.|:        .....|..|:.|.....:|.||.|.:..| :.:|.|..
 Worm    15 AAAAGSK----NVYSIDDNLVFKNPSHDGHEVFEKMAIDPSTTRVFVGAVNSLYDLTSADLTVRR 75

  Fly   119 EAVTGPLHDSPQCHAGGCPEDI--ETSLVNNFNKILVVSYAHDGILIACGSIRQGACEIYSLPRF 181
            ...|||..|||.|......|:.  :.|..|:..|.|.| |.....||.|.::.||.|.:.:|...
 Worm    76 HVQTGPQDDSPLCRDARNREECRHQLSRTNSHTKALSV-YDKSSKLIECSNLYQGRCRLRNLHNI 139

  Fly   182 PATPQFFAVPLAANDENASTYAFVGPARYAWKEEDILYVGTTFTNVGDYRHDVPAISSRRLDDLN 246
            .........|..:||.::|...|||........|.:||||.|   :|...||..::||..|....
 Worm   140 SEVISEAIEPRVSNDTSSSVVIFVGSGPANLSSEPVLYVGAT---IGSGDHDRMSVSSLFLRPQK 201

  Fly   247 YAEFSIQ----QSIINIDVKYRDH--FLVDYIYGFNSSEYAYFIIVQKKSHLADEAGYVTRLARI 305
            ..|....    .:.:::|.:.|.:  :.:|||.||.|.:|||| :.:::.::||::...:||.|:
 Worm   202 AFEVVFPGLYGGTHVSLDYRSRGYYKYQIDYINGFESGDYAYF-VTRQRVNIADDSSIQSRLVRV 265

  Fly   306 CITDPNYDSYTEITVQCTATENNVDYNIVRDAKVTPASHKLAQKMGIKKDDHVLVTVF---SPSR 367
            |..|.|:.||||:.::|  |:|.|::|:|:|..||.|.::||:.:.|...|.||..||   ..:.
 Worm   266 CTGDKNFHSYTEVPLEC--TQNGVEFNLVQDVYVTRAGYELAKSLDISVSDPVLYGVFWEGDKNS 328

  Fly   368 EISNQPESKSAMCIYSIKDIEDMFIENIHLCFNGTT-KDRNLGYISGTINDGRC-----PIVG-S 425
            ..|.:|..|||:|::::::||..|.:||..|:.||: ..:||.:.|.  ||. |     |..| .
 Worm   329 YRSQEPTGKSAICMFTMREIETSFKQNIMKCYKGTSGLKKNLPWFSS--NDD-CRFTTLPWEGIK 390

  Fly   426 LGNIYNFCSVGLKISGVSPITAHALFHFDNVSVTSVTATSTTDQQHSLAFLGTNMGVIKKVLL-S 489
            .|.     .|..||.|.:||:..|.:..::.|.........|.:..::||:||..|.:.|:|: |
 Worm   391 CGK-----DVNSKIGGDTPISTSATYVMEDSSNLLTAIAINTTRSSTVAFVGTQGGQLHKILIES 450

  Fly   490 GQSPGEYEEIVVDAGNRILPNTMMSPKKDFLYVLSQRKITKLRIEHC-SVYTNCSACLESRDPFC 553
            .:|..:|...::.....||.:.........:|:|:..|:.|:....| ::.|.|..||.||||:|
 Worm   451 KRSAEKYATEMLTDNEPILSDMEFGGDGKHVYILTPSKVIKMPTSRCEALSTQCDTCLSSRDPYC 515

  Fly   554 GWCSLEKRCTVRSTCQRDT--SASRWLSLGSGQQCIEFESIIPEKIPISELSHLHLIIRTLPEPF 616
            |||.....||...:|:|:.  ::..||.. ...:|....|:.|::|.|:...:|::.|..|..|.
 Worm   516 GWCVSNNHCTQEESCEREVPHTSRGWLDF-QNSKCPRIRSVKPDQIQINTADYLNVTIENLQAPK 579

