DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment faf and Usp9x

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524612.2 Gene:faf / 43749 FlyBaseID:FBgn0005632 Length:2778 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006527649.1 Gene:Usp9x / 22284 MGIID:894681 Length:2575 Species:Mus musculus


Alignment Length:2662 Identity:1258/2662 - (47%)
Similarity:1694/2662 - (63%) Gaps:247/2662 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 TTTTTTSPAQSAGSGSGIGTGTGTVANSSLPGGGSGSLDGNQDQQPAT--DSQSSDDVAASLSAN 89
            |.||..||   .|.....|......:...|....:.|.|.:.:..|||  |.|...|        
Mouse     2 TATTRGSP---VGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDEQGQGD-------- 55

  Fly    90 SVDSTITIVPP--EKLISSFPTTKLRSLTQKISNPRWVVPVLPEQELEVLLNAAIELTQAGVDHD 152
                    .||  |....:||.|.|..|...|:.|||||||||:.||||||.|||:|::.|:|..
Mouse    56 --------APPQIEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEAAIDLSKKGLDVK 112

  Fly   153 CEPCVEFYRNGLSTSFAKILTDEAVNSWKNNIHHCILVSCGKLLHLIAIHMQRDNPYLLDLLAIV 217
            .|.|..|:|:||:.||.||||||||:.||..||.||:.:..:|:.|....:.:|...||:|||:.
Mouse   113 SEACQRFFRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIINNTHRLVELCVAKLAQDWFPLLELLAMA 177

  Fly   218 FDPENKFNTFNAGRQPECFAAPDYIWGQLDSNKMYARPPPEPKNARGWLVDLINRFGQLGGFDNL 282
            .:|..||:.:| |.:| |.:....:  ||..::::|| .|:|::.:||||||:|:||.|.||..|
Mouse   178 LNPHCKFHIYN-GTRP-CESVSSSV--QLPEDELFAR-SPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQIL 237

  Fly   283 LERFNIGLELLKRNQNKCTGKNISVEGRVENGAQDNRLTLALIHSLLRPFGQCYELLMPATIAKY 347
            .:||..|                            :.|.:.:|.:|::|||||||.|...|:.||
Mouse   238 HDRFING----------------------------SALNVQIIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKY 274

  Fly   348 FMPTWNVVLDLLDSFTDEELKREVKPEGRNDYINGIVKSARLLASRLTGQEELIRDLEMFRLKMI 412
            |:|...:|...|::.||||||:|.|.|.:||.::.|:||.:.||||:.||||.:::||:||||||
Mouse   275 FLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKNEAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMI 339

  Fly   413 LRLLQVSSFNGKMNALNEINKVLSSVAYFSHRSQPLPHCMPEDEMDWLTADRMAQWIKSSDVLGV 477
            |||||:||||||||||||:|||:|||:|::||     |...||| :||||:|||:||:.:::|.:
Mouse   340 LRLLQISSFNGKMNALNEVNKVISSVSYYTHR-----HGSSEDE-EWLTAERMAEWIQQNNILSI 398

  Fly   478 VLKDSLHQPQYVEKLEKIIRFLIKEQALTLDDLDAVWRAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFTPE 542
            ||:|||||||||||||||:||:|||:||||.|||.:|.||||||||||||||||||||||||:||
Mouse   399 VLRDSLHQPQYVEKLEKILRFVIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVHDLLAKLAWDFSPE 463

  Fly   543 QLDHLFEAFQASMTTANKRQRERLLELIRRLAEDDKNGVMAQKVLKLFWTLAHSQEVPPEVLDQA 607
            ||||||:.|:||.|.|:|:|||:|||||||||||||:||||.|||.|.|.||||.:||.:::|.|
Mouse   464 QLDHLFDCFKASWTNASKKQREKLLELIRRLAEDDKDGVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLA 528

  Fly   608 LGAHVKILDYSCSQERDAQKTIWLDKCVDELKSGDGWVLPALRLIRDICCLY--------DTTTN 664
            |.||:|||||||||:||.||..|:|:.::||::.|.||:|||:.||:||.|:        .:..:
Mouse   529 LSAHIKILDYSCSQDRDTQKIQWIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSSSRFS 593

