DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MRE11 and Mre11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427389.1 Gene:MRE11 / 4361 HGNCID:7230 Length:725 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_071615.1 Gene:Mre11 / 64046 RGDID:69263 Length:706 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:726 Identity:626/726 - (86%)
Similarity:664/726 - (91%) Gaps:21/726 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSTADALDDENTFKILVATDIHLGFMEKDAVRGNDTFVTLDEILRLAQENEVDFILLGGDLFHEN 65
            ||..|.||||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
  Rat     1 MSPTDPLDDEDTFKILVATDIHLGFMEKDAVRGNDTFVTFDEILRLALENEVDFILLGGDLFHEN 65

Human    66 KPSRKTLHTCLELLRKYCMGDRPVQFEILSDQSVNFGFSKFPWVNYQDGNLNISIPVFSIHGNHD 130
            ||||||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat    66 KPSRKTLHSCLELLRKYCMGDRPVQFEIISDQSVNFGFSKFPWVNYRDGNLNISIPVFSIHGNHD 130

Human   131 DPTGADALCALDILSCAGFVNHFGRSMSVEKIDISPVLLQKGSTKIALYGLGSIPDERLYRMFVN 195
            ||||||||||||:||||||||||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   131 DPTGADALCALDVLSCAGFVNHFGRSMSVEKVDISPVLLQKGSTKLALYGLGSIPDERLYRMFVN 195

Human   196 KKVTMLRPKEDENSWFNLFVIHQNRSKHGSTNFIPEQFLDDFIDLVIWGHEHECKIAPTKNEQQL 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||
  Rat   196 KKVTMLRPKEDENSWFNLFVIHQNRSKHGSTNFIPEQFLDDFIDLVIWGHEHECKIGPTRNEQQL 260

Human   261 FYISQPGSSVVTSLSPGEAVKKHVGLLRIKGRKMNMHKIPLHTVRQFFMEDIVLANHPDIFNPDN 325
            ||:|||||||||:|||||.|||||||||:|||||||.|:||.|||||||||:||||||.:|||||
  Rat   261 FYVSQPGSSVVTALSPGETVKKHVGLLRVKGRKMNMQKLPLRTVRQFFMEDVVLANHPSLFNPDN 325

Human   326 PKVTQAIQSFCLEKIEEMLENAERERLGNSHQPEKPLVRLRVDYSGGFEPFSVLRFSQKFVDRVA 390
            |||||||||||||||||||::||||||||..||||||:|||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   326 PKVTQAIQSFCLEKIEEMLDSAERERLGNPQQPEKPLIRLRVDYSGGFEPFNVLRFSQKFVDRVA 390

Human   391 NPKDIIHFFRHREQKEKTGEEINFGKLITKP-SEGTTLRVEDLVKQYFQTAEKNVQLSLLTERGM 454
            ||||:||||||||||.||||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 NPKDVIHFFRHREQKGKTGEEINFGKLIIKPASEGTTLRVEDLVKQYFQTAEKNVQLSLLTERGM 455

Human   455 GEAVQEFVDKEEKDAIEELVKYQLEKTQRFLKERHIDALEDKIDEEVRRFRETRQKNTNEEDDEV 519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||
  Rat   456 GEAVQEFVDKEEKDAIEELVKYQLEKTQRFLKERHIDALEDKIDEEVRRFRESRQRNTNEEDDEV 520

Human   520 REAMTRARALRSQSEESASAFSADDLMSIDLAEQMANDSDDSISAATNKGRGRGRGRRGGRGQNS 584
            ||||:||||||||||.:||||||||| |.|:.||.|:|||||.||..::||||||||||||||::
  Rat   521 REAMSRARALRSQSENAASAFSADDL-SFDITEQTADDSDDSQSAVPSRGRGRGRGRRGGRGQST 584

Human   585 ASRGGSQRGRADTGLETSTRSRNSKTAVSASRNMSIIDAFKSTRQQPSRNVTTKNYSEVIEVDES 649
            |.|||||||| ||||..|||.|:||...|.||||||||||:||||||||||.||||||.||||||
  Rat   585 APRGGSQRGR-DTGLGISTRGRSSKATASTSRNMSIIDAFRSTRQQPSRNVATKNYSETIEVDES 648

Human   650 DVEEDIFPTTSKTDQRKGDLLEDYRDTSGFGRKWSSTSSSKIMSQSQVSKGVDFESSEDDDDDPF 714
            | ::|.|||:|:.|||                 ||.|:.||.|||||.:|||||||.||||||||
  Rat   649 D-DDDSFPTSSRADQR-----------------WSGTAPSKRMSQSQTAKGVDFESDEDDDDDPF 695

Human   715 MNTSSLRRNRR 725
            |:.|..|||||
  Rat   696 MSGSCPRRNRR 706

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MRE11NP_001427389.1 None
Mre11NP_071615.1 mre11 10..402 CDD:273153 363/391 (93%)
Interaction with NBN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P49959 87..117 27/29 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 505..706 154/220 (70%)
GAR. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P49959 570..594 20/23 (87%)

Return to query results.
Submit another query.