  Fly   617 NAKYRCVF----GNSTPIDAEILENGLGCATPPLDERPLIPTNTDHILVPLSVRSSETNKDFVSR 677
            ..:.:|:|    |::...|....:..|.|||||::..|.||||..|:...|.|.|..:.....:.
 Worm   580 GRRMQCLFQFSTGDAVVSDPMPFDGSLKCATPPMNRLPRIPTNEYHLPAKLIVVSDGSKLPLATT 644

  Fly   678 NFAFFDCSHHGNCQECLQSSWGCNWCIFDNKCVHKSL---QCR--NIENAVSTVG--------HC 729
            ||:|:||:.:.:|..|..|.:.|:||:..|:||...|   :||  :|.|.::..|        .|
 Worm   645 NFSFYDCNRYTSCSTCSASQFPCDWCLESNECVAGKLTEDKCRKQHIVNGLNRDGSSIRKGPSKC 709

  Fly   730 PHLKKNRPEILLPV-RVPI------EIRLEIENLPKPKSAHAGFLC-----TIHIEAAQMLLPAH 782
            ||       |:.|| ::.:      .|.:::||:  ..:....|.|     |:..|...|.    
 Worm   710 PH-------IVAPVSKMSVATGERRNISVKVENV--DATFMGDFKCEFKYGTVTHEKIAMR---- 761

  Fly   783 VESNKIVVCEK---------------TPYFYEINTHEYQAKVVVTWNFQHY-------------V 819
             .|:..:.|::               |||.:.           |.|:...:             |
 Worm   762 -TSDDTITCDEMLFEPYGTSLLGSGSTPYGFN-----------VIWSATGFAVGKKSINRVLDNV 814

  Fly   820 DTAIVTLYKCDVLGSHREHPDCSLCVTRD-PKYKCAWCS--NSCVYNETCIADKNSISSGSKSAI 881
            .:..:.:|.|:.|.:     :|..|:|.| .||.|.|||  :.|.....|         .::...
 Worm   815 ASLAIDVYSCENLAT-----NCGRCLTLDADKYDCGWCSLDSKCARPHQC---------SNRQIP 865

  Fly   882 EN------ECPLPRIDIIKPLSGPVEGGTLITIEGSNLGIREEDVRGKIFIGSVPCELENYQISV 940
            ||      .||.|.|:..||..|.:.|||.:||.|.|||....||...:.|.:||||:..|..|.
 Worm   866 ENWLNASQLCPNPVIEDFKPKKGSIFGGTRVTINGINLGRHVSDVEKAVQIANVPCEVVEYVPSQ 930

  Fly   941 KIECRTGASLYEMSAPIKVANDAG-------------FTESSVQFHFKNVLLTGLYPTIGPRSGG 992
            ||.|.||.|      |||.:|:.|             |..|:..|.:...:::.:.|..||||||
 Worm   931 KIVCVTGKS------PIKGSNERGVVAVTLRHDSLKFFAHSTEHFSYVQPVVSSMKPVKGPRSGG 989

  Fly   993 TQLSLIGKFLNIGSTMRAFLDEYECHIDVTQASSSQVSC---TTSEATQ-PEPIRSLHLVIDGAN 1053
            |.::|.|..|:.|:.:.....:..|.|  .:.:|..:.|   .:.|..| |     ||:..||  
 Worm   990 TDVTLTGVDLDTGAEVTVRFGQIGCKI--LERASGWLRCRMGASGEGGQFP-----LHIAFDG-- 1045

  Fly  1054 RTLECQISTPSITNTNPTRSNFGSYQLRSLPRQPCSIFNYTQDPRIMQIKPLRSFKSGGRVLTVH 1118
                                     ||::||..  ..|.:|.||.:..|.|.::..|||..:.|:
 Worm  1046 -------------------------QLQNLPIP--IYFEFTSDPSVQSISPNKTIPSGGITVDVY 1083

  Fly  1119 GIYLNSIQKPELEVF--YDNERVNKTSCVVINSNQMECPSPPVNYKFETFKKTNRKMDTELHLQN 1181
            |.....:|:|.: ||  ..:|:....:|.:.:...|:|.:|....|                   
 Worm  1084 GQGFTLLQRPRM-VFTGLGDEKSYGPACSIEDDQMMKCATPTAPGK------------------- 1128