  Fly   665 HAQRTQTSTNRQQVIERLQNDYSLVILVTNSLTAYMEKVRQMVTDSPGLDATRILIDGRFPHHVQ 729
            .:||:.....|..:|.:||::::||.||..:|..|||.:|....|:...|...:.:..|:.|..:
Mouse   594 QSQRSPHVFYRHDLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRMYGRDNEDYDPQTVRLGSRYSHVQE 658

  Fly   730 IAERLEFLKFLLKDGQLWLCADQAKQIWHCLAVNAVFPADREECFRWFGKLMGEEPDLDPGINKD 794
            :.|||.||:||||||||||||.||||||.|||.|||:..|||.||:|:.||||:||||||.||||
Mouse   659 VQERLNFLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKWYSKLMGDEPDLDPDINKD 723

  Fly   795 FFENNILQLDPHLLTESGIKCFERFFKAVNSKEDKLKAIHRGYMLDNEDLIGKDYLWRVITTGGE 859
            |||:|:|||||.||||:|:|||||||||||.:|.||.|..|.||:|:.:|||.||||||:....:
Mouse   724 FFESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCREGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQSND 788

  Fly   860 EIASKAIDLLKEVSTALGPRLQENIAEFHEMFIGECCSRLRTHYGNIVILGKTQLQEELDAPDQS 924
            :||.:|||||||:.|.||||||.|....||.||..|..||:..|..:.:|               
Mouse   789 DIACRAIDLLKEIYTNLGPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVL--------------- 838

  Fly   925 DNTNDESKDS-KMRFIEAEKMCRILKVLQEYVKECDRSFSGDRVHLPLSRVTRGKNTILYIRFQN 988
                |..||| .....||.:|.|:|.||:||:.|||..:..:|..||:||..|||:....:||.|
Mouse   839 ----DGDKDSINCARQEAVRMVRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFIVRFPN 899

  Fly   989 PGRSIDDMEIVTHSNETMAAFKRNLLKRIKGTSTANIKVDLFYANDEMIGVSDEINPLYQYTIRD 1053
            .||.:||:|:.:|:|:|:.:.:|.:|.||| .:.|:.|::|| ...|:|...|:...:.|..::|
Mouse   900 QGRQVDDLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIK-ANVAHTKIELF-VGGELIDPGDDRKLIGQLNLKD 962

  Fly  1054 KMNLTAKLTPVGTGLASSPDSSSDSSTGSP----------PRPCPDMQRVESESTLPGVIISQNY 1108
            |..:|||||.:.:.:.||||||||||||||          |.|       |.||.|||||:|.:.
Mouse   963 KSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNP-------EVESCLPGVIMSLHP 1020

  Fly  1109 QYTEFFLKLYQLGSDLEHGRLRDSAKVLLHLLPCDRQTIRQLKIMCKVPKAAVTVAVTGDKIAKD 1173
            :|..|..::..|||.|....|||.|:||:.|:|.|..||.:|:.:|.             ..||.
Mouse  1021 RYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPDSTTIEKLRAICL-------------DHAKL 1072

  Fly  1174 EEEKLYPTEQAGIEDEEEHCTPEQMFLHPTPAQVLYNLSVLHGLLIPALDPLGESALLVQSAWMH 1238
            .|..|.|             :.:.:|..|:.:||||...|::.||:||..||.:.:...|..::.
Mouse  1073 GESSLSP-------------SLDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLMPAGAPLTDDSSDFQFHFLK 1124

  Fly  1239 SGCAHFVLELLTKNNFLPSADMHTKRASFQCVLRLAKLFLYIVGSVLSRV----------GDEPM 1293
            ||....||.:||:|||||:|||.|:|.::...|::|||.|..:|....|.          |..||
Mouse  1125 SGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLNALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPM 1189

  Fly  1294 ICDLDNGSRSQVDILKQNFSTMPS-SSQGTLRAISAKLAVILAREMLSASPEGDRCRTLFSSTLQ 1357
             ..::..:..|..:|:....::|: ||:..||.:|.:||       ...|.|..|          
Mouse  1190 -TSVNQVTHDQAVVLQSALQSIPNPSSECMLRNVSVRLA-------QQISDEASR---------- 1236