  Fly  1182 SSFQTETRYKNEYDRKKRRADFGDTFRLYTNAGSSANYFVNNNMDVTTFVKVHETQLNLQLSFVM 1246
                              .:|.|...|:                              .:.:|..
 Worm  1129 ------------------DSDRGSQERI------------------------------TEYAFDF 1145

  Fly  1247 DNVQLVRNLNKYFHDIRSTIVYLADPKYLPFPNDGVKLYKGDSLVIEGELLNLAADEYDVNVTIG 1311
            |..:|.|:..|....  .|...|::|:::. |.:       |.|.:.|..|||||.|.|::|.:|
 Worm  1146 DGAELYRSRIKVMPS--PTFETLSEPRFVR-PGE-------DFLTLNGNHLNLAASERDIDVKVG 1200

  Fly  1312 TSQCNITSLALNQLLCIPPEQQPLPTDENGVDQSTDLPLVVVKVGRNLRFVIGYLKYDLNKPYVF 1376
            ...|.:|:||...|.|.||.::|     .|..:..  |.:||.|| |..|.||.:.||  .|.:.
 Worm  1201 GEPCPLTALANKVLTCQPPVKKP-----RGAGKLN--PEIVVTVG-NASFSIGEVSYD--SPGLS 1255

  Fly  1377 SHALLVGILTVALLVVVFVIVLIIFRRKSTQAEREYKRIQIQMITLESNVRSECKQAFAELQTDM 1441
            |....:.:..:..::.:.:.:::::||||...:|:.|.::.||.|:|..|.:|||:|||||||.:
 Worm  1256 SSLFFIIMFFIIFMIALIICLIVLYRRKSNTHQRQMKYLKTQMDTIEMKVATECKEAFAELQTSL 1320

  Fly  1442 TDLTADLESTGIPT---LDHVNYIMKVFFPGV-SDHPILNSPKFREGSPQTNYDAAMVQFEQLIG 1502
            ...|||| ..|.||   |::.:|..:|.||.. .:|.:|.:.:......:. .:|.:.:|.:|:.
 Worm  1321 NQYTADL-PLGTPTAPFLEYKDYCARVLFPNAGKNHAVLKNLEVDTHKAEA-IEAGLREFHKLLM 1383

  Fly  1503 NKYFLLMFIETLEAQRSSFSIRDRVNVASLIMVVLMNKMEYATEILKSLLLRLIDKSLASK-HPQ 1566
            ||.|||..:.|:||.: .|..:|||.|.||:||||..||.|.||:||.||..||:|::..| .|:
 Worm  1384 NKTFLLTMVRTMEANK-YFVGKDRVYVGSLLMVVLQEKMGYCTEMLKQLLRELIEKTVEKKFQPK 1447

  Fly  1567 LMLRRTESVVEKMLTNYLAICMYDYLKEY-AGSNLFLLFKAIKHQIEKGLVDAITNDARYSLSEE 1630
            ::.||:||:.|:||..:....::|:||.| ||..|:.||..||.|:|||..||:|.:||||||||
 Worm  1448 ILFRRSESIAERMLAAWFTFLLHDHLKTYDAGKKLYELFWGIKQQMEKGPQDALTLEARYSLSEE 1512

  Fly  1631 RLLHEQVTHSVVILHILQDD----LDEKVQCRVNDWDTISQVKLKILDAIFKNTPFSMRPSVNEV 1691
            :||.....:..:::.:...|    ..:.:..||.|.|||:|||.|.|||.::...|:.||:..::
 Worm  1513 KLLRATFEYKELMVFVSASDSVYSSTQDIPVRVLDCDTITQVKEKCLDAKYRGYRFADRPAPGDM 1577

  Fly  1692 DLEWRHGRGGHLTLQDEDLTTKTVNG-WKRLNTLAHYGVKESAVMSLIARQNDNYHIPYSKNQNS 1755
            :|||:.|..|.:.|||.|.:::...| ||||||||||.|..:|:::|.::.|..|::   .|.:|
 Worm  1578 ELEWKTGMNGKMALQDIDSSSRVEGGNWKRLNTLAHYNVPNNAILTLTSKSNSLYNL---VNFSS 1639