  Fly  1358 WSCPDISTIKAVVQLAWASSCGNLQALGNSSGDFEDEVI----------VPDGQDFSMCKEALEV 1412
             ..|||..|:|:.::.|.|.||.||.:.:.:    :||.          .||.:|..:|.|||||
Mouse  1237 -YMPDICVIRAIQKIIWTSGCGGLQLVFSPN----EEVTKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEV 1296

  Fly  1413 LTISFILNPSANEALTSDPNWPKFITSIVLKNPLRHVRQVASEQLFLASTYCAGDRRPFVYMVNL 1477
            :|:.|.|.|:|.:||:.:..|..||..::|....:.|||||.||.||..|.|....||.::.:.|
Mouse  1297 MTLCFALIPTALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPLLFFITL 1361

  Fly  1478 LVGALKTLVPQYESTCAEFFSVLCRTLSYGCIYNWPLQI--SEGLLGDEIKWLQRIRENVHATGD 1540
            |...|.:...:......::|::|...|:|.  ||..:.:  :|.||.:||.||:|||::|..||:
Mouse  1362 LFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYA--YNSNINVPNAEVLLNNEIDWLKRIRDDVKRTGE 1424

  Fly  1541 TQVHEELLEGHLCLAKELMFFLGADSKAQLN------ELIHELIDDFLFTASREFLHLRRHGSLR 1599
            |.|.|.:|||||.:.|||:.|...:.|..:.      .||.||||||:|.||..:|...|:|.|.
Mouse  1425 TGVEETILEGHLGVTKELLAFQTPEKKFHIGCEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELP 1489

  Fly  1600 QDTVPPPVCRSPHTIAAACDLLIALCQLCVPNMKLLTNTL-----IDFVCTDTDPLREWDYLPPV 1659
            .:.. .|||.||.||.|..:||:||...||.|:|.:.::|     |....|..:.|.||:|||||
Mouse  1490 AEQA-IPVCGSPATINAGFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPV 1553

  Fly  1660 GARPTKGFCGLKNAGATCYMNSVLQQLYMVPAVRVGILRAHGAATTDGEDFSGD---SDLTGGGL 1721
            |.||.|||.||||||||||||||:|||||:|::|.|||...|..:...:|.|||   .:.:....
Mouse  1554 GPRPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMSGDEKQDNESNVDP 1618

  Fly  1722 GSALFSGPASALVSLPSSSSTIEDGLHDVRKNYHVVILKHVQAIFAHLGHSALQYYVPRGLWTHF 1786
            ...:|..| ......|..|.| ||     ||.|::.:|:|:|.||.||..|.||||||||.|..|
Mouse  1619 RDDVFGYP-QQFEDKPPLSKT-ED-----RKEYNIGVLRHLQVIFGHLAASRLQYYVPRGFWKQF 1676

  Fly  1787 KLLGEPVNLREQQDAVEFFMSLLESLDEGLKALGQPQLMNATLGGSFSDQKICQECPHRYSKEEP 1851
            :|.|||||||||.||:|||.||::||||.|||||.|.:::..|||||:||||||.|||||..||.
Mouse  1677 RLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEALKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEES 1741

  Fly  1852 FSVFSVDIRNHSSLTESLEQYVKGELLEGADAYHCDKCDKKVVTVKRVCVKKLPPVLAIQLKRFE 1916
            |:..:||||||.:|.:||||||||:|||||:||||:||:|||.||||:.:||||||||||||||:
Mouse  1742 FTTLNVDIRNHQNLLDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRFD 1806

  Fly  1917 YDYERVCAIKFNDYFEFPRILDMEPYTVSGLAKLEGEVVE-----VGDNCQTNVE---TTKYELT 1973
            ||:||.|||||||||||||.||||||||:|:|||||:.|.     :..|.|:..|   :|||.|.
Mouse  1807 YDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQNEQSESEKAGSTKYRLV 1871

  Fly  1974 GIVVHSGQASGGHYFSYILSKNPANG-KCQWYKFDDGEVTECKMHEDEEMKAECFGGEYMGETYD 2037
            |::|||||||||||:|||:.:|..:| |.:|||||||:||||||.:|||||.:|||||||||.:|
Mouse  1872 GVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGEKNRWYKFDDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFD 1936

  Fly  2038 NNLKRMQYRRQKRWWNAYMLFYTRC-----DQTPVQYEPSVEQLSLAESRNMVLPLPKPIERSVR 2097
            :.:|||.|||||||||||:|||.|.     |...::|   :.::::....:.:: :|..||||||
Mouse  1937 HMMKRMSYRRQKRWWNAYILFYERMDTIGHDDEVIRY---ISEIAITTRPHQIV-MPSAIERSVR 1997

  Fly  2098 HQNIRFLHSRSIFSVEFFNFIKKLVSCNLLSAR----SNKITPAAEELSLLGVQLASQFLFHTGF 2158
            .||::|:|:|..:|:|:|.|:|||::||.:...    .:.::|.|||::::.:|||::|||.|||
Mouse  1998 KQNVQFMHNRMQYSLEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLSPEAEEITMISIQLAARFLFTTGF 2062

  Fly  2159 RTKKSLRGPVMEWYDALSHHIRSSALVRKWFANHALLSPPSRLGEYILMAPSPDVRTVFVKLVVF 2223
            .|||.:||...:|||||...:|.|..||.|||::.|.:..:|..||:|..||.:||..|.||:||
Mouse  2063 HTKKIVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRFSEYLLECPSAEVRGAFAKLIVF 2127

  Fly  2224 FCHFAINDEPL-----------TGYDGANLCEQVLISVLRLLKSEAADYGKHLPHYFSLFSMYVG 2277
            ..||::.|.|.           ..||..:|.:.:|.:||.||:.|.:::|:||..||:||.||..
Mouse  2128 IAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNLSLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYAN 2192

  Fly  2278 LGTREKQQLLRLNVPLQFIQVALDDGPGPAIKYQYPEFSKLHQVVSHLIRCSDVSEKCQSSNQNA 2342
            ||..||.|||:|:||..|:.|:||:||||.|||||.|..||:.|||.||||.:||.:.|||....
Mouse  2193 LGVAEKTQLLKLSVPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSINGN 2257

  Fly  2343 RPLSNPFKDPNVAHEELTPLSTECMDLLFNRTGYIKKVIEDTNVGDEGLKLLQYCSWENPHFSRA 2407
            ..|.|||.|||:: :.:.|:....:|:||.||.|:||:|||.:..||.:|||::|.||||.||..
Mouse  2258 PSLPNPFGDPNLS-QPIMPIQQNVVDILFVRTSYVKKIIEDCSNSDETVKLLRFCCWENPQFSST 2321

  Fly  2408 VLTELLWQCGFAYCHDMRHHTDLLLNILLIDDSWQHHRIHNALNGVAEEREGLLETIQRAKTHYQ 2472
            ||:|||||..::|.:::|.:.||||.||||:||||.|||||||.|:.::|:||.:||||:|.|||
Mouse  2322 VLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQILLIEDSWQTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQ 2386

  Fly  2473 KRAYQIIKCLTQLFHKSPIALQMLHTNSNITRHWSIAVEWLQGELDRQRGIG-CQYNSYSWSPPA 2536
            |||||.|||:..||...|:|.|:|..|.::.|.|:.|||||..||:|:...| .||...:||||.
Mouse  2387 KRAYQCIKCMVALFSSCPVAYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPV 2451

  Fly  2537 QSNDNTNGYMLERSQSAKNTWSMAFELCPDEVSEKT-------DENNEPNLETNMDENKSEP 2591
            |||:.:|||.||||.||:.|.:.|.||||:||.:.|       :|:.||:.:...||::|.|
Mouse  2452 QSNETSNGYFLERSHSARMTLAKACELCPEEVKKATSLQEIEMEESKEPDDQDAPDEHESPP 2513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
fafNP_524612.2 Ubl1_cv_Nsp3_N-like <994..1060 CDD:475130 22/65 (34%)
peptidase_C19C 1666..2064 CDD:239124 255/414 (62%)
DUF3517 2198..2566 CDD:463438 193/379 (51%)
Usp9xXP_006527649.1 Ubl1_cv_Nsp3_N-like <905..969 CDD:475130 22/65 (34%)
peptidase_C19C 1560..1963 CDD:239124 255/409 (62%)
DUF3517 2102..2481 CDD:463438 193/379 (51%)

Return to query results.
Submit another query.