  Fly  1756 APYHNFYFINNSQ--------------------------SHIIINNDIESGLQQPRVYHLVKPNI 1794
            ........:::..                          .|...:.|.::|.   ::||||||. 
 Worm  1640 TSMKTASILSDRSEKSSVSMKTPGVGSPKPWGAPPSVIADHASSSADTDNGF---KLYHLVKPT- 1700

  Fly  1795 PDHYMNIKNSVLSGGSPAFQSHVVNNCNDRVNKTIPEVYLTRLLATKGTIQKFVDDFFSIILTVN 1859
             :|            .|          .|...|.:.|:||||||..|||:.||:......|.: :
 Worm  1701 -EH------------GP----------TDSQEKMVTEIYLTRLLMMKGTLAKFITSLLESIFS-S 1741

  Fly  1860 EELPPAVKWLFDLLDEAARRHDIADTDIVHAWKSNCLPLRFWVNFIKNPDFIFDVNKTYSVDSCL 1924
            ..:||.:|::||.:||.||.|.|.|.::|||||||.||||||||.||||.|:||:.|...::.||
 Worm  1742 STVPPCIKYMFDFMDEQAREHGINDPEVVHAWKSNALPLRFWVNLIKNPHFLFDIQKPTKIEGCL 1806

  Fly  1925 SVIAQTFMDACSTSEHRLGKDSPSNKLLFAKDIPNYRIMVKEFYRDVSRLPQISDQEMSTAMQQL 1989
            ||:|||.||||||.:|:|.|||||:|||||||:..||.:|..:|.::|..|:|.|..|...:...
 Worm  1807 SVVAQTLMDACSTQDHQLTKDSPSSKLLFAKDMYQYRDLVDSYYTEISMTPRIDDATMGANLSAE 1871

  Fly  1990 SVRQNEEFDTISALKELYIYITKYKDQIMESLETDINCRKMHLSRKLGNVAATLDGD 2046
            |.:.|.||...|||.|||.|:.:||:.|:::||::.:.:...|..:|.::.|.::.|
 Worm  1872 SRQHNGEFHVFSALNELYKYLDQYKESIIDALESNEHAQASRLPGRLQDLLALMESD 1928

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PlexBNP_524616.2 Sema_plexin_like 86..534 CDD:200497 141/467 (30%)
PSI 535..586 CDD:396154 19/53 (36%)
TIG_plexin 594..682 CDD:465588 28/91 (31%)
PSI 683..730 CDD:214655 17/59 (29%)
TIG_2 738..827 CDD:465619 19/128 (15%)
PSI 836..877 CDD:214655 12/43 (28%)
IPT_plexin_repeat1 888..976 CDD:238585 37/100 (37%)
IPT_plexin_repeat2 977..1095 CDD:238584 28/121 (23%)
IPT_plexin_repeat3 1097..1211 CDD:238586 21/115 (18%)
TIG 1277..>1334 CDD:460355 21/56 (38%)
Plexin_cytopl 1452..2012 CDD:462434 233/596 (39%)
plx-1NP_001294554.1 Sema_plexin_like 42..495 CDD:200497 141/467 (30%)
PSI 496..550 CDD:396154 19/54 (35%)
TIG_plexin 556..649 CDD:465588 28/92 (30%)
PSI 650..>677 CDD:396154 9/26 (35%)
TIG_2 717..822 CDD:465619 16/122 (13%)
PSI 823..876 CDD:396154 16/66 (24%)
IPT_plexin_repeat1 878..973 CDD:238585 37/100 (37%)
IPT_PCSR 974..1059 CDD:238337 28/120 (23%)
IPT 1062..1146 CDD:472823 22/151 (15%)
IPT_PCSR 1179..1248 CDD:238337 30/76 (39%)
Plexin_cytopl 1333..1894 CDD:462434 231/593 (39%)

Return to query results.
Submit another query.